More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0723 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0723  30S ribosomal protein S2  100 
 
 		 241 aa  491  9.999999999999999e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04075  30S ribosomal protein S2  80.5 
 
 		 265 aa  413  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1610  30S ribosomal protein S2  82.1 
 
 		 254 aa  400  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00150432  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0377  30S ribosomal protein S2  68.92 
 
 		 281 aa  331  7.000000000000001e-90  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0112  ribosomal protein S2  65.37 
 
 		 274 aa  327  7e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000610418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4743  ribosomal protein S2  62.82 
 
 		 277 aa  311  3.9999999999999997e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000226587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3037  30S ribosomal subunit protein S2  61.83 
 
 		 254 aa  308  4e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000399073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3495  ribosomal protein S2  59.83 
 
 		 272 aa  298  6e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000642119  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0882  ribosomal protein S2  60.43 
 
 		 340 aa  297  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0050  30S ribosomal protein S2  56.28 
 
 		 313 aa  288  4e-77  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0424  30S ribosomal protein S2  54.05 
 
 		 256 aa  278  5e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0576373  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2013  30S ribosomal protein S2  54.09 
 
 		 260 aa  276  3e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.515396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1648  30S ribosomal protein S2  53.64 
 
 		 251 aa  274  9e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0403  30S ribosomal protein S2  52.73 
 
 		 253 aa  273  1.0000000000000001e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.489561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2353  30S ribosomal protein S2  51.49 
 
 		 255 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00564969  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2010  30S ribosomal protein S2  52.73 
 
 		 252 aa  269  2.9999999999999997e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.281351  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0007  ribosomal protein S2  52.74 
 
 		 276 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1810  30S ribosomal protein S2  50.91 
 
 		 253 aa  266  2e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.544221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  53.74 
 
 		 235 aa  258  5.0000000000000005e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  53.3 
 
 		 235 aa  258  7e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  51.49 
 
 		 244 aa  255  4e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185332  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0957  ribosomal protein S2  52.59 
 
 		 280 aa  255  5e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3991  ribosomal protein S2  50.22 
 
 		 316 aa  255  5e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  52.68 
 
 		 233 aa  253  1.0000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  50.86 
 
 		 235 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0882  ribosomal protein S2  51.79 
 
 		 236 aa  253  2.0000000000000002e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2479  30S ribosomal protein S2  52.68 
 
 		 233 aa  252  3e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000168536  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1978  30S ribosomal protein S2  51.34 
 
 		 232 aa  252  3e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000338661  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  51.56 
 
 		 238 aa  250  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1863  30S ribosomal protein S2  51.3 
 
 		 248 aa  251  1e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.454251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  51.35 
 
 		 301 aa  249  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000123477  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1921  30S ribosomal protein S2  48.32 
 
 		 267 aa  249  3e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.7747799999999994e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  51.79 
 
 		 233 aa  249  4e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000560898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3678  30S ribosomal protein S2  51.79 
 
 		 233 aa  249  4e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  51.79 
 
 		 233 aa  249  4e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  51.79 
 
 		 233 aa  249  4e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  51.79 
 
 		 233 aa  249  4e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000491144  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3925  30S ribosomal protein S2  51.79 
 
 		 233 aa  249  4e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000230027  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3965  30S ribosomal protein S2  51.79 
 
 		 233 aa  249  4e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1318  30S ribosomal protein S2  51.79 
 
 		 233 aa  249  4e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000762012  hitchhiker  4.07369e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3839  30S ribosomal protein S2  51.79 
 
 		 233 aa  249  4e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.22661e-62 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0237  ribosomal protein S2  47.95 
 
 		 314 aa  248  4e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.245227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4133  30S ribosomal protein S2  47.68 
 
 		 279 aa  248  5e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.549369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1006  30S ribosomal protein S2  51.79 
 
 		 252 aa  248  6e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000128012  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3650  30S ribosomal protein S2  51.34 
 
 		 233 aa  248  9e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2680  30S ribosomal protein S2  49.79 
 
 		 246 aa  247  1e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000034456  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2178  30S ribosomal protein S2  50 
 
 		 251 aa  247  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00294119  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3213  ribosomal protein S2  52.25 
 
 		 248 aa  246  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321925  unclonable  0.000000000222969 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3113  ribosomal protein S2  47.5 
 
 		 296 aa  246  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000518709  normal  0.0242876 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5911  ribosomal protein S2  47.26 
 
