More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1133 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1133  30S ribosomal protein S2  100 
 
 		 260 aa  537  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2108  30S ribosomal protein S2  83 
 
 		 254 aa  437  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2924  30S ribosomal protein S2  84.23 
 
 		 271 aa  431  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.240537 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0346  30S ribosomal protein S2  79.92 
 
 		 258 aa  396  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.564303  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2376  ribosomal protein S2  72.44 
 
 		 261 aa  387  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1941  ribosomal protein S2  68.08 
 
 		 262 aa  382  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1921  30S ribosomal protein S2  59.84 
 
 		 267 aa  319  3e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.7747799999999994e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  57.81 
 
 		 257 aa  319  3e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0295  30S ribosomal protein S2  60.64 
 
 		 315 aa  315  5e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0657172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0295  30S ribosomal protein S2  63.23 
 
 		 343 aa  311  4.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0422466  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0284  30S ribosomal protein S2  63.23 
 
 		 314 aa  311  6.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0474  30S ribosomal protein S2  59.04 
 
 		 304 aa  310  1e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536253  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  56.03 
 
 		 257 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1778  ribosomal protein S2  55.73 
 
 		 274 aa  308  8e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0273  30S ribosomal protein S2  63.35 
 
 		 301 aa  307  9e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5313  ribosomal protein S2  58.72 
 
 		 291 aa  307  1.0000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  58.94 
 
 		 262 aa  305  4.0000000000000004e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  60.09 
 
 		 255 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  59.65 
 
 		 256 aa  303  1.0000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000926335  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  60.09 
 
 		 255 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1250  30S ribosomal protein S2  60.96 
 
 		 251 aa  302  3.0000000000000004e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000302151  hitchhiker  0.0000384341 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0957  ribosomal protein S2  60.71 
 
 		 280 aa  302  4.0000000000000003e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1921  30S ribosomal protein S2  59.65 
 
 		 251 aa  300  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264289  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  62.66 
 
 		 233 aa  300  1e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  63.56 
 
 		 238 aa  300  2e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  60 
 
 		 235 aa  296  3e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1978  30S ribosomal protein S2  63.11 
 
 		 232 aa  294  9e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000338661  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  53.76 
 
 		 301 aa  293  1e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000123477  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1520  ribosomal protein S2  57.83 
 
 		 289 aa  293  3e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  59.11 
 
 		 262 aa  292  4e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3925  30S ribosomal protein S2  59.56 
 
 		 233 aa  292  4e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000230027  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3650  30S ribosomal protein S2  60.54 
 
 		 233 aa  292  4e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0742  ribosomal protein S2  56.63 
 
 		 281 aa  292  4e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000127244  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1318  30S ribosomal protein S2  59.56 
 
 		 233 aa  292  4e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000762012  hitchhiker  4.07369e-17 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  59.56 
 
 		 235 aa  292  4e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  59.38 
 
 		 235 aa  291  6e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  59.56 
 
 		 233 aa  291  8e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000491144  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  59.56 
 
 		 233 aa  291  8e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000560898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3678  30S ribosomal protein S2  59.56 
 
 		 233 aa  291  8e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  59.56 
 
 		 233 aa  291  8e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  59.56 
 
 		 233 aa  291  8e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3839  30S ribosomal protein S2  59.56 
 
 		 233 aa  291  8e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.22661e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3965  30S ribosomal protein S2  59.56 
 
 		 233 aa  291  8e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2479  30S ribosomal protein S2  59.11 
 
 		 233 aa  291  9e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000168536  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  57.14 
 
 		 262 aa  289  2e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000550841  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4961  30S ribosomal protein S2  56.68 
 
 		 255 aa  288  6e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3709  30S ribosomal protein S2  60 
 
 		 244 aa  287  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000237071  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  60.44 
 
 		 232 aa  287  1e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2347  30S ribosomal protein S2  58.22 
 
 		 291 aa  287  2e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000118359  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1006  30S ribosomal protein S2  53.97 
 
 		 252 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000128012  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  53.85 
 
 		 271 aa  285  4e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000778728  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1816  30S ribosomal protein S2  54.86 
 
 		 257 aa  285  4e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541904  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  56.89 
 
 		 255 aa  285  5e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000466794  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1238  30S ribosomal protein S2  57.02 
 
 		 259 aa  285  5e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000341164  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  56.89 
 
 		 255 aa  285  5e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000315088  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  57.6 
 
