More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1488 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1488  nucleoside diphosphate kinase  100 
 
 
137 aa  280  6.000000000000001e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.118139  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0990  nucleoside diphosphate kinase  86.13 
 
 
137 aa  244  4e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1702  nucleoside diphosphate kinase  85.4 
 
 
137 aa  241  1.9999999999999999e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0233  nucleoside diphosphate kinase  79.56 
 
 
137 aa  224  2e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0225  Nucleoside-diphosphate kinase  77.21 
 
 
137 aa  213  5.9999999999999996e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2183  Nucleoside-diphosphate kinase  73.53 
 
 
141 aa  213  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450102  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0377  nucleoside diphosphate kinase  76.64 
 
 
137 aa  211  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0354  nucleoside diphosphate kinase  76.64 
 
 
137 aa  211  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.773452  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1334  nucleoside diphosphate kinase  74.45 
 
 
137 aa  209  1e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1166  nucleoside diphosphate kinase  73.53 
 
 
141 aa  208  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1626  nucleoside diphosphate kinase  76.47 
 
 
137 aa  208  2e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1775  nucleoside-diphosphate kinase  72.99 
 
 
137 aa  207  5e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1086  nucleoside diphosphate kinase  72.79 
 
 
141 aa  206  7e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.895381  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1624  nucleoside diphosphate kinase  74.26 
 
 
141 aa  205  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.615734  hitchhiker  0.00226942 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1420  nucleoside diphosphate kinase  71.32 
 
 
141 aa  204  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.803456  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1307  nucleoside diphosphate kinase  72.26 
 
 
143 aa  203  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14820  nucleoside diphosphate kinase  72.26 
 
 
143 aa  203  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40330  Nucleoside-diphosphate kinase  71.53 
 
 
143 aa  202  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0849  nucleoside diphosphate kinase  72.26 
 
 
141 aa  200  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0879  nucleoside diphosphate kinase  72.26 
 
 
141 aa  200  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4605  nucleoside diphosphate kinase  70.8 
 
 
141 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.426522  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3394  nucleoside diphosphate kinase  69.85 
 
 
141 aa  197  3e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2850  nucleoside diphosphate kinase  70.59 
 
 
141 aa  197  3e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0084  nucleoside-diphosphate kinase  69.12 
 
 
141 aa  197  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.311434  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2886  nucleoside diphosphate kinase  68.61 
 
 
143 aa  196  6e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4329  nucleoside diphosphate kinase  71.53 
 
 
141 aa  197  6e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000143413 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2989  nucleoside diphosphate kinase  71.43 
 
 
142 aa  196  7e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0674599  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0899  nucleoside-diphosphate kinase  66.42 
 
 
143 aa  196  7.999999999999999e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3504  nucleoside diphosphate kinase  68.61 
 
 
143 aa  196  7.999999999999999e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1792  nucleoside diphosphate kinase  67.15 
 
 
141 aa  196  9e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1505  nucleoside diphosphate kinase  70.59 
 
 
141 aa  196  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1478  nucleoside diphosphate kinase  70.59 
 
 
141 aa  196  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2090  nucleoside diphosphate kinase  69.12 
 
 
141 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0590  nucleoside diphosphate kinase  68.38 
 
 
142 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0697929  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2052  Nucleoside-diphosphate kinase  70.07 
 
 
143 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.238298  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2311  nucleoside-diphosphate kinase  69.12 
 
 
141 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0861887  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2872  nucleoside-diphosphate kinase  68.38 
 
 
141 aa  195  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0892  nucleoside diphosphate kinase  70.8 
 
 
141 aa  194  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000198835 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2110  nucleoside diphosphate kinase  66.91 
 
 
141 aa  193  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2992  nucleoside diphosphate kinase  67.15 
 
 
159 aa  193  8.000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000780378  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0662  nucleoside diphosphate kinase  67.65 
 
 
141 aa  192  9e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0130513  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1342  nucleoside diphosphate kinase  68.38 
 
 
139 aa  192  1e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00960069  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0059  nucleoside diphosphate kinase  68.7 
 
 
141 aa  192  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.147771  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1348  nucleoside diphosphate kinase  68.7 
 
 
141 aa  192  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2358  nucleoside diphosphate kinase  68.7 
 
 
141 aa  192  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766138  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2193  nucleoside diphosphate kinase  68.7 
 
 
141 aa  192  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0662762  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1110  nucleoside diphosphate kinase  68.7 
 
 
141 aa  192  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.539018  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2231  nucleoside diphosphate kinase  68.7 
 
 
141 aa  192  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.666945  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06114  nucleoside diphosphate kinase  65.69 
 
 
141 aa  192  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.109761  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01052  nucleoside diphosphate kinase  65.69 
 
 
141 aa  192  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.299785  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1838  nucleoside diphosphate kinase  68.7 
 
