More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2044 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  100 
 
 		 257 aa  532  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  84.49 
 
 		 257 aa  436  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1921  30S ribosomal protein S2  84.19 
 
 		 251 aa  420  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264289  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  83.4 
 
 		 256 aa  418  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000926335  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1250  30S ribosomal protein S2  83.26 
 
 		 251 aa  419  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000302151  hitchhiker  0.0000384341 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  81.97 
 
 		 255 aa  407  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  81.97 
 
 		 255 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1921  30S ribosomal protein S2  73.22 
 
 		 267 aa  381  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.7747799999999994e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1778  ribosomal protein S2  64.98 
 
 		 274 aa  350  8.999999999999999e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  65.43 
 
 		 244 aa  345  4e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185332  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  69.6 
 
 		 233 aa  343  1e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  67.23 
 
 		 235 aa  340  9e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3213  ribosomal protein S2  69.06 
 
 		 248 aa  340  2e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321925  unclonable  0.000000000222969 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1978  30S ribosomal protein S2  67.97 
 
 		 232 aa  338  5e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000338661  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  66.38 
 
 		 235 aa  337  8e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  65.09 
 
 		 301 aa  335  5e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000123477  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1006  30S ribosomal protein S2  62.89 
 
 		 252 aa  333  1e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000128012  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  64.32 
 
 		 238 aa  332  3e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0474  30S ribosomal protein S2  65.16 
 
 		 304 aa  332  5e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536253  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  65.11 
 
 		 235 aa  331  9e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0295  30S ribosomal protein S2  67.09 
 
 		 343 aa  330  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0422466  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0284  30S ribosomal protein S2  67.09 
 
 		 314 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0442  30S ribosomal protein S2  66.23 
 
 		 252 aa  328  4e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000051714  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  64.76 
 
 		 232 aa  328  4e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0295  30S ribosomal protein S2  63.89 
 
 		 315 aa  328  5.0000000000000004e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0657172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  61 
 
 		 271 aa  328  5.0000000000000004e-89  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000778728  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0273  30S ribosomal protein S2  67.81 
 
 		 301 aa  325  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1941  ribosomal protein S2  58.89 
 
 		 262 aa  325  6e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1816  30S ribosomal protein S2  60.64 
 
 		 257 aa  323  1e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541904  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  59.75 
 
 		 262 aa  321  7e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  59.92 
 
 		 262 aa  320  9.999999999999999e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000550841  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1954  30S ribosomal protein S2  65.09 
 
 		 233 aa  318  5e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000941341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1672  30S ribosomal protein S2  65.09 
 
 		 233 aa  318  5e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000487185  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2455  30S ribosomal protein S2  62.77 
 
 		 255 aa  317  2e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3709  30S ribosomal protein S2  62.56 
 
 		 244 aa  315  3e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000237071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1318  30S ribosomal protein S2  63.88 
 
 		 233 aa  315  3e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000762012  hitchhiker  4.07369e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3925  30S ribosomal protein S2  63.88 
 
 		 233 aa  315  3e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000230027  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0882  ribosomal protein S2  63.27 
 
 		 236 aa  315  3e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2924  30S ribosomal protein S2  59.26 
 
 		 271 aa  316  3e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.240537 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  59.36 
 
 		 255 aa  315  4e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000315088  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2479  30S ribosomal protein S2  63.44 
 
 		 233 aa  315  4e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000168536  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  59.36 
 
 		 255 aa  315  4e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000466794  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  63.44 
 
 		 233 aa  315  5e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000560898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3678  30S ribosomal protein S2  63.44 
 
 		 233 aa  315  5e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  63.44 
 
 		 233 aa  315  5e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  63.44 
 
 		 233 aa  315  5e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3965  30S ribosomal protein S2  63.44 
 
 		 233 aa  315  5e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  63.44 
 
 		 233 aa  315  5e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000491144  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3839  30S ribosomal protein S2  63.44 
 
 		 233 aa  315  5e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.22661e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3650  30S ribosomal protein S2  63.44 
 
 		 233 aa  315  6e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  59 
 
 		 262 aa  314  9.999999999999999e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2376  ribosomal protein S2  56.15 
 
 		 261 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2108  30S ribosomal protein S2  60.08 
 
 		 254 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0742  ribosomal protein S2  60.08 
 
 		 281 aa  312  2.9999999999999996e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000127244  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2680  30S ribosomal protein S2  64.32 
 
 		 246 aa  312  2.9999999999999996e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000034456  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1520  ribosomal protein S2  61.67 
 
