More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1759 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1759  nucleoside diphosphate kinase  100 
 
 		 140 aa  285  2e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.248736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0894  nucleoside diphosphate kinase  93.57 
 
 		 140 aa  268  1e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.139474  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0030  nucleoside diphosphate kinase  85 
 
 		 140 aa  244  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.348386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3333  nucleoside-diphosphate kinase  79.29 
 
 		 140 aa  227  5e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148108 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0775  nucleoside diphosphate kinase  77.14 
 
 		 140 aa  224  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.251907 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1979  nucleoside diphosphate kinase  74.29 
 
 		 140 aa  219  8e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0514  nucleoside diphosphate kinase  75.71 
 
 		 140 aa  219  9.999999999999999e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.321088  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0694  nucleoside diphosphate kinase  75.71 
 
 		 140 aa  218  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.900866  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0685  nucleoside diphosphate kinase  75 
 
 		 140 aa  216  6e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2169  nucleoside diphosphate kinase  76.26 
 
 		 140 aa  216  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2328  nucleoside diphosphate kinase  75.71 
 
 		 140 aa  215  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1079  nucleoside diphosphate kinase  73.57 
 
 		 140 aa  214  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000368146 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1224  nucleoside diphosphate kinase  73.57 
 
 		 140 aa  215  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131645 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2594  nucleoside diphosphate kinase  73.57 
 
 		 140 aa  212  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.772748  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3160  nucleoside diphosphate kinase  72.06 
 
 		 139 aa  211  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00622384 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2961  nucleoside diphosphate kinase  72.86 
 
 		 140 aa  212  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0984592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1234  nucleoside-diphosphate kinase  72.86 
 
 		 140 aa  210  4.9999999999999996e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0263228  normal  0.0520892 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0488  nucleoside diphosphate kinase  73.91 
 
 		 140 aa  210  5.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.94112  normal  0.716052 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2485  nucleoside diphosphate kinase  72.86 
 
 		 140 aa  209  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0924623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2318  nucleoside diphosphate kinase  72.14 
 
 		 140 aa  209  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1822  nucleoside diphosphate kinase  71.43 
 
 		 140 aa  208  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2122  nucleoside diphosphate kinase  71.43 
 
 		 140 aa  207  3e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1601  nucleoside diphosphate kinase  71.43 
 
 		 140 aa  207  4e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00859967  normal  0.254258 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3466  nucleoside diphosphate kinase  71.43 
 
 		 140 aa  206  7e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.157142  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0957  nucleoside diphosphate kinase  71.43 
 
 		 140 aa  206  9e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2012  nucleoside diphosphate kinase  72.46 
 
 		 140 aa  204  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.684832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2288  nucleoside diphosphate kinase  72.46 
 
 		 140 aa  204  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.416222 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0237  nucleoside diphosphate kinase  69.06 
 
 		 140 aa  202  9e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.803486  normal  0.83109 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1552  nucleoside diphosphate kinase  74.24 
 
 		 132 aa  202  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.744593  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0968  nucleoside diphosphate kinase  70 
 
 		 140 aa  202  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00326747 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1350  nucleoside diphosphate kinase  70 
 
 		 140 aa  201  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.388595 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01364  nucleoside diphosphate kinase  69.06 
 
 		 143 aa  202  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1974  nucleoside diphosphate kinase  71.74 
 
 		 140 aa  202  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.209722 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2052  Nucleoside-diphosphate kinase  67.86 
 
 		 143 aa  202  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.238298  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1127  nucleoside diphosphate kinase  69.29 
 
 		 140 aa  200  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.355617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4923  nucleoside diphosphate kinase  69.29 
 
 		 140 aa  200  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0403558  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4361  nucleoside diphosphate kinase  69.29 
 
 		 140 aa  199  7e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.669349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2190  Nucleoside-diphosphate kinase  68.12 
 
 		 142 aa  199  9e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0925  nucleoside diphosphate kinase  68.12 
 
 		 139 aa  197  3e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.621681 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1311  nucleoside-diphosphate kinase  69.29 
 
 		 140 aa  197  5e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.298971  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2894  nucleoside diphosphate kinase  67.86 
 
 		 140 aa  196  7e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.588521  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1538  nucleoside diphosphate kinase  67.86 
 
 		 140 aa  196  7e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3838  nucleoside diphosphate kinase  73.57 
 
 		 140 aa  196  7.999999999999999e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.502354 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2433  nucleoside diphosphate kinase  67.14 
 
 		 140 aa  196  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3130  nucleoside diphosphate kinase  65.47 
 
 		 143 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0990343  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1746  nucleoside diphosphate kinase  68.57 
 
 		 140 aa  194  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2901  normal  0.105235 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1248  nucleoside diphosphate kinase  62.59 
 
 		 141 aa  192  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2862  nucleoside diphosphate kinase  64.03 
 
 		 143 aa  191  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.760882  hitchhiker  0.0000000204456 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4605  nucleoside diphosphate kinase  67.39 
 
 		 141 aa  190  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.426522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0590  nucleoside diphosphate kinase  64.49 
 
