More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0403 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0403  30S ribosomal protein S2  100 
 
 		 281 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.000000078779  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0809  ribosomal protein S2  86.33 
 
 		 272 aa  459  9.999999999999999e-129  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0994  30S ribosomal protein S2  67.98 
 
 		 303 aa  370  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271344  normal  0.423917 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0237  ribosomal protein S2  67.84 
 
 		 314 aa  371  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.245227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3243  SSU ribosomal protein S2P  63.38 
 
 		 307 aa  373  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.191936  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0676  30S ribosomal protein S2  67.47 
 
 		 292 aa  364  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.560219  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2507  ribosomal protein S2  65.91 
 
 		 353 aa  366  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.282743  normal  0.375385 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10120  SSU ribosomal protein S2P  62.2 
 
 		 318 aa  363  1e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1484  ribosomal protein S2  66.27 
 
 		 326 aa  363  1e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.068355  normal  0.329281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1529  ribosomal protein S2  64.98 
 
 		 344 aa  363  2e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3410  ribosomal protein S2  64.16 
 
 		 283 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.7242  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1180  ribosomal protein S2  66.67 
 
 		 317 aa  361  6e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.920095  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11190  SSU ribosomal protein S2P  67.46 
 
 		 310 aa  361  8e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.025157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1004  ribosomal protein S2  67.06 
 
 		 283 aa  359  2e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.663705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1415  ribosomal protein S2  57.74 
 
 		 311 aa  359  3e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23610  SSU ribosomal protein S2P  64.43 
 
 		 317 aa  356  2.9999999999999997e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.699441  normal  0.141313 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3581  30S ribosomal protein S2  62.24 
 
 		 289 aa  355  5.999999999999999e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3113  ribosomal protein S2  63.64 
 
 		 296 aa  348  7e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000518709  normal  0.0242876 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06740  30S ribosomal protein S2  69.84 
 
 		 285 aa  347  2e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0485569  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1668  ribosomal protein S2  62.19 
 
 		 282 aa  344  1e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.688416  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1230  30S ribosomal protein S2  58.42 
 
 		 279 aa  343  2e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133873  normal  0.0467572 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1161  30S ribosomal protein S2  63.95 
 
 		 300 aa  340  2e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1863  Ribosomal protein S2-like protein  65.61 
 
 		 317 aa  340  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0527106 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2104  ribosomal protein S2  61.9 
 
 		 272 aa  338  8e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1322  30S ribosomal protein S2  59.04 
 
 		 295 aa  337  9.999999999999999e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1367  30S ribosomal protein S2  66.67 
 
 		 294 aa  337  9.999999999999999e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.480409  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2198  30S ribosomal protein S2  59.72 
 
 		 297 aa  336  1.9999999999999998e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.441521 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1384  30S ribosomal protein S2  66.67 
 
 		 291 aa  336  2.9999999999999997e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000357638 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4133  30S ribosomal protein S2  62.65 
 
 		 279 aa  335  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.549369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12904  30S ribosomal protein S2  60.28 
 
 		 287 aa  335  5e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0383521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5911  ribosomal protein S2  59.39 
 
 		 304 aa  333  2e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00672322  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1993  30S ribosomal protein S2  59.57 
 
 		 284 aa  332  5e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1974  30S ribosomal protein S2  59.57 
 
 		 284 aa  332  5e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.34334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2039  30S ribosomal protein S2  59.57 
 
 		 284 aa  332  5e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.07144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3991  ribosomal protein S2  60.46 
 
 		 316 aa  328  7e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1542  SSU ribosomal protein S2P  60.3 
 
 		 275 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09890  SSU ribosomal protein S2P  57.44 
 
 		 278 aa  319  3.9999999999999996e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2209  30S ribosomal protein S2  65.93 
 
 		 273 aa  316  3e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.092398  normal  0.16392 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  56.89 
 
 		 262 aa  283  2.0000000000000002e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  58.22 
 
 		 233 aa  283  2.0000000000000002e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0080  ribosomal protein S2  58.67 
 
 		 263 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000155744  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  55.02 
 
 		 257 aa  282  5.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  52.85 
 
 		 257 aa  281  6.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1250  30S ribosomal protein S2  57.21 
 
 		 251 aa  280  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000302151  hitchhiker  0.0000384341 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  56.36 
 
 		 232 aa  279  3e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1921  30S ribosomal protein S2  56.43 
 
 		 267 aa  279  3e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.7747799999999994e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1978  30S ribosomal protein S2  58.67 
 
