More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1094 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1094  30S ribosomal protein S2  100 
 
 		 261 aa  538  9.999999999999999e-153  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.240704  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1316  30S ribosomal protein S2  94.68 
 
 		 263 aa  511  1e-144  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.715024  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1197  30S ribosomal protein S2  94.68 
 
 		 263 aa  511  1e-144  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0547  30S ribosomal protein S2  93.92 
 
 		 263 aa  509  1e-143  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1442  30S ribosomal protein S2  87.55 
 
 		 258 aa  474  1e-133  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.333535  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1262  30S ribosomal protein S2  84.73 
 
 		 289 aa  468  1.0000000000000001e-131  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000765471  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0551  30S ribosomal protein S2  85.5 
 
 		 262 aa  465  9.999999999999999e-131  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000123187  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0840  30S ribosomal protein S2  81.99 
 
 		 267 aa  446  1.0000000000000001e-124  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00899072  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0406  ribosomal protein S2  80.62 
 
 		 263 aa  417  1e-116  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1802  30S ribosomal protein S2  70.82 
 
 		 259 aa  379  1e-104  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0866848  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  55.34 
 
 		 257 aa  296  3e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  60.81 
 
 		 233 aa  295  4e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  58.3 
 
 		 262 aa  295  5e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  54.55 
 
 		 257 aa  290  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1668  ribosomal protein S2  55.86 
 
 		 282 aa  290  2e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.688416  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3113  ribosomal protein S2  55.1 
 
 		 296 aa  287  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000518709  normal  0.0242876 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0237  ribosomal protein S2  55.91 
 
 		 314 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.245227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  60.09 
 
 		 235 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2104  ribosomal protein S2  53.64 
 
 		 272 aa  286  2.9999999999999996e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0676  30S ribosomal protein S2  56.35 
 
 		 292 aa  285  5e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.560219  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1993  30S ribosomal protein S2  56.41 
 
 		 284 aa  285  5e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1974  30S ribosomal protein S2  56.41 
 
 		 284 aa  285  5e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.34334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2039  30S ribosomal protein S2  56.41 
 
 		 284 aa  285  5e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.07144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3213  ribosomal protein S2  60.18 
 
 		 248 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321925  unclonable  0.000000000222969 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1161  30S ribosomal protein S2  55.74 
 
 		 300 aa  283  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1180  ribosomal protein S2  54.62 
 
 		 317 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.920095  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  58.3 
 
 		 235 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1921  30S ribosomal protein S2  58.85 
 
 		 251 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264289  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1921  30S ribosomal protein S2  56.73 
 
 		 267 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.7747799999999994e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4133  30S ribosomal protein S2  53.94 
 
 		 279 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.549369  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0994  30S ribosomal protein S2  55.86 
 
 		 303 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271344  normal  0.423917 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  53.97 
 
 		 256 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000926335  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2209  30S ribosomal protein S2  58.56 
 
 		 273 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.092398  normal  0.16392 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1250  30S ribosomal protein S2  57.96 
 
 		 251 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000302151  hitchhiker  0.0000384341 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1230  30S ribosomal protein S2  52.22 
 
 		 279 aa  282  3.0000000000000004e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133873  normal  0.0467572 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1484  ribosomal protein S2  53.97 
 
 		 326 aa  282  4.0000000000000003e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.068355  normal  0.329281 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3581  30S ribosomal protein S2  53.26 
 
 		 289 aa  282  4.0000000000000003e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  58.56 
 
 		 235 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23610  SSU ribosomal protein S2P  52.94 
 
 		 317 aa  282  5.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.699441  normal  0.141313 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  57.46 
 
 		 238 aa  281  6.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3709  30S ribosomal protein S2  59.64 
 
 		 244 aa  281  6.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000237071  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  55.07 
 
 		 301 aa  281  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000123477  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2198  30S ribosomal protein S2  56.72 
 
 		 297 aa  280  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.441521 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1004  ribosomal protein S2  53.82 
 
 		 283 aa  280  2e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.663705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1978  30S ribosomal protein S2  59.64 
 
 		 232 aa  280  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000338661  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3243  SSU ribosomal protein S2P  53.28 
 
 		 307 aa  280  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.191936  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3991  ribosomal protein S2  58.41 
 
 		 316 aa  279  3e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2507  ribosomal protein S2  52.63 
 
 		 353 aa  278  4e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.282743  normal  0.375385 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  56.89 
 
