228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNI04340 on replicon NC_006694
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006694  CNI04340  40S ribosomal protein S0, putative  100 
 
 		 292 aa  597  1e-170  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.220661  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03172  40S ribosomal protein S0 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B8F8]  65.68 
 
 		 293 aa  324  1e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.51633 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13682  predicted protein  61.64 
 
 		 220 aa  309  2.9999999999999997e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76999  ribosomal protein S0A  60.09 
 
 		 261 aa  295  6e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.937942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12355  Ribosomal protein Sa, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  54.06 
 
 		 290 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.30496  normal  0.113443 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1047  ribosomal protein S2  45.35 
 
 		 226 aa  179  4e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.269348  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0219  30S ribosomal protein S2  41.76 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.664063  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1693  30S ribosomal protein S2  41.76 
 
 		 221 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0274  30S ribosomal protein S2  42.19 
 
 		 214 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0907  30S ribosomal protein S2  41.76 
 
 		 220 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1524  30S ribosomal protein S2  40.66 
 
 		 221 aa  162  6e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.524219  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2140  30S ribosomal protein S2  42.11 
 
 		 225 aa  162  6e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000050996  hitchhiker  0.0000667505 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0759  30S ribosomal protein S2  41.52 
 
 		 220 aa  160  2e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.817066  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1810  30S ribosomal protein S2  38.02 
 
 		 205 aa  155  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2378  30S ribosomal protein S2  35.98 
 
 		 202 aa  154  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00361654  normal  0.260163 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2215  30S ribosomal protein S2  40.24 
 
 		 203 aa  153  2.9999999999999998e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1302  ribosomal protein S2  38.95 
 
 		 199 aa  149  5e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.29354  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0478  30S ribosomal protein S2  43.2 
 
 		 206 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2393  30S ribosomal protein S2  42.26 
 
 		 214 aa  145  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000018478  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1237  30S ribosomal protein S2  37.7 
 
 		 202 aa  144  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.161578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1423  30S ribosomal protein S2  38.24 
 
 		 247 aa  143  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.017125 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2514  30S ribosomal protein S2  40.12 
 
 		 267 aa  142  7e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2544  ribosomal protein S2  39.77 
 
 		 269 aa  140  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0430  ribosomal protein S2  39.2 
 
 		 263 aa  140  3e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.748529  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1826  30S ribosomal protein S2  39.88 
 
 		 268 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2599  30S ribosomal protein S2  39.08 
 
 		 259 aa  139  4.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.11317 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0027  30S ribosomal protein S2  39.31 
 
 		 208 aa  138  1e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0061  30S ribosomal protein S2  38.73 
 
 		 208 aa  138  1e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.924609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1104  30S ribosomal protein S2  37.57 
 
 		 207 aa  137  2e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0058  30S ribosomal protein S2  36.99 
 
 		 206 aa  136  5e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0190126 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2892  30S ribosomal protein S2  35.98 
 
 		 202 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00129354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_2002  30S ribosomal protein S2  34.92 
 
 		 215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0316  30S ribosomal protein S2  32.78 
 
 		 207 aa  112  5e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3194  ribosomal protein S2  25.44 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.758099  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0026  30S ribosomal protein S2  27.16 
 
 		 351 aa  68.9  0.0000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1398  SSU ribosomal protein S2P  24.77 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000184086  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0371  30S ribosomal protein S2  25.5 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04251  40S ribosomal protein S2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06570)  26.15 
 
 		 332 aa  62  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.474341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  23.36 
 
 		 271 aa  62  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000778728  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1199  30S ribosomal protein S2  25.7 
 
 		 258 aa  62  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0195465  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32903  predicted protein  22.61 
 
