More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0560 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0560  nucleoside diphosphate kinase  100 
 
 
139 aa  288  1e-77  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0893  nucleoside diphosphate kinase  64.96 
 
 
145 aa  189  9e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1183  nucleoside diphosphate kinase  63.24 
 
 
139 aa  186  1e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1117  nucleoside diphosphate kinase  63.5 
 
 
142 aa  186  1e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.357968  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1234  nucleoside-diphosphate kinase  63.24 
 
 
140 aa  182  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0263228  normal  0.0520892 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2183  Nucleoside-diphosphate kinase  59.71 
 
 
141 aa  181  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450102  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1488  nucleoside diphosphate kinase  62.5 
 
 
137 aa  181  4.0000000000000006e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.118139  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0237  nucleoside diphosphate kinase  61.03 
 
 
140 aa  181  4.0000000000000006e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.803486  normal  0.83109 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1086  nucleoside diphosphate kinase  58.99 
 
 
141 aa  180  5.0000000000000004e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.895381  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1624  nucleoside diphosphate kinase  60.43 
 
 
141 aa  180  7e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.615734  hitchhiker  0.00226942 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1311  nucleoside-diphosphate kinase  62.96 
 
 
140 aa  180  7e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.298971  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1166  nucleoside diphosphate kinase  58.99 
 
 
141 aa  179  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0084  nucleoside-diphosphate kinase  58.99 
 
 
141 aa  178  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.311434  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2612  nucleoside diphosphate kinase  58.27 
 
 
141 aa  177  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00143318  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2169  nucleoside diphosphate kinase  61.03 
 
 
140 aa  176  7e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2311  nucleoside-diphosphate kinase  58.27 
 
 
141 aa  176  9e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0861887  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2090  nucleoside diphosphate kinase  58.27 
 
 
141 aa  176  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0590  nucleoside diphosphate kinase  57.66 
 
 
142 aa  176  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0697929  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3394  nucleoside diphosphate kinase  57.55 
 
 
141 aa  175  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1420  nucleoside diphosphate kinase  57.55 
 
 
141 aa  176  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.803456  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1974  nucleoside diphosphate kinase  61.48 
 
 
140 aa  175  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.209722 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1868  nucleoside diphosphate kinase  57.55 
 
 
141 aa  175  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0894  nucleoside diphosphate kinase  61.19 
 
 
140 aa  175  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.139474  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2850  nucleoside diphosphate kinase  59.42 
 
 
141 aa  175  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2110  nucleoside diphosphate kinase  56.83 
 
 
141 aa  175  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2231  nucleoside diphosphate kinase  56.12 
 
 
141 aa  174  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.666945  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1838  nucleoside diphosphate kinase  56.12 
 
 
141 aa  174  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.629382  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2012  nucleoside diphosphate kinase  60.74 
 
 
140 aa  174  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.684832  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1348  nucleoside diphosphate kinase  56.12 
 
 
141 aa  174  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2358  nucleoside diphosphate kinase  56.12 
 
 
141 aa  174  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766138  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0059  nucleoside diphosphate kinase  56.12 
 
 
141 aa  174  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.147771  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2231  nucleoside diphosphate kinase  56.83 
 
 
141 aa  174  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2193  nucleoside diphosphate kinase  56.12 
 
 
141 aa  174  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0662762  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1110  nucleoside diphosphate kinase  56.12 
 
 
141 aa  174  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.539018  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0662  nucleoside diphosphate kinase  58.27 
 
 
141 aa  174  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0130513  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1792  nucleoside diphosphate kinase  58.27 
 
 
141 aa  174  4e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1759  nucleoside diphosphate kinase  60.29 
 
 
140 aa  174  4e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.248736 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1342  nucleoside diphosphate kinase  58.39 
 
 
139 aa  174  4e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00960069  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2052  Nucleoside-diphosphate kinase  59.71 
 
 
143 aa  174  5e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.238298  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2000  nucleoside diphosphate kinase  56.83 
 
 
141 aa  174  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.136751 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2872  nucleoside-diphosphate kinase  58.27 
 
 
141 aa  173  6e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1293  nucleoside diphosphate kinase  58.27 
 
 
141 aa  173  7e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000414366  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0849  nucleoside diphosphate kinase  56.12 
 
 
141 aa  173  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0879  nucleoside diphosphate kinase  56.12 
 
 
141 aa  173  7e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2288  nucleoside diphosphate kinase  60.74 
 
 
140 aa  173  7e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.416222 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0990  nucleoside diphosphate kinase  61.03 
 
 
137 aa  173  8e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2485  nucleoside diphosphate kinase  61.03 
 
 
140 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0924623  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0488  nucleoside diphosphate kinase  60 
 
 
140 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.94112  normal  0.716052 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1702  nucleoside diphosphate kinase  61.03 
 
