More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1276 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1276  30S ribosomal protein S2  100 
 
 		 271 aa  553  1e-157  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000462027  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0577  30S ribosomal protein S2  60.94 
 
 		 294 aa  332  5e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000845501  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  62.78 
 
 		 244 aa  311  1e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185332  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  59.83 
 
 		 233 aa  306  3e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  58.62 
 
 		 235 aa  305  6e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1816  30S ribosomal protein S2  57.45 
 
 		 257 aa  302  3.0000000000000004e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541904  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  59.64 
 
 		 238 aa  302  4.0000000000000003e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3709  30S ribosomal protein S2  60.09 
 
 		 244 aa  301  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000237071  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  55.65 
 
 		 257 aa  300  2e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1978  30S ribosomal protein S2  58.77 
 
 		 232 aa  300  2e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000338661  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  57.33 
 
 		 235 aa  298  5e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3213  ribosomal protein S2  59.03 
 
 		 248 aa  298  8e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321925  unclonable  0.000000000222969 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  56.84 
 
 		 256 aa  298  8e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000926335  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1006  30S ribosomal protein S2  56.33 
 
 		 252 aa  296  2e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000128012  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  57.76 
 
 		 235 aa  296  3e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1921  30S ribosomal protein S2  54.24 
 
 		 267 aa  293  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.7747799999999994e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1520  ribosomal protein S2  56.33 
 
 		 289 aa  293  3e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  57.02 
 
 		 255 aa  292  4e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  57.02 
 
 		 255 aa  291  6e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  53.62 
 
 		 301 aa  291  1e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000123477  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  56.5 
 
 		 262 aa  290  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  56.64 
 
 		 257 aa  289  4e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0295  30S ribosomal protein S2  56.14 
 
 		 343 aa  289  4e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0422466  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0295  30S ribosomal protein S2  55.04 
 
 		 315 aa  288  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0657172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0284  30S ribosomal protein S2  56.14 
 
 		 314 aa  288  6e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  56.5 
 
 		 232 aa  287  1e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1250  30S ribosomal protein S2  55.26 
 
 		 251 aa  286  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000302151  hitchhiker  0.0000384341 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0166  30S ribosomal protein S2  60.09 
 
 		 260 aa  285  4e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000940316  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0882  ribosomal protein S2  57.4 
 
 		 236 aa  285  4e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0273  30S ribosomal protein S2  56.89 
 
 		 301 aa  285  5e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0164  30S ribosomal protein S2  60.09 
 
 		 262 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0926  30S ribosomal protein S2  59.19 
 
 		 257 aa  285  7e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148572  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1921  30S ribosomal protein S2  54.82 
 
 		 251 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264289  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  56.95 
 
 		 262 aa  283  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0957  ribosomal protein S2  56.9 
 
 		 280 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2455  30S ribosomal protein S2  54.82 
 
 		 255 aa  282  3.0000000000000004e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3925  30S ribosomal protein S2  55.51 
 
 		 233 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000230027  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1318  30S ribosomal protein S2  55.51 
 
 		 233 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000762012  hitchhiker  4.07369e-17 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2680  30S ribosomal protein S2  56.5 
 
 		 246 aa  282  4.0000000000000003e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000034456  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  56.05 
 
 		 255 aa  282  5.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000466794  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  56.05 
 
 		 255 aa  282  5.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000315088  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  55.07 
 
 		 233 aa  281  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000560898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3678  30S ribosomal protein S2  55.07 
 
 		 233 aa  281  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  55.07 
 
 		 233 aa  281  6.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  55.07 
 
 		 233 aa  281  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193043  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2479  30S ribosomal protein S2  54.63 
 
 		 233 aa  281  6.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000168536  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3965  30S ribosomal protein S2  55.07 
 
 		 233 aa  281  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  55.07 
 
 		 233 aa  281  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000491144  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3839  30S ribosomal protein S2  55.07 
 
 		 233 aa  281  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.22661e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3650  30S ribosomal protein S2  55.07 
 
 		 233 aa  281  9e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0442  30S ribosomal protein S2  53.75 
 
 		 252 aa  281  1e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000051714  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0474  30S ribosomal protein S2  54.42 
 
 		 304 aa  278  9e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536253  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1668  ribosomal protein S2  51.57 
 
 		 282 aa  277  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.688416  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1778  ribosomal protein S2  52.77 
 
