More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1199 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1199  30S ribosomal protein S2  100 
 
 		 258 aa  526  1e-148  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0195465  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0975  SSU ribosomal protein S2P  71.26 
 
 		 260 aa  381  1e-105  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2455  30S ribosomal protein S2  74.89 
 
 		 255 aa  379  1e-104  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  67.43 
 
 		 262 aa  376  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000550841  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0105  30S ribosomal protein S2  72.48 
 
 		 255 aa  375  1e-103  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000131996  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1832  30S ribosomal protein S2  71.71 
 
 		 256 aa  372  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000152831  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  66.67 
 
 		 271 aa  369  1e-101  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000778728  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  68.07 
 
 		 238 aa  350  1e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  70.48 
 
 		 233 aa  350  2e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2479  30S ribosomal protein S2  69.13 
 
 		 233 aa  348  7e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000168536  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3925  30S ribosomal protein S2  68.7 
 
 		 233 aa  344  8e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000230027  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1318  30S ribosomal protein S2  68.7 
 
 		 233 aa  344  8e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000762012  hitchhiker  4.07369e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  68.26 
 
 		 233 aa  343  1e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000560898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3678  30S ribosomal protein S2  68.26 
 
 		 233 aa  343  1e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  68.26 
 
 		 233 aa  343  1e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  68.26 
 
 		 233 aa  343  1e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3839  30S ribosomal protein S2  68.26 
 
 		 233 aa  343  1e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.22661e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  68.26 
 
 		 233 aa  343  1e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000491144  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3965  30S ribosomal protein S2  68.26 
 
 		 233 aa  343  1e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1816  30S ribosomal protein S2  64.84 
 
 		 257 aa  343  1e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541904  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3650  30S ribosomal protein S2  68.26 
 
 		 233 aa  343  2e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  66.23 
 
 		 235 aa  342  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  66.09 
 
 		 235 aa  342  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3709  30S ribosomal protein S2  67.25 
 
 		 244 aa  338  5e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000237071  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  66.67 
 
 		 235 aa  338  5e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1006  30S ribosomal protein S2  67.49 
 
 		 252 aa  337  9e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000128012  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  63.45 
 
 		 262 aa  335  5e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  66.96 
 
 		 255 aa  333  1e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000315088  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  66.96 
 
 		 255 aa  333  1e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000466794  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  66.08 
 
 		 262 aa  330  2e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1978  30S ribosomal protein S2  64.5 
 
 		 232 aa  323  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000338661  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  62.14 
 
 		 244 aa  323  2e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185332  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0442  30S ribosomal protein S2  67.97 
 
 		 252 aa  322  5e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000051714  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  60.89 
 
 		 257 aa  318  7e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1520  ribosomal protein S2  60.47 
 
 		 289 aa  315  5e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0957  ribosomal protein S2  63.45 
 
 		 280 aa  315  5e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  63 
 
 		 232 aa  314  9.999999999999999e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3213  ribosomal protein S2  64.29 
 
 		 248 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321925  unclonable  0.000000000222969 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2680  30S ribosomal protein S2  61.13 
 
 		 246 aa  313  9.999999999999999e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000034456  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0882  ribosomal protein S2  62.72 
 
 		 236 aa  313  1.9999999999999998e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1954  30S ribosomal protein S2  64.66 
 
 		 233 aa  312  3.9999999999999997e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000941341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1672  30S ribosomal protein S2  64.66 
 
 		 233 aa  312  3.9999999999999997e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000487185  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0742  ribosomal protein S2  60.87 
 
 		 281 aa  310  1e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000127244  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1238  30S ribosomal protein S2  60.85 
 
 		 259 aa  310  1e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000341164  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1778  ribosomal protein S2  64.6 
 
 		 274 aa  310  1e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  58.82 
 
 		 257 aa  310  2e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1848  ribosomal protein S2  60.53 
 
 		 288 aa  309  4e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0363359  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1921  30S ribosomal protein S2  63.48 
 
 		 251 aa  306  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264289  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  63.91 
 
 		 255 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1161  30S ribosomal protein S2  60.09 
 
 		 272 aa  306  2.0000000000000002e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000246943 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  63.91 
 
 		 255 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1250  30S ribosomal protein S2  61.74 
 
 		 251 aa  305  4.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000302151  hitchhiker  0.0000384341 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  62.88 
 
