More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0371 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0371  30S ribosomal protein S2  100 
 
 		 291 aa  590  1e-167  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl561  30S ribosomal protein S2  73.03 
 
 		 283 aa  371  1e-102  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  49.78 
 
 		 257 aa  238  8e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0882  ribosomal protein S2  49.33 
 
 		 236 aa  238  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1921  30S ribosomal protein S2  49.56 
 
 		 267 aa  236  3e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.7747799999999994e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  50.67 
 
 		 255 aa  236  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  52.47 
 
 		 235 aa  236  4e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  50.67 
 
 		 255 aa  236  4e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  52.02 
 
 		 235 aa  235  6e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  50.67 
 
 		 233 aa  234  1.0000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002746  SSU ribosomal protein S2p (SAe)  51.58 
 
 		 242 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0133087  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  49.78 
 
 		 256 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000926335  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3213  ribosomal protein S2  49.77 
 
 		 248 aa  231  8.000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321925  unclonable  0.000000000222969 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1851  30S ribosomal protein S2  50.68 
 
 		 242 aa  230  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165959  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  49.78 
 
 		 235 aa  230  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  48.43 
 
 		 232 aa  229  3e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1250  30S ribosomal protein S2  48.44 
 
 		 251 aa  228  6e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000302151  hitchhiker  0.0000384341 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  49.11 
 
 		 301 aa  229  6e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000123477  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1238  30S ribosomal protein S2  51.13 
 
 		 259 aa  229  6e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000341164  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2427  30S ribosomal protein S2  48.95 
 
 		 243 aa  228  7e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0204898  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03237  30S ribosomal protein S2  50.23 
 
 		 253 aa  228  7e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0442  30S ribosomal protein S2  50.22 
 
 		 252 aa  228  8e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000051714  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1006  30S ribosomal protein S2  50.22 
 
 		 252 aa  228  8e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000128012  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1921  30S ribosomal protein S2  48.07 
 
 		 251 aa  228  9e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264289  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  48.88 
 
 		 244 aa  228  9e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185332  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  47.81 
 
 		 238 aa  228  9e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1978  30S ribosomal protein S2  49.33 
 
 		 232 aa  228  9e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000338661  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1249  ribosomal protein S2  48.42 
 
 		 243 aa  226  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  48.88 
 
 		 233 aa  226  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000560898  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0166  30S ribosomal protein S2  51.13 
 
 		 260 aa  226  3e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000940316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3678  30S ribosomal protein S2  48.88 
 
 		 233 aa  226  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  48.88 
 
 		 233 aa  226  3e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  48.88 
 
 		 233 aa  226  3e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3965  30S ribosomal protein S2  48.88 
 
 		 233 aa  226  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3839  30S ribosomal protein S2  48.88 
 
 		 233 aa  226  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.22661e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  48.88 
 
 		 233 aa  226  3e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000491144  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0164  30S ribosomal protein S2  51.13 
 
 		 262 aa  226  3e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1161  30S ribosomal protein S2  47.16 
 
 		 300 aa  226  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2479  30S ribosomal protein S2  48.88 
 
 		 233 aa  226  4e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000168536  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2981  30S ribosomal protein S2  50.23 
 
 		 241 aa  226  4e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.44963  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3991  ribosomal protein S2  48.42 
 
 		 316 aa  225  5.0000000000000005e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  48.44 
 
 		 257 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3581  30S ribosomal protein S2  46.72 
 
 		 289 aa  225  6e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1318  30S ribosomal protein S2  48.43 
 
 		 233 aa  225  6e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000762012  hitchhiker  4.07369e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3925  30S ribosomal protein S2  48.43 
 
 		 233 aa  225  6e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000230027  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  47.98 
 
 		 262 aa  224  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000193238  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00167  30S ribosomal protein S2  49.32 
 
 		 241 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00889913  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3434  ribosomal protein S2  49.32 
 
 		 241 aa  224  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.129061  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3650  30S ribosomal protein S2  47.98 
 
 		 233 aa  224  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00166  hypothetical protein  49.32 
 
 		 241 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00754113  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3165  30S ribosomal protein S2  49.77 
 
 		 241 aa  223  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1974  30S ribosomal protein S2  47.11 
 
