More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2578 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2578  30S ribosomal protein S2  100 
 
 		 268 aa  552  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3528  30S ribosomal protein S2  100 
 
 		 268 aa  552  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.421739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1153  30S ribosomal protein S2  77.99 
 
 		 269 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4883  30S ribosomal protein S2  78.04 
 
 		 264 aa  426  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2061  30S ribosomal protein S2  75.09 
 
 		 265 aa  416  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.4963 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4236  30S ribosomal protein S2  76.92 
 
 		 260 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000647656 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2530  30S ribosomal protein S2  75.73 
 
 		 251 aa  400  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.963698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1161  30S ribosomal protein S2  79.22 
 
 		 272 aa  397  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000246943 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16641  30S ribosomal protein S2  70.93 
 
 		 239 aa  364  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.503664 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1222  30S ribosomal protein S2  70.87 
 
 		 238 aa  365  1e-100  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.29801 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08311  30S ribosomal protein S2  69.96 
 
 		 234 aa  363  2e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.419677  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1247  30S ribosomal protein S2  68.75 
 
 		 239 aa  362  4e-99  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0978856  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08141  30S ribosomal protein S2  70.93 
 
 		 234 aa  362  4e-99  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08131  30S ribosomal protein S2  70.93 
 
 		 234 aa  362  4e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0157  30S ribosomal protein S2  70.93 
 
 		 230 aa  361  8e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0761  30S ribosomal protein S2  71.11 
 
 		 233 aa  359  3e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10101  30S ribosomal protein S2  69.16 
 
 		 238 aa  356  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0824098 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07891  30S ribosomal protein S2  70.78 
 
 		 222 aa  349  3e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.992425 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1816  30S ribosomal protein S2  54.86 
 
 		 257 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541904  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  53.49 
 
 		 271 aa  302  4.0000000000000003e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000778728  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  59.24 
 
 		 262 aa  300  2e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0164  30S ribosomal protein S2  59.91 
 
 		 262 aa  295  4e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0166  30S ribosomal protein S2  59.91 
 
 		 260 aa  295  5e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000940316  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  57.46 
 
 		 235 aa  294  8e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1978  30S ribosomal protein S2  56.9 
 
 		 232 aa  293  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000338661  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2455  30S ribosomal protein S2  56.17 
 
 		 255 aa  293  2e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3709  30S ribosomal protein S2  57.71 
 
 		 244 aa  292  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000237071  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1199  30S ribosomal protein S2  54.27 
 
 		 258 aa  292  4e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0195465  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0742  ribosomal protein S2  55.65 
 
 		 281 aa  290  2e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000127244  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1238  30S ribosomal protein S2  58.15 
 
 		 259 aa  290  2e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000341164  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0975  SSU ribosomal protein S2P  50.58 
 
 		 260 aa  289  3e-77  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  55.98 
 
 		 238 aa  288  4e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  54.55 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185332  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  53.41 
 
 		 257 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1778  ribosomal protein S2  56.54 
 
 		 274 aa  286  2.9999999999999996e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  52.73 
 
 		 262 aa  285  4e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  56.39 
 
 		 233 aa  285  5.999999999999999e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0105  30S ribosomal protein S2  54.85 
 
 		 255 aa  285  5.999999999999999e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000131996  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  53.23 
 
 		 262 aa  284  1.0000000000000001e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000550841  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1006  30S ribosomal protein S2  55.28 
 
 		 252 aa  284  1.0000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000128012  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1848  ribosomal protein S2  54.55 
 
 		 288 aa  284  1.0000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0363359  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  55.26 
 
 		 235 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  54.82 
 
 		 235 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0442  30S ribosomal protein S2  53.39 
 
 		 252 aa  281  7.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000051714  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1832  30S ribosomal protein S2  55.32 
 
 		 256 aa  280  1e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000152831  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  52.46 
 
 		 255 aa  280  2e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000315088  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  52.46 
 
 		 255 aa  280  2e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000466794  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  54.63 
 
 		 232 aa  280  2e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0926  30S ribosomal protein S2  57.27 
 
 		 257 aa  279  4e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148572  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3213  ribosomal protein S2  54.39 
 
 		 248 aa  279  4e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321925  unclonable  0.000000000222969 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1520  ribosomal protein S2  56.5 
 
