More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3333 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3333  nucleoside-diphosphate kinase  100 
 
 		 140 aa  285  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148108 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0030  nucleoside diphosphate kinase  83.57 
 
 		 140 aa  237  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.348386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1234  nucleoside-diphosphate kinase  78.57 
 
 		 140 aa  232  1.0000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0263228  normal  0.0520892 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1759  nucleoside diphosphate kinase  79.29 
 
 		 140 aa  227  5e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.248736 
 
 
-
 
NC_004310  BR0694  nucleoside diphosphate kinase  77.86 
 
 		 140 aa  226  6e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.900866  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0685  nucleoside diphosphate kinase  77.14 
 
 		 140 aa  225  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2594  nucleoside diphosphate kinase  75.71 
 
 		 140 aa  223  7e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.772748  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0894  nucleoside diphosphate kinase  77.86 
 
 		 140 aa  222  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.139474  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0957  nucleoside diphosphate kinase  77.14 
 
 		 140 aa  221  4e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2894  nucleoside diphosphate kinase  75 
 
 		 140 aa  218  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.588521  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1538  nucleoside diphosphate kinase  75 
 
 		 140 aa  218  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1248  nucleoside diphosphate kinase  70.5 
 
 		 141 aa  217  3.9999999999999997e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2169  nucleoside diphosphate kinase  76.98 
 
 		 140 aa  217  5e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1979  nucleoside diphosphate kinase  72.86 
 
 		 140 aa  216  6e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1127  nucleoside diphosphate kinase  74.29 
 
 		 140 aa  216  7.999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.355617 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0775  nucleoside diphosphate kinase  75 
 
 		 140 aa  216  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.251907 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1224  nucleoside diphosphate kinase  74.29 
 
 		 140 aa  216  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131645 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1079  nucleoside diphosphate kinase  74.29 
 
 		 140 aa  216  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000368146 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01364  nucleoside diphosphate kinase  74.1 
 
 		 143 aa  215  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1822  nucleoside diphosphate kinase  72.14 
 
 		 140 aa  213  5e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3130  nucleoside diphosphate kinase  73.38 
 
 		 143 aa  213  5e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0990343  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1350  nucleoside diphosphate kinase  73.57 
 
 		 140 aa  212  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.388595 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2328  nucleoside diphosphate kinase  76.43 
 
 		 140 aa  211  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0514  nucleoside diphosphate kinase  71.43 
 
 		 140 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.321088  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1311  nucleoside-diphosphate kinase  74.29 
 
 		 140 aa  211  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.298971  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2886  nucleoside diphosphate kinase  69.78 
 
 		 143 aa  210  5.999999999999999e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0590  nucleoside diphosphate kinase  69.57 
 
 		 142 aa  208  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0697929  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0925  nucleoside diphosphate kinase  71.01 
 
 		 139 aa  207  3e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.621681 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1746  nucleoside diphosphate kinase  70.71 
 
 		 140 aa  204  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2901  normal  0.105235 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2961  nucleoside diphosphate kinase  72.14 
 
 		 140 aa  204  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0984592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2190  Nucleoside-diphosphate kinase  69.57 
 
 		 142 aa  204  4e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1792  nucleoside diphosphate kinase  69.06 
 
 		 141 aa  203  5e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1624  nucleoside diphosphate kinase  69.57 
 
 		 141 aa  203  6e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.615734  hitchhiker  0.00226942 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2850  nucleoside diphosphate kinase  68.35 
 
 		 141 aa  203  7e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2183  Nucleoside-diphosphate kinase  69.17 
 
 		 141 aa  203  8e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450102  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4256  nucleoside diphosphate kinase  69.06 
 
 		 143 aa  202  9e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1342  nucleoside diphosphate kinase  67.39 
 
 		 139 aa  202  9e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00960069  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3160  nucleoside diphosphate kinase  68.61 
 
 		 139 aa  202  9e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00622384 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1293  nucleoside diphosphate kinase  68.42 
 
 		 141 aa  202  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000414366  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0662  nucleoside diphosphate kinase  69.17 
 
 		 141 aa  202  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0130513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0990  nucleoside diphosphate kinase  67.88 
 
 		 137 aa  202  2e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1402  nucleoside diphosphate kinase  67.15 
 
 		 144 aa  201  3e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000394217  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1702  nucleoside diphosphate kinase  68.61 
 
 		 137 aa  201  3e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2380  nucleoside-diphosphate kinase  68.12 
 
 		 141 aa  201  3e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3394  nucleoside diphosphate kinase  67.67 
 
 		 141 aa  200  5e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0849  nucleoside diphosphate kinase  69.57 
 
 		 141 aa  200  6e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1868  nucleoside diphosphate kinase  69.92 
 
 		 141 aa  200  6e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0879  nucleoside diphosphate kinase  69.57 
 
