More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0051 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0051  30S ribosomal protein S2  100 
 
 		 281 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0293672  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  52.73 
 
 		 255 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  52.27 
 
 		 255 aa  253  3e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  51.83 
 
 		 257 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1921  30S ribosomal protein S2  53.18 
 
 		 251 aa  252  6e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264289  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  50.67 
 
 		 244 aa  251  1e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185332  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1921  30S ribosomal protein S2  52.91 
 
 		 267 aa  250  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.7747799999999994e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1978  30S ribosomal protein S2  51.57 
 
 		 232 aa  249  4e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000338661  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1250  30S ribosomal protein S2  52.27 
 
 		 251 aa  249  5e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000302151  hitchhiker  0.0000384341 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  52.27 
 
 		 256 aa  249  5e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000926335  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2347  30S ribosomal protein S2  44.17 
 
 		 291 aa  245  6.999999999999999e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000118359  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1816  30S ribosomal protein S2  49.34 
 
 		 257 aa  244  9e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541904  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0578  ribosomal protein S2  51.97 
 
 		 243 aa  244  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  51.36 
 
 		 257 aa  243  3e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  49.59 
 
 		 262 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3650  30S ribosomal protein S2  50.22 
 
 		 233 aa  242  6e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3213  ribosomal protein S2  49.55 
 
 		 248 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321925  unclonable  0.000000000222969 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2733  ribosomal protein S2  48.98 
 
 		 271 aa  241  1e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36757e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  50 
 
 		 235 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0882  ribosomal protein S2  50.22 
 
 		 236 aa  241  1e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  50.22 
 
 		 233 aa  240  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000560898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3678  30S ribosomal protein S2  50.22 
 
 		 233 aa  240  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  50.22 
 
 		 233 aa  240  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  50.22 
 
 		 233 aa  240  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3839  30S ribosomal protein S2  50.22 
 
 		 233 aa  240  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.22661e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3965  30S ribosomal protein S2  50.22 
 
 		 233 aa  240  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  49.33 
 
 		 238 aa  240  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2479  30S ribosomal protein S2  50.22 
 
 		 233 aa  240  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000168536  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1318  30S ribosomal protein S2  50.22 
 
 		 233 aa  240  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000762012  hitchhiker  4.07369e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  50.22 
 
 		 233 aa  240  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000491144  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  51.12 
 
 		 271 aa  240  2e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000778728  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  50.22 
 
 		 235 aa  240  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3925  30S ribosomal protein S2  50.22 
 
 		 233 aa  240  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000230027  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0525  30S ribosomal protein S2  49.55 
 
 		 238 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000167283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  49.55 
 
 		 233 aa  239  4e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0295  30S ribosomal protein S2  51.56 
 
 		 343 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0422466  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0284  30S ribosomal protein S2  51.56 
 
 		 314 aa  238  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  50.45 
 
 		 301 aa  237  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000123477  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0474  30S ribosomal protein S2  52.89 
 
 		 304 aa  236  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536253  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0957  ribosomal protein S2  48.25 
 
 		 280 aa  236  2e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  47.53 
 
 		 262 aa  236  3e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  48.88 
 
 		 232 aa  236  3e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0166  30S ribosomal protein S2  48.43 
 
 		 260 aa  236  4e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000940316  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0273  30S ribosomal protein S2  51.57 
 
 		 301 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1520  ribosomal protein S2  49.11 
 
 		 289 aa  236  4e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0164  30S ribosomal protein S2  47.98 
 
 		 262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  47.53 
 
 		 255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000315088  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  48.46 
 
 		 235 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  47.53 
 
 		 255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000466794  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1848  ribosomal protein S2  50.22 
 
 		 288 aa  234  1.0000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0363359  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0742  ribosomal protein S2  48.44 
 
 		 281 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000127244  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2019  30S ribosomal protein S2  47.83 
 
 		 262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418742 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1238  30S ribosomal protein S2  48.44 
 
 		 259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000341164  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0213  ribosomal protein S2  48.2 
 
 		 257 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3709  30S ribosomal protein S2  48.44 
 
 		 244 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000237071  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0403  30S ribosomal protein S2  48.65 
 
 		 253 aa  232  4.0000000000000004e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.489561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1006  30S ribosomal protein S2  45.27 
 
