More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2805 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2805  30S ribosomal protein S2  100 
 
 		 313 aa  630  1e-180  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00564496  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1380  30S ribosomal protein S2  75.71 
 
 		 288 aa  402  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272546  normal  0.0375782 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3196  ribosomal protein S2  72.02 
 
 		 253 aa  392  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2436  30S ribosomal protein S2  70.28 
 
 		 334 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1859  30S ribosomal protein S2  63.74 
 
 		 332 aa  374  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.113122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4517  30S ribosomal protein S2  69.48 
 
 		 330 aa  375  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1694  30S ribosomal protein S2  64.47 
 
 		 332 aa  377  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4827  30S ribosomal protein S2  62.11 
 
 		 349 aa  371  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.356192  normal  0.0170734 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1381  30S ribosomal protein S2  67.05 
 
 		 267 aa  371  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0583  30S ribosomal protein S2  69.88 
 
 		 271 aa  370  1e-101  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0651099  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1162  30S ribosomal protein S2  68.27 
 
 		 256 aa  368  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.278359  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2029  30S ribosomal protein S2  69.08 
 
 		 256 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.306741  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1698  30S ribosomal protein S2  64.56 
 
 		 349 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1776  30S ribosomal protein S2  67.87 
 
 		 255 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.890792 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1583  30S ribosomal protein S2  67.87 
 
 		 255 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1131  30S ribosomal protein S2  67.47 
 
 		 255 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.439275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2223  30S ribosomal protein S2  68.57 
 
 		 361 aa  364  1e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1119  30S ribosomal protein S2  67.61 
 
 		 254 aa  363  1e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4439  30S ribosomal protein S2  66.26 
 
 		 334 aa  359  3e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000842833 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9516  30S ribosomal protein S2  69.58 
 
 		 307 aa  359  4e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2347  30S ribosomal protein S2  62.81 
 
 		 355 aa  359  4e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.473707 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2073  30S ribosomal protein S2  62.81 
 
 		 355 aa  359  4e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.193389  normal  0.160852 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3450  30S ribosomal protein S2  61.43 
 
 		 355 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0387566  normal  0.644555 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2828  30S ribosomal protein S2  69.26 
 
 		 331 aa  354  8.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00696653  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1694  30S ribosomal protein S2  63.03 
 
 		 349 aa  354  1e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.754731 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2857  30S ribosomal protein S2  67.47 
 
 		 331 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.32716  normal  0.180299 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2528  30S ribosomal protein S2  67.77 
 
 		 248 aa  353  2e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3268  30S ribosomal protein S2  67.47 
 
 		 331 aa  350  1e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138284  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2033  30S ribosomal protein S2  62.68 
 
 		 354 aa  348  8e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0655537 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2306  30S ribosomal protein S2  66.25 
 
 		 276 aa  344  1e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3726  30S ribosomal protein S2  63.31 
 
 		 261 aa  343  2.9999999999999997e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1960  30S ribosomal protein S2  58.48 
 
 		 277 aa  341  9e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1548  30S ribosomal protein S2  64.85 
 
 		 259 aa  340  1e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.403357 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1586  30S ribosomal protein S2  63.56 
 
 		 262 aa  340  2e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.551794  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2860  30S ribosomal protein S2  61.85 
 
 		 253 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1433  30S ribosomal protein S2  61.85 
 
 		 251 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0086997 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1694  30S ribosomal protein S2  64.02 
 
 		 256 aa  339  5e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.559566  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0460  30S ribosomal protein S2  62.8 
 
 		 250 aa  337  9.999999999999999e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.968608 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1510  30S ribosomal protein S2  61.85 
 
 		 274 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.0221668 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1210  30S ribosomal protein S2  64.85 
 
 		 256 aa  332  3e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3347  30S ribosomal protein S2  63.33 
 
 		 260 aa  332  7.000000000000001e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.259933  normal  0.727871 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1369  30S ribosomal protein S2  63.45 
 
 		 251 aa  328  6e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.512665  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0532  30S ribosomal protein S2  55.7 
 
 		 282 aa  285  5e-76  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00675401  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0517  30S ribosomal protein S2  54.04 
 
 		 291 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.285229  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0514  30S ribosomal protein S2  52.74 
 
 		 288 aa  280  2e-74  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1840  SSU ribosomal protein S2P  55 
 
 		 262 aa  280  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1553  ribosomal protein S2  54.91 
 
 		 242 aa  278  9e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10120  SSU ribosomal protein S2P  51.62 
 
 		 318 aa  277  1e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2507  ribosomal protein S2  57.64 
 