 		 255 aa  278  5e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  56.89 
 
 		 255 aa  278  5e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3410  ribosomal protein S2  59.19 
 
 		 283 aa  278  6e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.7242  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11190  SSU ribosomal protein S2P  54.29 
 
 		 310 aa  278  8e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.025157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1816  30S ribosomal protein S2  56.5 
 
 		 257 aa  278  9e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541904  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1778  ribosomal protein S2  53.09 
 
 		 274 aa  277  1e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  52.12 
 
 		 262 aa  276  2e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12904  30S ribosomal protein S2  55.79 
 
 		 287 aa  276  2e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0383521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1285  ribosomal protein S2  57.4 
 
 		 248 aa  276  2e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297191  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1322  30S ribosomal protein S2  56.3 
 
 		 295 aa  276  2e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1529  ribosomal protein S2  53.17 
 
 		 344 aa  276  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1542  SSU ribosomal protein S2P  57.89 
 
 		 275 aa  276  3e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2347  30S ribosomal protein S2  56.31 
 
 		 291 aa  275  4e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000118359  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  51.94 
 
 		 255 aa  275  4e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000466794  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  51.94 
 
 		 255 aa  275  4e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000315088  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0626  ribosomal protein S2  58.3 
 
 		 237 aa  275  5e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.761856  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2479  30S ribosomal protein S2  57.4 
 
 		 233 aa  275  5e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000168536  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  57.4 
 
 		 233 aa  275  6e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000560898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3678  30S ribosomal protein S2  57.4 
 
 		 233 aa  275  6e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  57.4 
 
 		 233 aa  275  6e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  57.4 
 
 		 233 aa  275  6e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3839  30S ribosomal protein S2  57.4 
 
 		 233 aa  275  6e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.22661e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3965  30S ribosomal protein S2  57.4 
 
 		 233 aa  275  6e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  57.4 
 
 		 233 aa  275  6e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000491144  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2733  ribosomal protein S2  54.47 
 
 		 271 aa  275  7e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36757e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1318  30S ribosomal protein S2  57.85 
 
 		 233 aa  274  9e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000762012  hitchhiker  4.07369e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3925  30S ribosomal protein S2  57.85 
 
 		 233 aa  274  9e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000230027  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5911  ribosomal protein S2  51.57 
 
 		 304 aa  274  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00672322  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1199  30S ribosomal protein S2  51.41 
 
 		 258 aa  273  1.0000000000000001e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0195465  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0295  30S ribosomal protein S2  58.3 
 
 		 343 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0422466  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3650  30S ribosomal protein S2  57.4 
 
 		 233 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0926  30S ribosomal protein S2  59.64 
 
 		 257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148572  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0577  30S ribosomal protein S2  54.58 
 
 		 294 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000845501  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1006  30S ribosomal protein S2  54 
 
 		 252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000128012  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0284  30S ribosomal protein S2  58.3 
 
 		 314 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0742  ribosomal protein S2  53.09 
 
 		 281 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000127244  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0295  30S ribosomal protein S2  58.74 
 
 		 315 aa  271  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0657172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10120  SSU ribosomal protein S2P  50.19 
 
 		 318 aa  271  6e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  54.36 
 
 		 244 aa  271  6e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185332  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1941  ribosomal protein S2  51.15 
 
 		 262 aa  271  6e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  51.53 
 
 		 262 aa  271  8.000000000000001e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000550841  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  56.95 
 
 		 232 aa  271  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1415  ribosomal protein S2  52.05 
 
 		 311 aa  270  1e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0273  30S ribosomal protein S2  58.82 
 
 		 301 aa  270  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09890  SSU ribosomal protein S2P  58.22 
 
 		 278 aa  270  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0164  30S ribosomal protein S2  58.3 
 
 		 262 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08130  SSU ribosomal protein S2P  56.88 
 
 		 250 aa  269  2.9999999999999997e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000058431  unclonable  0.00000000192008 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06740  30S ribosomal protein S2  56.75 
 
 		 285 aa  269  4e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0485569  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0166  30S ribosomal protein S2  57.85 
 
 		 260 aa  268  5e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000940316  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12270  SSU ribosomal protein S2P  57.47 
 
 		 294 aa  268  5e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000736157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17060  30S ribosomal protein S2  53.85 
 
 		 246 aa  268  5e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1103  ribosomal protein S2  57.47 
 
 		 278 aa  268  5.9999999999999995e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  unclonable  9.34188e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>