 		 252 aa  232  4.0000000000000004e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000128012  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0442  30S ribosomal protein S2  47.27 
 
 		 252 aa  232  4.0000000000000004e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000051714  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3581  30S ribosomal protein S2  46.09 
 
 		 289 aa  232  5e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1161  30S ribosomal protein S2  46.5 
 
 		 300 aa  232  6e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0295  30S ribosomal protein S2  45.25 
 
 		 315 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0657172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0406  ribosomal protein S2  48.32 
 
 		 263 aa  231  1e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0551  30S ribosomal protein S2  49.1 
 
 		 262 aa  230  2e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000123187  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1230  30S ribosomal protein S2  49.77 
 
 		 279 aa  230  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133873  normal  0.0467572 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1810  30S ribosomal protein S2  49.11 
 
 		 253 aa  228  6e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.544221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1442  30S ribosomal protein S2  45.04 
 
 		 258 aa  228  6e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.333535  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1322  30S ribosomal protein S2  49.77 
 
 		 295 aa  228  7e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1954  30S ribosomal protein S2  48.21 
 
 		 233 aa  228  7e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000941341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1672  30S ribosomal protein S2  48.21 
 
 		 233 aa  228  7e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000487185  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2455  30S ribosomal protein S2  47.09 
 
 		 255 aa  228  9e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2680  30S ribosomal protein S2  47.51 
 
 		 246 aa  228  1e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000034456  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4827  30S ribosomal protein S2  43.46 
 
 		 349 aa  228  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.356192  normal  0.0170734 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0237  ribosomal protein S2  45.14 
 
 		 314 aa  227  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.245227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0424  30S ribosomal protein S2  47.09 
 
 		 256 aa  226  2e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0576373  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1262  30S ribosomal protein S2  47.75 
 
 		 289 aa  227  2e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000765471  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1203  30S ribosomal protein S2  47.98 
 
 		 246 aa  227  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159372  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3410  ribosomal protein S2  48.46 
 
 		 283 aa  226  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.7242  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0994  30S ribosomal protein S2  48.42 
 
 		 303 aa  226  3e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271344  normal  0.423917 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1316  30S ribosomal protein S2  48.65 
 
 		 263 aa  226  4e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.715024  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0080  ribosomal protein S2  48.88 
 
 		 263 aa  226  4e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000155744  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1484  ribosomal protein S2  47.11 
 
 		 326 aa  226  4e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.068355  normal  0.329281 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08130  SSU ribosomal protein S2P  48.65 
 
 		 250 aa  226  4e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000058431  unclonable  0.00000000192008 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1197  30S ribosomal protein S2  48.65 
 
 		 263 aa  226  4e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1778  ribosomal protein S2  48.89 
 
 		 274 aa  225  6e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0676  30S ribosomal protein S2  47.56 
 
 		 292 aa  225  7e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.560219  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2013  30S ribosomal protein S2  47.56 
 
 		 260 aa  225  7e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.515396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1094  30S ribosomal protein S2  48.65 
 
 		 261 aa  225  7e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.240704  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0547  30S ribosomal protein S2  48.2 
 
 		 263 aa  224  9e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1131  30S ribosomal protein S2  44.8 
 
 		 255 aa  224  9e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.439275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2010  30S ribosomal protein S2  47.09 
 
 		 252 aa  224  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.281351  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3450  30S ribosomal protein S2  42.23 
 
 		 355 aa  223  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0387566  normal  0.644555 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2353  30S ribosomal protein S2  47.3 
 
 		 255 aa  223  2e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00564969  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1648  30S ribosomal protein S2  47.53 
 
 		 251 aa  223  3e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2528  30S ribosomal protein S2  44.53 
 
 		 248 aa  222  4e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1004  ribosomal protein S2  44 
 
 		 283 aa  223  4e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.663705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5313  ribosomal protein S2  45.5 
 
 		 291 aa  222  4.9999999999999996e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1381  30S ribosomal protein S2  46.43 
 
 		 267 aa  222  4.9999999999999996e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1497  ribosomal protein S2  46.4 
 
 		 260 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1466  30S ribosomal protein S2  43.17 
 
 		 247 aa  222  7e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.162448  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2530  30S ribosomal protein S2  46.85 
 
 		 251 aa  221  8e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.963698  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>