More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND04600 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006686  CND04600  ribosomal protein, putative  100 
 
 		 307 aa  624  1e-178  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04251  40S ribosomal protein S2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06570)  37.15 
 
 		 332 aa  162  6e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.474341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32903  predicted protein  34.16 
 
 		 421 aa  122  9e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.174506 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1203  30S ribosomal protein S2  30.87 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159372  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2223  30S ribosomal protein S2  28.99 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1238  30S ribosomal protein S2  28.69 
 
 		 259 aa  99.8  6e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000341164  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0742  ribosomal protein S2  30.26 
 
 		 281 aa  99.4  7e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000127244  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0213  ribosomal protein S2  31.05 
 
 		 257 aa  99.4  7e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  32.14 
 
 		 235 aa  97.4  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1586  30S ribosomal protein S2  26.64 
 
 		 262 aa  97.4  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.551794  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0926  30S ribosomal protein S2  30.36 
 
 		 257 aa  96.7  4e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148572  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1369  30S ribosomal protein S2  27.48 
 
 		 251 aa  95.5  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.512665  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1131  30S ribosomal protein S2  27.93 
 
 		 255 aa  95.1  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.439275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0080  ribosomal protein S2  29.39 
 
 		 263 aa  95.1  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000155744  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2528  30S ribosomal protein S2  29.22 
 
 		 248 aa  95.1  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0577  30S ribosomal protein S2  26.32 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000845501  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1776  30S ribosomal protein S2  28.38 
 
 		 255 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.890792 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1583  30S ribosomal protein S2  28.38 
 
 		 255 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0460  30S ribosomal protein S2  26.75 
 
 		 250 aa  92.8  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.968608 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1153  30S ribosomal protein S2  29.6 
 
 		 269 aa  92.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1694  30S ribosomal protein S2  29.96 
 
 		 332 aa  92  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2578  30S ribosomal protein S2  29.07 
 
 		 268 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1197  30S ribosomal protein S2  27.31 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1316  30S ribosomal protein S2  27.31 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.715024  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2029  30S ribosomal protein S2  27.03 
 
 		 256 aa  90.9  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.306741  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3528  30S ribosomal protein S2  29.07 
 
 		 268 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.421739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  26.79 
 
 		 262 aa  90.9  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000550841  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1848  ribosomal protein S2  28.76 
 
 		 288 aa  91.3  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0363359  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2436  30S ribosomal protein S2  30.4 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0007  ribosomal protein S2  27.73 
 
 		 276 aa  91.3  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9516  30S ribosomal protein S2  27.03 
 
 		 307 aa  90.9  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1262  30S ribosomal protein S2  25.38 
 
 		 289 aa  90.9  3e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000765471  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0840  30S ribosomal protein S2  25.75 
 
 		 267 aa  90.5  3e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00899072  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1161  30S ribosomal protein S2  28.05 
 
 		 300 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1381  30S ribosomal protein S2  25.23 
 
 		 267 aa  90.9  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0626  ribosomal protein S2  28.25 
 
 		 237 aa  90.1  4e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.761856  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2885  30S ribosomal protein S2  26.58 
 
 		 242 aa  90.1  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000206646  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1960  30S ribosomal protein S2  26.67 
 
 		 277 aa  90.5  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  27.63 
 
 		 262 aa  90.1  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1859  30S ribosomal protein S2  29.96 
 
 		 332 aa  90.1  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.113122 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1802  30S ribosomal protein S2  27.73 
 
 		 259 aa  89.7  5e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0866848  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1966  ribosomal protein S2  26.98 
 
 		 251 aa  89.7  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_004310  BR1162  30S ribosomal protein S2  26.58 
 
 		 256 aa  89.4  7e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.278359  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1119  30S ribosomal protein S2  26.58 
 
 		 254 aa  89.4  7e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  28 
 
 		 301 aa  89.4  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000123477  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0578  ribosomal protein S2  28.57 
 
 		 243 aa  89.4  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0583  30S ribosomal protein S2  29.28 
 
 		 271 aa  89.4  7e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0651099  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1444  ribosomal protein S2  25.78 
 
 		 250 aa  89.4  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.152019  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1160  ribosomal protein S2  25.78 
 
 		 250 aa  89.4  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0547  30S ribosomal protein S2  27.04 
 
 		 263 aa  89  8e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0164  30S ribosomal protein S2  28.57 
 
 		 262 aa  89  9e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1520  ribosomal protein S2  29.65 
 
 		 289 aa  88.6  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1941  ribosomal protein S2  27.27 
 