 
137 aa  172  9.999999999999999e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2544  nucleoside diphosphate kinase  56.12 
 
 
141 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0478014  hitchhiker  0.00487946 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1402  nucleoside diphosphate kinase  57.25 
 
 
144 aa  172  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000394217  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2380  nucleoside-diphosphate kinase  56.83 
 
 
141 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1591  nucleoside diphosphate kinase  56.12 
 
 
141 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2961  nucleoside diphosphate kinase  60.29 
 
 
140 aa  171  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0984592  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2328  nucleoside diphosphate kinase  60.29 
 
 
140 aa  171  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0899  nucleoside-diphosphate kinase  56.83 
 
 
143 aa  170  5e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1460  nucleoside diphosphate kinase  56.12 
 
 
141 aa  170  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425797  normal  0.366312 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4329  nucleoside diphosphate kinase  56.12 
 
 
141 aa  170  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000143413 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0225  Nucleoside-diphosphate kinase  60.29 
 
 
137 aa  170  5.999999999999999e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1839  nucleoside diphosphate kinase  56.12 
 
 
141 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.587203 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6264  nucleoside diphosphate kinase  56.12 
 
 
141 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1815  nucleoside diphosphate kinase  56.12 
 
 
141 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1307  nucleoside diphosphate kinase  56.12 
 
 
143 aa  169  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14820  nucleoside diphosphate kinase  56.12 
 
 
143 aa  169  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0030  nucleoside diphosphate kinase  59.26 
 
 
140 aa  169  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.348386  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1248  nucleoside diphosphate kinase  56.12 
 
 
141 aa  169  9e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3333  nucleoside-diphosphate kinase  57.35 
 
 
140 aa  169  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.148108 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3466  nucleoside diphosphate kinase  61.03 
 
 
140 aa  169  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.157142  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4605  nucleoside diphosphate kinase  55.4 
 
 
141 aa  169  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.426522  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0892  nucleoside diphosphate kinase  56.12 
 
 
141 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000198835 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1726  nucleoside diphosphate kinase  56.12 
 
 
141 aa  169  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.204847 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1123  nucleoside diphosphate kinase  57.25 
 
 
142 aa  169  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592805  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1753  nucleoside diphosphate kinase  56.12 
 
 
141 aa  169  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1656  nucleoside diphosphate kinase  55.4 
 
 
141 aa  169  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.110606  normal  0.295678 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1423  nucleoside diphosphate kinase  56.12 
 
 
141 aa  168  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235945  normal  0.0433038 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1717  nucleoside diphosphate kinase  56.12 
 
 
141 aa  168  2e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01052  nucleoside diphosphate kinase  53.96 
 
 
141 aa  169  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.299785  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06114  nucleoside diphosphate kinase  53.96 
 
 
141 aa  169  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.109761  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1781  nucleoside diphosphate kinase  56.12 
 
 
141 aa  168  2e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1334  nucleoside diphosphate kinase  57.66 
 
 
137 aa  167  3e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1147  nucleoside diphosphate kinase  58.27 
 
 
141 aa  167  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18828  normal  0.662914 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1055  nucleoside diphosphate kinase  58.27 
 
 
141 aa  167  4e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.223396  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2318  nucleoside diphosphate kinase  60.29 
 
 
140 aa  167  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201028  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1626  nucleoside diphosphate kinase  59.12 
 
 
137 aa  167  5e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2190  Nucleoside-diphosphate kinase  57.35 
 
 
142 aa  167  6e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4361  nucleoside diphosphate kinase  55.88 
 
 
140 aa  166  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.669349  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2886  nucleoside diphosphate kinase  54.68 
 
 
143 aa  166  9e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1505  nucleoside diphosphate kinase  57.35 
 
 
141 aa  166  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1601  nucleoside diphosphate kinase  58.82 
 
 
140 aa  165  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00859967  normal  0.254258 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2992  nucleoside diphosphate kinase  57.55 
 
 
159 aa  166  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000780378  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0731  Nucleoside-diphosphate kinase  58.02 
 
 
143 aa  166  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1211  nucleoside diphosphate kinase  57.55 
 
 
141 aa  165  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2182  nucleoside diphosphate kinase  57.78 
 
 
146 aa  165  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1906  nucleoside diphosphate kinase  55.4 
 
 
143 aa  165  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0354  nucleoside diphosphate kinase  59.56 
 
 
137 aa  165  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.773452  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4923  nucleoside diphosphate kinase  55.88 
 
 
140 aa  165  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0403558  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1775  nucleoside-diphosphate kinase  58.09 
 
 
137 aa  165  2e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2122  nucleoside diphosphate kinase  58.82 
 
 
140 aa  165  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1350  nucleoside diphosphate kinase  55.15 
 
 
140 aa  164  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.388595 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0377  nucleoside diphosphate kinase  59.56 
 
 
137 aa  164  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>