More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0377 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0377  30S ribosomal protein S2  100 
 
 		 281 aa  575  1.0000000000000001e-163  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0112  ribosomal protein S2  66.67 
 
 		 274 aa  334  1e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000610418  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04075  30S ribosomal protein S2  63.95 
 
 		 265 aa  325  5e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1610  30S ribosomal protein S2  66.08 
 
 		 254 aa  324  8.000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00150432  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0723  30S ribosomal protein S2  66.11 
 
 		 241 aa  322  3e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4743  ribosomal protein S2  58.82 
 
 		 277 aa  312  4.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000226587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3495  ribosomal protein S2  57.32 
 
 		 272 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000642119  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0882  ribosomal protein S2  62.67 
 
 		 340 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3037  30S ribosomal subunit protein S2  55.42 
 
 		 254 aa  300  1e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000399073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0050  30S ribosomal protein S2  53.33 
 
 		 313 aa  296  2e-79  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2353  30S ribosomal protein S2  54.24 
 
 		 255 aa  287  1e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00564969  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0424  30S ribosomal protein S2  55.13 
 
 		 256 aa  287  1e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0576373  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2010  30S ribosomal protein S2  53.39 
 
 		 252 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.281351  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0403  30S ribosomal protein S2  53.39 
 
 		 253 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.489561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1648  30S ribosomal protein S2  54.24 
 
 		 251 aa  281  8.000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2013  30S ribosomal protein S2  55.91 
 
 		 260 aa  280  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.515396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0007  ribosomal protein S2  55.06 
 
 		 276 aa  280  2e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1810  30S ribosomal protein S2  55.2 
 
 		 253 aa  277  1e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.544221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  52.97 
 
 		 238 aa  264  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1668  ribosomal protein S2  46.45 
 
 		 282 aa  264  1e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.688416  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1978  30S ribosomal protein S2  55.36 
 
 		 232 aa  263  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000338661  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  56.05 
 
 		 235 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3213  ribosomal protein S2  55.91 
 
 		 248 aa  262  6e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321925  unclonable  0.000000000222969 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  55.61 
 
 		 235 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3991  ribosomal protein S2  50.86 
 
 		 316 aa  259  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  51.44 
 
 		 262 aa  259  3e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  55.36 
 
 		 235 aa  259  3e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1006  30S ribosomal protein S2  53.69 
 
 		 252 aa  258  9e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000128012  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  51.24 
 
 		 244 aa  257  1e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185332  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1921  30S ribosomal protein S2  53.04 
 
 		 267 aa  257  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.7747799999999994e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2479  30S ribosomal protein S2  56.95 
 
 		 233 aa  257  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000168536  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2104  ribosomal protein S2  48.95 
 
 		 272 aa  256  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  53.57 
 
 		 233 aa  256  3e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1161  30S ribosomal protein S2  48.78 
 
 		 300 aa  256  3e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  52.67 
 
 		 271 aa  256  3e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000778728  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  51.48 
 
 		 257 aa  256  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2680  30S ribosomal protein S2  51.24 
 
 		 246 aa  256  3e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000034456  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0742  ribosomal protein S2  53.57 
 
 		 281 aa  256  4e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000127244  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0442  30S ribosomal protein S2  54.1 
 
 		 252 aa  255  5e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000051714  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0295  30S ribosomal protein S2  50.4 
 
 		 343 aa  254  8e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0422466  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1250  30S ribosomal protein S2  51.52 
 
 		 251 aa  254  9e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000302151  hitchhiker  0.0000384341 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  56.5 
 
 		 233 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000560898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3678  30S ribosomal protein S2  56.5 
 
 		 233 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  56.5 
 
 		 233 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  56.5 
 
 		 233 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3839  30S ribosomal protein S2  56.5 
 
 		 233 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.22661e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  56.5 
 
 		 233 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000491144  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3965  30S ribosomal protein S2  56.5 
 
 		 233 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3581  30S ribosomal protein S2  48.37 
 
 		 289 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0284  30S ribosomal protein S2  50.4 
 
 		 314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3709  30S ribosomal protein S2  54.91 
 
 		 244 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000237071  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0295  30S ribosomal protein S2  53.39 
 
