More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04075 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_04075  30S ribosomal protein S2  100 
 
 		 265 aa  537  9.999999999999999e-153  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1610  30S ribosomal protein S2  81.22 
 
 		 254 aa  403  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00150432  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0723  30S ribosomal protein S2  80.5 
 
 		 241 aa  398  9.999999999999999e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0112  ribosomal protein S2  64.91 
 
 		 274 aa  330  2e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000610418  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0377  30S ribosomal protein S2  64.86 
 
 		 281 aa  316  2e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4743  ribosomal protein S2  59.29 
 
 		 277 aa  313  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000226587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3037  30S ribosomal subunit protein S2  59.76 
 
 		 254 aa  312  3.9999999999999997e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000399073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0882  ribosomal protein S2  59.83 
 
 		 340 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3495  ribosomal protein S2  58.37 
 
 		 272 aa  301  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000642119  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0424  30S ribosomal protein S2  58.04 
 
 		 256 aa  296  2e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0576373  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0403  30S ribosomal protein S2  54.72 
 
 		 253 aa  294  1e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.489561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2010  30S ribosomal protein S2  57.94 
 
 		 252 aa  294  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.281351  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2353  30S ribosomal protein S2  57.66 
 
 		 255 aa  291  5e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00564969  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0050  30S ribosomal protein S2  55.93 
 
 		 313 aa  289  3e-77  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1648  30S ribosomal protein S2  56.03 
 
 		 251 aa  289  4e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2013  30S ribosomal protein S2  57.27 
 
 		 260 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.515396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1810  30S ribosomal protein S2  55.36 
 
 		 253 aa  280  1e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.544221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0007  ribosomal protein S2  51.37 
 
 		 276 aa  280  2e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  55 
 
 		 235 aa  263  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  55 
 
 		 235 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1978  30S ribosomal protein S2  54.3 
 
 		 232 aa  262  4e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000338661  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  51.8 
 
 		 301 aa  259  3e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000123477  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2479  30S ribosomal protein S2  55.91 
 
 		 233 aa  259  4e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000168536  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  52.49 
 
 		 244 aa  258  9e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185332  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3991  ribosomal protein S2  46.89 
 
 		 316 aa  256  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  52.94 
 
 		 233 aa  256  3e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0705  ribosomal protein S2  49.4 
 
 		 250 aa  255  4e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000421001  unclonable  0.0000000254138 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2178  30S ribosomal protein S2  51.35 
 
 		 251 aa  254  8e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00294119  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3839  30S ribosomal protein S2  55 
 
 		 233 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.22661e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  55 
 
 		 233 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000560898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3678  30S ribosomal protein S2  55 
 
 		 233 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  55 
 
 		 233 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  55 
 
 		 233 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3965  30S ribosomal protein S2  55 
 
 		 233 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  55 
 
 		 233 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000491144  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0808  ribosomal protein S2  51.35 
 
 		 269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.15468  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3925  30S ribosomal protein S2  55 
 
 		 233 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000230027  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1318  30S ribosomal protein S2  55 
 
 		 233 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000762012  hitchhiker  4.07369e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3650  30S ribosomal protein S2  54.55 
 
 		 233 aa  253  3e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1006  30S ribosomal protein S2  49.21 
 
 		 252 aa  253  3e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000128012  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  51.13 
 
 		 235 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  49.36 
 
 		 238 aa  252  4.0000000000000004e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0882  ribosomal protein S2  51.13 
 
 		 236 aa  252  4.0000000000000004e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1921  30S ribosomal protein S2  49.17 
 
 		 267 aa  251  6e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.7747799999999994e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3213  ribosomal protein S2  53.42 
 
 		 248 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321925  unclonable  0.000000000222969 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3709  30S ribosomal protein S2  53.85 
 
 		 244 aa  250  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000237071  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1250  30S ribosomal protein S2  48.91 
 
 		 251 aa  250  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000302151  hitchhiker  0.0000384341 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  48.13 
 
 		 262 aa  250  2e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  50.22 
 
 		 256 aa  250  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000926335  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0957  ribosomal protein S2  52.73 
 
 		 280 aa  249  3e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08130  SSU ribosomal protein S2P  50.45 
 
 		 250 aa  249  3e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000058431  unclonable  0.00000000192008 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1863  30S ribosomal protein S2  49.32 
 
