More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0840 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0840  30S ribosomal protein S2  100 
 
 		 267 aa  551  1e-156  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00899072  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1442  30S ribosomal protein S2  83.14 
 
 		 258 aa  455  1e-127  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.333535  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1262  30S ribosomal protein S2  81.13 
 
 		 289 aa  450  1e-125  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000765471  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1197  30S ribosomal protein S2  81.15 
 
 		 263 aa  442  1e-123  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1316  30S ribosomal protein S2  81.15 
 
 		 263 aa  442  1e-123  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.715024  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0547  30S ribosomal protein S2  80.38 
 
 		 263 aa  440  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0551  30S ribosomal protein S2  80.38 
 
 		 262 aa  439  9.999999999999999e-123  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000123187  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1094  30S ribosomal protein S2  81.99 
 
 		 261 aa  431  1e-120  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.240704  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0406  ribosomal protein S2  75.76 
 
 		 263 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1802  30S ribosomal protein S2  69.7 
 
 		 259 aa  379  1e-104  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0866848  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  57.79 
 
 		 262 aa  296  2e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  59.91 
 
 		 233 aa  296  3e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  53.54 
 
 		 257 aa  290  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  55.98 
 
 		 238 aa  290  2e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2347  30S ribosomal protein S2  51.23 
 
 		 291 aa  288  7e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000118359  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1250  30S ribosomal protein S2  59.73 
 
 		 251 aa  288  7e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000302151  hitchhiker  0.0000384341 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1921  30S ribosomal protein S2  56.5 
 
 		 267 aa  287  1e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.7747799999999994e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1921  30S ribosomal protein S2  59.73 
 
 		 251 aa  285  4e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264289  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  56.14 
 
 		 301 aa  285  4e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000123477  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  53.47 
 
 		 257 aa  285  4e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  58.41 
 
 		 256 aa  284  8e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000926335  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  59.64 
 
 		 235 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2733  ribosomal protein S2  56.2 
 
 		 271 aa  282  3.0000000000000004e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36757e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1006  30S ribosomal protein S2  55.28 
 
 		 252 aa  282  3.0000000000000004e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000128012  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3213  ribosomal protein S2  58.37 
 
 		 248 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321925  unclonable  0.000000000222969 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  57.85 
 
 		 232 aa  283  3.0000000000000004e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0994  30S ribosomal protein S2  59.19 
 
 		 303 aa  280  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271344  normal  0.423917 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3709  30S ribosomal protein S2  56.95 
 
 		 244 aa  280  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000237071  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3581  30S ribosomal protein S2  54.17 
 
 		 289 aa  280  2e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1668  ribosomal protein S2  57.52 
 
 		 282 aa  280  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.688416  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1161  30S ribosomal protein S2  54.58 
 
 		 300 aa  280  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  57.85 
 
 		 235 aa  280  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1978  30S ribosomal protein S2  57.85 
 
 		 232 aa  278  6e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000338661  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  56.64 
 
 		 255 aa  278  9e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2104  ribosomal protein S2  53.73 
 
 		 272 aa  278  9e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0237  ribosomal protein S2  53.33 
 
 		 314 aa  278  9e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.245227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  56.64 
 
 		 255 aa  277  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1816  30S ribosomal protein S2  51.56 
 
 		 257 aa  277  1e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541904  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1238  30S ribosomal protein S2  56.47 
 
 		 259 aa  276  2e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000341164  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3113  ribosomal protein S2  56.39 
 
 		 296 aa  277  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000518709  normal  0.0242876 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1484  ribosomal protein S2  53.53 
 
 		 326 aa  276  2e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.068355  normal  0.329281 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  56.95 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185332  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0295  30S ribosomal protein S2  55.06 
 
 		 343 aa  275  4e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0422466  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0295  30S ribosomal protein S2  54.66 
 
 		 315 aa  275  4e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0657172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0284  30S ribosomal protein S2  55.06 
 
 		 314 aa  275  4e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0676  30S ribosomal protein S2  57.02 
 
 		 292 aa  275  5e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.560219  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2479  30S ribosomal protein S2  57.4 
 
 		 233 aa  275  6e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000168536  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  55.86 
 
 		 235 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1974  30S ribosomal protein S2  56.19 
 
 		 284 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.34334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1322  30S ribosomal protein S2  57.85 
 
 		 295 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1230  30S ribosomal protein S2  57.85 
 
