More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0583 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0583  30S ribosomal protein S2  100 
 
 
271 aa  556  1e-158  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0651099  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2029  30S ribosomal protein S2  86.4 
 
 
256 aa  461  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.306741  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1162  30S ribosomal protein S2  85.2 
 
 
256 aa  457  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.278359  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1119  30S ribosomal protein S2  84.27 
 
 
254 aa  451  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1131  30S ribosomal protein S2  81.82 
 
 
255 aa  444  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.439275  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1381  30S ribosomal protein S2  75.19 
 
 
267 aa  436  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1776  30S ribosomal protein S2  79.45 
 
 
255 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.890792 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1583  30S ribosomal protein S2  79.05 
 
 
255 aa  431  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2528  30S ribosomal protein S2  79.67 
 
 
248 aa  418  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9516  30S ribosomal protein S2  76.32 
 
 
307 aa  416  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1859  30S ribosomal protein S2  72.33 
 
 
332 aa  391  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.113122 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2223  30S ribosomal protein S2  75.61 
 
 
361 aa  393  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4827  30S ribosomal protein S2  68.16 
 
 
349 aa  393  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.356192  normal  0.0170734 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4517  30S ribosomal protein S2  73.2 
 
 
330 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1698  30S ribosomal protein S2  68.68 
 
 
349 aa  388  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1694  30S ribosomal protein S2  71.54 
 
 
332 aa  386  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4439  30S ribosomal protein S2  68.85 
 
 
334 aa  387  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000842833 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2436  30S ribosomal protein S2  70.75 
 
 
334 aa  381  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3196  ribosomal protein S2  71.95 
 
 
253 aa  382  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2347  30S ribosomal protein S2  69.08 
 
 
355 aa  378  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.473707 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2073  30S ribosomal protein S2  69.08 
 
 
355 aa  378  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.193389  normal  0.160852 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1380  30S ribosomal protein S2  70.8 
 
 
288 aa  374  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272546  normal  0.0375782 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3450  30S ribosomal protein S2  67.43 
 
 
355 aa  377  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0387566  normal  0.644555 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2828  30S ribosomal protein S2  72.87 
 
 
331 aa  371  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00696653  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1694  30S ribosomal protein S2  69.26 
 
 
349 aa  373  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.754731 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3726  30S ribosomal protein S2  69.04 
 
 
261 aa  371  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3268  30S ribosomal protein S2  71.15 
 
 
331 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138284  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2860  30S ribosomal protein S2  66.4 
 
 
253 aa  368  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1433  30S ribosomal protein S2  66.4 
 
 
251 aa  368  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0086997 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1510  30S ribosomal protein S2  66.4 
 
 
274 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.0221668 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2033  30S ribosomal protein S2  68.3 
 
 
354 aa  367  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0655537 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2857  30S ribosomal protein S2  70.75 
 
 
331 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.32716  normal  0.180299 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2805  30S ribosomal protein S2  69.88 
 
 
313 aa  366  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00564496  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1548  30S ribosomal protein S2  69.87 
 
 
259 aa  363  2e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.403357 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1210  30S ribosomal protein S2  71.13 
 
 
256 aa  360  1e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2306  30S ribosomal protein S2  67.5 
 
 
276 aa  356  2.9999999999999997e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1586  30S ribosomal protein S2  64.37 
 
 
262 aa  342  5e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.551794  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3347  30S ribosomal protein S2  65.45 
 
 
260 aa  338  5.9999999999999996e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.259933  normal  0.727871 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1694  30S ribosomal protein S2  62.15 
 
 
256 aa  336  1.9999999999999998e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.559566  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1960  30S ribosomal protein S2  58.58 
 
 
277 aa  326  2.0000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0460  30S ribosomal protein S2  61.85 
 
 
250 aa  324  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.968608 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1369  30S ribosomal protein S2  62.61 
 
 
251 aa  311  5.999999999999999e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.512665  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0517  30S ribosomal protein S2  57.45 
 
 
291 aa  291  1e-77  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.285229  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0532  30S ribosomal protein S2  58.23 
 
 
282 aa  290  2e-77  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00675401  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0514  30S ribosomal protein S2  57.02 
 
 
288 aa  289  3e-77  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0295  30S ribosomal protein S2  60.27 
 
 
315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0657172  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  52.29 
 
 
257 aa  277  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0295  30S ribosomal protein S2  58.3 
 
 
343 aa  276  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0422466  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0284  30S ribosomal protein S2  58.3 
 
