More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl561 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl561  30S ribosomal protein S2  100 
 
 		 283 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0371  30S ribosomal protein S2  73.03 
 
 		 291 aa  371  1e-102  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  52.07 
 
 		 235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  49.33 
 
 		 233 aa  232  4.0000000000000004e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  51.61 
 
 		 235 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3839  30S ribosomal protein S2  50.23 
 
 		 233 aa  229  5e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.22661e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  50.23 
 
 		 233 aa  229  5e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000560898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3678  30S ribosomal protein S2  50.23 
 
 		 233 aa  229  5e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  50.23 
 
 		 233 aa  229  5e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  50.23 
 
 		 233 aa  229  5e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  50.23 
 
 		 233 aa  229  5e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000491144  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3965  30S ribosomal protein S2  50.23 
 
 		 233 aa  229  5e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0213  ribosomal protein S2  48.15 
 
 		 257 aa  229  5e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  47.5 
 
 		 244 aa  228  8e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185332  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  47.51 
 
 		 235 aa  228  9e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2479  30S ribosomal protein S2  50.23 
 
 		 233 aa  228  9e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000168536  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1318  30S ribosomal protein S2  49.54 
 
 		 233 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000762012  hitchhiker  4.07369e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3925  30S ribosomal protein S2  49.54 
 
 		 233 aa  228  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000230027  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3650  30S ribosomal protein S2  49.08 
 
 		 233 aa  227  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  46.67 
 
 		 257 aa  225  6e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0882  ribosomal protein S2  48.42 
 
 		 236 aa  225  8e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1160  ribosomal protein S2  47.96 
 
 		 250 aa  224  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1444  ribosomal protein S2  47.96 
 
 		 250 aa  224  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.152019  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1978  30S ribosomal protein S2  47.06 
 
 		 232 aa  223  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000338661  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2530  30S ribosomal protein S2  48.13 
 
 		 251 aa  223  3e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.963698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3709  30S ribosomal protein S2  47.96 
 
 		 244 aa  223  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000237071  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1921  30S ribosomal protein S2  46.49 
 
 		 267 aa  223  4e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.7747799999999994e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3213  ribosomal protein S2  47.47 
 
 		 248 aa  222  4e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321925  unclonable  0.000000000222969 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  47.11 
 
 		 255 aa  222  4e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  47.11 
 
 		 255 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0080  ribosomal protein S2  49.11 
 
 		 263 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000155744  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1153  30S ribosomal protein S2  47.14 
 
 		 269 aa  222  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1380  30S ribosomal protein S2  47.58 
 
 		 288 aa  221  7e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272546  normal  0.0375782 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2427  30S ribosomal protein S2  49.13 
 
 		 243 aa  221  8e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0204898  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3581  30S ribosomal protein S2  45.71 
 
 		 289 aa  221  9e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  47.51 
 
 		 262 aa  221  9.999999999999999e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1250  30S ribosomal protein S2  46.7 
 
 		 251 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000302151  hitchhiker  0.0000384341 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5313  ribosomal protein S2  46.76 
 
 		 291 aa  221  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08130  SSU ribosomal protein S2P  48.89 
 
 		 250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000058431  unclonable  0.00000000192008 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0742  ribosomal protein S2  44.34 
 
 		 281 aa  219  3e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000127244  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1161  30S ribosomal protein S2  47.96 
 
 		 300 aa  219  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  47.51 
 
 		 271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000778728  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1921  30S ribosomal protein S2  46.35 
 
 		 251 aa  219  5e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264289  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0578  ribosomal protein S2  48.42 
 
 		 243 aa  218  6e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1238  30S ribosomal protein S2  47.06 
 
 		 259 aa  218  6e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000341164  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002746  SSU ribosomal protein S2p (SAe)  46.86 
 
 		 242 aa  218  7.999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0133087  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  46.15 
 
 		 232 aa  218  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2061  30S ribosomal protein S2  44.69 
 
 		 265 aa  218  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.4963 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  44.1 
 
 		 238 aa  218  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4961  30S ribosomal protein S2  46.33 
 
 		 255 aa  218  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1974  30S ribosomal protein S2  46.61 
 
 		 284 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.34334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1993  30S ribosomal protein S2  46.61 
 