 		 248 aa  249  3e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.454251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  51.58 
 
 		 232 aa  248  6e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0237  ribosomal protein S2  47.35 
 
 		 314 aa  248  6e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.245227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12270  SSU ribosomal protein S2P  50 
 
 		 294 aa  248  7e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000736157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2680  30S ribosomal protein S2  50.91 
 
 		 246 aa  247  1e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000034456  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1497  ribosomal protein S2  49.09 
 
 		 260 aa  247  1e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1520  ribosomal protein S2  50.22 
 
 		 289 aa  246  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1921  30S ribosomal protein S2  48.91 
 
 		 251 aa  246  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264289  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1954  30S ribosomal protein S2  50.9 
 
 		 233 aa  246  3e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000941341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1672  30S ribosomal protein S2  50.9 
 
 		 233 aa  246  3e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000487185  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  46.72 
 
 		 262 aa  246  4e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  47.6 
 
 		 257 aa  246  4e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  51.58 
 
 		 255 aa  245  4.9999999999999997e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000466794  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  51.58 
 
 		 255 aa  245  4.9999999999999997e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000315088  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0474  30S ribosomal protein S2  48.55 
 
 		 304 aa  244  6.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536253  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1778  ribosomal protein S2  48.95 
 
 		 274 aa  244  8e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0442  30S ribosomal protein S2  51.13 
 
 		 252 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000051714  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1816  30S ribosomal protein S2  50.68 
 
 		 257 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541904  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1161  30S ribosomal protein S2  44.53 
 
 		 300 aa  243  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2347  30S ribosomal protein S2  46.67 
 
 		 291 aa  243  3e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000118359  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  48.03 
 
 		 255 aa  243  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1466  30S ribosomal protein S2  44.96 
 
 		 247 aa  242  3.9999999999999997e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.162448  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3581  30S ribosomal protein S2  44.94 
 
 		 289 aa  242  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  48.03 
 
 		 255 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0295  30S ribosomal protein S2  48.42 
 
 		 343 aa  242  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0422466  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0284  30S ribosomal protein S2  48.42 
 
 		 314 aa  242  5e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1276  30S ribosomal protein S2  48.25 
 
 		 271 aa  242  5e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000462027  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1454  ribosomal protein S2  46.61 
 
 		 244 aa  241  6e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.118632  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0295  30S ribosomal protein S2  47.96 
 
 		 315 aa  241  7e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0657172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0676  30S ribosomal protein S2  48.46 
 
 		 292 aa  240  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.560219  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5911  ribosomal protein S2  45.78 
 
 		 304 aa  240  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00672322  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1444  ribosomal protein S2  47.56 
 
 		 250 aa  240  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.152019  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0994  30S ribosomal protein S2  49.13 
 
 		 303 aa  240  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271344  normal  0.423917 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0273  30S ribosomal protein S2  48.4 
 
 		 301 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1160  ribosomal protein S2  47.56 
 
 		 250 aa  240  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5313  ribosomal protein S2  45.64 
 
 		 291 aa  240  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  47.52 
 
 		 262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000550841  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1159  ribosomal protein S2  50 
 
 		 275 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4133  30S ribosomal protein S2  45.16 
 
 		 279 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.549369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1974  30S ribosomal protein S2  46.35 
 
 		 284 aa  239  4e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.34334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1993  30S ribosomal protein S2  46.35 
 
 		 284 aa  239  4e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2039  30S ribosomal protein S2  46.35 
 
 		 284 aa  239  4e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.07144  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1679  30S ribosomal protein S2  45.99 
 
 		 254 aa  238  5e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1103  ribosomal protein S2  47.98 
 
 		 278 aa  238  5e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  unclonable  9.34188e-16 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1673  30S ribosomal protein S2  45.99 
 
 		 254 aa  238  5.999999999999999e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12904  30S ribosomal protein S2  47.11 
 
 		 287 aa  238  6.999999999999999e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0383521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1881  30S ribosomal protein S2  49.1 
 
 		 247 aa  238  8e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.717146  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3113  ribosomal protein S2  46.7 
 
 		 296 aa  238  8e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000518709  normal  0.0242876 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  47.14 
 
 		 257 aa  238  9e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>