 
141 aa  192  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.629382  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3333  nucleoside-diphosphate kinase  65.69 
 
 
140 aa  191  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.148108 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1601  nucleoside diphosphate kinase  67.65 
 
 
141 aa  192  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.144621 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2000  nucleoside diphosphate kinase  67.65 
 
 
141 aa  192  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.136751 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2612  nucleoside diphosphate kinase  68.38 
 
 
141 aa  191  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00143318  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1929  nucleoside diphosphate kinase  67.65 
 
 
141 aa  192  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1402  nucleoside diphosphate kinase  68.15 
 
 
144 aa  191  3e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000394217  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1248  nucleoside diphosphate kinase  64.96 
 
 
141 aa  191  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1868  nucleoside diphosphate kinase  67.65 
 
 
141 aa  191  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2231  nucleoside diphosphate kinase  68.7 
 
 
141 aa  191  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1293  nucleoside diphosphate kinase  66.91 
 
 
141 aa  191  4e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000414366  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1055  nucleoside diphosphate kinase  71.32 
 
 
141 aa  190  5e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.223396  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2190  Nucleoside-diphosphate kinase  67.15 
 
 
142 aa  190  5e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1147  nucleoside diphosphate kinase  71.32 
 
 
141 aa  190  5e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18828  normal  0.662914 
 
 
-
 
NC_002620  TC0787  nucleoside diphosphate kinase  67.88 
 
 
141 aa  189  8e-48  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.365993  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0731  Nucleoside-diphosphate kinase  66.91 
 
 
143 aa  189  8e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1717  nucleoside diphosphate kinase  66.42 
 
 
141 aa  189  9e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1781  nucleoside diphosphate kinase  66.42 
 
 
141 aa  189  9e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2544  nucleoside diphosphate kinase  68.7 
 
 
141 aa  189  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0478014  hitchhiker  0.00487946 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1430  nucleoside diphosphate kinase  67.88 
 
 
141 aa  189  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1244  nucleoside diphosphate kinase  67.88 
 
 
141 aa  189  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1591  nucleoside diphosphate kinase  68.7 
 
 
141 aa  189  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1656  nucleoside diphosphate kinase  65.69 
 
 
141 aa  189  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.110606  normal  0.295678 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2182  nucleoside diphosphate kinase  69.23 
 
 
146 aa  188  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2380  nucleoside-diphosphate kinase  67.18 
 
 
141 aa  188  2.9999999999999997e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2231  nucleoside diphosphate kinase  67.94 
 
 
147 aa  187  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00256702  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2319  nucleoside diphosphate kinase  67.94 
 
 
147 aa  187  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0482879  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1460  nucleoside diphosphate kinase  68.7 
 
 
141 aa  187  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425797  normal  0.366312 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1123  nucleoside diphosphate kinase  68.38 
 
 
142 aa  186  5.999999999999999e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592805  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1629  nucleoside diphosphate kinase  67.94 
 
 
147 aa  186  7e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243843  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01364  nucleoside diphosphate kinase  66.42 
 
 
143 aa  186  9e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1211  nucleoside diphosphate kinase  69.12 
 
 
141 aa  185  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1839  nucleoside diphosphate kinase  67.94 
 
 
141 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.587203 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6264  nucleoside diphosphate kinase  67.94 
 
 
141 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1815  nucleoside diphosphate kinase  67.94 
 
 
141 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5023  nucleoside diphosphate kinase  67.65 
 
 
141 aa  184  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447003  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2169  nucleoside diphosphate kinase  64.23 
 
 
140 aa  184  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1726  nucleoside diphosphate kinase  67.94 
 
 
141 aa  185  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.204847 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0237  nucleoside diphosphate kinase  64.71 
 
 
140 aa  184  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.803486  normal  0.83109 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1423  nucleoside diphosphate kinase  67.18 
 
 
141 aa  185  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235945  normal  0.0433038 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1753  nucleoside diphosphate kinase  67.94 
 
 
141 aa  185  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3130  nucleoside diphosphate kinase  64.96 
 
 
143 aa  182  9e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0990343  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0560  nucleoside diphosphate kinase  62.5 
 
 
139 aa  181  4.0000000000000006e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1311  nucleoside-diphosphate kinase  63.24 
 
 
140 aa  180  5.0000000000000004e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.298971  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1747  nucleoside diphosphate kinase  62.77 
 
 
143 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000066664  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1827  nucleoside diphosphate kinase  62.77 
 
 
143 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00692161  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2141  nucleoside diphosphate kinase  62.77 
 
 
143 aa  180  6e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000896706  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2272  nucleoside diphosphate kinase  62.77 
 
 
143 aa  180  6e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000444266  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2389  nucleoside diphosphate kinase  62.04 
 
 
143 aa  179  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00124206  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1906  nucleoside diphosphate kinase  64.96 
 
 
143 aa  179  1e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>