More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10693 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_10693  nucleoside diphosphate kinase  100 
 
 		 161 aa  330  5e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.371269  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4976  nucleoside diphosphate kinase  76.26 
 
 		 139 aa  224  4e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5469  Nucleoside-diphosphate kinase  71.94 
 
 		 139 aa  206  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.628942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0538  Nucleoside-diphosphate kinase  67.63 
 
 		 139 aa  196  7.999999999999999e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000118128 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2236  nucleoside diphosphate kinase  66.17 
 
 		 141 aa  185  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4382  Nucleoside-diphosphate kinase  63.31 
 
 		 139 aa  182  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.46204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2368  nucleoside diphosphate kinase  64.93 
 
 		 140 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0653822  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6029  Nucleoside-diphosphate kinase  64.75 
 
 		 139 aa  181  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.208035 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0229  nucleoside diphosphate kinase  64.18 
 
 		 140 aa  181  5.0000000000000004e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.559671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2180  nucleoside diphosphate kinase  64.18 
 
 		 140 aa  181  5.0000000000000004e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0298319  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0339  nucleoside diphosphate kinase  64.18 
 
 		 140 aa  179  1e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3648  nucleoside diphosphate kinase  63.31 
 
 		 139 aa  179  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2009  nucleoside diphosphate kinase  63.91 
 
 		 141 aa  177  4e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000148983  normal  0.309195 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0204  nucleoside diphosphate kinase  61.94 
 
 		 140 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2485  nucleoside diphosphate kinase  61.19 
 
 		 140 aa  165  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0924623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3466  nucleoside diphosphate kinase  59.7 
 
 		 140 aa  164  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.157142  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2961  nucleoside diphosphate kinase  60.45 
 
 		 140 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0984592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3160  nucleoside diphosphate kinase  55.97 
 
 		 139 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00622384 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0775  nucleoside diphosphate kinase  56.72 
 
 		 140 aa  160  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.251907 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1488  nucleoside diphosphate kinase  57.46 
 
 		 137 aa  160  6e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.118139  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2216  Nucleoside-diphosphate kinase  56.72 
 
 		 140 aa  159  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.529954  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1759  nucleoside diphosphate kinase  56.52 
 
 		 140 aa  159  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.248736 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2122  nucleoside diphosphate kinase  58.21 
 
 		 140 aa  159  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1974  nucleoside diphosphate kinase  57.89 
 
 		 140 aa  159  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.209722 
 
 
-
 
NC_004310  BR0694  nucleoside diphosphate kinase  55.97 
 
 		 140 aa  158  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.900866  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2012  nucleoside diphosphate kinase  57.14 
 
 		 140 aa  158  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.684832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2328  nucleoside diphosphate kinase  57.46 
 
 		 140 aa  158  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0225  Nucleoside-diphosphate kinase  57.89 
 
 		 137 aa  157  4e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2288  nucleoside diphosphate kinase  57.14 
 
 		 140 aa  157  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.416222 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1601  nucleoside diphosphate kinase  56.72 
 
 		 140 aa  157  5e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00859967  normal  0.254258 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0488  nucleoside diphosphate kinase  57.89 
 
 		 140 aa  157  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.94112  normal  0.716052 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2318  nucleoside diphosphate kinase  58.21 
 
 		 140 aa  157  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2164  Nucleoside-diphosphate kinase  53.73 
 
 		 139 aa  157  7e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.961833 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0685  nucleoside diphosphate kinase  55.22 
 
 		 140 aa  157  9e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4923  nucleoside diphosphate kinase  58.14 
 
 		 140 aa  156  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0403558  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0787  nucleoside diphosphate kinase  55.22 
 
 		 141 aa  155  2e-37  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.365993  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4361  nucleoside diphosphate kinase  58.14 
 
 		 140 aa  155  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.669349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0894  nucleoside diphosphate kinase  55.07 
 
 		 140 aa  155  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.139474  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1626  nucleoside diphosphate kinase  55.56 
 
 		 137 aa  154  4e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01364  nucleoside diphosphate kinase  57.46 
 
 		 143 aa  154  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1702  nucleoside diphosphate kinase  56.72 
 
 		 137 aa  154  4e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2559  nucleoside diphosphate kinase  53.73 
 
 		 137 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.17056e-35 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2686  nucleoside diphosphate kinase  53.33 
 
 		 137 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  4.77267e-18  normal  0.505951 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1110  nucleoside diphosphate kinase  51.85 
 
 		 137 aa  154  7e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000208887  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1654  nucleoside diphosphate kinase  53.73 
 
 		 137 aa  154  7e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000296551  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3873  nucleoside diphosphate kinase  52.99 
 
 		 141 aa  154  7e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.775561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2594  nucleoside diphosphate kinase  54.48 
 
 		 140 aa  153  8e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.772748  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0354  nucleoside diphosphate kinase  55.97 
 
 		 137 aa  153  9e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.773452  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0514  nucleoside diphosphate kinase  53.73 
 
