More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4092 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
322 aa  642    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0496567  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3885  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.08 
 
 
331 aa  291  8e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.426528  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.49 
 
 
343 aa  285  5e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.91 
 
 
330 aa  275  8e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0131606  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.71 
 
 
388 aa  271  1e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.575298  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.17 
 
 
372 aa  263  3e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.173212  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1191  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.14 
 
 
342 aa  252  7e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 
346 aa  245  6.999999999999999e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2587  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.7 
 
 
383 aa  230  3e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.32423  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.21 
 
 
301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20807  normal  0.604183 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0684  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.07 
 
 
298 aa  160  3e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0527807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5699  ABC transporter, permease  36.23 
 
 
300 aa  156  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202302  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.09 
 
 
293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0357708  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.83 
 
 
290 aa  150  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.204889 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.19 
 
 
291 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125001  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.4 
 
 
290 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.377446  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.79 
 
 
298 aa  139  8.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.22 
 
 
303 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3655  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.9 
 
 
302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1658  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  36.09 
 
 
302 aa  130  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0488394  normal  0.487753 
 
 
-
 
NC_002936  DET1492  peptide ABC transporter, permease protein  31 
 
 
279 aa  129  6e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31 
 
 
279 aa  129  6e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.8 
 
 
274 aa  129  7.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.534309  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01330  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  34.82 
 
 
311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.8 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.951442  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1547  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.8 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.107676  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6186  ABC transporter related  31.93 
 
 
590 aa  126  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.3 
 
 
334 aa  126  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.88 
 
 
276 aa  125  1e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1268  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease component  30.48 
 
 
279 aa  125  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 
325 aa  124  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.21 
 
 
280 aa  123  5e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0590918  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1613  oligopeptide ABC transporter, permease protein  28.7 
 
 
319 aa  122  8e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2747  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.83 
 
 
288 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1400  ABC transporter related  31.62 
 
 
638 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785888  normal  0.726008 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  29.62 
 
 
342 aa  120  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17740  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  31.34 
 
 
331 aa  120  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00436739  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.35 
 
 
311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00767174  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0629  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.91 
 
 
289 aa  119  7e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.709425  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2503  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.47 
 
 
299 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.876873  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0043  hypothetical protein  32.23 
 
 
269 aa  116  5e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.728589  normal  0.420247 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.11 
 
 
309 aa  115  8.999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00634879  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2578  ABC-type [(GlcNAc)2] transporter, permease protein  26.42 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0843  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.67 
 
 
818 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000335755  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.17 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2726  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.31 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.576006 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0929  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.62 
 
 
350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.48 
 
 
277 aa  114  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.39 
 
 
279 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.194033 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.29 
 
 
309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.383419  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03425  hypothetical protein  28.09 
 
 
341 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.75 
 
 
292 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340693  normal  0.469526 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2379  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.17 
 
 
273 aa  113  5e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141415  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002584  (GlcNAc)2 ABC transporter permease component 2  28.09 
 
 
341 aa  112  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
320 aa  112  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 
485 aa  112  7.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.08 
 
 
320 aa  112  9e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5782  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.34 
 
 
292 aa  112  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.10252 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1898  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.54 
 
 
331 aa  112  9e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1482  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  31.2 
 
 
727 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.93 
 
 
344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3009  ABC transporter related  30 
 
 
314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.450322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2084  ABC transporter, permease  32.23 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.741475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7446  ABC transporter, permease  29.17 
 
 
299 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913354  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3198  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.67 
 
 
260 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  unclonable  0.0000000283157  unclonable  0.000000000020531 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20160  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  30.6 
 
 
621 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.533008  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2198  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.21 
 
 
290 aa  109  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00106936  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0928  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.22 
 
 
274 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00180433  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.23 
 
 
277 aa  108  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0912  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components  28.19 
 
 
304 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1420  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.6 
 
 
471 aa  108  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0657441  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1118  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
354 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.844451  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0147  peptide ABC transporter, permease protein  27 
 
 
341 aa  108  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.21 
 
 
299 aa  108  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.502248  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.7 
 
 
280 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.284624  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.96 
 
 
311 aa  106  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.292723 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0718  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  30.04 
 
 
455 aa  106  5e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.47 
 
 
314 aa  106  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1180  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.66 
 
 
336 aa  106  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
352 aa  106  6e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0911  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.04 
 
 
472 aa  106  7e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.99842 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.93 
 
 
321 aa  105  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.187971  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.58 
 
 
359 aa  105  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.6 
 
 
331 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0878076  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0211  oligopeptide ABC transporter, permease  33.62 
 
 
307 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0243  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.62 
 
 
307 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19890  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  30.96 
 
 
289 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00186711  hitchhiker  0.000357505 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1074  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  29.78 
 
 
464 aa  103  3e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0250  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.62 
 
 
307 aa  104  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5078  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.33 
 
 
306 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.59 
 
 
385 aa  103  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.295297 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0247  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.33 
 
 
306 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0546254  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0747  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.4 
 
 
279 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.14 
 
 
318 aa  103  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2743  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.58 
 
 
302 aa  103  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.418739  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0562  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.7 
 
 
840 aa  103  4e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0220  oligopeptide ABC transporter permease  33.62 
 
 
307 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0210  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.9 
 
 
307 aa  103  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.52 
 
 
280 aa  103  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0346829  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>