More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3650 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013923  Nmag_3650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
359 aa  717    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1596  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.37 
 
 
344 aa  259  6e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.67 
 
 
295 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.35 
 
 
469 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.04 
 
 
300 aa  242  6e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.765267  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.45 
 
 
304 aa  240  2e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292743  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1183  putative permease of ABC transporter  42 
 
 
301 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.056047  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1867  ABC-type transport system protein  41.5 
 
 
288 aa  238  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.06 
 
 
309 aa  236  6e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0983  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
495 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.99676  normal  0.0550466 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.55 
 
 
485 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.431647  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
496 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.08 
 
 
287 aa  233  3e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.45 
 
 
494 aa  233  3e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.7 
 
 
313 aa  233  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.35 
 
 
309 aa  233  6e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1157  peptide ABC transporter, permease protein, putative  49.33 
 
 
473 aa  232  9e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.28 
 
 
303 aa  232  9e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.551804 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.89 
 
 
497 aa  231  1e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.826633 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3233  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  49.31 
 
 
300 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1343  peptide ABC transporter, permease protein, putative  48.46 
 
 
479 aa  231  1e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.736839  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.87 
 
 
303 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.78 
 
 
305 aa  231  1e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.95778  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.31 
 
 
300 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.7 
 
 
280 aa  230  4e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3965  hypothetical protein  49.31 
 
 
300 aa  229  5e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1222  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.08 
 
 
310 aa  229  6e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.93 
 
 
298 aa  228  9e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00781305  normal  0.217965 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2053  peptide ABC transporter permease  47.75 
 
 
303 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.942235  normal  0.455607 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.68 
 
 
310 aa  227  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.7 
 
 
280 aa  227  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1671  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.87 
 
 
293 aa  226  3e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.08 
 
 
311 aa  226  4e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5359  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  47.7 
 
 
289 aa  226  7e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.632265  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.61 
 
 
345 aa  224  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.02 
 
 
347 aa  224  1e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.435279  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1236  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.49 
 
 
284 aa  224  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143707  normal  0.209567 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.93 
 
 
285 aa  224  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.15 
 
 
293 aa  224  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  normal  0.436885 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.32 
 
 
304 aa  223  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.581816  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.83 
 
 
337 aa  223  4e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.46 
 
 
294 aa  223  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881682  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.91 
 
 
294 aa  223  6e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00097283 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.73 
 
 
299 aa  222  6e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00209608  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1570  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  41.37 
 
 
298 aa  222  7e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2172  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  41.37 
 
 
298 aa  222  7e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1688  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  41.37 
 
 
298 aa  222  8e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.175944  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01443  D-ala-D-ala transporter subunit  41.37 
 
 
298 aa  222  9e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.45304  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1674  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  41.37 
 
 
298 aa  222  9e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01455  hypothetical protein  41.37 
 
 
298 aa  222  9e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.47297  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
285 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.81 
 
 
359 aa  221  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.61209  hitchhiker  0.00385009 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0112  dipeptide transporter  41.13 
 
 
304 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4391  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  37.29 
 
 
299 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4232  oligopeptide transport system, permease  37.29 
 
 
299 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4609  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  37.29 
 
 
299 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0011  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.01 
 
 
307 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4731  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  37.29 
 
 
299 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2097  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  41.01 
 
 
298 aa  220  3e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.01 
 
 
298 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00686598  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3250  dipeptide ABC transporter, permease protein DppC, putative  41.22 
 
 
301 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193894  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1435  peptide ABC transporter, permease protein  45.15 
 
 
282 aa  219  5e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4244  oligopeptide ABC transporter, permease  36.79 
 
 
299 aa  219  5e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.07 
 
 
287 aa  219  5e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.144364 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.62 
 
 
293 aa  219  5e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000296229  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4119  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  42.45 
 
 
282 aa  219  5e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.143493 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0269  ABC transporter related protein  45.98 
 
 
867 aa  219  6e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2922  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.64 
 
 
285 aa  219  7e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5351  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  41.92 
 
 
317 aa  219  7e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.64 
 
 
299 aa  219  7.999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4111  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.6 
 
 
299 aa  219  7.999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.553979  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3847  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.91 
 
 
297 aa  218  8.999999999999998e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.88 
 
 
302 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.23 
 
 
274 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0146821  normal  0.125484 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.19 
 
 
291 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.62 
 
 
300 aa  218  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.641847 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.6 
 
 
299 aa  218  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111328  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.42 
 
 
356 aa  217  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.2 
 
 
301 aa  217  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0374  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.7 
 
 
300 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.284254  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2849  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.37 
 
 
304 aa  216  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1443  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.61 
 
 
277 aa  216  5.9999999999999996e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.486684  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3739  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.21 
 
 
300 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146994  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.26 
 
 
298 aa  215  9e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0407535  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.92 
 
 
299 aa  215  9e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16510  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  47.53 
 
 
321 aa  215  9e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.69344 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.22 
 
 
284 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.399737 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0370  nickel ABC transporter, permease subunit NikC  39.12 
 
 
284 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.55 
 
 
300 aa  215  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.5 
 
 
300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.29 
 
 
296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.09 
 
 
355 aa  213  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.49 
 
 
280 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5440  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.46 
 
 
310 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362913 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4042  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.87 
 
 
307 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0890  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  40.07 
 
 
303 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.221253  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5171  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.03 
 
 
311 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.23044 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1748  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  40.65 
 
 
294 aa  213  5.999999999999999e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.161109  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 
258 aa  212  5.999999999999999e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.289806  normal  0.295413 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2594  oligopeptide ABC transporter, permease protein  43.64 
 
 
285 aa  212  7e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>