More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0648 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0648  ribosomal protein S2  100 
 
 
324 aa  651    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.154128  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  56.12 
 
 
238 aa  295  9e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  57.33 
 
 
235 aa  292  5e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  57.78 
 
 
235 aa  292  5e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  58.67 
 
 
262 aa  290  3e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3709  30S ribosomal protein S2  58.22 
 
 
244 aa  288  6e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000237071  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  57.14 
 
 
233 aa  287  1e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1816  30S ribosomal protein S2  52.22 
 
 
257 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541904  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  57.59 
 
 
235 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  56 
 
 
255 aa  286  4e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000466794  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  56 
 
 
255 aa  286  4e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000315088  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0882  ribosomal protein S2  58.67 
 
 
236 aa  285  8e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  55.11 
 
 
262 aa  284  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1006  30S ribosomal protein S2  54.88 
 
 
252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000128012  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0442  30S ribosomal protein S2  53.72 
 
 
252 aa  281  9e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000051714  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  51.48 
 
 
257 aa  281  9e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1978  30S ribosomal protein S2  56 
 
 
232 aa  281  9e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000338661  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  56 
 
 
232 aa  279  5e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0926  30S ribosomal protein S2  54.67 
 
 
257 aa  278  9e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148572  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  52.49 
 
 
257 aa  278  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3213  ribosomal protein S2  56.11 
 
 
248 aa  277  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321925  unclonable  0.000000000222969 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  56.25 
 
 
256 aa  276  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000926335  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1921  30S ribosomal protein S2  58.04 
 
 
251 aa  276  3e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264289  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1921  30S ribosomal protein S2  55.47 
 
 
267 aa  276  3e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.7747799999999994e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2479  30S ribosomal protein S2  55.11 
 
 
233 aa  276  3e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000168536  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  56.33 
 
 
301 aa  276  3e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000123477  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  54.67 
 
 
233 aa  276  4e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000560898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3678  30S ribosomal protein S2  54.67 
 
 
233 aa  276  4e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  54.67 
 
 
233 aa  276  4e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  54.67 
 
 
233 aa  276  4e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193043  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3925  30S ribosomal protein S2  54.67 
 
 
233 aa  276  4e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000230027  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  54.67 
 
 
233 aa  276  4e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000491144  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3965  30S ribosomal protein S2  54.67 
 
 
233 aa  276  4e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1318  30S ribosomal protein S2  54.67 
 
 
233 aa  276  4e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000762012  hitchhiker  4.07369e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3839  30S ribosomal protein S2  54.67 
 
 
233 aa  276  4e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.22661e-62 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1203  30S ribosomal protein S2  51.84 
 
 
246 aa  276  5e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159372  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3650  30S ribosomal protein S2  54.71 
 
 
233 aa  275  9e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1133  30S ribosomal protein S2  54.91 
 
 
260 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  53.16 
 
 
244 aa  273  3e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185332  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0166  30S ribosomal protein S2  54.22 
 
 
260 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000940316  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0957  ribosomal protein S2  54.02 
 
 
280 aa  272  4.0000000000000004e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0164  30S ribosomal protein S2  54.22 
 
 
262 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0742  ribosomal protein S2  53.85 
 
 
281 aa  272  5.000000000000001e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000127244  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  55.56 
 
 
271 aa  272  5.000000000000001e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000778728  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  54.46 
 
 
255 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0975  SSU ribosomal protein S2P  53.33 
 
 
260 aa  272  6e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1199  30S ribosomal protein S2  55.11 
 
 
258 aa  272  6e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0195465  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2376  ribosomal protein S2  52.19 
 
 
261 aa  272  7e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1250  30S ribosomal protein S2  56.7 
 
 
251 aa  271  8.000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000302151  hitchhiker  0.0000384341 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  54.46 
 
 
255 aa  271  8.000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2455  30S ribosomal protein S2  56.89 
 
 
255 aa  271  1e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  51.87 
 
 
262 aa  270  2e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000550841  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1238  30S ribosomal protein S2  54.22 
 
 
259 aa  269  5e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000341164  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2347  30S ribosomal protein S2  52.86 
 
 
291 aa  268  7e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000118359  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1832  30S ribosomal protein S2  52.16 
 
