More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0387 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0387  nucleoside diphosphate kinase  100 
 
 		 141 aa  290  4e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004352  nucleoside diphosphate kinase  57.45 
 
 		 141 aa  174  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1289  nucleoside diphosphate kinase  59.57 
 
 		 142 aa  174  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1114  nucleoside diphosphate kinase  59.57 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.66458  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0285  nucleoside diphosphate kinase  58.87 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000362394  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3012  nucleoside diphosphate kinase  56.74 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1182  nucleoside diphosphate kinase  59.57 
 
 		 142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01064  nucleoside diphosphate kinase  56.74 
 
 		 141 aa  172  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2784  nucleoside diphosphate kinase  56.03 
 
 		 143 aa  171  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.19869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0725  nucleoside diphosphate kinase  56.74 
 
 		 144 aa  171  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2765  nucleoside diphosphate kinase  56.03 
 
 		 143 aa  171  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2896  nucleoside diphosphate kinase  56.03 
 
 		 143 aa  171  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2721  nucleoside diphosphate kinase  56.03 
 
 		 143 aa  171  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.916716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2678  nucleoside diphosphate kinase  56.03 
 
 		 143 aa  171  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0422  nucleoside diphosphate kinase  58.87 
 
 		 142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.920358  normal  0.0102374 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2741  Nucleoside-diphosphate kinase  56.74 
 
 		 143 aa  171  3.9999999999999995e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02410  nucleoside diphosphate kinase  56.03 
 
 		 143 aa  171  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1150  Nucleoside-diphosphate kinase  56.03 
 
 		 143 aa  171  5e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.306657  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2893  nucleoside diphosphate kinase  56.03 
 
 		 143 aa  171  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2669  nucleoside diphosphate kinase  56.03 
 
 		 143 aa  171  5e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02372  hypothetical protein  56.03 
 
 		 143 aa  171  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3743  nucleoside diphosphate kinase  56.03 
 
 		 143 aa  171  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1624  nucleoside diphosphate kinase  56.03 
 
 		 141 aa  170  5e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.615734  hitchhiker  0.00226942 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2802  nucleoside diphosphate kinase  56.03 
 
 		 143 aa  171  5e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1159  nucleoside diphosphate kinase  56.03 
 
 		 143 aa  171  5e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.695355  normal  0.0329875 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2164  Nucleoside-diphosphate kinase  57.04 
 
 		 139 aa  169  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.961833 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2670  nucleoside diphosphate kinase  55.32 
 
 		 143 aa  169  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.20658 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3613  nucleoside diphosphate kinase  58.87 
 
 		 141 aa  168  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.367991 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2850  nucleoside diphosphate kinase  56.03 
 
 		 141 aa  167  5e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01364  nucleoside diphosphate kinase  54.61 
 
 		 143 aa  167  6e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3130  nucleoside diphosphate kinase  55.32 
 
 		 143 aa  166  7e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0990343  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0619  nucleoside-diphosphate kinase  55.8 
 
 		 141 aa  166  8e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000154193  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1301  nucleoside diphosphate kinase  56.03 
 
 		 143 aa  166  8e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.378961  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3018  nucleoside diphosphate kinase  56.03 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1747  nucleoside diphosphate kinase  55.32 
 
 		 143 aa  166  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000066664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1827  nucleoside diphosphate kinase  55.32 
 
 		 143 aa  166  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00692161  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2274  nucleoside diphosphate kinase  54.61 
 
 		 143 aa  165  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2390  nucleoside diphosphate kinase  55.32 
 
 		 143 aa  165  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00297694  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4256  nucleoside diphosphate kinase  53.9 
 
 		 143 aa  164  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1254  nucleoside diphosphate kinase  56.03 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1906  nucleoside diphosphate kinase  53.19 
 
 		 143 aa  164  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2052  Nucleoside-diphosphate kinase  53.19 
 
 		 143 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.238298  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1430  nucleoside diphosphate kinase  53.9 
 
 		 141 aa  165  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2272  nucleoside diphosphate kinase  54.61 
 
 		 143 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000444266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40330  Nucleoside-diphosphate kinase  51.06 
 
 		 143 aa  164  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2862  nucleoside diphosphate kinase  55.32 
 
 		 143 aa  164  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.760882  hitchhiker  0.0000000204456 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2310  nucleoside diphosphate kinase  55.32 
 
 		 143 aa  164  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00703116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2141  nucleoside diphosphate kinase  53.9 
 
 		 143 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000896706  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2216  Nucleoside-diphosphate kinase  54.68 
 
 		 140 aa  163  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.529954  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2377  nucleoside diphosphate kinase  53.9 
 
 		 143 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000377324  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2389  nucleoside diphosphate kinase  53.9 
 
 		 143 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00124206  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2493  nucleoside diphosphate kinase  53.9 
 
