More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_2031 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_2031  putative Myb2 protein  100 
 
 		 585 aa  1221    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.370562  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  44.89 
 
 		 745 aa  487  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0200  molybdopterin oxidoreductase domain-containing protein  42.03 
 
 		 590 aa  451  1e-125  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.33 
 
 		 677 aa  394  1e-108  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.51 
 
 		 676 aa  389  1e-106  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.39 
 
 		 674 aa  384  1e-105  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.96 
 
 		 676 aa  382  1e-105  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.24 
 
 		 674 aa  380  1e-104  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.03 
 
 		 674 aa  377  1e-103  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.04 
 
 		 674 aa  374  1e-102  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2805  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.82 
 
 		 945 aa  373  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.23 
 
 		 676 aa  374  1e-102  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.67 
 
 		 879 aa  370  1e-101  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.41 
 
 		 925 aa  370  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.39 
 
 		 900 aa  371  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2706  formate dehydrogenase, alpha subunit  38 
 
 		 541 aa  372  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.92 
 
 		 920 aa  367  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0786  formate dehydrogenase alpha subunit  38.92 
 
 		 529 aa  362  9e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.57 
 
 		 893 aa  362  2e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1109  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.03 
 
 		 963 aa  358  9.999999999999999e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.612386  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1753  formate dehydrogenase alpha subunit  35.68 
 
 		 716 aa  358  1.9999999999999998e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0179443  hitchhiker  0.000996092 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.24 
 
 		 687 aa  356  5.999999999999999e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.57 
 
 		 893 aa  356  5.999999999999999e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.41 
 
 		 904 aa  355  1e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00220  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.73 
 
 		 906 aa  353  4e-96  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0797991 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1855  molybdopterin oxidoreductase  37.89 
 
 		 527 aa  353  7e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1268  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.3 
 
 		 716 aa  350  4e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.424555  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.55 
 
 		 898 aa  349  1e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25280  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.27 
 
 		 911 aa  347  4e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0556633 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.39 
 
 		 901 aa  347  4e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0729  formate dehydrogenase H  36.82 
 
 		 715 aa  345  8.999999999999999e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.708724 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3682  anaerobic formate dehydrogenase, alpha subunit, -type  36.82 
 
 		 715 aa  345  1e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3829  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.82 
 
 		 715 aa  345  1e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151921  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4072  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.31 
 
 		 957 aa  345  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.75 
 
 		 893 aa  343  5.999999999999999e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4651  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.28 
 
 		 937 aa  343  7e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.13 
 
 		 686 aa  342  8e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2513  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.52 
 
 		 927 aa  342  8e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0190469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4578  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.07 
 
 		 723 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1028  putative formate dehydrogenase alpha subunit  37.57 
 
 		 536 aa  341  2e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0324  formate dehydrogenase alpha subunit  35.14 
 
 		 713 aa  339  7e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1545  molybdopterin oxidoreductase  35.87 
 
 		 527 aa  339  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.82 
 
 		 688 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1781  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.92 
 
 		 716 aa  339  9.999999999999999e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0281  formate dehydrogenase alpha subunit  35.74 
 
 		 559 aa  337  2.9999999999999997e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  35.3 
 
 		 695 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2721  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.22 
 
 		 716 aa  337  3.9999999999999995e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0016187  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0846  molybdopterin oxidoreductase  37.04 
 
 		 527 aa  335  1e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4635  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  35.56 
 
 		 559 aa  335  1e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4324  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  35.56 
 
 		 715 aa  335  2e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2859  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.68 
 
 		 808 aa  335  2e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.960143 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4542  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  35.56 
 
 		 715 aa  335  2e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2424  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.05 
 
 		 718 aa  334  2e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.680227 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3948  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.56 
 
 		 715 aa  335  2e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2797  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.7 
 
 		 961 aa  334  3e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265518  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0337  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.07 
 
 		 955 aa  334  3e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.21 
 
 		 917 aa  333  5e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0031  molybdopterin oxidoreductase  35.52 
 
 		 528 aa  332  9e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.116629  normal  0.760475 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3913  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.38 
 
 		 715 aa  332  1e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3470  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.14 
 
 		 963 aa  332  1e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.873157  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3266  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.66 
 
 		 988 aa  332  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271284  normal  0.20027 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03951  formate dehydrogenase-H, selenopolypeptide subunit  35.38 
 
 		 715 aa  331  3e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.803476  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6171  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.85 
 
 		 989 aa  331  3e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.796652 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1383  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.2 
 
 		 716 aa  331  3e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.627092  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03911  hypothetical protein  35.38 
 
 		 715 aa  331  3e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.988265  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4582  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.85 
 
 		 989 aa  330  4e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.656955 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5043  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.85 
 
 		 989 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.331865  normal  0.361747 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.99 
 
 		 1406 aa  330  6e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1830  putative formate dehydrogenase alpha subunit  35.75 
 
 		 536 aa  329  7e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  36.3 
 
 		 899 aa  329  8e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1795  molybdopterin oxidoreductase  35.34 
 
 		 526 aa  329  9e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.79 
 
 		 688 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.97 
 
 		 689 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0293  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.48 
 
 		 989 aa  327  3e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.97 
 
 		 900 aa  326  6e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00920  formate dehydrogenase alpha subunit  33.57 
 
 		 737 aa  324  2e-87  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5226  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.38 
 
 		 988 aa  325  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  35.79 
 
 		 689 aa  325  2e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  35.37 
 
 		 687 aa  324  2e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8358  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.38 
 
 		 988 aa  325  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0473  formate dehydrogenase, chain A  35.32 
 
 		 581 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.4 
 
 		 1410 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2823  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.68 
 
 		 949 aa  320  3e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.156592  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.43 
 
 		 688 aa  320  5e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.84 
 
 		 688 aa  319  7.999999999999999e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2249  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.86 
 
 		 903 aa  318  2e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.580662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2427  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.03 
 
 		 929 aa  318  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.45 
 
 		 905 aa  317  5e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.58 
 
 		 1440 aa  316  8e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3269  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.44 
 
 		 942 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3493  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.88 
 
 		 1425 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0871  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.7 
 
 		 1425 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.510403  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0398  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  34.54 
 
 		 1385 aa  313  7.999999999999999e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0720  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.54 
 
 		 949 aa  312  9e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.25 
 
 		 724 aa  311  2e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.52 
 
 		 1421 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4097  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.93 
 
 		 959 aa  311  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0031  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.46 
 
 		 1000 aa  311  2.9999999999999997e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0623  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.99 
 
 		 948 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.816724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0997  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.03 
 
 		 953 aa  310  4e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>