 		 140 aa  152  1e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.321088  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0925  nucleoside diphosphate kinase  52.24 
 
 		 139 aa  153  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.621681 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0377  nucleoside diphosphate kinase  55.97 
 
 		 137 aa  153  1e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0968  nucleoside diphosphate kinase  55.22 
 
 		 140 aa  153  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00326747 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0233  nucleoside diphosphate kinase  56.72 
 
 		 137 aa  153  1e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0990  nucleoside diphosphate kinase  55.22 
 
 		 137 aa  152  2e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1301  nucleoside diphosphate kinase  55.97 
 
 		 143 aa  152  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.378961  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2417  nucleoside-diphosphate kinase  52.45 
 
 		 164 aa  152  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2890  Nucleoside-diphosphate kinase  53.73 
 
 		 138 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.421827  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1775  nucleoside-diphosphate kinase  54.48 
 
 		 137 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1334  nucleoside diphosphate kinase  54.07 
 
 		 137 aa  151  5e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1979  nucleoside diphosphate kinase  52.99 
 
 		 140 aa  150  8e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1079  nucleoside diphosphate kinase  54.48 
 
 		 140 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000368146 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1224  nucleoside diphosphate kinase  53.73 
 
 		 140 aa  149  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131645 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3838  nucleoside diphosphate kinase  58.21 
 
 		 140 aa  149  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.502354 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1624  nucleoside diphosphate kinase  53.33 
 
 		 141 aa  149  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.615734  hitchhiker  0.00226942 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1580  nucleoside diphosphate kinase  52.99 
 
 		 137 aa  149  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000001622  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1781  nucleoside diphosphate kinase  54.48 
 
 		 141 aa  149  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1717  nucleoside diphosphate kinase  54.48 
 
 		 141 aa  149  2e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0030  nucleoside diphosphate kinase  53.62 
 
 		 140 aa  149  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.348386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2390  nucleoside diphosphate kinase  54.48 
 
 		 143 aa  149  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00297694  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2862  nucleoside diphosphate kinase  53.73 
 
 		 143 aa  147  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.760882  hitchhiker  0.0000000204456 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3244  nucleoside diphosphate kinase  49.25 
 
 		 137 aa  147  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189269  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1601  nucleoside diphosphate kinase  51.85 
 
 		 141 aa  148  4e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.144621 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1929  nucleoside diphosphate kinase  51.85 
 
 		 141 aa  148  4e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2850  nucleoside diphosphate kinase  52.9 
 
 		 141 aa  147  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2182  nucleoside diphosphate kinase  51.88 
 
 		 146 aa  148  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3611  nucleoside diphosphate kinase  51.49 
 
 		 138 aa  147  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2310  nucleoside diphosphate kinase  52.99 
 
 		 143 aa  147  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00703116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1498  nucleoside diphosphate kinase  53.73 
 
 		 143 aa  147  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.300953  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3130  nucleoside diphosphate kinase  54.48 
 
 		 143 aa  147  6e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0990343  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2231  nucleoside diphosphate kinase  53.49 
 
 		 147 aa  147  8e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00256702  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0074  Nucleoside-diphosphate kinase  50 
 
 		 138 aa  147  8e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1822  nucleoside diphosphate kinase  54.48 
 
 		 140 aa  147  9e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2319  nucleoside diphosphate kinase  53.49 
 
 		 147 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0482879  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0474  hypothetical protein  55.91 
 
 		 130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2433  nucleoside diphosphate kinase  52.24 
 
 		 140 aa  146  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1906  nucleoside diphosphate kinase  51.85 
 
 		 143 aa  146  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1289  nucleoside diphosphate kinase  52.59 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2538  nucleoside diphosphate kinase  53.73 
 
 		 139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.565005  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2886  nucleoside diphosphate kinase  52.99 
 
 		 143 aa  145  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5149  Nucleoside-diphosphate kinase  50.75 
 
 		 139 aa  145  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.639842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1747  nucleoside diphosphate kinase  54.48 
 
 		 143 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000066664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1827  nucleoside diphosphate kinase  54.48 
 
 		 143 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00692161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01052  nucleoside diphosphate kinase  53.73 
 
 		 141 aa  144  5e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.299785  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06114  nucleoside diphosphate kinase  53.73 
 
 		 141 aa  144  5e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.109761  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1629  nucleoside diphosphate kinase  52.71 
 
 		 147 aa  144  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243843  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2183  Nucleoside-diphosphate kinase  51.11 
 
 		 141 aa  144  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450102  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0387  nucleoside diphosphate kinase  48.2 
 
 		 141 aa  144  7.0000000000000006e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1182  nucleoside diphosphate kinase  52.59 
 
 		 142 aa  143  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1656  nucleoside diphosphate kinase  53.73 
 
 		 141 aa  143  8.000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.110606  normal  0.295678 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1439  nucleoside diphosphate kinase  52.24 
 
 		 139 aa  143  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0019677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>