157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_76999 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_76999  ribosomal protein S0A  100 
 
 		 261 aa  534  1e-151  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.937942  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03172  40S ribosomal protein S0 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B8F8]  71.62 
 
 		 293 aa  345  5e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.51633 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13682  predicted protein  59.91 
 
 		 220 aa  279  3e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI04340  40S ribosomal protein S0, putative  61.06 
 
 		 292 aa  278  8e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.220661  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12355  Ribosomal protein Sa, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  56.92 
 
 		 290 aa  237  1e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.30496  normal  0.113443 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0274  30S ribosomal protein S2  46.29 
 
 		 214 aa  167  2e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1047  ribosomal protein S2  39.78 
 
 		 226 aa  157  2e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.269348  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0061  30S ribosomal protein S2  41.81 
 
 		 208 aa  155  6e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.924609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0027  30S ribosomal protein S2  41.81 
 
 		 208 aa  152  4e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1302  ribosomal protein S2  42.31 
 
 		 199 aa  152  5.9999999999999996e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.29354  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0058  30S ribosomal protein S2  40.11 
 
 		 206 aa  150  2e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0190126 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1104  30S ribosomal protein S2  40.11 
 
 		 207 aa  149  4e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2378  30S ribosomal protein S2  37.85 
 
 		 202 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00361654  normal  0.260163 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2140  30S ribosomal protein S2  39.66 
 
 		 225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000050996  hitchhiker  0.0000667505 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_2002  30S ribosomal protein S2  42.44 
 
 		 215 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2215  30S ribosomal protein S2  39.55 
 
 		 203 aa  145  6e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1810  30S ribosomal protein S2  40 
 
 		 205 aa  144  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0759  30S ribosomal protein S2  38.01 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.817066  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1423  30S ribosomal protein S2  41.32 
 
 		 247 aa  143  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.017125 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1524  30S ribosomal protein S2  37.43 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.524219  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0478  30S ribosomal protein S2  42.01 
 
 		 206 aa  142  4e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2393  30S ribosomal protein S2  41.18 
 
 		 214 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000018478  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1237  30S ribosomal protein S2  40.11 
 
 		 202 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.161578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1693  30S ribosomal protein S2  36.26 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0219  30S ribosomal protein S2  36.26 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.664063  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0907  30S ribosomal protein S2  36.26 
 
 		 220 aa  140  3e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0430  ribosomal protein S2  38.54 
 
 		 263 aa  136  4e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.748529  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2544  ribosomal protein S2  39.04 
 
 		 269 aa  135  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2599  30S ribosomal protein S2  39.25 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.11317 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2514  30S ribosomal protein S2  39.53 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1826  30S ribosomal protein S2  40.24 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2892  30S ribosomal protein S2  41.42 
 
 		 202 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00129354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0316  30S ribosomal protein S2  31.64 
 
 		 207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1398  SSU ribosomal protein S2P  26.94 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000184086  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3194  ribosomal protein S2  23.04 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.758099  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1520  ribosomal protein S2  25.09 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32903  predicted protein  22.96 
 
 		 421 aa  58.9  0.00000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.174506 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0026  30S ribosomal protein S2  39.44 
 
 		 351 aa  58.2  0.0000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1238  30S ribosomal protein S2  23.5 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000341164  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  23.7 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000778728  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2108  30S ribosomal protein S2  23.04 
 
 		 254 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0525  30S ribosomal protein S2  22.75 
 
 		 238 aa  53.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000167283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1954  30S ribosomal protein S2  24.43 
 
 		 233 aa  53.5  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000941341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1672  30S ribosomal protein S2  24.43 
 
 		 233 aa  53.5  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000487185  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  23.04 
 
 		 235 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0957  ribosomal protein S2  24.42 
 
 		 280 aa  53.1  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1199  30S ribosomal protein S2  24.55 
 
 		 258 aa  53.1  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0195465  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2019  30S ribosomal protein S2  22.22 
 
 		 262 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418742 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  22.58 
 
