More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2029 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_2029  30S ribosomal protein S2  100 
 
 		 256 aa  525  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.306741  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1162  30S ribosomal protein S2  97.27 
 
 		 256 aa  514  1.0000000000000001e-145  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.278359  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1119  30S ribosomal protein S2  96.46 
 
 		 254 aa  508  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1131  30S ribosomal protein S2  86.22 
 
 		 255 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.439275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1583  30S ribosomal protein S2  85.49 
 
 		 255 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1776  30S ribosomal protein S2  85.88 
 
 		 255 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.890792 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0583  30S ribosomal protein S2  86.4 
 
 		 271 aa  461  1e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0651099  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1381  30S ribosomal protein S2  81.92 
 
 		 267 aa  459  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2528  30S ribosomal protein S2  85.02 
 
 		 248 aa  449  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9516  30S ribosomal protein S2  82.3 
 
 		 307 aa  429  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2223  30S ribosomal protein S2  75.58 
 
 		 361 aa  406  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4827  30S ribosomal protein S2  74.5 
 
 		 349 aa  403  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.356192  normal  0.0170734 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3196  ribosomal protein S2  74.31 
 
 		 253 aa  404  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1859  30S ribosomal protein S2  73.15 
 
 		 332 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.113122 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1694  30S ribosomal protein S2  73.15 
 
 		 332 aa  397  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4517  30S ribosomal protein S2  73.81 
 
 		 330 aa  397  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4439  30S ribosomal protein S2  74.49 
 
 		 334 aa  396  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000842833 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2073  30S ribosomal protein S2  75.62 
 
 		 355 aa  394  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.193389  normal  0.160852 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2347  30S ribosomal protein S2  75.62 
 
 		 355 aa  394  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.473707 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1698  30S ribosomal protein S2  73.12 
 
 		 349 aa  394  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2436  30S ribosomal protein S2  73.6 
 
 		 334 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2033  30S ribosomal protein S2  75.5 
 
 		 354 aa  384  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0655537 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1380  30S ribosomal protein S2  72.98 
 
 		 288 aa  384  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272546  normal  0.0375782 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1694  30S ribosomal protein S2  73.05 
 
 		 349 aa  384  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.754731 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3450  30S ribosomal protein S2  71.89 
 
 		 355 aa  383  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0387566  normal  0.644555 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2828  30S ribosomal protein S2  71.88 
 
 		 331 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00696653  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1433  30S ribosomal protein S2  69.72 
 
 		 251 aa  374  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0086997 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2860  30S ribosomal protein S2  69.72 
 
 		 253 aa  374  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2857  30S ribosomal protein S2  72.62 
 
 		 331 aa  374  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.32716  normal  0.180299 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3726  30S ribosomal protein S2  69.48 
 
 		 261 aa  375  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3268  30S ribosomal protein S2  71.65 
 
 		 331 aa  371  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138284  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1510  30S ribosomal protein S2  70.12 
 
 		 274 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.0221668 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1548  30S ribosomal protein S2  69.8 
 
 		 259 aa  369  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.403357 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2805  30S ribosomal protein S2  69.08 
 
 		 313 aa  367  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00564496  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2306  30S ribosomal protein S2  67.89 
 
 		 276 aa  361  7.0000000000000005e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1210  30S ribosomal protein S2  69.87 
 
 		 256 aa  358  3e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1586  30S ribosomal protein S2  66.8 
 
 		 262 aa  350  8.999999999999999e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.551794  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1694  30S ribosomal protein S2  65.85 
 
 		 256 aa  348  4e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.559566  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3347  30S ribosomal protein S2  65.85 
 
 		 260 aa  347  9e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.259933  normal  0.727871 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0460  30S ribosomal protein S2  63.86 
 
 		 250 aa  340  9e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.968608 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1960  30S ribosomal protein S2  63.05 
 
 		 277 aa  334  7e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1369  30S ribosomal protein S2  63.03 
 
 		 251 aa  319  3e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.512665  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0517  30S ribosomal protein S2  56.97 
 
 		 291 aa  298  5e-80  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.285229  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0514  30S ribosomal protein S2  56.56 
 
 		 288 aa  296  2e-79  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  54.26 
 
 		 257 aa  287  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0532  30S ribosomal protein S2  55.7 
 
 		 282 aa  285  4e-76  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00675401  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  57.59 
 
 		 255 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  57.59 
 
 		 255 aa  284  9e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1444  ribosomal protein S2  57.33 
 
 		 250 aa  282  3.0000000000000004e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.152019  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0295  30S ribosomal protein S2  59.38 
 