 		 289 aa  312  3.9999999999999997e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0957  ribosomal protein S2  64.16 
 
 		 280 aa  311  5.999999999999999e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1199  30S ribosomal protein S2  58.82 
 
 		 258 aa  310  2e-83  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0195465  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0578  ribosomal protein S2  63.44 
 
 		 243 aa  309  2e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1133  30S ribosomal protein S2  59.65 
 
 		 260 aa  305  5.0000000000000004e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0105  30S ribosomal protein S2  58.17 
 
 		 255 aa  304  8.000000000000001e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000131996  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3581  30S ribosomal protein S2  57.65 
 
 		 289 aa  303  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1161  30S ribosomal protein S2  57.31 
 
 		 300 aa  303  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1238  30S ribosomal protein S2  59.58 
 
 		 259 aa  302  4.0000000000000003e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000341164  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4961  30S ribosomal protein S2  62.11 
 
 		 255 aa  301  6.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1668  ribosomal protein S2  60.09 
 
 		 282 aa  301  8.000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.688416  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0975  SSU ribosomal protein S2P  57.66 
 
 		 260 aa  301  8.000000000000001e-81  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0676  30S ribosomal protein S2  57.32 
 
 		 292 aa  300  1e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.560219  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3991  ribosomal protein S2  55.6 
 
 		 316 aa  301  1e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1203  30S ribosomal protein S2  58.58 
 
 		 246 aa  300  1e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159372  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12904  30S ribosomal protein S2  60.09 
 
 		 287 aa  300  1e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0383521  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0237  ribosomal protein S2  56.73 
 
 		 314 aa  299  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.245227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2104  ribosomal protein S2  56.92 
 
 		 272 aa  299  2e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3410  ribosomal protein S2  57.87 
 
 		 283 aa  300  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.7242  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1840  SSU ribosomal protein S2P  61.95 
 
 		 262 aa  300  2e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1848  ribosomal protein S2  59.05 
 
 		 288 aa  299  3e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0363359  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1004  ribosomal protein S2  57.66 
 
 		 283 aa  298  4e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.663705  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0994  30S ribosomal protein S2  55.78 
 
 		 303 aa  298  4e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271344  normal  0.423917 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1276  30S ribosomal protein S2  57.51 
 
 		 271 aa  298  4e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000462027  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2347  30S ribosomal protein S2  55.04 
 
 		 291 aa  298  5e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000118359  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4133  30S ribosomal protein S2  55.34 
 
 		 279 aa  298  6e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.549369  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1832  30S ribosomal protein S2  57.77 
 
 		 256 aa  297  9e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000152831  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0551  30S ribosomal protein S2  56 
 
 		 262 aa  297  9e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000123187  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1974  30S ribosomal protein S2  58.33 
 
 		 284 aa  296  2e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.34334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5313  ribosomal protein S2  61.43 
 
 		 291 aa  296  2e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1993  30S ribosomal protein S2  58.33 
 
 		 284 aa  296  2e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2039  30S ribosomal protein S2  58.33 
 
 		 284 aa  296  2e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.07144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1262  30S ribosomal protein S2  53.94 
 
 		 289 aa  295  5e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000765471  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1180  ribosomal protein S2  55.79 
 
 		 317 aa  295  5e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.920095  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2733  ribosomal protein S2  58.66 
 
 		 271 aa  295  6e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36757e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1442  30S ribosomal protein S2  55.12 
 
 		 258 aa  294  1e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.333535  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0577  30S ribosomal protein S2  57.37 
 
 		 294 aa  293  2e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000845501  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0926  30S ribosomal protein S2  58.15 
 
 		 257 aa  293  2e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148572  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23610  SSU ribosomal protein S2P  55.51 
 
 		 317 aa  293  2e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.699441  normal  0.141313 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1466  30S ribosomal protein S2  59.07 
 
 		 247 aa  293  2e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.162448  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1484  ribosomal protein S2  55.42 
 
 		 326 aa  293  2e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.068355  normal  0.329281 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3243  SSU ribosomal protein S2P  55.74 
 
 		 307 aa  293  2e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.191936  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2209  30S ribosomal protein S2  57.96 
 
 		 273 aa  293  2e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.092398  normal  0.16392 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1266  30S ribosomal protein S2  58.26 
 
 		 267 aa  292  3e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.357343 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0164  30S ribosomal protein S2  57.27 
 
 		 262 aa  292  4e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000119331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>