 		 255 aa  53.1  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000315088  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  22.58 
 
 		 255 aa  53.1  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000466794  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1966  ribosomal protein S2  25.1 
 
 		 251 aa  52.8  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0442  30S ribosomal protein S2  24.09 
 
 		 252 aa  52.8  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000051714  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0371  30S ribosomal protein S2  41.27 
 
 		 291 aa  52.4  0.000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  21.66 
 
 		 262 aa  52  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1049  30S ribosomal protein S2  24.26 
 
 		 264 aa  52  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0905437  normal  0.331293 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  22.58 
 
 		 235 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0882  ribosomal protein S2  23.96 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2924  30S ribosomal protein S2  22.12 
 
 		 271 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.240537 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1941  ribosomal protein S2  22.14 
 
 		 262 aa  51.6  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0295  30S ribosomal protein S2  23.81 
 
 		 315 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0657172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  22.12 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0648  ribosomal protein S2  23.64 
 
 		 324 aa  50.8  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.154128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0975  SSU ribosomal protein S2P  35.29 
 
 		 260 aa  50.4  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3925  30S ribosomal protein S2  21.26 
 
 		 263 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0841532 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04251  40S ribosomal protein S2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06570)  23.41 
 
 		 332 aa  50.1  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.474341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2479  30S ribosomal protein S2  21.2 
 
 		 233 aa  50.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000168536  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1848  ribosomal protein S2  22.6 
 
 		 288 aa  50.1  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0363359  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  23.5 
 
 		 257 aa  49.7  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  23.18 
 
 		 244 aa  49.7  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185332  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  20.74 
 
 		 233 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000560898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3678  30S ribosomal protein S2  20.74 
 
 		 233 aa  49.3  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  20.74 
 
 		 233 aa  49.3  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  20.74 
 
 		 233 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  20.74 
 
 		 233 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000491144  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1318  30S ribosomal protein S2  21.2 
 
 		 233 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000762012  hitchhiker  4.07369e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3965  30S ribosomal protein S2  20.74 
 
 		 233 aa  49.3  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3839  30S ribosomal protein S2  20.74 
 
 		 233 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.22661e-62 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2455  30S ribosomal protein S2  25.45 
 
 		 255 aa  49.3  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3925  30S ribosomal protein S2  21.2 
 
 		 233 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000230027  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4961  30S ribosomal protein S2  23 
 
 		 255 aa  49.3  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3650  30S ribosomal protein S2  20.74 
 
 		 233 aa  48.9  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_321  ribosomal protein S2  23.5 
 
 		 245 aa  48.9  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000206427  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0377  30S ribosomal protein S2  23.5 
 
 		 245 aa  48.5  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000247942  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1921  30S ribosomal protein S2  24.04 
 
 		 267 aa  48.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.7747799999999994e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0295  30S ribosomal protein S2  22.62 
 
 		 343 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0422466  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0284  30S ribosomal protein S2  22.13 
 
 		 314 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0166  30S ribosomal protein S2  23.64 
 
 		 260 aa  48.1  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000940316  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1816  30S ribosomal protein S2  22.73 
 
 		 257 aa  48.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541904  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0164  30S ribosomal protein S2  23.64 
 
 		 262 aa  48.5  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1153  30S ribosomal protein S2  23.3 
 
 		 269 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1780  30S ribosomal protein S2  39.13 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000158872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0705  ribosomal protein S2  35.38 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000421001  unclonable  0.0000000254138 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0273  30S ribosomal protein S2  22.13 
 
 		 301 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1203  30S ribosomal protein S2  22.07 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159372  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0359  30S ribosomal protein S2  23.04 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000354346  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl561  30S ribosomal protein S2  22.82 
 
 		 283 aa  47  0.0003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  22.91 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000123477  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1610  30S ribosomal protein S2  24.66 
 
 		 254 aa  47  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00150432  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3709  30S ribosomal protein S2  23.26 
 
 		 244 aa  47  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000237071  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4743  ribosomal protein S2  22.43 
 
 		 277 aa  47  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000226587  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>