 		 279 aa  273  1.0000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133873  normal  0.0467572 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1993  30S ribosomal protein S2  56.19 
 
 		 284 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1199  30S ribosomal protein S2  50 
 
 		 258 aa  274  1.0000000000000001e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0195465  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1778  ribosomal protein S2  51.76 
 
 		 274 aa  274  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2039  30S ribosomal protein S2  56.19 
 
 		 284 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.07144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1285  ribosomal protein S2  56.05 
 
 		 248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297191  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3410  ribosomal protein S2  56.95 
 
 		 283 aa  272  3e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.7242  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4133  30S ribosomal protein S2  55.31 
 
 		 279 aa  273  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.549369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0626  ribosomal protein S2  56.5 
 
 		 237 aa  273  3e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.761856  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2209  30S ribosomal protein S2  56.31 
 
 		 273 aa  273  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.092398  normal  0.16392 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  56.95 
 
 		 233 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000560898  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1941  ribosomal protein S2  51.63 
 
 		 262 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3678  30S ribosomal protein S2  56.95 
 
 		 233 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  56.95 
 
 		 233 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  56.95 
 
 		 233 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3965  30S ribosomal protein S2  56.95 
 
 		 233 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1318  30S ribosomal protein S2  57.4 
 
 		 233 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000762012  hitchhiker  4.07369e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3925  30S ribosomal protein S2  57.4 
 
 		 233 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000230027  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  56.95 
 
 		 233 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000491144  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3839  30S ribosomal protein S2  56.95 
 
 		 233 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.22661e-62 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1542  SSU ribosomal protein S2P  55.38 
 
 		 275 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0273  30S ribosomal protein S2  55.1 
 
 		 301 aa  271  6e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0442  30S ribosomal protein S2  54.1 
 
 		 252 aa  271  7e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000051714  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0742  ribosomal protein S2  49.8 
 
 		 281 aa  271  7e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000127244  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  53.01 
 
 		 271 aa  271  7e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000778728  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0926  30S ribosomal protein S2  58.3 
 
 		 257 aa  271  8.000000000000001e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148572  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3650  30S ribosomal protein S2  56.95 
 
 		 233 aa  271  9e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3991  ribosomal protein S2  55.95 
 
 		 316 aa  270  1e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0882  ribosomal protein S2  55.16 
 
 		 236 aa  271  1e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0474  30S ribosomal protein S2  52.44 
 
 		 304 aa  270  2e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536253  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1180  ribosomal protein S2  56 
 
 		 317 aa  270  2e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.920095  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12904  30S ribosomal protein S2  55.31 
 
 		 287 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0383521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08130  SSU ribosomal protein S2P  56.42 
 
 		 250 aa  269  2.9999999999999997e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000058431  unclonable  0.00000000192008 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0164  30S ribosomal protein S2  56.95 
 
 		 262 aa  268  5e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  50.81 
 
 		 262 aa  268  5e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000550841  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2507  ribosomal protein S2  54.55 
 
 		 353 aa  268  5.9999999999999995e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.282743  normal  0.375385 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23610  SSU ribosomal protein S2P  49.8 
 
 		 317 aa  268  8e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.699441  normal  0.141313 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0577  30S ribosomal protein S2  54.19 
 
 		 294 aa  268  8.999999999999999e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000845501  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2198  30S ribosomal protein S2  53.85 
 
 		 297 aa  268  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.441521 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0166  30S ribosomal protein S2  56.5 
 
 		 260 aa  267  1e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000940316  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1004  ribosomal protein S2  53.28 
 
 		 283 aa  267  1e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.663705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0975  SSU ribosomal protein S2P  51.54 
 
 		 260 aa  267  1e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0105  30S ribosomal protein S2  55.16 
 
 		 255 aa  266  2e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000131996  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17060  30S ribosomal protein S2  56.76 
 
 		 246 aa  265  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1483  30S ribosomal protein S2  56.76 
 
 		 246 aa  265  5e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1529  ribosomal protein S2  55.16 
 
 		 344 aa  265  5.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0957  ribosomal protein S2  55.79 
 
 		 280 aa  265  7e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5911  ribosomal protein S2  55.41 
 
 		 304 aa  265  7e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00672322  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0578  ribosomal protein S2  57.85 
 
 		 243 aa  265  7e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0123  30S ribosomal protein S2  52.7 
 
 		 262 aa  265  8e-70  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.839635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>