More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0532 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD0532  30S ribosomal protein S2  100 
 
 		 282 aa  577  1e-164  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00675401  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0517  30S ribosomal protein S2  62.6 
 
 		 291 aa  344  8e-94  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.285229  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0514  30S ribosomal protein S2  60.75 
 
 		 288 aa  341  8e-93  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0948  ribosomal protein S2  56.2 
 
 		 298 aa  293  2e-78  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.405377  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1694  30S ribosomal protein S2  56.54 
 
 		 256 aa  293  2e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.559566  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1586  30S ribosomal protein S2  57.56 
 
 		 262 aa  291  9e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.551794  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0583  30S ribosomal protein S2  58.23 
 
 		 271 aa  290  2e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0651099  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3196  ribosomal protein S2  54.01 
 
 		 253 aa  288  1e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1162  30S ribosomal protein S2  55.27 
 
 		 256 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.278359  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1381  30S ribosomal protein S2  55.27 
 
 		 267 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2029  30S ribosomal protein S2  55.7 
 
 		 256 aa  285  5e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.306741  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1583  30S ribosomal protein S2  56.84 
 
 		 255 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1776  30S ribosomal protein S2  56.84 
 
 		 255 aa  285  8e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.890792 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1119  30S ribosomal protein S2  54.43 
 
 		 254 aa  283  2.0000000000000002e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3347  30S ribosomal protein S2  57.26 
 
 		 260 aa  282  4.0000000000000003e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.259933  normal  0.727871 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2805  30S ribosomal protein S2  55.7 
 
 		 313 aa  282  5.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00564496  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1131  30S ribosomal protein S2  55.13 
 
 		 255 aa  281  8.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.439275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9516  30S ribosomal protein S2  56.41 
 
 		 307 aa  281  8.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4439  30S ribosomal protein S2  56.07 
 
 		 334 aa  280  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000842833 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2223  30S ribosomal protein S2  56.17 
 
 		 361 aa  278  6e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2528  30S ribosomal protein S2  56.03 
 
 		 248 aa  277  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1433  30S ribosomal protein S2  52.74 
 
 		 251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0086997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4517  30S ribosomal protein S2  53.36 
 
 		 330 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2860  30S ribosomal protein S2  52.74 
 
 		 253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1859  30S ribosomal protein S2  52.94 
 
 		 332 aa  273  3e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.113122 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2436  30S ribosomal protein S2  53.36 
 
 		 334 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1694  30S ribosomal protein S2  53.36 
 
 		 332 aa  271  1e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1548  30S ribosomal protein S2  52.74 
 
 		 259 aa  271  1e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.403357 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4827  30S ribosomal protein S2  52.74 
 
 		 349 aa  270  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.356192  normal  0.0170734 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1510  30S ribosomal protein S2  51.9 
 
 		 274 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.0221668 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1698  30S ribosomal protein S2  53.16 
 
 		 349 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3450  30S ribosomal protein S2  52.79 
 
 		 355 aa  268  5e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0387566  normal  0.644555 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2828  30S ribosomal protein S2  54.2 
 
 		 331 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00696653  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3726  30S ribosomal protein S2  50.63 
 
 		 261 aa  267  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2073  30S ribosomal protein S2  54.95 
 
 		 355 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.193389  normal  0.160852 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2347  30S ribosomal protein S2  54.95 
 
 		 355 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.473707 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2857  30S ribosomal protein S2  53.78 
 
 		 331 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.32716  normal  0.180299 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2306  30S ribosomal protein S2  52.1 
 
 		 276 aa  263  3e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1694  30S ribosomal protein S2  55.51 
 
 		 349 aa  262  4e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.754731 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1380  30S ribosomal protein S2  50.63 
 
 		 288 aa  262  4e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272546  normal  0.0375782 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3268  30S ribosomal protein S2  52.3 
 
 		 331 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138284  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1210  30S ribosomal protein S2  51.48 
 
 		 256 aa  259  4e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1960  30S ribosomal protein S2  45.05 
 
 		 277 aa  259  4e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2033  30S ribosomal protein S2  52.79 
 
 		 354 aa  256  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0655537 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0460  30S ribosomal protein S2  48.93 
 
 		 250 aa  250  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.968608 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1530  SSU ribosomal protein S2P  52.63 
 
 		 249 aa  247  1e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000131876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1369  30S ribosomal protein S2  50.22 
 
 		 251 aa  246  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.512665  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1553  ribosomal protein S2  44.96 
 
 		 242 aa  245  4.9999999999999997e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1285  ribosomal protein S2  48.03 
 