 		 315 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0657172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1160  ribosomal protein S2  57.33 
 
 		 250 aa  282  3.0000000000000004e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1250  30S ribosomal protein S2  58.48 
 
 		 251 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000302151  hitchhiker  0.0000384341 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0295  30S ribosomal protein S2  57.59 
 
 		 343 aa  282  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0422466  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0284  30S ribosomal protein S2  57.85 
 
 		 314 aa  281  7.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1553  ribosomal protein S2  53.88 
 
 		 242 aa  280  2e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0273  30S ribosomal protein S2  58.11 
 
 		 301 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1921  30S ribosomal protein S2  56.22 
 
 		 267 aa  279  3e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.7747799999999994e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1230  30S ribosomal protein S2  54.62 
 
 		 279 aa  277  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133873  normal  0.0467572 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1921  30S ribosomal protein S2  57.59 
 
 		 251 aa  276  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264289  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  54.91 
 
 		 301 aa  276  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000123477  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1840  SSU ribosomal protein S2P  53.78 
 
 		 262 aa  276  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1322  30S ribosomal protein S2  54.2 
 
 		 295 aa  275  6e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2108  30S ribosomal protein S2  54.96 
 
 		 254 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3410  ribosomal protein S2  54.08 
 
 		 283 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.7242  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2376  ribosomal protein S2  52.99 
 
 		 261 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3113  ribosomal protein S2  55.46 
 
 		 296 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000518709  normal  0.0242876 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0994  30S ribosomal protein S2  53.78 
 
 		 303 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271344  normal  0.423917 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5911  ribosomal protein S2  51.82 
 
 		 304 aa  273  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00672322  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1778  ribosomal protein S2  53.33 
 
 		 274 aa  273  3e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  54.46 
 
 		 256 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000926335  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1133  30S ribosomal protein S2  57.78 
 
 		 260 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0577  30S ribosomal protein S2  52.17 
 
 		 294 aa  271  7e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000845501  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12904  30S ribosomal protein S2  53.98 
 
 		 287 aa  271  8.000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0383521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  54.31 
 
 		 257 aa  271  8.000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0237  ribosomal protein S2  54.39 
 
 		 314 aa  270  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.245227  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1668  ribosomal protein S2  52.1 
 
 		 282 aa  270  1e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.688416  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2507  ribosomal protein S2  51.45 
 
 		 353 aa  270  2e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.282743  normal  0.375385 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1941  ribosomal protein S2  51.19 
 
 		 262 aa  270  2e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0676  30S ribosomal protein S2  52.97 
 
 		 292 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.560219  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1249  ribosomal protein S2  51.42 
 
 		 243 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0474  30S ribosomal protein S2  53.09 
 
 		 304 aa  269  4e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536253  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3581  30S ribosomal protein S2  49.27 
 
 		 289 aa  268  5e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1161  30S ribosomal protein S2  53.74 
 
 		 300 aa  268  5e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0941  30S ribosomal protein S2  54.43 
 
 		 241 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0031234  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3360  30S ribosomal protein S2  54.43 
 
 		 241 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.720807  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2924  30S ribosomal protein S2  54.98 
 
 		 271 aa  268  7e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.240537 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1484  ribosomal protein S2  52.53 
 
 		 326 aa  268  7e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.068355  normal  0.329281 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1338  30S ribosomal protein S2  54.95 
 
 		 250 aa  268  8e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.21078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1530  SSU ribosomal protein S2P  57.73 
 
 		 249 aa  268  8e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000131876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0948  ribosomal protein S2  53.85 
 
 		 298 aa  267  1e-70  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.405377  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1520  ribosomal protein S2  56.09 
 
 		 289 aa  267  1e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1529  ribosomal protein S2  53.95 
 
 		 344 aa  266  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23610  SSU ribosomal protein S2P  52.57 
 
 		 317 aa  267  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.699441  normal  0.141313 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2104  ribosomal protein S2  53.54 
 
 		 272 aa  266  2e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1004  ribosomal protein S2  53.07 
 
 		 283 aa  266  2e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.663705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1180  ribosomal protein S2  51.19 
 
 		 317 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.920095  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3991  ribosomal protein S2  52.85 
 
 		 316 aa  265  4e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1682  30S ribosomal protein S2  54.95 
 
 		 250 aa  265  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00674019  normal  0.113442 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0256  30S ribosomal protein S2  53.16 
 
 		 241 aa  265  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.424632  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4961  30S ribosomal protein S2  57.96 
 
 		 255 aa  265  5e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>