More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3194 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3194  ribosomal protein S2  100 
 
 		 247 aa  509  1e-143  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.758099  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  49.11 
 
 		 257 aa  254  7e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1250  30S ribosomal protein S2  48.21 
 
 		 251 aa  249  3e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000302151  hitchhiker  0.0000384341 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08130  SSU ribosomal protein S2P  47.58 
 
 		 250 aa  248  5e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000058431  unclonable  0.00000000192008 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1921  30S ribosomal protein S2  49.55 
 
 		 251 aa  248  6e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264289  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  48.21 
 
 		 257 aa  248  7e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1978  30S ribosomal protein S2  49.12 
 
 		 232 aa  247  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000338661  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  49.11 
 
 		 235 aa  246  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0442  30S ribosomal protein S2  48.89 
 
 		 252 aa  245  4e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000051714  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1780  30S ribosomal protein S2  48.76 
 
 		 243 aa  244  6.999999999999999e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000158872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  46.88 
 
 		 255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  46.88 
 
 		 256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000926335  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  46.88 
 
 		 255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0551  30S ribosomal protein S2  47.06 
 
 		 262 aa  243  3e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000123187  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0926  30S ribosomal protein S2  48.89 
 
 		 257 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148572  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  44.87 
 
 		 301 aa  242  3.9999999999999997e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000123477  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1006  30S ribosomal protein S2  47.52 
 
 		 252 aa  242  3.9999999999999997e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000128012  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1161  30S ribosomal protein S2  47.77 
 
 		 300 aa  242  5e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3581  30S ribosomal protein S2  46.88 
 
 		 289 aa  241  7.999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1262  30S ribosomal protein S2  48.25 
 
 		 289 aa  240  1e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000765471  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  47.77 
 
 		 233 aa  239  2e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0882  ribosomal protein S2  48 
 
 		 236 aa  240  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  47.11 
 
 		 271 aa  239  2e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000778728  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0406  ribosomal protein S2  46.88 
 
 		 263 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0705  ribosomal protein S2  47.93 
 
 		 250 aa  239  2.9999999999999997e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000421001  unclonable  0.0000000254138 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1238  30S ribosomal protein S2  47.6 
 
 		 259 aa  239  4e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000341164  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0295  30S ribosomal protein S2  49.11 
 
 		 343 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0422466  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0295  30S ribosomal protein S2  48.23 
 
 		 315 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0657172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1816  30S ribosomal protein S2  45.58 
 
 		 257 aa  238  5e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541904  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  43.67 
 
 		 244 aa  238  5e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185332  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0284  30S ribosomal protein S2  49.11 
 
 		 314 aa  238  5e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1966  ribosomal protein S2  48.09 
 
 		 251 aa  238  8e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  47.11 
 
 		 232 aa  238  8e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1863  30S ribosomal protein S2  46.26 
 
 		 248 aa  238  8e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.454251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0474  30S ribosomal protein S2  45.34 
 
 		 304 aa  238  9e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536253  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1103  ribosomal protein S2  44.93 
 
 		 278 aa  237  1e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  unclonable  9.34188e-16 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1442  30S ribosomal protein S2  45.42 
 
 		 258 aa  237  1e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.333535  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  45.38 
 
 		 238 aa  236  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1049  30S ribosomal protein S2  48.74 
 
 		 264 aa  236  2e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0905437  normal  0.331293 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  48 
 
 		 262 aa  237  2e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0273  30S ribosomal protein S2  49.1 
 
 		 301 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1778  ribosomal protein S2  47.11 
 
 		 274 aa  236  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1466  30S ribosomal protein S2  47.11 
 
 		 247 aa  235  5.0000000000000005e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.162448  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1954  30S ribosomal protein S2  47.35 
 
 		 233 aa  235  5.0000000000000005e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000941341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1672  30S ribosomal protein S2  47.35 
 
 		 233 aa  235  5.0000000000000005e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000487185  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1322  30S ribosomal protein S2  46.67 
 
 		 295 aa  234  7e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2530  30S ribosomal protein S2  44.35 
 
 		 251 aa  234  8e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.963698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3213  ribosomal protein S2  47.27 
 
 		 248 aa  234  9e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321925  unclonable  0.000000000222969 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1230  30S ribosomal protein S2  46.67 
 
 		 279 aa  234  9e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133873  normal  0.0467572 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  42.92 
 