 		 248 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297191  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1249  ribosomal protein S2  48.05 
 
 		 243 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2178  30S ribosomal protein S2  48.61 
 
 		 251 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00294119  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1863  30S ribosomal protein S2  47.6 
 
 		 248 aa  242  3.9999999999999997e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.454251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2976  ribosomal protein S2  46.12 
 
 		 244 aa  243  3.9999999999999997e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.801384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  50 
 
 		 301 aa  242  5e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000123477  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3281  30S ribosomal protein S2  46.72 
 
 		 242 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000428583  hitchhiker  0.0000650106 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  50.64 
 
 		 255 aa  239  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  50.64 
 
 		 255 aa  239  4e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1348  30S ribosomal protein S2  46.33 
 
 		 242 aa  238  9e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000164287  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1554  30S ribosomal protein S2  46.51 
 
 		 242 aa  238  9e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541684  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1088  30S ribosomal protein S2  49.56 
 
 		 239 aa  238  9e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0768857  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2981  30S ribosomal protein S2  47.23 
 
 		 241 aa  237  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.44963  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2427  30S ribosomal protein S2  47.86 
 
 		 243 aa  236  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0204898  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1250  30S ribosomal protein S2  51.07 
 
 		 251 aa  237  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000302151  hitchhiker  0.0000384341 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3161  30S ribosomal protein S2  46.33 
 
 		 242 aa  237  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00024185  normal  0.41061 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1450  30S ribosomal protein S2  45.56 
 
 		 242 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000541736  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1629  30S ribosomal protein S2  44.96 
 
 		 242 aa  236  3e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1445  30S ribosomal protein S2  45.56 
 
 		 242 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000563194  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2902  30S ribosomal protein S2  45.56 
 
 		 242 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000838626  normal  0.171153 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1481  30S ribosomal protein S2  45.56 
 
 		 242 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000136329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2641  30S ribosomal protein S2  44.96 
 
 		 242 aa  236  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000811634  normal  0.237811 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2708  30S ribosomal protein S2  44.96 
 
 		 242 aa  236  3e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000765128  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2815  30S ribosomal protein S2  44.96 
 
 		 242 aa  236  3e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1497  ribosomal protein S2  47.33 
 
 		 260 aa  236  4e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0171  30S ribosomal protein S2  47.84 
 
 		 241 aa  235  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.349633  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0173  30S ribosomal protein S2  47.84 
 
 		 241 aa  235  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0245787  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03237  30S ribosomal protein S2  47.84 
 
 		 253 aa  235  5.0000000000000005e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0162  30S ribosomal protein S2  47.84 
 
 		 241 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00314588  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00167  30S ribosomal protein S2  47.84 
 
 		 241 aa  235  6e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00889913  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3434  ribosomal protein S2  47.84 
 
 		 241 aa  235  6e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.129061  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0180  30S ribosomal protein S2  47.84 
 
 		 241 aa  235  6e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0157211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2885  30S ribosomal protein S2  46.33 
 
 		 242 aa  235  6e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000206646  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00166  hypothetical protein  47.84 
 
 		 241 aa  235  6e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00754113  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3491  30S ribosomal protein S2  47.84 
 
 		 241 aa  235  6e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.177739  normal  0.659943 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0179  30S ribosomal protein S2  47.84 
 
 		 241 aa  235  6e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0347621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0295  30S ribosomal protein S2  51.12 
 
 		 315 aa  235  7e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0657172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1270  30S ribosomal protein S2  44.36 
 
 		 242 aa  235  7e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00260886  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0941  30S ribosomal protein S2  47.84 
 
 		 241 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0031234  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  49.34 
 
 		 257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3165  30S ribosomal protein S2  47.23 
 
 		 241 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3360  30S ribosomal protein S2  47.84 
 
 		 241 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.720807  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  51.33 
 
 		 256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000926335  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0238  30S ribosomal protein S2  47.41 
 
 		 241 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.593758 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1555  30S ribosomal protein S2  46.96 
 
 		 246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0241  30S ribosomal protein S2  47.41 
 
 		 241 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  47.97 
 
 		 262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000550841  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3255  30S ribosomal protein S2  46.96 
 
 		 246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1328  30S ribosomal protein S2  46.96 
 
 		 246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151067  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2056  30S ribosomal protein S2  46.96 
 
 		 246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.23127  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0238  30S ribosomal protein S2  47.41 
 
 		 241 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0254  30S ribosomal protein S2  47.41 
 
 		 241 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.965891  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>