 		 284 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  46.29 
 
 		 256 aa  218  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000926335  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2039  30S ribosomal protein S2  46.61 
 
 		 284 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.07144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2209  30S ribosomal protein S2  46.61 
 
 		 273 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.092398  normal  0.16392 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3991  ribosomal protein S2  48.42 
 
 		 316 aa  217  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03237  30S ribosomal protein S2  46.86 
 
 		 253 aa  217  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  45.98 
 
 		 301 aa  216  4e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000123477  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4883  30S ribosomal protein S2  45.13 
 
 		 264 aa  216  4e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4133  30S ribosomal protein S2  45.7 
 
 		 279 aa  215  5e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.549369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1802  30S ribosomal protein S2  45.78 
 
 		 259 aa  215  5.9999999999999996e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0866848  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1668  ribosomal protein S2  46.22 
 
 		 282 aa  215  7e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.688416  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  45.7 
 
 		 255 aa  215  7e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000315088  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  45.7 
 
 		 255 aa  215  7e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000466794  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0525  30S ribosomal protein S2  44.34 
 
 		 238 aa  215  8e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000167283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0442  30S ribosomal protein S2  44.58 
 
 		 252 aa  215  8e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000051714  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1103  ribosomal protein S2  46.22 
 
 		 278 aa  215  8e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  unclonable  9.34188e-16 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3113  ribosomal protein S2  47.51 
 
 		 296 aa  215  8e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000518709  normal  0.0242876 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1542  SSU ribosomal protein S2P  50 
 
 		 275 aa  215  8e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2507  ribosomal protein S2  47.75 
 
 		 353 aa  214  9e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.282743  normal  0.375385 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  46.15 
 
 		 262 aa  214  9.999999999999999e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1851  30S ribosomal protein S2  48.1 
 
 		 242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165959  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1778  ribosomal protein S2  45.25 
 
 		 274 aa  213  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12270  SSU ribosomal protein S2P  45.74 
 
 		 294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000736157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0164  30S ribosomal protein S2  46.61 
 
 		 262 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2578  30S ribosomal protein S2  44.69 
 
 		 268 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0166  30S ribosomal protein S2  46.61 
 
 		 260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000940316  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3528  30S ribosomal protein S2  44.69 
 
 		 268 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.421739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1199  30S ribosomal protein S2  46.15 
 
 		 258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0195465  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  44.89 
 
 		 257 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1272  ribosomal protein S2  49.33 
 
 		 244 aa  213  3.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120741  normal  0.39597 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1006  30S ribosomal protein S2  46.15 
 
 		 252 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000128012  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0295  30S ribosomal protein S2  47.06 
 
 		 315 aa  212  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0657172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2104  ribosomal protein S2  45.78 
 
 		 272 aa  212  7e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2805  30S ribosomal protein S2  46.9 
 
 		 313 aa  212  7e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00564496  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1249  ribosomal protein S2  45.7 
 
 		 243 aa  211  9e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2455  30S ribosomal protein S2  46.61 
 
 		 255 aa  211  9e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0705  ribosomal protein S2  46.49 
 
 		 250 aa  211  1e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000421001  unclonable  0.0000000254138 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0957  ribosomal protein S2  48.85 
 
 		 280 aa  211  1e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0648  ribosomal protein S2  44.6 
 
 		 324 aa  211  1e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.154128  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0237  ribosomal protein S2  47.75 
 
 		 314 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.245227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12904  30S ribosomal protein S2  47.96 
 
 		 287 aa  211  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0383521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1266  30S ribosomal protein S2  45.95 
 
 		 267 aa  211  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.357343 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1442  30S ribosomal protein S2  45.33 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.333535  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0994  30S ribosomal protein S2  47.75 
 
 		 303 aa  210  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271344  normal  0.423917 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2223  30S ribosomal protein S2  44.69 
 
 		 361 aa  210  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0157  30S ribosomal protein S2  44.34 
 
 		 230 aa  210  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4236  30S ribosomal protein S2  44.14 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000647656 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1247  30S ribosomal protein S2  45.25 
 
 		 239 aa  210  2e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0978856  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1586  30S ribosomal protein S2  44.44 
 
 		 262 aa  210  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.551794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>