More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_32903 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009046  PICST_32903  predicted protein  100 
 
 		 421 aa  869    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.174506 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04251  40S ribosomal protein S2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06570)  41.04 
 
 		 332 aa  203  4e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.474341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0648  ribosomal protein S2  31.88 
 
 		 324 aa  149  1.0000000000000001e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.154128  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl561  30S ribosomal protein S2  33.73 
 
 		 283 aa  143  4e-33  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  31.84 
 
 		 262 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1776  30S ribosomal protein S2  31.42 
 
 		 255 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.890792 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0525  30S ribosomal protein S2  30.4 
 
 		 238 aa  138  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000167283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1583  30S ribosomal protein S2  31.42 
 
 		 255 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4961  30S ribosomal protein S2  30.94 
 
 		 255 aa  137  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0742  ribosomal protein S2  31.39 
 
 		 281 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000127244  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2528  30S ribosomal protein S2  32.11 
 
 		 248 aa  137  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  31.39 
 
 		 255 aa  136  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000315088  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  31.39 
 
 		 255 aa  136  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000466794  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0080  ribosomal protein S2  29.91 
 
 		 263 aa  136  8e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000155744  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1203  30S ribosomal protein S2  32.74 
 
 		 246 aa  135  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159372  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1161  30S ribosomal protein S2  31.88 
 
 		 272 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000246943 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  30.49 
 
 		 271 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000778728  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0926  30S ribosomal protein S2  30.94 
 
 		 257 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148572  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1520  ribosomal protein S2  29.07 
 
 		 289 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04600  ribosomal protein, putative  34.05 
 
 		 307 aa  134  3e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2733  ribosomal protein S2  29.82 
 
 		 271 aa  134  3e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36757e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  31.39 
 
 		 235 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1162  30S ribosomal protein S2  30.53 
 
 		 256 aa  134  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.278359  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9516  30S ribosomal protein S2  29.2 
 
 		 307 aa  133  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0157  30S ribosomal protein S2  33.18 
 
 		 230 aa  133  5e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1119  30S ribosomal protein S2  30.09 
 
 		 254 aa  133  5e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4883  30S ribosomal protein S2  30.34 
 
 		 264 aa  133  6e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1131  30S ribosomal protein S2  29.65 
 
 		 255 aa  133  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.439275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1954  30S ribosomal protein S2  30.8 
 
 		 233 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000941341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1672  30S ribosomal protein S2  30.8 
 
 		 233 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000487185  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  30.94 
 
 		 235 aa  132  9e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1586  30S ribosomal protein S2  31.17 
 
 		 262 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.551794  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0237  ribosomal protein S2  31.14 
 
 		 314 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.245227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1381  30S ribosomal protein S2  29.2 
 
 		 267 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  30.94 
 
 		 235 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  30.8 
 
 		 233 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0213  ribosomal protein S2  28 
 
 		 257 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2061  30S ribosomal protein S2  30.49 
 
 		 265 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.4963 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1222  30S ribosomal protein S2  33.18 
 
 		 238 aa  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.29801 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  30.49 
 
 		 238 aa  131  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0705  ribosomal protein S2  30.43 
 
 		 250 aa  131  2.0000000000000002e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000421001  unclonable  0.0000000254138 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1548  30S ribosomal protein S2  31.74 
 
 		 259 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.403357 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3528  30S ribosomal protein S2  31.62 
 
 		 268 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.421739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2578  30S ribosomal protein S2  31.62 
 
 		 268 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06740  30S ribosomal protein S2  30.26 
 
 		 285 aa  130  3e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0485569  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  28.76 
 
 		 257 aa  130  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2029  30S ribosomal protein S2  29.2 
 
 		 256 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.306741  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1380  30S ribosomal protein S2  30.26 
 
 		 288 aa  130  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272546  normal  0.0375782 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2347  30S ribosomal protein S2  30.8 
 
 		 355 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.473707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4743  ribosomal protein S2  30.04 
 
 		 277 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000226587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2073  30S ribosomal protein S2  30.8 
 
 		 355 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.193389  normal  0.160852 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3194  ribosomal protein S2  30.97 
 
