More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_12270 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_12270  SSU ribosomal protein S2P  100 
 
 
294 aa  599  1e-170  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000736157  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1103  ribosomal protein S2  79.49 
 
 
278 aa  416  9.999999999999999e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  unclonable  9.34188e-16 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08130  SSU ribosomal protein S2P  78.32 
 
 
250 aa  389  1e-107  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000058431  unclonable  0.00000000192008 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0705  ribosomal protein S2  64.41 
 
 
250 aa  335  5.999999999999999e-91  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000421001  unclonable  0.0000000254138 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3709  30S ribosomal protein S2  60.71 
 
 
244 aa  298  9e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000237071  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1668  ribosomal protein S2  51.19 
 
 
282 aa  296  3e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.688416  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  59.46 
 
 
235 aa  296  3e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  59.46 
 
 
235 aa  295  5e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  57.2 
 
 
262 aa  294  1e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4133  30S ribosomal protein S2  54.79 
 
 
279 aa  292  5e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.549369  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  58.04 
 
 
233 aa  290  2e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1974  30S ribosomal protein S2  57.71 
 
 
284 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.34334  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1993  30S ribosomal protein S2  57.71 
 
 
284 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2039  30S ribosomal protein S2  57.71 
 
 
284 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.07144  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2209  30S ribosomal protein S2  58.22 
 
 
273 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.092398  normal  0.16392 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2104  ribosomal protein S2  51.84 
 
 
272 aa  288  1e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3991  ribosomal protein S2  55.74 
 
 
316 aa  287  1e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  46.18 
 
 
301 aa  287  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000123477  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1238  30S ribosomal protein S2  56.41 
 
 
259 aa  286  2.9999999999999996e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000341164  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12904  30S ribosomal protein S2  49.48 
 
 
287 aa  285  5e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0383521  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3113  ribosomal protein S2  56.89 
 
 
296 aa  285  7e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000518709  normal  0.0242876 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1978  30S ribosomal protein S2  57.59 
 
 
232 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000338661  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0742  ribosomal protein S2  56.7 
 
 
281 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000127244  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0676  30S ribosomal protein S2  57.2 
 
 
292 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.560219  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0237  ribosomal protein S2  57.14 
 
 
314 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.245227  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3581  30S ribosomal protein S2  50 
 
 
289 aa  283  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  57.59 
 
 
235 aa  282  6.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1816  30S ribosomal protein S2  52.92 
 
 
257 aa  281  1e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541904  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1415  ribosomal protein S2  54.36 
 
 
311 aa  280  3e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2680  30S ribosomal protein S2  54.96 
 
 
246 aa  280  3e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000034456  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0994  30S ribosomal protein S2  57.85 
 
 
303 aa  280  3e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271344  normal  0.423917 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  55.36 
 
 
244 aa  279  4e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185332  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3213  ribosomal protein S2  57.27 
 
 
248 aa  278  6e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321925  unclonable  0.000000000222969 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0551  30S ribosomal protein S2  52.51 
 
 
262 aa  277  1e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000123187  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  55.2 
 
 
238 aa  277  1e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1180  ribosomal protein S2  55.31 
 
 
317 aa  277  1e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.920095  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  54.91 
 
 
255 aa  276  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  54.91 
 
 
255 aa  276  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0626  ribosomal protein S2  56.56 
 
 
237 aa  276  3e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.761856  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1484  ribosomal protein S2  56 
 
 
326 aa  276  3e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.068355  normal  0.329281 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0442  30S ribosomal protein S2  54.05 
 
 
252 aa  276  3e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000051714  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1262  30S ribosomal protein S2  57.47 
 
 
289 aa  276  4e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000765471  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  54.27 
 
 
255 aa  275  5e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000315088  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  54.7 
 
 
262 aa  275  5e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  54.27 
 
 
255 aa  275  5e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000466794  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2507  ribosomal protein S2  55.02 
 
 
353 aa  275  5e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.282743  normal  0.375385 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1161  30S ribosomal protein S2  52.26 
 
 
300 aa  275  5e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5911  ribosomal protein S2  54.22 
 
 
304 aa  275  6e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00672322  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10120  SSU ribosomal protein S2P  54.35 
 