 		 304 aa  246  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00672322  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  48.74 
 
 		 257 aa  246  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1974  30S ribosomal protein S2  47.83 
 
 		 284 aa  245  4e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.34334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1993  30S ribosomal protein S2  47.83 
 
 		 284 aa  245  4e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1668  ribosomal protein S2  48.13 
 
 		 282 aa  245  4e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.688416  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2039  30S ribosomal protein S2  47.83 
 
 		 284 aa  245  4e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.07144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1250  30S ribosomal protein S2  47.6 
 
 		 251 aa  245  4.9999999999999997e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000302151  hitchhiker  0.0000384341 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12904  30S ribosomal protein S2  49.78 
 
 		 287 aa  245  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0383521  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2347  30S ribosomal protein S2  51.36 
 
 		 291 aa  244  6.999999999999999e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000118359  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3709  30S ribosomal protein S2  52.23 
 
 		 244 aa  244  6.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000237071  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  48.12 
 
 		 257 aa  244  8e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0676  30S ribosomal protein S2  47.86 
 
 		 292 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.560219  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0284  30S ribosomal protein S2  50.68 
 
 		 314 aa  243  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  50.45 
 
 		 232 aa  244  9.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0295  30S ribosomal protein S2  50.68 
 
 		 343 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0422466  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0295  30S ribosomal protein S2  51.13 
 
 		 315 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0657172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1454  ribosomal protein S2  46.22 
 
 		 244 aa  243  1.9999999999999999e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.118632  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1778  ribosomal protein S2  49.79 
 
 		 274 aa  243  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1520  ribosomal protein S2  51.11 
 
 		 289 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1921  30S ribosomal protein S2  48.47 
 
 		 251 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264289  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0273  30S ribosomal protein S2  50.68 
 
 		 301 aa  242  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09890  SSU ribosomal protein S2P  52.43 
 
 		 278 aa  241  5e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0808  ribosomal protein S2  50.9 
 
 		 269 aa  241  7e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.15468  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0994  30S ribosomal protein S2  47.86 
 
 		 303 aa  241  7e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271344  normal  0.423917 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1816  30S ribosomal protein S2  51.35 
 
 		 257 aa  241  7.999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541904  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  48.9 
 
 		 256 aa  241  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000926335  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  49.14 
 
 		 262 aa  240  1e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000550841  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2209  30S ribosomal protein S2  48.43 
 
 		 273 aa  241  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.092398  normal  0.16392 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2104  ribosomal protein S2  46.35 
 
 		 272 aa  240  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  48.91 
 
 		 255 aa  239  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3581  30S ribosomal protein S2  47.11 
 
 		 289 aa  239  2e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1161  30S ribosomal protein S2  47.66 
 
 		 300 aa  239  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1004  ribosomal protein S2  47.66 
 
 		 283 aa  239  2.9999999999999997e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.663705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  48.21 
 
 		 262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  48.91 
 
 		 255 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1088  30S ribosomal protein S2  49.56 
 
 		 239 aa  239  2.9999999999999997e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0768857  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1466  30S ribosomal protein S2  48.87 
 
 		 247 aa  239  2.9999999999999997e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.162448  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12270  SSU ribosomal protein S2P  46.61 
 
 		 294 aa  239  4e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000736157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0442  30S ribosomal protein S2  47.54 
 
 		 252 aa  238  5e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000051714  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1159  ribosomal protein S2  50.47 
 
 		 275 aa  238  5e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  50.45 
 
 		 262 aa  238  5.999999999999999e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1954  30S ribosomal protein S2  50 
 
 		 233 aa  238  6.999999999999999e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000941341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1672  30S ribosomal protein S2  50 
 
 		 233 aa  238  6.999999999999999e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000487185  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1199  30S ribosomal protein S2  50.66 
 
 		 258 aa  238  6.999999999999999e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0195465  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  50 
 
 		 255 aa  238  8e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000315088  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  50 
 
 		 255 aa  238  8e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000466794  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0241  30S ribosomal protein S2  48.72 
 
 		 241 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0238  30S ribosomal protein S2  48.72 
 
 		 241 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.593758 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0254  30S ribosomal protein S2  48.72 
 
 		 241 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.965891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0238  30S ribosomal protein S2  48.72 
 
 		 241 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0256  30S ribosomal protein S2  48.72 
 
 		 241 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.424632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>