More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0200 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0200  molybdopterin oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
590 aa  1233    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  49.3 
 
 
745 aa  559  1e-158  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2031  putative Myb2 protein  42.03 
 
 
585 aa  451  1e-125  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.370562  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0786  formate dehydrogenase alpha subunit  43.39 
 
 
529 aa  443  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.98 
 
 
677 aa  442  1e-123  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.83 
 
 
674 aa  442  1e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.48 
 
 
674 aa  438  1e-121  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.3 
 
 
674 aa  438  1e-121  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1855  molybdopterin oxidoreductase  43.19 
 
 
527 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0473  formate dehydrogenase, chain A  39.5 
 
 
581 aa  427  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2706  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.11 
 
 
541 aa  427  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.17 
 
 
676 aa  422  1e-117  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.77 
 
 
674 aa  423  1e-117  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.52 
 
 
676 aa  420  1e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.75 
 
 
879 aa  420  1e-116  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0846  molybdopterin oxidoreductase  42.83 
 
 
527 aa  419  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.99 
 
 
676 aa  422  1e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.65 
 
 
901 aa  416  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.95 
 
 
904 aa  414  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.32 
 
 
900 aa  404  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.39 
 
 
893 aa  398  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.65 
 
 
900 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1028  putative formate dehydrogenase alpha subunit  38.45 
 
 
536 aa  392  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.6 
 
 
920 aa  394  1e-108  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.87 
 
 
917 aa  388  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.45 
 
 
893 aa  389  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.26 
 
 
893 aa  389  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.48 
 
 
687 aa  388  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.5 
 
 
898 aa  387  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  39.93 
 
 
687 aa  383  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1830  putative formate dehydrogenase alpha subunit  37.92 
 
 
536 aa  383  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1795  molybdopterin oxidoreductase  37.41 
 
 
526 aa  383  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.09 
 
 
688 aa  379  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.93 
 
 
688 aa  378  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.52 
 
 
688 aa  374  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.68 
 
 
905 aa  375  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0324  formate dehydrogenase alpha subunit  36.73 
 
 
713 aa  370  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  37.44 
 
 
689 aa  371  1e-101  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  38.08 
 
 
899 aa  366  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.48 
 
 
686 aa  366  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.97 
 
 
688 aa  366  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.57 
 
 
689 aa  367  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25280  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.98 
 
 
911 aa  362  1e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0556633 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.63 
 
 
685 aa  361  2e-98  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1781  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.87 
 
 
716 aa  359  8e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  36.47 
 
 
695 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.49 
 
 
1406 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.04 
 
 
1440 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.93 
 
 
668 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1383  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.87 
 
 
716 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.627092  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2721  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.15 
 
 
716 aa  355  8.999999999999999e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0016187  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0031  molybdopterin oxidoreductase  36.51 
 
 
528 aa  355  8.999999999999999e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.116629  normal  0.760475 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3198  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.28 
 
 
1432 aa  354  2e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.554904 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0988  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.15 
 
 
1428 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3298  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.11 
 
 
1432 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.15 
 
 
1421 aa  353  4e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1268  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.33 
 
 
716 aa  353  7e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.424555  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3051  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.76 
 
 
1424 aa  352  8e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4119  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.27 
 
 
754 aa  352  8e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1545  molybdopterin oxidoreductase  35.7 
 
 
527 aa  352  8e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0871  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.33 
 
 
1425 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.510403  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00220  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.56 
 
 
906 aa  352  1e-95  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0797991 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4746  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.19 
 
 
1111 aa  349  7e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.879601  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3493  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.15 
 
 
1425 aa  349  7e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3829  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.68 
 
 
715 aa  348  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0729  formate dehydrogenase H  34.51 
 
 
715 aa  348  1e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.708724 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3421  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.15 
 
 
1425 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0825  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.76 
 
 
1432 aa  348  1e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00541451 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.25 
 
 
886 aa  348  2e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2945  molybdopterin oxidoreductase  35.8 
 
 
542 aa  348  2e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.381249 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3682  anaerobic formate dehydrogenase, alpha subunit, -type  34.51 
 
 
715 aa  347  3e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4160  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.91 
 
 
1110 aa  346  7e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.129392  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1038  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.11 
 
 
1130 aa  344  2.9999999999999997e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4578  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.23 
 
 
723 aa  343  5e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2424  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.99 
 
 
718 aa  341  2e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.680227 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.6 
 
 
686 aa  340  5e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1753  formate dehydrogenase alpha subunit  33.22 
 
 
716 aa  339  8e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0179443  hitchhiker  0.000996092 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.71 
 
 
1410 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4111  molybdopterin oxidoreductase  36.58 
 
 
647 aa  337  3.9999999999999995e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.191585  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0555  formate dehydrogenase subunit alpha  33.16 
 
 
957 aa  336  9e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.358497 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4635  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  34.62 
 
 
559 aa  333  4e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3948  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.62 
 
 
715 aa  333  7.000000000000001e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4542  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  34.62 
 
 
715 aa  333  7.000000000000001e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4324  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  34.62 
 
 
715 aa  333  7.000000000000001e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03951  formate dehydrogenase-H, selenopolypeptide subunit  34.39 
 
 
715 aa  332  1e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.803476  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4144  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.4 
 
 
983 aa  332  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110494  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03911  hypothetical protein  34.39 
 
 
715 aa  332  1e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.988265  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.54 
 
 
1440 aa  332  1e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1282  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.99 
 
 
933 aa  331  2e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.402771 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1809  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.4 
 
 
960 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.550904  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0293  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.25 
 
 
989 aa  330  4e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1339  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.59 
 
 
662 aa  330  4e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3913  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.44 
 
 
715 aa  330  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5226  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.26 
 
 
988 aa  330  6e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2185  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.92 
 
 
960 aa  329  7e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.602321  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.95 
 
 
925 aa  329  7e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1391  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.35 
 
 
947 aa  329  8e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0281  formate dehydrogenase alpha subunit  35.25 
 
 
559 aa  329  8e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0964  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  34.59 
 
 
982 aa  329  8e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133867  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3089  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.46 
 
 
959 aa  329  9e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.440267  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>