98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3483 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3483  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
437 aa  854    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3612  extracellular solute-binding protein  38.11 
 
 
411 aa  199  7.999999999999999e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.423524  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3940  extracellular solute-binding protein  38.27 
 
 
439 aa  197  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20470  extracellular solute-binding protein family 1  25.09 
 
 
406 aa  77.8  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000403753  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0475  extracellular solute-binding protein family 1  28.44 
 
 
397 aa  63.2  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6732  extracellular solute-binding protein family 1  25.08 
 
 
425 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255639  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  22.78 
 
 
415 aa  62.8  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0712  extracellular solute-binding protein family 1  24.83 
 
 
397 aa  59.7  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.518168  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  26.64 
 
 
419 aa  58.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  25.54 
 
 
464 aa  57.4  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0984  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 
392 aa  57  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000118485  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0966  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 
392 aa  56.6  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000011003  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0238  maltose ABC transporter periplasmic protein  24.21 
 
 
396 aa  56.2  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.941451 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 
391 aa  56.2  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 
391 aa  56.2  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0914  maltose/maltodextrin ABC transporter, periplasmic maltose/maltodextrin-binding protein  24.9 
 
 
411 aa  55.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.459005  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0968  extracellular solute-binding protein  24.21 
 
 
411 aa  54.3  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155665  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3883  maltose/maltodextrin ABC transporter periplasmic maltose/maltodextrin-binding protein  24.21 
 
 
411 aa  53.9  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.265603 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11260  lipoprotein (sugar-binding) lpqY  29.11 
 
 
468 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432408 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0596  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 
390 aa  52.8  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00439649  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  27.3 
 
 
447 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1170  extracellular solute-binding protein family 1  24.74 
 
 
397 aa  52.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.441465  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.04 
 
 
439 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3956  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.15 
 
 
416 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.282171  normal  0.0187852 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  25.77 
 
 
456 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3995  maltose ABC transporter periplasmic protein  25.84 
 
 
396 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0495972  normal  0.57528 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1181  extracellular solute-binding protein  23.57 
 
 
413 aa  51.2  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000595288  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4496  maltose ABC transporter periplasmic protein  25.84 
 
 
396 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5515  maltose ABC transporter periplasmic protein  25.84 
 
 
396 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.241432  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03866  hypothetical protein  25.84 
 
 
396 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0271  extracellular solute-binding protein family 1  27.7 
 
 
387 aa  51.6  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  23.37 
 
 
431 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4586  maltose ABC transporter periplasmic protein  25.84 
 
 
396 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4274  maltose ABC transporter periplasmic protein  25.84 
 
 
396 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3962  extracellular solute-binding protein family 1  25.84 
 
 
396 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03906  maltose ABC transporter periplasmic protein  25.84 
 
 
396 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  21.83 
 
 
410 aa  51.6  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1055  extracellular solute-binding protein  21.37 
 
 
418 aa  51.6  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.404897  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  25.98 
 
 
435 aa  51.2  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  23.14 
 
 
428 aa  50.4  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  22.87 
 
 
430 aa  50.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  23.98 
 
 
424 aa  49.7  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 
433 aa  49.7  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0854  extracellular solute-binding protein family 1  23.77 
 
 
398 aa  48.5  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.124504  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  22.85 
 
 
411 aa  48.9  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  25.09 
 
 
433 aa  48.5  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4486  maltose ABC transporter periplasmic protein  23.47 
 
 
396 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  22.85 
 
 
411 aa  48.9  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2146  extracellular solute-binding protein  24.14 
 
 
414 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4623  maltose ABC transporter periplasmic protein  23.47 
 
 
396 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.108824 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  22.26 
 
 
395 aa  48.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0406  extracellular solute-binding protein family 1  25.48 
 
 
428 aa  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00219397  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4421  maltose ABC transporter periplasmic protein  23.47 
 
 
396 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100315 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4571  maltose ABC transporter periplasmic protein  23.47 
 
 
396 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.552535  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4572  maltose ABC transporter periplasmic protein  23.47 
 
 
396 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0168981 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0306  maltose ABC transporter periplasmic protein  23.6 
 
 
403 aa  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000110695  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0378  maltose ABC transporter periplasmic protein  23.6 
 
 
403 aa  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3914  maltose ABC transporter periplasmic protein  23.6 
 
 
403 aa  48.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4472  maltose ABC transporter periplasmic protein  24.88 
 
 
397 aa  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 
421 aa  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2465  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 
443 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.270585  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  22.01 
 
 
414 aa  47.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1276  extracellular solute-binding protein family 1  25.33 
 
 
417 aa  47.8  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000485827  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6528  extracellular solute-binding protein family 1  23.02 
 
 
415 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0890  extracellular solute-binding protein  33.8 
 
 
450 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.315589  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2420  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 
443 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.783182  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  24.3 
 
 
422 aa  47.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  26.79 
 
 
446 aa  47.4  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2624  extracellular solute-binding protein  23.98 
 
 
444 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2459  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 
443 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.924766  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29320  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.72 
 
 
443 aa  47  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25 
 
 
406 aa  47  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4136  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.96 
 
 
400 aa  46.6  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  23.31 
 
 
406 aa  46.6  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1438  extracellular solute-binding protein  24.25 
 
 
400 aa  46.6  0.0009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000172655  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0230  putative transporter periplasmic binding protein  26.49 
 
 
426 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  23.16 
 
 
434 aa  46.2  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1650  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.49 
 
 
426 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.572617  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0354  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.49 
 
 
426 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.824168  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3775  extracellular solute-binding protein  23.85 
 
 
441 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.577316  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0065  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.49 
 
 
426 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1232  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.49 
 
 
426 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715088  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4289  extracellular solute-binding protein family 1  25.96 
 
 
400 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1138  extracellular solute-binding protein family 1  24.51 
 
 
423 aa  45.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.443513  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1739  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.95 
 
 
426 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1073  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.49 
 
 
399 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3132  maltose ABC transporter periplasmic protein  26.79 
 
 
395 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559599  normal  0.0111617 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1118  extracellular solute-binding protein family 1  23 
 
 
400 aa  45.8  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704817  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3988  extracellular solute-binding protein family 1  25.37 
 
 
422 aa  45.1  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  22.94 
 
 
440 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4267  extracellular solute-binding protein family 1  25.3 
 
 
400 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0701  extracellular solute-binding protein family 1  21.95 
 
 
432 aa  44.3  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1296  extracellular solute-binding protein family 1  25.43 
 
 
443 aa  43.9  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 
466 aa  43.9  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 
415 aa  43.5  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  22.55 
 
 
423 aa  43.5  0.007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.8 
 
 
426 aa  43.1  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 
424 aa  43.1  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>