 
256 aa  268  8e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000152831  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1941  ribosomal protein S2  51.48 
 
 
262 aa  267  2e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0105  30S ribosomal protein S2  54.13 
 
 
255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000131996  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1954  30S ribosomal protein S2  55.75 
 
 
233 aa  265  5.999999999999999e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000941341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1672  30S ribosomal protein S2  55.75 
 
 
233 aa  265  5.999999999999999e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000487185  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4236  30S ribosomal protein S2  53.33 
 
 
260 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000647656 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0551  30S ribosomal protein S2  49.4 
 
 
262 aa  264  2e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000123187  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2108  30S ribosomal protein S2  54.46 
 
 
254 aa  263  3e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0359  30S ribosomal protein S2  50 
 
 
245 aa  263  3e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000354346  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1444  ribosomal protein S2  50.88 
 
 
250 aa  263  4e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.152019  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0295  30S ribosomal protein S2  54.95 
 
 
343 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0422466  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1160  ribosomal protein S2  50.88 
 
 
250 aa  263  4e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0577  30S ribosomal protein S2  53.6 
 
 
294 aa  262  4.999999999999999e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000845501  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0295  30S ribosomal protein S2  55.41 
 
 
315 aa  262  6e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0657172  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0284  30S ribosomal protein S2  54.95 
 
 
314 aa  262  6e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0213  ribosomal protein S2  52.46 
 
 
257 aa  262  6e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0377  30S ribosomal protein S2  50.44 
 
 
245 aa  262  6.999999999999999e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000247942  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0474  30S ribosomal protein S2  52.87 
 
 
304 aa  262  6.999999999999999e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536253  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1161  30S ribosomal protein S2  53.78 
 
 
272 aa  262  6.999999999999999e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000246943 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_321  ribosomal protein S2  50.44 
 
 
245 aa  261  8e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000206427  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4883  30S ribosomal protein S2  51.93 
 
 
264 aa  260  2e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2924  30S ribosomal protein S2  53.57 
 
 
271 aa  259  3e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.240537 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0273  30S ribosomal protein S2  55.45 
 
 
301 aa  260  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3581  30S ribosomal protein S2  48.45 
 
 
289 aa  259  3e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2061  30S ribosomal protein S2  52 
 
 
265 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.4963 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2680  30S ribosomal protein S2  51.12 
 
 
246 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000034456  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1276  30S ribosomal protein S2  50.88 
 
 
271 aa  259  6e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000462027  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2306  30S ribosomal protein S2  51.35 
 
 
276 aa  258  7e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1161  30S ribosomal protein S2  50.39 
 
 
300 aa  258  8e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1520  ribosomal protein S2  52.61 
 
 
289 aa  258  1e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2530  30S ribosomal protein S2  53.07 
 
 
251 aa  258  1e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.963698  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1262  30S ribosomal protein S2  51.77 
 
 
289 aa  257  2e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000765471  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1094  30S ribosomal protein S2  50.42 
 
 
261 aa  257  2e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.240704  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1442  30S ribosomal protein S2  48.83 
 
 
258 aa  256  3e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.333535  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2733  ribosomal protein S2  52.26 
 
 
271 aa  256  4e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36757e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0547  30S ribosomal protein S2  48.06 
 
 
263 aa  256  5e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1840  SSU ribosomal protein S2P  46.12 
 
 
262 aa  255  6e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1848  ribosomal protein S2  51.11 
 
 
288 aa  255  8e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0363359  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0840  30S ribosomal protein S2  47.55 
 
 
267 aa  255  8e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00899072  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0406  ribosomal protein S2  52.94 
 
 
263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1316  30S ribosomal protein S2  52.7 
 
 
263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.715024  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1153  30S ribosomal protein S2  52.44 
 
 
269 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1197  30S ribosomal protein S2  52.7 
 
 
263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3113  ribosomal protein S2  49.6 
 
 
296 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000518709  normal  0.0242876 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4961  30S ribosomal protein S2  51.8 
 
 
255 aa  254  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1380  30S ribosomal protein S2  49.57 
 
 
288 aa  253  3e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272546  normal  0.0375782 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>