More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0696 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
321 aa  627  1e-178  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000200943 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0684  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.05 
 
 
298 aa  170  3e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0527807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
301 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20807  normal  0.604183 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 
388 aa  163  3e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.575298  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.06 
 
 
303 aa  143  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.47 
 
 
330 aa  139  6e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0131606  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
277 aa  132  6.999999999999999e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.48 
 
 
293 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0357708  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.12 
 
 
372 aa  129  9.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.173212  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.15 
 
 
291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125001  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.64 
 
 
290 aa  125  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.204889 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.75 
 
 
346 aa  125  8.000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.95 
 
 
343 aa  125  9e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1191  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.12 
 
 
342 aa  125  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3885  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.5 
 
 
331 aa  121  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.426528  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5699  ABC transporter, permease  32.42 
 
 
300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202302  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.33 
 
 
290 aa  120  3e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.377446  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0912  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components  35.42 
 
 
304 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7446  ABC transporter, permease  32 
 
 
299 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913354  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2726  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.17 
 
 
303 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.576006 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.951442  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.8 
 
 
298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1658  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  31.37 
 
 
302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0488394  normal  0.487753 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1547  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.26 
 
 
285 aa  117  3e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.107676  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.2 
 
 
322 aa  115  8.999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0496567  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.6 
 
 
292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340693  normal  0.469526 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0346829  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.44 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0590918  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1482  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.74 
 
 
727 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0043  hypothetical protein  35.14 
 
 
269 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.728589  normal  0.420247 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1678  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.74 
 
 
289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.771808  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7183  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  31.65 
 
 
335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.587678  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2084  ABC transporter, permease  30.17 
 
 
293 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.741475 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.61 
 
 
334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.91 
 
 
274 aa  110  4.0000000000000004e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.534309  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1898  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.68 
 
 
331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01330  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  32.98 
 
 
311 aa  109  5e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5782  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.06 
 
 
292 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.10252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  31.08 
 
 
342 aa  108  9.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.76 
 
 
300 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.41 
 
 
344 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0998  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.2 
 
 
283 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.8284200000000003e-62 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.04 
 
 
279 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.194033 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3655  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.52 
 
 
302 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.8 
 
 
287 aa  107  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0860  oligopeptide ABC transporter permease  35.75 
 
 
283 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0824  oligopeptide ABC transporter, permease  32.57 
 
 
283 aa  106  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0910  oligopeptide ABC transporter permease protein  35.75 
 
 
283 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.6 
 
 
385 aa  106  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.295297 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2230  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.97 
 
 
450 aa  106  6e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.938775  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0809  oligopeptide ABC transporter, permease  35.75 
 
 
283 aa  106  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3928  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  35.1 
 
 
394 aa  106  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1613  oligopeptide ABC transporter, permease protein  30.04 
 
 
319 aa  105  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.29 
 
 
390 aa  106  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7126  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.29 
 
 
390 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0947  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.57 
 
 
283 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177412  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1400  ABC transporter related  31.4 
 
 
638 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785888  normal  0.726008 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.49 
 
 
299 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1002  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.39 
 
 
283 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5233  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36 
 
 
283 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4384  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.57 
 
 
283 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  9.52955e-23 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4595  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.53 
 
 
391 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.579671  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.95 
 
 
283 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.789025  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.95 
 
 
386 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2743  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
302 aa  103  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.418739  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.04 
 
 
280 aa  103  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1684  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.1 
 
 
367 aa  103  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000435882  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.1 
 
 
367 aa  103  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.251856  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0916  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.04 
 
 
280 aa  103  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2567  putative dipeptide transport system permease protein  35.64 
 
 
274 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.255906 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
387 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.219738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7458  peptide ABC transporter, permease protein  33.69 
 
 
281 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0385  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.74 
 
 
343 aa  102  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.519425 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1180  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.07 
 
 
336 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19890  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  32.06 
 
 
289 aa  102  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00186711  hitchhiker  0.000357505 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7230  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.41 
 
 
386 aa  102  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195015  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.67 
 
 
281 aa  102  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170759  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.68 
 
 
387 aa  102  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.257329  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.49 
 
 
311 aa  102  9e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2587  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.77 
 
 
383 aa  102  9e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.32423  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2747  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.43 
 
 
288 aa  102  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5698  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  33.01 
 
 
387 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.040975  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20160  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  31.7 
 
 
621 aa  101  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.533008  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7556  putative dipeptide ABC transporter (permease protein)  33.33 
 
 
279 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.34 
 
 
280 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0547  peptide ABC transporter, protein inner membrane binding component  27.85 
 
 
327 aa  101  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0218475  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17740  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  29.96 
 
 
331 aa  100  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00436739  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.27 
 
 
344 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1395  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  30.58 
 
 
288 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.064701  decreased coverage  0.00784209 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002584  (GlcNAc)2 ABC transporter permease component 2  25.95 
 
 
341 aa  100  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.26 
 
 
320 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.69 
 
 
280 aa  100  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1809  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.38 
 
 
301 aa  100  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295614  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5517  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  32.54 
 
 
379 aa  99.8  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.585071  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2578  ABC-type [(GlcNAc)2] transporter, permease protein  34.08 
 
 
341 aa  99.4  7e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.38 
 
 
331 aa  99.4  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0878076  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2716  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.11 
 
 
301 aa  99.4  8e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2594  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.13 
 
 
364 aa  99.4  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.853093  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1684  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.03 
 
 
312 aa  99  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6294  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.88 
 
 
303 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>