 		 353 aa  278  1e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.282743  normal  0.375385 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23610  SSU ribosomal protein S2P  57.02 
 
 		 317 aa  276  3e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.699441  normal  0.141313 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1180  ribosomal protein S2  58.7 
 
 		 317 aa  275  5e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.920095  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4133  30S ribosomal protein S2  55.84 
 
 		 279 aa  275  5e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.549369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1230  30S ribosomal protein S2  53.7 
 
 		 279 aa  275  7e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133873  normal  0.0467572 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1160  ribosomal protein S2  57.08 
 
 		 250 aa  275  8e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1444  ribosomal protein S2  57.08 
 
 		 250 aa  275  8e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.152019  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1249  ribosomal protein S2  57.59 
 
 		 243 aa  275  9e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3113  ribosomal protein S2  56.95 
 
 		 296 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000518709  normal  0.0242876 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12904  30S ribosomal protein S2  58.3 
 
 		 287 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0383521  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1668  ribosomal protein S2  50.52 
 
 		 282 aa  273  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.688416  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1322  30S ribosomal protein S2  52.65 
 
 		 295 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1004  ribosomal protein S2  58.48 
 
 		 283 aa  273  2.0000000000000002e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.663705  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0237  ribosomal protein S2  54.9 
 
 		 314 aa  272  4.0000000000000004e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.245227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  56.07 
 
 		 255 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  55.36 
 
 		 301 aa  272  5.000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000123477  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3410  ribosomal protein S2  56.83 
 
 		 283 aa  272  6e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.7242  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1778  ribosomal protein S2  50.19 
 
 		 274 aa  272  7e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1484  ribosomal protein S2  59.28 
 
 		 326 aa  272  7e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.068355  normal  0.329281 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  56.07 
 
 		 255 aa  271  7e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2198  30S ribosomal protein S2  47 
 
 		 297 aa  271  8.000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.441521 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1993  30S ribosomal protein S2  56.05 
 
 		 284 aa  271  8.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1974  30S ribosomal protein S2  56.05 
 
 		 284 aa  271  8.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.34334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2039  30S ribosomal protein S2  56.05 
 
 		 284 aa  271  8.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.07144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2209  30S ribosomal protein S2  56.56 
 
 		 273 aa  271  9e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.092398  normal  0.16392 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0941  30S ribosomal protein S2  57.27 
 
 		 241 aa  271  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0031234  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3360  30S ribosomal protein S2  57.27 
 
 		 241 aa  271  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.720807  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1272  ribosomal protein S2  55.88 
 
 		 244 aa  270  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120741  normal  0.39597 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  57.53 
 
 		 235 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1088  30S ribosomal protein S2  57.14 
 
 		 239 aa  270  2e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0768857  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3165  30S ribosomal protein S2  57.27 
 
 		 241 aa  271  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2981  30S ribosomal protein S2  57.27 
 
 		 241 aa  270  2e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.44963  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2104  ribosomal protein S2  53.1 
 
 		 272 aa  270  2.9999999999999997e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2108  30S ribosomal protein S2  55.84 
 
 		 254 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  57.02 
 
 		 233 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0676  30S ribosomal protein S2  57.21 
 
 		 292 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.560219  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1250  30S ribosomal protein S2  56.52 
 
 		 251 aa  268  8e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000302151  hitchhiker  0.0000384341 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0742  ribosomal protein S2  55.56 
 
 		 281 aa  268  8e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000127244  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1529  ribosomal protein S2  54.29 
 
 		 344 aa  268  8.999999999999999e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0238  30S ribosomal protein S2  56.36 
 
 		 241 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.593758 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1266  30S ribosomal protein S2  56.96 
 
 		 267 aa  267  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.357343 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0254  30S ribosomal protein S2  56.36 
 
 		 241 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.965891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0256  30S ribosomal protein S2  56.36 
 
 		 241 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.424632  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  53.67 
 
 		 257 aa  268  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0238  30S ribosomal protein S2  56.36 
 
 		 241 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0563  SSU ribosomal protein S2P  54.95 
 
 		 246 aa  268  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0241  30S ribosomal protein S2  56.36 
 
 		 241 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3991  ribosomal protein S2  50.86 
 
 		 316 aa  267  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11190  SSU ribosomal protein S2P  56.7 
 
 		 310 aa  267  2e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.025157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1133  30S ribosomal protein S2  56.76 
 
 		 260 aa  267  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38990  30S ribosomal protein S2  57.14 
 
 		 246 aa  267  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3435  30S ribosomal protein S2  55.45 
 
 		 241 aa  267  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0042148  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>