 		 315 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0657172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1318  30S ribosomal protein S2  56.05 
 
 		 233 aa  253  3e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000762012  hitchhiker  4.07369e-17 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0882  ribosomal protein S2  53.57 
 
 		 236 aa  253  3e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3925  30S ribosomal protein S2  56.05 
 
 		 233 aa  253  3e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000230027  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2178  30S ribosomal protein S2  52.04 
 
 		 251 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00294119  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3650  30S ribosomal protein S2  55.61 
 
 		 233 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  51.34 
 
 		 257 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1272  ribosomal protein S2  50.21 
 
 		 244 aa  252  5.000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120741  normal  0.39597 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  52.68 
 
 		 256 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000926335  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1159  ribosomal protein S2  55.14 
 
 		 275 aa  252  5.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0273  30S ribosomal protein S2  51.02 
 
 		 301 aa  252  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  50.89 
 
 		 301 aa  251  7e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000123477  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0676  30S ribosomal protein S2  49.57 
 
 		 292 aa  251  8.000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.560219  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4133  30S ribosomal protein S2  47.68 
 
 		 279 aa  251  8.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.549369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1778  ribosomal protein S2  47.33 
 
 		 274 aa  251  9.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  51.3 
 
 		 255 aa  251  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  51.3 
 
 		 255 aa  251  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1497  ribosomal protein S2  51.57 
 
 		 260 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2209  30S ribosomal protein S2  49.78 
 
 		 273 aa  251  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.092398  normal  0.16392 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2347  30S ribosomal protein S2  50.67 
 
 		 291 aa  250  2e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000118359  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1322  30S ribosomal protein S2  48.15 
 
 		 295 aa  250  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  52.1 
 
 		 262 aa  250  2e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000550841  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1863  30S ribosomal protein S2  51.57 
 
 		 248 aa  250  2e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.454251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0350  30S ribosomal protein S2  50.81 
 
 		 264 aa  249  3e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.20969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  52.68 
 
 		 232 aa  249  3e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0389  30S ribosomal protein S2  50.81 
 
 		 264 aa  249  3e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0342077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1454  ribosomal protein S2  50.87 
 
 		 244 aa  249  3e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.118632  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  52.68 
 
 		 262 aa  249  4e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12904  30S ribosomal protein S2  49.12 
 
 		 287 aa  249  4e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0383521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1993  30S ribosomal protein S2  48.68 
 
 		 284 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1974  30S ribosomal protein S2  48.68 
 
 		 284 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.34334  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2733  ribosomal protein S2  49.59 
 
 		 271 aa  249  4e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36757e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23610  SSU ribosomal protein S2P  47.54 
 
 		 317 aa  249  4e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.699441  normal  0.141313 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2039  30S ribosomal protein S2  48.68 
 
 		 284 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.07144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1230  30S ribosomal protein S2  47.74 
 
 		 279 aa  249  5e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133873  normal  0.0467572 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0808  ribosomal protein S2  52.23 
 
 		 269 aa  248  6e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.15468  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2455  30S ribosomal protein S2  54.02 
 
 		 255 aa  248  6e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1520  ribosomal protein S2  51.98 
 
 		 289 aa  248  9e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1921  30S ribosomal protein S2  51.3 
 
 		 251 aa  247  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264289  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0994  30S ribosomal protein S2  50.87 
 
 		 303 aa  247  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271344  normal  0.423917 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0237  ribosomal protein S2  49.12 
 
 		 314 aa  247  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.245227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  51.79 
 
 		 255 aa  247  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000315088  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  51.79 
 
 		 255 aa  247  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000466794  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3410  ribosomal protein S2  49.56 
 
 		 283 aa  247  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.7242  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1466  30S ribosomal protein S2  51.57 
 
 		 247 aa  247  2e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.162448  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12270  SSU ribosomal protein S2P  48.89 
 
 		 294 aa  246  3e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000736157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1180  ribosomal protein S2  46.25 
 
 		 317 aa  246  3e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.920095  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1004  ribosomal protein S2  49.34 
 
 		 283 aa  246  3e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.663705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2548  30S ribosomal protein S2  52.8 
 
 		 250 aa  246  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.443564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>