 		 232 aa  279  4e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000338661  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  59.56 
 
 		 244 aa  278  9e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185332  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  54.4 
 
 		 255 aa  275  4e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000315088  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  55.36 
 
 		 235 aa  276  4e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  56.44 
 
 		 235 aa  275  4e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1816  30S ribosomal protein S2  57.78 
 
 		 257 aa  275  4e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541904  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  54.4 
 
 		 255 aa  275  4e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000466794  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1520  ribosomal protein S2  52.73 
 
 		 289 aa  274  9e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0626  ribosomal protein S2  57.96 
 
 		 237 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.761856  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  57.78 
 
 		 301 aa  274  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000123477  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3709  30S ribosomal protein S2  56.89 
 
 		 244 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000237071  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1921  30S ribosomal protein S2  57.33 
 
 		 251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264289  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3213  ribosomal protein S2  59.28 
 
 		 248 aa  273  3e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321925  unclonable  0.000000000222969 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1778  ribosomal protein S2  57.78 
 
 		 274 aa  273  3e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  54 
 
 		 262 aa  272  5.000000000000001e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  55.8 
 
 		 235 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  53.11 
 
 		 262 aa  270  2e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000550841  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0474  30S ribosomal protein S2  53.63 
 
 		 304 aa  269  5e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536253  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0742  ribosomal protein S2  51.65 
 
 		 281 aa  269  5e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000127244  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2479  30S ribosomal protein S2  56.25 
 
 		 233 aa  268  5e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000168536  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  54.58 
 
 		 238 aa  268  5.9999999999999995e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0213  ribosomal protein S2  54.91 
 
 		 257 aa  268  7e-71  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1006  30S ribosomal protein S2  56.89 
 
 		 252 aa  268  7e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000128012  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1318  30S ribosomal protein S2  56.7 
 
 		 233 aa  268  1e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000762012  hitchhiker  4.07369e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3925  30S ribosomal protein S2  56.7 
 
 		 233 aa  268  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000230027  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  56.25 
 
 		 233 aa  267  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000560898  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3839  30S ribosomal protein S2  56.25 
 
 		 233 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.22661e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3678  30S ribosomal protein S2  56.25 
 
 		 233 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  56.25 
 
 		 233 aa  267  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  56.25 
 
 		 233 aa  267  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193043  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  57.33 
 
 		 255 aa  267  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  56.25 
 
 		 233 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000491144  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3965  30S ribosomal protein S2  56.25 
 
 		 233 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0551  30S ribosomal protein S2  51.16 
 
 		 262 aa  267  2e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000123187  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3650  30S ribosomal protein S2  56.25 
 
 		 233 aa  267  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  57.33 
 
 		 255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08130  SSU ribosomal protein S2P  57.14 
 
 		 250 aa  266  2.9999999999999995e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000058431  unclonable  0.00000000192008 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1131  30S ribosomal protein S2  50.41 
 
 		 255 aa  266  4e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.439275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  53.47 
 
 		 271 aa  266  4e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000778728  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1238  30S ribosomal protein S2  53.5 
 
 		 259 aa  265  4e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000341164  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  55.56 
 
 		 256 aa  265  7e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000926335  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1381  30S ribosomal protein S2  48.15 
 
 		 267 aa  265  8e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0442  30S ribosomal protein S2  54.15 
 
 		 252 aa  264  1e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000051714  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1049  30S ribosomal protein S2  51.26 
 
 		 264 aa  263  2e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0905437  normal  0.331293 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1103  ribosomal protein S2  54.87 
 
 		 278 aa  263  2e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  unclonable  9.34188e-16 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1262  30S ribosomal protein S2  50.58 
 
 		 289 aa  263  3e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000765471  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1941  ribosomal protein S2  50.36 
 
 		 262 aa  263  3e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2680  30S ribosomal protein S2  54.46 
 
 		 246 aa  263  3e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000034456  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2376  ribosomal protein S2  54.22 
 
 		 261 aa  263  3e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4961  30S ribosomal protein S2  53.5 
 
 		 255 aa  261  8e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0882  ribosomal protein S2  54.67 
 
 		 236 aa  261  8e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1199  30S ribosomal protein S2  53.56 
 
 		 258 aa  261  8.999999999999999e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0195465  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1776  30S ribosomal protein S2  49.39 
 
 		 255 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.890792 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9516  30S ribosomal protein S2  52.21 
 
 		 307 aa  261  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>