 		 289 aa  278  9e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0882  ribosomal protein S2  57.02 
 
 		 236 aa  277  1e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1203  30S ribosomal protein S2  53.88 
 
 		 246 aa  277  1e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159372  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1941  ribosomal protein S2  52.11 
 
 		 262 aa  277  2e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0080  ribosomal protein S2  55.46 
 
 		 263 aa  276  3e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000155744  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0213  ribosomal protein S2  55.9 
 
 		 257 aa  275  5e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1921  30S ribosomal protein S2  54.82 
 
 		 251 aa  275  6e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264289  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1250  30S ribosomal protein S2  54.27 
 
 		 251 aa  275  6e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000302151  hitchhiker  0.0000384341 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0578  ribosomal protein S2  59.47 
 
 		 243 aa  275  7e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  54.39 
 
 		 233 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000560898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3678  30S ribosomal protein S2  54.39 
 
 		 233 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  54.39 
 
 		 233 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  54.39 
 
 		 233 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193043  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3925  30S ribosomal protein S2  54.82 
 
 		 233 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000230027  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2479  30S ribosomal protein S2  54.39 
 
 		 233 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000168536  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3965  30S ribosomal protein S2  54.39 
 
 		 233 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3650  30S ribosomal protein S2  55.26 
 
 		 233 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  54.39 
 
 		 233 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000491144  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1318  30S ribosomal protein S2  54.82 
 
 		 233 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000762012  hitchhiker  4.07369e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3839  30S ribosomal protein S2  54.39 
 
 		 233 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.22661e-62 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1668  ribosomal protein S2  54.91 
 
 		 282 aa  273  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.688416  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  52.74 
 
 		 257 aa  273  3e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4133  30S ribosomal protein S2  52.99 
 
 		 279 aa  273  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.549369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2104  ribosomal protein S2  55.41 
 
 		 272 aa  272  4.0000000000000004e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2209  30S ribosomal protein S2  54.91 
 
 		 273 aa  271  6e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.092398  normal  0.16392 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2347  30S ribosomal protein S2  51.56 
 
 		 291 aa  270  1e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000118359  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3991  ribosomal protein S2  56.25 
 
 		 316 aa  271  1e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1974  30S ribosomal protein S2  54.91 
 
 		 284 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.34334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12904  30S ribosomal protein S2  54.91 
 
 		 287 aa  270  2e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0383521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1993  30S ribosomal protein S2  54.91 
 
 		 284 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2039  30S ribosomal protein S2  54.91 
 
 		 284 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.07144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0957  ribosomal protein S2  54.85 
 
 		 280 aa  269  2.9999999999999997e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  54.46 
 
 		 255 aa  268  7e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  53.57 
 
 		 256 aa  268  8e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000926335  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  54.46 
 
 		 255 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2376  ribosomal protein S2  52.81 
 
 		 261 aa  267  1e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0577  30S ribosomal protein S2  53.6 
 
 		 294 aa  267  2e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000845501  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5911  ribosomal protein S2  55.8 
 
 		 304 aa  266  2.9999999999999995e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00672322  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1954  30S ribosomal protein S2  54.15 
 
 		 233 aa  265  4e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000941341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1672  30S ribosomal protein S2  54.15 
 
 		 233 aa  265  4e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000487185  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3113  ribosomal protein S2  53.57 
 
 		 296 aa  265  5.999999999999999e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000518709  normal  0.0242876 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2507  ribosomal protein S2  53.68 
 
 		 353 aa  265  7e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.282743  normal  0.375385 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1484  ribosomal protein S2  52.67 
 
 		 326 aa  264  1e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.068355  normal  0.329281 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1161  30S ribosomal protein S2  50.61 
 
 		 300 aa  263  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11190  SSU ribosomal protein S2P  55.11 
 
 		 310 aa  263  2e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.025157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2108  30S ribosomal protein S2  52.44 
 
 		 254 aa  263  2e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0994  30S ribosomal protein S2  55.36 
 
 		 303 aa  262  4e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271344  normal  0.423917 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1133  30S ribosomal protein S2  54.46 
 
 		 260 aa  262  4e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1322  30S ribosomal protein S2  54.22 
 
 		 295 aa  262  4e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0474  30S ribosomal protein S2  49.39 
 
 		 304 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>