 
318 aa  275  6e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  53.57 
 
 
257 aa  275  6e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3925  30S ribosomal protein S2  55.86 
 
 
233 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000230027  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1318  30S ribosomal protein S2  55.86 
 
 
233 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000762012  hitchhiker  4.07369e-17 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0213  ribosomal protein S2  50.82 
 
 
257 aa  274  1.0000000000000001e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3243  SSU ribosomal protein S2P  48.8 
 
 
307 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.191936  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  55.41 
 
 
233 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000560898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3678  30S ribosomal protein S2  55.41 
 
 
233 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  55.41 
 
 
233 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  55.41 
 
 
233 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193043  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1004  ribosomal protein S2  54.39 
 
 
283 aa  274  2.0000000000000002e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.663705  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1250  30S ribosomal protein S2  54.91 
 
 
251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000302151  hitchhiker  0.0000384341 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3965  30S ribosomal protein S2  55.41 
 
 
233 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  55.41 
 
 
233 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000491144  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3650  30S ribosomal protein S2  55.41 
 
 
233 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23610  SSU ribosomal protein S2P  52.63 
 
 
317 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.699441  normal  0.141313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1529  ribosomal protein S2  53.98 
 
 
344 aa  273  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3839  30S ribosomal protein S2  55.41 
 
 
233 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.22661e-62 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1778  ribosomal protein S2  54.91 
 
 
274 aa  273  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3410  ribosomal protein S2  55.22 
 
 
283 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.7242  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2479  30S ribosomal protein S2  55.41 
 
 
233 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000168536  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2198  30S ribosomal protein S2  49.33 
 
 
297 aa  272  6e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.441521 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  56.25 
 
 
232 aa  272  6e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11190  SSU ribosomal protein S2P  51.42 
 
 
310 aa  271  6e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.025157  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0166  30S ribosomal protein S2  53.45 
 
 
260 aa  271  8.000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000940316  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09890  SSU ribosomal protein S2P  55.76 
 
 
278 aa  271  8.000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0164  30S ribosomal protein S2  53.68 
 
 
262 aa  271  9e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1316  30S ribosomal protein S2  54.62 
 
 
263 aa  271  1e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.715024  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0406  ribosomal protein S2  52.74 
 
 
263 aa  271  1e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1322  30S ribosomal protein S2  48.11 
 
 
295 aa  271  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1442  30S ribosomal protein S2  56.56 
 
 
258 aa  271  1e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.333535  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1197  30S ribosomal protein S2  54.62 
 
 
263 aa  271  1e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1094  30S ribosomal protein S2  57.47 
 
 
261 aa  270  2e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.240704  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1520  ribosomal protein S2  54.3 
 
 
289 aa  270  2e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1230  30S ribosomal protein S2  48.95 
 
 
279 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133873  normal  0.0467572 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1006  30S ribosomal protein S2  51.19 
 
 
252 aa  269  2.9999999999999997e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000128012  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0295  30S ribosomal protein S2  53.36 
 
 
343 aa  269  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0422466  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  50.78 
 
 
257 aa  269  4e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0284  30S ribosomal protein S2  53.36 
 
 
314 aa  269  4e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0926  30S ribosomal protein S2  54.46 
 
 
257 aa  269  5e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148572  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  51.68 
 
 
262 aa  269  5e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000550841  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0547  30S ribosomal protein S2  56.56 
 
 
263 aa  268  5.9999999999999995e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0295  30S ribosomal protein S2  50.6 
 
 
315 aa  268  7e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0657172  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  51.79 
 
 
256 aa  268  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000926335  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1921  30S ribosomal protein S2  54.02 
 
 
251 aa  266  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264289  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0273  30S ribosomal protein S2  53.85 
 
 
301 aa  266  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0957  ribosomal protein S2  52.14 
 
 
280 aa  267  2e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0080  ribosomal protein S2  55.11 
 
 
263 aa  267  2e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000155744  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06740  30S ribosomal protein S2  59.29 
 
 
285 aa  266  2.9999999999999995e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0485569  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  50.4 
 
 
271 aa  266  4e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000778728  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0840  30S ribosomal protein S2  55.2 
 
 
267 aa  265  5.999999999999999e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00899072  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0882  ribosomal protein S2  54.75 
 
 
236 aa  265  5.999999999999999e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>