 		 256 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000926335  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1921  30S ribosomal protein S2  62.77 
 
 		 267 aa  305  6e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.7747799999999994e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  61.9 
 
 		 301 aa  305  6e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000123477  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4236  30S ribosomal protein S2  56.84 
 
 		 260 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000647656 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0295  30S ribosomal protein S2  63.68 
 
 		 315 aa  302  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0657172  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4883  30S ribosomal protein S2  57.26 
 
 		 264 aa  301  8.000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2061  30S ribosomal protein S2  57.89 
 
 		 265 aa  301  8.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.4963 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1153  30S ribosomal protein S2  56.15 
 
 		 269 aa  300  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0295  30S ribosomal protein S2  61.57 
 
 		 343 aa  299  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0422466  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0284  30S ribosomal protein S2  61.84 
 
 		 314 aa  299  3e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0926  30S ribosomal protein S2  59.47 
 
 		 257 aa  298  8e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148572  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2530  30S ribosomal protein S2  56.49 
 
 		 251 aa  297  1e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.963698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0080  ribosomal protein S2  57.69 
 
 		 263 aa  296  2e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000155744  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0273  30S ribosomal protein S2  61.95 
 
 		 301 aa  296  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0578  ribosomal protein S2  61.67 
 
 		 243 aa  296  2e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0164  30S ribosomal protein S2  58.15 
 
 		 262 aa  296  3e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0166  30S ribosomal protein S2  58.15 
 
 		 260 aa  295  4e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000940316  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1941  ribosomal protein S2  53.78 
 
 		 262 aa  294  8e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3528  30S ribosomal protein S2  54.27 
 
 		 268 aa  292  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.421739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2578  30S ribosomal protein S2  54.27 
 
 		 268 aa  292  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2347  30S ribosomal protein S2  58.93 
 
 		 291 aa  292  4e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000118359  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08131  30S ribosomal protein S2  55.22 
 
 		 234 aa  292  4e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1203  30S ribosomal protein S2  59.11 
 
 		 246 aa  292  4e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159372  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08141  30S ribosomal protein S2  55.22 
 
 		 234 aa  292  4e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1668  ribosomal protein S2  56.07 
 
 		 282 aa  290  1e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.688416  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08311  30S ribosomal protein S2  55.02 
 
 		 234 aa  289  3e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.419677  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0761  30S ribosomal protein S2  54.78 
 
 		 233 aa  288  7e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4133  30S ribosomal protein S2  54.7 
 
 		 279 aa  287  9e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.549369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0474  30S ribosomal protein S2  59.73 
 
 		 304 aa  287  1e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536253  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2104  ribosomal protein S2  56.07 
 
 		 272 aa  287  1e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1974  30S ribosomal protein S2  55.7 
 
 		 284 aa  286  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.34334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2039  30S ribosomal protein S2  55.7 
 
 		 284 aa  286  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.07144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1993  30S ribosomal protein S2  55.7 
 
 		 284 aa  286  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2209  30S ribosomal protein S2  55.75 
 
 		 273 aa  285  4e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.092398  normal  0.16392 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1840  SSU ribosomal protein S2P  57.08 
 
 		 262 aa  285  5.999999999999999e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0577  30S ribosomal protein S2  55.3 
 
 		 294 aa  285  7e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000845501  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3113  ribosomal protein S2  58.04 
 
 		 296 aa  284  9e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000518709  normal  0.0242876 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3991  ribosomal protein S2  56.17 
 
 		 316 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1230  30S ribosomal protein S2  54.62 
 
 		 279 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133873  normal  0.0467572 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1553  ribosomal protein S2  52.89 
 
 		 242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2733  ribosomal protein S2  55.65 
 
 		 271 aa  283  2.0000000000000002e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36757e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3281  30S ribosomal protein S2  53.91 
 
 		 242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000428583  hitchhiker  0.0000650106 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10101  30S ribosomal protein S2  54.59 
 
 		 238 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0824098 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2885  30S ribosomal protein S2  53.91 
 
 		 242 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000206646  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1554  30S ribosomal protein S2  54.77 
 
 		 242 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541684  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1445  30S ribosomal protein S2  54.32 
 
 		 242 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000563194  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0157  30S ribosomal protein S2  54.19 
 
 		 230 aa  282  4.0000000000000003e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1450  30S ribosomal protein S2  54.32 
 
 		 242 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000541736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>