 		 274 aa  277  1e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1238  30S ribosomal protein S2  56.5 
 
 		 259 aa  276  2e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000341164  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0105  30S ribosomal protein S2  56.58 
 
 		 255 aa  276  4e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000131996  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  49.62 
 
 		 271 aa  274  9e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000778728  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1832  30S ribosomal protein S2  56.39 
 
 		 256 aa  274  1.0000000000000001e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000152831  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1203  30S ribosomal protein S2  53.28 
 
 		 246 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159372  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1941  ribosomal protein S2  47.97 
 
 		 262 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2104  ribosomal protein S2  51.36 
 
 		 272 aa  273  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  52.14 
 
 		 262 aa  273  3e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000550841  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08130  SSU ribosomal protein S2P  53.64 
 
 		 250 aa  272  4.0000000000000004e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000058431  unclonable  0.00000000192008 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12904  30S ribosomal protein S2  55.11 
 
 		 287 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0383521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3991  ribosomal protein S2  55.26 
 
 		 316 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0742  ribosomal protein S2  49.8 
 
 		 281 aa  272  5.000000000000001e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000127244  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5313  ribosomal protein S2  52.47 
 
 		 291 aa  271  1e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1161  30S ribosomal protein S2  51.78 
 
 		 300 aa  271  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3581  30S ribosomal protein S2  51.75 
 
 		 289 aa  271  1e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0578  ribosomal protein S2  56.05 
 
 		 243 aa  270  2e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1484  ribosomal protein S2  50.19 
 
 		 326 aa  269  2.9999999999999997e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.068355  normal  0.329281 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0994  30S ribosomal protein S2  51.18 
 
 		 303 aa  269  4e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271344  normal  0.423917 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3410  ribosomal protein S2  49.21 
 
 		 283 aa  268  7e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.7242  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1974  30S ribosomal protein S2  51.97 
 
 		 284 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.34334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1993  30S ribosomal protein S2  51.97 
 
 		 284 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1381  30S ribosomal protein S2  54.78 
 
 		 267 aa  267  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0237  ribosomal protein S2  50.79 
 
 		 314 aa  267  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.245227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1199  30S ribosomal protein S2  52.63 
 
 		 258 aa  267  1e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0195465  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2039  30S ribosomal protein S2  51.97 
 
 		 284 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.07144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3113  ribosomal protein S2  50.2 
 
 		 296 aa  266  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000518709  normal  0.0242876 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1249  ribosomal protein S2  51.11 
 
 		 243 aa  266  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1954  30S ribosomal protein S2  54.02 
 
 		 233 aa  266  2e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000941341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1672  30S ribosomal protein S2  54.02 
 
 		 233 aa  266  2e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000487185  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4133  30S ribosomal protein S2  49.01 
 
 		 279 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.549369  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2733  ribosomal protein S2  49.8 
 
 		 271 aa  265  5.999999999999999e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36757e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0676  30S ribosomal protein S2  49.8 
 
 		 292 aa  264  8.999999999999999e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.560219  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2209  30S ribosomal protein S2  52.91 
 
 		 273 aa  264  8.999999999999999e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.092398  normal  0.16392 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2029  30S ribosomal protein S2  52.42 
 
 		 256 aa  264  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.306741  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4961  30S ribosomal protein S2  46.36 
 
 		 255 aa  263  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2530  30S ribosomal protein S2  49.14 
 
 		 251 aa  263  2e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.963698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1119  30S ribosomal protein S2  51.98 
 
 		 254 aa  263  2e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0525  30S ribosomal protein S2  51.32 
 
 		 238 aa  263  2e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000167283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1848  ribosomal protein S2  52.89 
 
 		 288 aa  263  3e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0363359  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2347  30S ribosomal protein S2  51.36 
 
 		 291 aa  262  3e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000118359  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1162  30S ribosomal protein S2  51.98 
 
 		 256 aa  263  3e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.278359  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1004  ribosomal protein S2  50.2 
 
 		 283 aa  263  3e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.663705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1529  ribosomal protein S2  50.82 
 
 		 344 aa  262  4e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1153  30S ribosomal protein S2  50.88 
 
 		 269 aa  262  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5911  ribosomal protein S2  51.1 
 
 		 304 aa  262  4.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00672322  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9516  30S ribosomal protein S2  53.98 
 
 		 307 aa  261  6e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>