 		 284 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.34334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0179  30S ribosomal protein S2  49.32 
 
 		 241 aa  224  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0347621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0171  30S ribosomal protein S2  49.32 
 
 		 241 aa  223  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.349633  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0173  30S ribosomal protein S2  49.32 
 
 		 241 aa  223  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0245787  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1993  30S ribosomal protein S2  47.11 
 
 		 284 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3491  30S ribosomal protein S2  49.32 
 
 		 241 aa  224  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.177739  normal  0.659943 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0180  30S ribosomal protein S2  49.32 
 
 		 241 aa  224  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0157211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0295  30S ribosomal protein S2  49.77 
 
 		 315 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0657172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0162  30S ribosomal protein S2  49.32 
 
 		 241 aa  223  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00314588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2039  30S ribosomal protein S2  47.11 
 
 		 284 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.07144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2209  30S ribosomal protein S2  47.53 
 
 		 273 aa  223  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.092398  normal  0.16392 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0525  30S ribosomal protein S2  46.22 
 
 		 238 aa  223  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000167283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0578  ribosomal protein S2  50.23 
 
 		 243 aa  223  4e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4133  30S ribosomal protein S2  46.22 
 
 		 279 aa  222  4e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.549369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0941  30S ribosomal protein S2  48.87 
 
 		 241 aa  223  4e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0031234  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1668  ribosomal protein S2  47.11 
 
 		 282 aa  222  4e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.688416  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3360  30S ribosomal protein S2  48.87 
 
 		 241 aa  223  4e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.720807  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1778  ribosomal protein S2  47.06 
 
 		 274 aa  222  4.9999999999999996e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  47.83 
 
 		 255 aa  222  6e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000466794  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  47.83 
 
 		 255 aa  222  6e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000315088  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1444  ribosomal protein S2  46.26 
 
 		 250 aa  222  6e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.152019  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1160  ribosomal protein S2  46.26 
 
 		 250 aa  222  6e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  47.39 
 
 		 262 aa  222  7e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5313  ribosomal protein S2  45.81 
 
 		 291 aa  222  7e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2507  ribosomal protein S2  42.01 
 
 		 353 aa  222  7e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.282743  normal  0.375385 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  45.74 
 
 		 262 aa  221  8e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000550841  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0707  30S ribosomal protein S2  49.32 
 
 		 241 aa  221  8e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0255267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0527  ribosomal protein S2  48.43 
 
 		 232 aa  221  9.999999999999999e-57  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.53334  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0295  30S ribosomal protein S2  48.87 
 
 		 343 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0422466  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3790  30S ribosomal protein S2  48.87 
 
 		 241 aa  221  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1013  30S ribosomal protein S2  49.32 
 
 		 241 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000151526  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0238  30S ribosomal protein S2  48.87 
 
 		 241 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.593758 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0238  30S ribosomal protein S2  48.87 
 
 		 241 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0254  30S ribosomal protein S2  48.87 
 
 		 241 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.965891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0241  30S ribosomal protein S2  48.87 
 
 		 241 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3435  30S ribosomal protein S2  49.32 
 
 		 241 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0042148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0284  30S ribosomal protein S2  48.87 
 
 		 314 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0256  30S ribosomal protein S2  48.87 
 
 		 241 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.424632  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1066  30S ribosomal protein S2  49.32 
 
 		 241 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00351639  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2104  ribosomal protein S2  47.11 
 
 		 272 aa  220  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0080  ribosomal protein S2  49.55 
 
 		 263 aa  219  3e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000155744  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12904  30S ribosomal protein S2  47.56 
 
 		 287 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0383521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2976  ribosomal protein S2  48.82 
 
 		 244 aa  219  3.9999999999999997e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.801384  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1553  ribosomal protein S2  45.25 
 
 		 242 aa  219  5e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2436  30S ribosomal protein S2  44.44 
 
 		 334 aa  218  7e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3726  30S ribosomal protein S2  45.65 
 
 		 261 aa  218  7.999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0742  ribosomal protein S2  45.74 
 
 		 281 aa  218  8.999999999999998e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000127244  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1285  ribosomal protein S2  47.75 
 
 		 248 aa  218  8.999999999999998e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297191  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17060  30S ribosomal protein S2  48.21 
 
 		 246 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>