 
314 aa  276  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1230  30S ribosomal protein S2  53.23 
 
 
279 aa  275  4e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133873  normal  0.0467572 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1553  ribosomal protein S2  54.59 
 
 
242 aa  275  5e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  57.14 
 
 
255 aa  275  5e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  57.14 
 
 
255 aa  275  7e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1444  ribosomal protein S2  56.9 
 
 
250 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.152019  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0273  30S ribosomal protein S2  58.11 
 
 
301 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1322  30S ribosomal protein S2  52.82 
 
 
295 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1160  ribosomal protein S2  56.9 
 
 
250 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1250  30S ribosomal protein S2  57.59 
 
 
251 aa  273  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000302151  hitchhiker  0.0000384341 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3410  ribosomal protein S2  54.11 
 
 
283 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.7242  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1840  SSU ribosomal protein S2P  54.22 
 
 
262 aa  272  5.000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1921  30S ribosomal protein S2  54.51 
 
 
267 aa  270  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.7747799999999994e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  54.22 
 
 
301 aa  271  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000123477  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0994  30S ribosomal protein S2  51.41 
 
 
303 aa  270  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271344  normal  0.423917 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1921  30S ribosomal protein S2  57.14 
 
 
251 aa  268  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264289  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  55.8 
 
 
256 aa  267  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000926335  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2376  ribosomal protein S2  54.63 
 
 
261 aa  266  2e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0237  ribosomal protein S2  54.39 
 
 
314 aa  267  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.245227  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2507  ribosomal protein S2  51.03 
 
 
353 aa  266  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.282743  normal  0.375385 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1133  30S ribosomal protein S2  56.44 
 
 
260 aa  267  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23610  SSU ribosomal protein S2P  52.23 
 
 
317 aa  266  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.699441  normal  0.141313 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1004  ribosomal protein S2  53.71 
 
 
283 aa  266  2e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.663705  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1778  ribosomal protein S2  51.5 
 
 
274 aa  267  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1484  ribosomal protein S2  51.82 
 
 
326 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.068355  normal  0.329281 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3113  ribosomal protein S2  53.48 
 
 
296 aa  266  4e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000518709  normal  0.0242876 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0676  30S ribosomal protein S2  52.97 
 
 
292 aa  266  4e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.560219  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1668  ribosomal protein S2  51.02 
 
 
282 aa  265  7e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.688416  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  53.88 
 
 
257 aa  265  8e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3243  SSU ribosomal protein S2P  49.19 
 
 
307 aa  264  1e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.191936  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3581  30S ribosomal protein S2  52.02 
 
 
289 aa  263  2e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0948  ribosomal protein S2  53.12 
 
 
298 aa  263  2e-69  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.405377  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0577  30S ribosomal protein S2  52.5 
 
 
294 aa  263  2e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000845501  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12904  30S ribosomal protein S2  52.65 
 
 
287 aa  262  4e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0383521  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1529  ribosomal protein S2  50.78 
 
 
344 aa  262  4e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1161  30S ribosomal protein S2  53.74 
 
 
300 aa  262  4e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2108  30S ribosomal protein S2  52.89 
 
 
254 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1338  30S ribosomal protein S2  54.95 
 
 
250 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.21078  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1006  30S ribosomal protein S2  52.36 
 
 
252 aa  262  6e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000128012  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1249  ribosomal protein S2  54.42 
 
 
243 aa  261  6e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5911  ribosomal protein S2  50.4 
 
 
304 aa  261  6.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00672322  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5313  ribosomal protein S2  55.61 
 
 
291 aa  259  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1682  30S ribosomal protein S2  54.95 
 
 
250 aa  259  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00674019  normal  0.113442 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1520  ribosomal protein S2  54.91 
 
 
289 aa  259  3e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1530  SSU ribosomal protein S2P  55.91 
 
 
249 aa  259  4e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000131876  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1851  30S ribosomal protein S2  54.91 
 
 
242 aa  259  4e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165959  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1180  ribosomal protein S2  51.77 
 
 
317 aa  259  5.0000000000000005e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.920095  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2924  30S ribosomal protein S2  52.81 
 
 
271 aa  258  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.240537 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2104  ribosomal protein S2  50.61 
 
 
272 aa  258  5.0000000000000005e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3360  30S ribosomal protein S2  55.08 
 
 
241 aa  258  6e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.720807  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11190  SSU ribosomal protein S2P  53.07 
 
 
310 aa  258  6e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.025157  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0941  30S ribosomal protein S2  55.08 
 
 
241 aa  258  6e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0031234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>