112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_12355 on replicon NC_009357
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009357  OSTLU_12355  Ribosomal protein Sa, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  100 
 
 		 290 aa  600  1e-170  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.30496  normal  0.113443 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13682  predicted protein  65.89 
 
 		 220 aa  306  2.0000000000000002e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03172  40S ribosomal protein S0 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B8F8]  53.07 
 
 		 293 aa  284  1.0000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.51633 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04340  40S ribosomal protein S0, putative  62.75 
 
 		 292 aa  276  3e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.220661  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76999  ribosomal protein S0A  54.09 
 
 		 261 aa  247  1e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.937942  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1047  ribosomal protein S2  40.74 
 
 		 226 aa  162  7e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.269348  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2140  30S ribosomal protein S2  39.13 
 
 		 225 aa  149  5e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000050996  hitchhiker  0.0000667505 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2544  ribosomal protein S2  39.13 
 
 		 269 aa  147  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0274  30S ribosomal protein S2  39.43 
 
 		 214 aa  147  3e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1693  30S ribosomal protein S2  37.29 
 
 		 221 aa  147  3e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0219  30S ribosomal protein S2  37.29 
 
 		 221 aa  147  3e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.664063  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0907  30S ribosomal protein S2  36.72 
 
 		 220 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0430  ribosomal protein S2  38.04 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.748529  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1524  30S ribosomal protein S2  36.16 
 
 		 221 aa  144  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.524219  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1810  30S ribosomal protein S2  37.1 
 
 		 205 aa  143  4e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0478  30S ribosomal protein S2  40.24 
 
 		 206 aa  142  9e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1237  30S ribosomal protein S2  36.27 
 
 		 202 aa  142  9e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.161578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0759  30S ribosomal protein S2  35.59 
 
 		 220 aa  139  7e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.817066  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1826  30S ribosomal protein S2  39.64 
 
 		 268 aa  139  7e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2378  30S ribosomal protein S2  33.88 
 
 		 202 aa  136  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00361654  normal  0.260163 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2599  30S ribosomal protein S2  36.76 
 
 		 259 aa  135  6.0000000000000005e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.11317 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2514  30S ribosomal protein S2  35.71 
 
 		 267 aa  135  8e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1302  ribosomal protein S2  32.65 
 
 		 199 aa  135  8e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.29354  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2215  30S ribosomal protein S2  35.96 
 
 		 203 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1423  30S ribosomal protein S2  35.88 
 
 		 247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.017125 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0061  30S ribosomal protein S2  36.55 
 
 		 208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.924609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2393  30S ribosomal protein S2  37.5 
 
 		 214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000018478  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0027  30S ribosomal protein S2  34.52 
 
 		 208 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1104  30S ribosomal protein S2  34.01 
 
 		 207 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0058  30S ribosomal protein S2  32.08 
 
 		 206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0190126 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2892  30S ribosomal protein S2  34.2 
 
 		 202 aa  122  9e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00129354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0316  30S ribosomal protein S2  30.81 
 
 		 207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_2002  30S ribosomal protein S2  35.06 
 
 		 215 aa  115  6.9999999999999995e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1398  SSU ribosomal protein S2P  26.07 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000184086  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04251  40S ribosomal protein S2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06570)  27.18 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.474341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32903  predicted protein  23.65 
 
 		 421 aa  59.3  0.00000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.174506 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  24.3 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000315088  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  24.3 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000466794  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2479  30S ribosomal protein S2  24.88 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000168536  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0648  ribosomal protein S2  23.39 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.154128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1199  30S ribosomal protein S2  25.43 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0195465  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  24.42 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000560898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3678  30S ribosomal protein S2  24.42 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  24.42 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  24.42 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3965  30S ribosomal protein S2  24.42 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  24.42 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000491144  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3839  30S ribosomal protein S2  24.42 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.22661e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3925  30S ribosomal protein S2  24.88 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000230027  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1318  30S ribosomal protein S2  24.88 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000762012  hitchhiker  4.07369e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3650  30S ribosomal protein S2  24.2 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  24.11 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3194  ribosomal protein S2  24.66 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.758099  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  23.56 
 