 		 143 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000115766  hitchhiker  0.00287307 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1970  nucleoside diphosphate kinase  53.9 
 
 		 143 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570351  hitchhiker  0.000372949 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3611  nucleoside diphosphate kinase  54.41 
 
 		 138 aa  163  8e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1629  nucleoside diphosphate kinase  49.29 
 
 		 147 aa  163  9e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243843  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1123  nucleoside diphosphate kinase  54.61 
 
 		 142 aa  163  9e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592805  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1307  nucleoside diphosphate kinase  49.65 
 
 		 143 aa  161  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2319  nucleoside diphosphate kinase  48.57 
 
 		 147 aa  161  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0482879  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14820  nucleoside diphosphate kinase  49.65 
 
 		 143 aa  161  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3244  nucleoside diphosphate kinase  52.94 
 
 		 137 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189269  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2417  nucleoside-diphosphate kinase  53.9 
 
 		 164 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2231  nucleoside diphosphate kinase  48.57 
 
 		 147 aa  160  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00256702  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1498  nucleoside diphosphate kinase  52.48 
 
 		 143 aa  160  6e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.300953  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0849  nucleoside diphosphate kinase  51.77 
 
 		 141 aa  160  7e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0879  nucleoside diphosphate kinase  51.77 
 
 		 141 aa  160  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0590  nucleoside diphosphate kinase  50 
 
 		 142 aa  160  8.000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0697929  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1783  nucleoside diphosphate kinase  52.48 
 
 		 143 aa  159  8.000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000760949 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3504  nucleoside diphosphate kinase  49.65 
 
 		 143 aa  159  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1183  nucleoside diphosphate kinase  54.35 
 
 		 139 aa  159  1e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4605  nucleoside diphosphate kinase  51.77 
 
 		 141 aa  159  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.426522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2182  nucleoside diphosphate kinase  51.8 
 
 		 146 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2686  nucleoside diphosphate kinase  49.26 
 
 		 137 aa  158  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  4.77267e-18  normal  0.505951 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2190  Nucleoside-diphosphate kinase  51.06 
 
 		 142 aa  158  3e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3873  nucleoside diphosphate kinase  54.01 
 
 		 141 aa  158  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.775561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0007  nucleoside-diphosphate kinase  53.57 
 
 		 144 aa  157  4e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0647  nucleoside diphosphate kinase  51.06 
 
 		 143 aa  157  6e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.415341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1352  nucleoside-diphosphate kinase  53.33 
 
 		 135 aa  156  7e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.378261  unclonable  0.00000000000374498 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4329  nucleoside diphosphate kinase  51.06 
 
 		 141 aa  156  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000143413 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1110  nucleoside diphosphate kinase  50.74 
 
 		 137 aa  156  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000208887  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1580  nucleoside diphosphate kinase  50 
 
 		 137 aa  156  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000001622  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0892  nucleoside diphosphate kinase  51.06 
 
 		 141 aa  155  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000198835 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2559  nucleoside diphosphate kinase  49.26 
 
 		 137 aa  155  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.17056e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1654  nucleoside diphosphate kinase  49.26 
 
 		 137 aa  155  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000296551  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3160  nucleoside diphosphate kinase  51.85 
 
 		 139 aa  155  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00622384 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0225  Nucleoside-diphosphate kinase  52.21 
 
 		 137 aa  154  3e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2886  nucleoside diphosphate kinase  50.35 
 
 		 143 aa  155  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2625  nucleoside-diphosphate kinase  51.08 
 
 		 139 aa  155  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0685  nucleoside diphosphate kinase  50 
 
 		 140 aa  154  5.0000000000000005e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0678  nucleoside diphosphate kinase  51.06 
 
 		 143 aa  154  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.910925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2380  nucleoside-diphosphate kinase  50.35 
 
 		 141 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2169  nucleoside diphosphate kinase  54.29 
 
 		 140 aa  153  7e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1601  nucleoside diphosphate kinase  50 
 
 		 141 aa  153  8e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.144621 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2544  nucleoside diphosphate kinase  48.23 
 
 		 141 aa  153  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0478014  hitchhiker  0.00487946 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1929  nucleoside diphosphate kinase  50 
 
 		 141 aa  153  8e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1781  nucleoside diphosphate kinase  51.06 
 
 		 141 aa  153  9e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1430  nucleoside diphosphate kinase  49.65 
 
 		 141 aa  153  9e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1244  nucleoside diphosphate kinase  49.65 
 
 		 141 aa  153  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0560  nucleoside diphosphate kinase  50.36 
 
 		 139 aa  153  9e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1717  nucleoside diphosphate kinase  51.06 
 
 		 141 aa  153  9e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0233  nucleoside diphosphate kinase  52.94 
 
 		 137 aa  152  1e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>