 		 244 aa  285  5.999999999999999e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185332  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1859  30S ribosomal protein S2  54.18 
 
 		 332 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.113122 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3213  ribosomal protein S2  58.82 
 
 		 248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321925  unclonable  0.000000000222969 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4517  30S ribosomal protein S2  59.55 
 
 		 330 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0882  ribosomal protein S2  58.67 
 
 		 236 aa  282  4.0000000000000003e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1262  30S ribosomal protein S2  51.97 
 
 		 289 aa  281  5.000000000000001e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000765471  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0442  30S ribosomal protein S2  53.88 
 
 		 252 aa  281  6.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000051714  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1180  ribosomal protein S2  54.15 
 
 		 317 aa  281  7.000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.920095  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1694  30S ribosomal protein S2  53.39 
 
 		 332 aa  280  1e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2680  30S ribosomal protein S2  51.63 
 
 		 246 aa  279  3e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000034456  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1004  ribosomal protein S2  55.46 
 
 		 283 aa  279  3e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.663705  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1484  ribosomal protein S2  53.6 
 
 		 326 aa  279  4e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.068355  normal  0.329281 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23610  SSU ribosomal protein S2P  54.98 
 
 		 317 aa  279  4e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.699441  normal  0.141313 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2436  30S ribosomal protein S2  59.09 
 
 		 334 aa  278  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0926  30S ribosomal protein S2  58.67 
 
 		 257 aa  278  6e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148572  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2029  30S ribosomal protein S2  54.98 
 
 		 256 aa  277  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.306741  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1583  30S ribosomal protein S2  53.52 
 
 		 255 aa  277  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1776  30S ribosomal protein S2  53.52 
 
 		 255 aa  276  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.890792 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1381  30S ribosomal protein S2  52.87 
 
 		 267 aa  276  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1863  30S ribosomal protein S2  59.11 
 
 		 248 aa  276  2e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.454251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1199  30S ribosomal protein S2  56.25 
 
 		 258 aa  276  2e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0195465  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11190  SSU ribosomal protein S2P  53.5 
 
 		 310 aa  276  3e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.025157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0648  ribosomal protein S2  51.81 
 
 		 324 aa  276  3e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.154128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4133  30S ribosomal protein S2  51.92 
 
 		 279 aa  275  4e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.549369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2104  ribosomal protein S2  50.56 
 
 		 272 aa  275  6e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1266  30S ribosomal protein S2  54.29 
 
 		 267 aa  275  7e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.357343 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1119  30S ribosomal protein S2  53.33 
 
 		 254 aa  275  7e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1380  30S ribosomal protein S2  58.82 
 
 		 288 aa  275  7e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272546  normal  0.0375782 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2019  30S ribosomal protein S2  57.58 
 
 		 262 aa  274  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418742 
 
 
-
 
NC_004310  BR1162  30S ribosomal protein S2  53.78 
 
 		 256 aa  274  1.0000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.278359  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4439  30S ribosomal protein S2  60.09 
 
 		 334 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000842833 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1668  ribosomal protein S2  50.55 
 
 		 282 aa  273  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.688416  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1249  ribosomal protein S2  52.74 
 
 		 243 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2507  ribosomal protein S2  56.77 
 
 		 353 aa  273  2.0000000000000002e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.282743  normal  0.375385 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1840  SSU ribosomal protein S2P  51.54 
 
 		 262 aa  273  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3165  30S ribosomal protein S2  53.09 
 
 		 241 aa  273  3e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0551  30S ribosomal protein S2  50.79 
 
 		 262 aa  273  3e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000123187  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1230  30S ribosomal protein S2  56 
 
 		 279 aa  273  3e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133873  normal  0.0467572 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1415  ribosomal protein S2  54.2 
 
 		 311 aa  272  3e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2223  30S ribosomal protein S2  58.64 
 
 		 361 aa  272  4.0000000000000004e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1442  30S ribosomal protein S2  51.19 
 
 		 258 aa  272  5.000000000000001e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.333535  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3243  SSU ribosomal protein S2P  51.33 
 
 		 307 aa  271  5.000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.191936  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0808  ribosomal protein S2  57.59 
 
 		 269 aa  271  6e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.15468  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12904  30S ribosomal protein S2  56.7 
 
 		 287 aa  271  7e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0383521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0578  ribosomal protein S2  58.48 
 
 		 243 aa  271  7e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>