 		 262 aa  88.6  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4517  30S ribosomal protein S2  29.07 
 
 		 330 aa  88.6  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl561  30S ribosomal protein S2  28.28 
 
 		 283 aa  88.6  1e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2805  30S ribosomal protein S2  28.32 
 
 		 313 aa  88.6  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00564496  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0166  30S ribosomal protein S2  28.57 
 
 		 260 aa  88.6  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000940316  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1548  30S ribosomal protein S2  28.7 
 
 		 259 aa  89  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.403357 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1668  ribosomal protein S2  28 
 
 		 282 aa  87.8  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.688416  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1094  30S ribosomal protein S2  26.47 
 
 		 261 aa  87.8  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.240704  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4439  30S ribosomal protein S2  27.23 
 
 		 334 aa  87.8  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000842833 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1133  30S ribosomal protein S2  26.11 
 
 		 260 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3581  30S ribosomal protein S2  27.71 
 
 		 289 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2981  30S ribosomal protein S2  27.19 
 
 		 241 aa  87.8  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.44963  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1554  30S ribosomal protein S2  26.58 
 
 		 242 aa  87.8  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541684  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3165  30S ribosomal protein S2  27.19 
 
 		 241 aa  88.2  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1270  30S ribosomal protein S2  27.93 
 
 		 242 aa  88.2  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00260886  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3450  30S ribosomal protein S2  27.27 
 
 		 355 aa  87  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0387566  normal  0.644555 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2376  ribosomal protein S2  25.79 
 
 		 261 aa  87  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0295  30S ribosomal protein S2  26.21 
 
 		 343 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0422466  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3161  30S ribosomal protein S2  26.01 
 
 		 242 aa  87.4  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00024185  normal  0.41061 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1510  30S ribosomal protein S2  27.83 
 
 		 274 aa  87  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.0221668 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1272  ribosomal protein S2  27.23 
 
 		 244 aa  87.4  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120741  normal  0.39597 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3347  30S ribosomal protein S2  27.93 
 
 		 260 aa  87  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.259933  normal  0.727871 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0551  30S ribosomal protein S2  25.51 
 
 		 262 aa  87  3e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000123187  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0809  ribosomal protein S2  26.58 
 
 		 272 aa  87.4  3e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1481  30S ribosomal protein S2  26.13 
 
 		 242 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000136329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1694  30S ribosomal protein S2  28.83 
 
 		 349 aa  86.7  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.754731 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1450  30S ribosomal protein S2  26.13 
 
 		 242 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000541736  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1445  30S ribosomal protein S2  26.13 
 
 		 242 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000563194  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3281  30S ribosomal protein S2  25.23 
 
 		 242 aa  87  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000428583  hitchhiker  0.0000650106 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2902  30S ribosomal protein S2  26.13 
 
 		 242 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000838626  normal  0.171153 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1348  30S ribosomal protein S2  26.13 
 
 		 242 aa  86.7  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000164287  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1840  SSU ribosomal protein S2P  25.45 
 
 		 262 aa  87  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1816  30S ribosomal protein S2  30.8 
 
 		 257 aa  87  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541904  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1778  ribosomal protein S2  28.02 
 
 		 274 aa  86.3  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2104  ribosomal protein S2  27.95 
 
 		 272 aa  86.7  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2108  30S ribosomal protein S2  25.74 
 
 		 254 aa  86.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1629  30S ribosomal protein S2  26.13 
 
 		 242 aa  86.3  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2641  30S ribosomal protein S2  26.13 
 
 		 242 aa  86.3  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000811634  normal  0.237811 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2708  30S ribosomal protein S2  26.13 
 
 		 242 aa  86.3  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000765128  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2815  30S ribosomal protein S2  26.13 
 
 		 242 aa  86.3  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1433  30S ribosomal protein S2  27.83 
 
 		 251 aa  85.9  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0086997 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2860  30S ribosomal protein S2  27.83 
 
 		 253 aa  85.9  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2066  30S ribosomal protein S2  25.89 
 
 		 266 aa  85.5  9e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2828  30S ribosomal protein S2  29.96 
 
 		 331 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00696653  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0941  30S ribosomal protein S2  26.58 
 
 		 241 aa  85.5  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0031234  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3360  30S ribosomal protein S2  26.58 
 
 		 241 aa  85.5  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.720807  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2347  30S ribosomal protein S2  27.73 
 
 		 355 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.473707 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3726  30S ribosomal protein S2  27.92 
 
 		 261 aa  85.1  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.361852 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>