 		 262 aa  55.5  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0975  SSU ribosomal protein S2P  23.74 
 
 		 260 aa  55.5  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4743  ribosomal protein S2  27 
 
 		 277 aa  53.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000226587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  23.61 
 
 		 235 aa  52.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0371  30S ribosomal protein S2  23.92 
 
 		 291 aa  50.8  0.00002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1610  30S ribosomal protein S2  26.09 
 
 		 254 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00150432  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0026  30S ribosomal protein S2  36.23 
 
 		 351 aa  51.2  0.00002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0442  30S ribosomal protein S2  23.85 
 
 		 252 aa  50.4  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000051714  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0957  ribosomal protein S2  24.07 
 
 		 280 aa  49.7  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1049  30S ribosomal protein S2  22.37 
 
 		 264 aa  49.3  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0905437  normal  0.331293 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  24.07 
 
 		 255 aa  49.3  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  24.22 
 
 		 255 aa  49.3  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0112  ribosomal protein S2  23.36 
 
 		 274 aa  48.9  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000610418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  24.27 
 
 		 256 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000926335  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf061  30S ribosomal protein S2  22.49 
 
 		 307 aa  48.9  0.0001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.838903  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1941  ribosomal protein S2  24.2 
 
 		 262 aa  48.5  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1780  30S ribosomal protein S2  23.25 
 
 		 243 aa  48.1  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000158872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1153  30S ribosomal protein S2  25.69 
 
 		 269 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  23.15 
 
 		 233 aa  47.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2347  30S ribosomal protein S2  22.69 
 
 		 291 aa  47.4  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000118359  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3709  30S ribosomal protein S2  22.22 
 
 		 244 aa  46.6  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000237071  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1954  30S ribosomal protein S2  23.29 
 
 		 233 aa  46.6  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000941341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1672  30S ribosomal protein S2  23.29 
 
 		 233 aa  46.6  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000487185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  23.15 
 
 		 257 aa  46.6  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1966  ribosomal protein S2  32.35 
 
 		 251 aa  46.6  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0809  ribosomal protein S2  23.87 
 
 		 272 aa  46.6  0.0005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  23.61 
 
 		 271 aa  46.2  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000778728  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2019  30S ribosomal protein S2  23.36 
 
 		 262 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418742 
 
 
-
 
NC_002936  DET0377  30S ribosomal protein S2  24.32 
 
 		 245 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000247942  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl561  30S ribosomal protein S2  22.77 
 
 		 283 aa  45.8  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1250  30S ribosomal protein S2  24.07 
 
 		 251 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000302151  hitchhiker  0.0000384341 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  21.59 
 
 		 232 aa  45.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0403  30S ribosomal protein S2  23.29 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.000000078779  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0284  30S ribosomal protein S2  23.01 
 
 		 314 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1520  ribosomal protein S2  23.39 
 
 		 289 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1832  30S ribosomal protein S2  30.88 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000152831  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2455  30S ribosomal protein S2  22.71 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3726  30S ribosomal protein S2  22.77 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1006  30S ribosomal protein S2  23.29 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000128012  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_321  ribosomal protein S2  23.53 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000206427  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0295  30S ribosomal protein S2  23.01 
 
 		 343 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0422466  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  21.92 
 
 		 238 aa  43.9  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0882  ribosomal protein S2  21.76 
 
 		 236 aa  43.9  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  21.66 
 
 		 235 aa  44.3  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0123  30S ribosomal protein S2  21.63 
 
 		 262 aa  43.9  0.003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.839635  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0359  30S ribosomal protein S2  23.08 
 
 		 245 aa  43.9  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000354346  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  21.96 
 
 		 262 aa  43.5  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000550841  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>