 		 247 aa  130  4.0000000000000003e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.758099  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2479  30S ribosomal protein S2  30.94 
 
 		 233 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000168536  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0112  ribosomal protein S2  30.97 
 
 		 274 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000610418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4236  30S ribosomal protein S2  30.04 
 
 		 260 aa  130  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000647656 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1238  30S ribosomal protein S2  29.15 
 
 		 259 aa  130  6e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000341164  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07891  30S ribosomal protein S2  33.03 
 
 		 222 aa  129  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.992425 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2376  ribosomal protein S2  29.6 
 
 		 261 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1247  30S ribosomal protein S2  32.74 
 
 		 239 aa  129  9.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0978856  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2223  30S ribosomal protein S2  27.24 
 
 		 361 aa  129  9.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0994  30S ribosomal protein S2  29.82 
 
 		 303 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271344  normal  0.423917 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1384  30S ribosomal protein S2  29.39 
 
 		 291 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000357638 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0676  30S ribosomal protein S2  31.14 
 
 		 292 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.560219  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3495  ribosomal protein S2  30.49 
 
 		 272 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000642119  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4827  30S ribosomal protein S2  30.53 
 
 		 349 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.356192  normal  0.0170734 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1322  30S ribosomal protein S2  29.82 
 
 		 295 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3726  30S ribosomal protein S2  31.03 
 
 		 261 aa  129  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1180  ribosomal protein S2  30.7 
 
 		 317 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.920095  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  30.49 
 
 		 233 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000560898  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1230  30S ribosomal protein S2  29.39 
 
 		 279 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133873  normal  0.0467572 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3678  30S ribosomal protein S2  30.49 
 
 		 233 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  30.49 
 
 		 233 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  30.49 
 
 		 233 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193043  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  31.39 
 
 		 262 aa  128  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000550841  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3410  ribosomal protein S2  30.26 
 
 		 283 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.7242  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1250  30S ribosomal protein S2  29.57 
 
 		 251 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000302151  hitchhiker  0.0000384341 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3965  30S ribosomal protein S2  30.49 
 
 		 233 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  30.49 
 
 		 233 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000491144  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0050  30S ribosomal protein S2  29.91 
 
 		 313 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2455  30S ribosomal protein S2  30.49 
 
 		 255 aa  128  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1367  30S ribosomal protein S2  28.95 
 
 		 294 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.480409  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3839  30S ribosomal protein S2  30.49 
 
 		 233 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.22661e-62 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0547  30S ribosomal protein S2  30.04 
 
 		 263 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2924  30S ribosomal protein S2  28.75 
 
 		 271 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.240537 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2108  30S ribosomal protein S2  28.7 
 
 		 254 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1133  30S ribosomal protein S2  28.7 
 
 		 260 aa  127  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0957  ribosomal protein S2  29.91 
 
 		 280 aa  127  3e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1199  30S ribosomal protein S2  31.39 
 
 		 258 aa  127  3e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0195465  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3243  SSU ribosomal protein S2P  30.26 
 
 		 307 aa  127  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.191936  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10101  30S ribosomal protein S2  32.29 
 
 		 238 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0824098 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2306  30S ribosomal protein S2  30.6 
 
 		 276 aa  127  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16641  30S ribosomal protein S2  31.84 
 
 		 239 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.503664 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1049  30S ribosomal protein S2  30.99 
 
 		 264 aa  127  4.0000000000000003e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0905437  normal  0.331293 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1316  30S ribosomal protein S2  29.6 
 
 		 263 aa  127  5e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.715024  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0295  30S ribosomal protein S2  29.6 
 
 		 315 aa  127  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0657172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1197  30S ribosomal protein S2  29.6 
 
 		 263 aa  127  5e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1941  ribosomal protein S2  28.7 
 
 		 262 aa  127  5e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3650  30S ribosomal protein S2  30.63 
 
 		 233 aa  126  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3450  30S ribosomal protein S2  30.36 
 
 		 355 aa  126  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0387566  normal  0.644555 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0882  ribosomal protein S2  30.67 
 
 		 340 aa  126  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591925  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>