 		 262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  43.78 
 
 		 255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000315088  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  43.78 
 
 		 255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000466794  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1921  30S ribosomal protein S2  45.54 
 
 		 267 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.7747799999999994e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3528  30S ribosomal protein S2  47.11 
 
 		 268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.421739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0840  30S ribosomal protein S2  45.49 
 
 		 267 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00899072  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2578  30S ribosomal protein S2  47.11 
 
 		 268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3925  30S ribosomal protein S2  48 
 
 		 233 aa  233  3e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000230027  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3650  30S ribosomal protein S2  48.44 
 
 		 233 aa  232  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1318  30S ribosomal protein S2  48 
 
 		 233 aa  233  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000762012  hitchhiker  4.07369e-17 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0164  30S ribosomal protein S2  47.6 
 
 		 262 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12270  SSU ribosomal protein S2P  43.1 
 
 		 294 aa  232  4.0000000000000004e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000736157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3113  ribosomal protein S2  45.09 
 
 		 296 aa  232  4.0000000000000004e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000518709  normal  0.0242876 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0166  30S ribosomal protein S2  47.6 
 
 		 260 aa  231  5e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000940316  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1802  30S ribosomal protein S2  46.43 
 
 		 259 aa  232  5e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0866848  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1004  ribosomal protein S2  42.98 
 
 		 283 aa  232  5e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.663705  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  47.35 
 
 		 233 aa  231  6e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000560898  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2198  30S ribosomal protein S2  45.78 
 
 		 297 aa  231  6e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.441521 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3678  30S ribosomal protein S2  47.35 
 
 		 233 aa  231  6e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  47.35 
 
 		 233 aa  231  6e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  47.35 
 
 		 233 aa  231  6e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  47.35 
 
 		 233 aa  231  6e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000491144  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3965  30S ribosomal protein S2  47.35 
 
 		 233 aa  231  6e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1153  30S ribosomal protein S2  46.67 
 
 		 269 aa  231  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3839  30S ribosomal protein S2  47.35 
 
 		 233 aa  231  6e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.22661e-62 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3410  ribosomal protein S2  45.95 
 
 		 283 aa  231  8.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.7242  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1810  30S ribosomal protein S2  47.56 
 
 		 253 aa  230  1e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.544221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0676  30S ribosomal protein S2  46.4 
 
 		 292 aa  230  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.560219  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1094  30S ribosomal protein S2  46.05 
 
 		 261 aa  230  1e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.240704  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1668  ribosomal protein S2  45.09 
 
 		 282 aa  230  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.688416  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2479  30S ribosomal protein S2  47.11 
 
 		 233 aa  230  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000168536  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0626  ribosomal protein S2  45.5 
 
 		 237 aa  230  2e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.761856  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  44.44 
 
 		 235 aa  229  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1119  30S ribosomal protein S2  46.88 
 
 		 254 aa  230  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2029  30S ribosomal protein S2  46.88 
 
 		 256 aa  229  3e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.306741  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12904  30S ribosomal protein S2  44.64 
 
 		 287 aa  229  3e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0383521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0742  ribosomal protein S2  45.33 
 
 		 281 aa  229  3e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000127244  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3709  30S ribosomal protein S2  45.33 
 
 		 244 aa  229  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000237071  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2455  30S ribosomal protein S2  44 
 
 		 255 aa  229  4e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1162  30S ribosomal protein S2  46.43 
 
 		 256 aa  228  5e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.278359  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5911  ribosomal protein S2  45.98 
 
 		 304 aa  229  5e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00672322  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1941  ribosomal protein S2  44.49 
 
 		 262 aa  228  6e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0237  ribosomal protein S2  45.05 
 
 		 314 aa  228  6e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.245227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  46.22 
 
 		 262 aa  228  7e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000550841  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0080  ribosomal protein S2  45.37 
 
 		 263 aa  228  9e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000155744  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  44.89 
 
 		 235 aa  227  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0424  30S ribosomal protein S2  45.53 
 
 		 256 aa  228  1e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0576373  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2013  30S ribosomal protein S2  47.73 
 
 		 260 aa  227  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.515396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3991  ribosomal protein S2  44.64 
 
 		 316 aa  227  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0577  30S ribosomal protein S2  43.11 
 
 		 294 aa  227  1e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000845501  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1520  ribosomal protein S2  45.58 
 
 		 289 aa  227  1e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>