 		 421 aa  60.8  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.174506 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1610  30S ribosomal protein S2  25.75 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00150432  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0648  ribosomal protein S2  23.28 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.154128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1520  ribosomal protein S2  23.33 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0975  SSU ribosomal protein S2P  22.62 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  23.44 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000315088  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  23.44 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000466794  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1153  30S ribosomal protein S2  26.62 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl561  30S ribosomal protein S2  41.27 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf061  30S ribosomal protein S2  23.7 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.838903  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04075  30S ribosomal protein S2  24.64 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2479  30S ribosomal protein S2  22.49 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000168536  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3528  30S ribosomal protein S2  30.28 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.421739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2578  30S ribosomal protein S2  30.28 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  23.14 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0705  ribosomal protein S2  23.39 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000421001  unclonable  0.0000000254138 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3495  ribosomal protein S2  22.71 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000642119  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  22.01 
 
 		 233 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000560898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3678  30S ribosomal protein S2  22.01 
 
 		 233 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  22.01 
 
 		 233 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  22.01 
 
 		 233 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3965  30S ribosomal protein S2  22.01 
 
 		 233 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  22.01 
 
 		 233 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000491144  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4743  ribosomal protein S2  24.15 
 
 		 277 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000226587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  23.7 
 
 		 235 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3839  30S ribosomal protein S2  22.01 
 
 		 233 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.22661e-62 
 
 
-
 
NC_002950  PG0377  30S ribosomal protein S2  22.43 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0723  30S ribosomal protein S2  26.09 
 
 		 241 aa  54.7  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  22.01 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3925  30S ribosomal protein S2  22.01 
 
 		 233 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000230027  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2507  ribosomal protein S2  22.03 
 
 		 353 aa  54.7  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.282743  normal  0.375385 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1318  30S ribosomal protein S2  22.01 
 
 		 233 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000762012  hitchhiker  4.07369e-17 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0442  30S ribosomal protein S2  23.44 
 
 		 252 aa  54.3  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000051714  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3650  30S ribosomal protein S2  21.53 
 
 		 233 aa  53.9  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0525  30S ribosomal protein S2  23.42 
 
 		 238 aa  53.9  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000167283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0674  ribosomal protein S2  26.42 
 
 		 231 aa  53.9  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2347  30S ribosomal protein S2  22.83 
 
 		 291 aa  53.1  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000118359  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0112  ribosomal protein S2  22.69 
 
 		 274 aa  52.8  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000610418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2010  30S ribosomal protein S2  23.88 
 
 		 252 aa  52.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.281351  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1049  30S ribosomal protein S2  23.38 
 
 		 264 aa  52.4  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0905437  normal  0.331293 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2455  30S ribosomal protein S2  25.35 
 
 		 255 aa  52.4  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2353  30S ribosomal protein S2  22.89 
 
 		 255 aa  52.4  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00564969  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3925  30S ribosomal protein S2  21.95 
 
 		 263 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0424  30S ribosomal protein S2  22.89 
 
 		 256 aa  51.6  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0576373  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0676  30S ribosomal protein S2  22.33 
 
 		 292 aa  50.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.560219  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1648  30S ribosomal protein S2  22.73 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3581  30S ribosomal protein S2  22.97 
 
 		 289 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_321  ribosomal protein S2  24.29 
 
 		 245 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000206427  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1367  30S ribosomal protein S2  20.95 
 
 		 294 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.480409  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1384  30S ribosomal protein S2  21.43 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000357638 
 
 
-
 
NC_002936  DET0377  30S ribosomal protein S2  24.29 
 
 		 245 aa  50.4  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000247942  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04600  ribosomal protein, putative  25.65 
 
 		 307 aa  50.4  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0007  ribosomal protein S2  22.43 
 
 		 276 aa  50.8  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1848  ribosomal protein S2  22.01 
 
 		 288 aa  50.4  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0363359  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2108  30S ribosomal protein S2  21.53 
 
 		 254 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0295  30S ribosomal protein S2  22.33 
 
 		 315 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0657172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2019  30S ribosomal protein S2  21.95 
 
 		 262 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418742 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0237  ribosomal protein S2  22.38 
 
 		 314 aa  50.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.245227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  22.82 
 
 		 257 aa  50.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0359  30S ribosomal protein S2  23.81 
 
 		 245 aa  50.1  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000354346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>