 		 142 aa  190  6e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0697929  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1439  nucleoside diphosphate kinase  65.44 
 
 		 139 aa  190  6e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0019677  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2886  nucleoside diphosphate kinase  64.03 
 
 		 143 aa  189  7e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2310  nucleoside diphosphate kinase  63.31 
 
 		 143 aa  189  8e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00703116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1601  nucleoside diphosphate kinase  63.77 
 
 		 141 aa  189  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.144621 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2390  nucleoside diphosphate kinase  63.31 
 
 		 143 aa  189  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00297694  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1929  nucleoside diphosphate kinase  63.77 
 
 		 141 aa  189  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4256  nucleoside diphosphate kinase  62.86 
 
 		 143 aa  189  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1624  nucleoside diphosphate kinase  64.49 
 
 		 141 aa  188  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.615734  hitchhiker  0.00226942 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2538  nucleoside diphosphate kinase  68.38 
 
 		 139 aa  187  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.565005  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0849  nucleoside diphosphate kinase  64.49 
 
 		 141 aa  187  5e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0879  nucleoside diphosphate kinase  64.49 
 
 		 141 aa  187  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06114  nucleoside diphosphate kinase  63.31 
 
 		 141 aa  187  5.999999999999999e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.109761  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01052  nucleoside diphosphate kinase  63.31 
 
 		 141 aa  187  5.999999999999999e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.299785  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2850  nucleoside diphosphate kinase  64.03 
 
 		 141 aa  187  5.999999999999999e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1498  nucleoside diphosphate kinase  62.59 
 
 		 143 aa  187  5.999999999999999e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.300953  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0354  nucleoside diphosphate kinase  64.44 
 
 		 137 aa  186  7e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.773452  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0377  nucleoside diphosphate kinase  64.44 
 
 		 137 aa  186  8e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2389  nucleoside diphosphate kinase  64.03 
 
 		 143 aa  186  8e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00124206  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1970  nucleoside diphosphate kinase  64.03 
 
 		 143 aa  186  8e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570351  hitchhiker  0.000372949 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2377  nucleoside diphosphate kinase  64.03 
 
 		 143 aa  186  8e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000377324  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2493  nucleoside diphosphate kinase  64.03 
 
 		 143 aa  186  8e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000115766  hitchhiker  0.00287307 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1626  nucleoside diphosphate kinase  64.93 
 
 		 137 aa  186  9e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1792  nucleoside diphosphate kinase  63.31 
 
 		 141 aa  186  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1717  nucleoside diphosphate kinase  62.59 
 
 		 141 aa  186  1e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1781  nucleoside diphosphate kinase  62.59 
 
 		 141 aa  186  1e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1656  nucleoside diphosphate kinase  64.03 
 
 		 141 aa  186  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.110606  normal  0.295678 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1747  nucleoside diphosphate kinase  63.31 
 
 		 143 aa  185  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000066664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1827  nucleoside diphosphate kinase  63.31 
 
 		 143 aa  185  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00692161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2417  nucleoside-diphosphate kinase  61.87 
 
 		 164 aa  186  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2141  nucleoside diphosphate kinase  63.31 
 
 		 143 aa  185  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000896706  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1783  nucleoside diphosphate kinase  61.87 
 
 		 143 aa  185  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000760949 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4329  nucleoside diphosphate kinase  64.49 
 
 		 141 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000143413 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2272  nucleoside diphosphate kinase  63.31 
 
 		 143 aa  185  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000444266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2164  Nucleoside-diphosphate kinase  63.24 
 
 		 139 aa  184  3e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.961833 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1301  nucleoside diphosphate kinase  61.15 
 
 		 143 aa  184  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.378961  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2890  Nucleoside-diphosphate kinase  62.5 
 
 		 138 aa  184  4e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.421827  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1430  nucleoside diphosphate kinase  64.49 
 
 		 141 aa  183  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2183  Nucleoside-diphosphate kinase  62.41 
 
 		 141 aa  184  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450102  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1244  nucleoside diphosphate kinase  64.49 
 
 		 141 aa  183  5e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2380  nucleoside-diphosphate kinase  63.97 
 
 		 141 aa  184  5e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1342  nucleoside diphosphate kinase  58.7 
 
 		 139 aa  182  9e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00960069  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0892  nucleoside diphosphate kinase  63.77 
 
 		 141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000198835 
 
 
-
 
NC_002620  TC0787  nucleoside diphosphate kinase  62.96 
 
 		 141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.365993  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1289  nucleoside diphosphate kinase  61.59 
 
 		 142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2274  nucleoside diphosphate kinase  61.87 
 
 		 143 aa  181  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1402  nucleoside diphosphate kinase  58.39 
 
 		 144 aa  181  3e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000394217  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1114  nucleoside diphosphate kinase  60.87 
 
 		 143 aa  181  4.0000000000000006e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.66458  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1906  nucleoside diphosphate kinase  61.15 
 
 		 143 aa  180  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3504  nucleoside diphosphate kinase  62.86 
 
 		 143 aa  180  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1182  nucleoside diphosphate kinase  61.59 
 
 		 142 aa  180  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>