 		 141 aa  200  6e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2052  Nucleoside-diphosphate kinase  67.14 
 
 		 143 aa  199  7e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.238298  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1123  nucleoside diphosphate kinase  67.63 
 
 		 142 aa  199  9e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592805  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2485  nucleoside diphosphate kinase  70.71 
 
 		 140 aa  199  9e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0924623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0488  nucleoside diphosphate kinase  71.01 
 
 		 140 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.94112  normal  0.716052 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1580  nucleoside diphosphate kinase  67.15 
 
 		 137 aa  198  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000001622  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0237  nucleoside diphosphate kinase  68.35 
 
 		 140 aa  198  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.803486  normal  0.83109 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2390  nucleoside diphosphate kinase  68.35 
 
 		 143 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00297694  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2989  nucleoside diphosphate kinase  69.17 
 
 		 142 aa  197  3e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0674599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0899  nucleoside-diphosphate kinase  65.47 
 
 		 143 aa  198  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2318  nucleoside diphosphate kinase  70.71 
 
 		 140 aa  197  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0354  nucleoside diphosphate kinase  67.88 
 
 		 137 aa  197  3.9999999999999996e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.773452  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2122  nucleoside diphosphate kinase  72.14 
 
 		 140 aa  197  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2433  nucleoside diphosphate kinase  67.86 
 
 		 140 aa  197  3.9999999999999996e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1626  nucleoside diphosphate kinase  68.38 
 
 		 137 aa  197  5e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2090  nucleoside diphosphate kinase  66.92 
 
 		 141 aa  197  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1307  nucleoside diphosphate kinase  66.91 
 
 		 143 aa  197  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14820  nucleoside diphosphate kinase  66.91 
 
 		 143 aa  197  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0377  nucleoside diphosphate kinase  67.88 
 
 		 137 aa  197  6e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2000  nucleoside diphosphate kinase  66.92 
 
 		 141 aa  196  7.999999999999999e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.136751 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4329  nucleoside diphosphate kinase  68.84 
 
 		 141 aa  196  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000143413 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2110  nucleoside diphosphate kinase  66.17 
 
 		 141 aa  196  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0731  Nucleoside-diphosphate kinase  66.91 
 
 		 143 aa  196  7.999999999999999e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2862  nucleoside diphosphate kinase  66.91 
 
 		 143 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.760882  hitchhiker  0.0000000204456 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1430  nucleoside diphosphate kinase  68.84 
 
 		 141 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1244  nucleoside diphosphate kinase  68.84 
 
 		 141 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2389  nucleoside diphosphate kinase  67.63 
 
 		 143 aa  195  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00124206  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1086  nucleoside diphosphate kinase  68.42 
 
 		 141 aa  195  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.895381  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2493  nucleoside diphosphate kinase  67.63 
 
 		 143 aa  195  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000115766  hitchhiker  0.00287307 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2612  nucleoside diphosphate kinase  68.42 
 
 		 141 aa  195  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00143318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1591  nucleoside diphosphate kinase  67.67 
 
 		 141 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2377  nucleoside diphosphate kinase  67.63 
 
 		 143 aa  195  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000377324  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1970  nucleoside diphosphate kinase  67.63 
 
 		 143 aa  195  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570351  hitchhiker  0.000372949 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1552  nucleoside diphosphate kinase  73.48 
 
 		 132 aa  196  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.744593  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1110  nucleoside diphosphate kinase  66.42 
 
 		 137 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000208887  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0084  nucleoside-diphosphate kinase  67.67 
 
 		 141 aa  195  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.311434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2417  nucleoside-diphosphate kinase  66.91 
 
 		 164 aa  194  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1110  nucleoside diphosphate kinase  66.17 
 
 		 141 aa  194  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.539018  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0059  nucleoside diphosphate kinase  66.17 
 
 		 141 aa  194  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.147771  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1348  nucleoside diphosphate kinase  66.17 
 
 		 141 aa  194  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2141  nucleoside diphosphate kinase  66.91 
 
 		 143 aa  194  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000896706  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2358  nucleoside diphosphate kinase  66.17 
 
 		 141 aa  194  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766138  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2310  nucleoside diphosphate kinase  66.19 
 
 		 143 aa  194  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00703116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2231  nucleoside diphosphate kinase  66.17 
 
 		 141 aa  194  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.666945  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1838  nucleoside diphosphate kinase  66.17 
 
 		 141 aa  194  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.629382  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0892  nucleoside diphosphate kinase  68.12 
 
 		 141 aa  194  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000198835 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1301  nucleoside diphosphate kinase  66.19 
 
 		 143 aa  194  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.378961  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2193  nucleoside diphosphate kinase  66.17 
 
 		 141 aa  194  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0662762  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2992  nucleoside diphosphate kinase  66.91 
 
 		 159 aa  194  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000780378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2272  nucleoside diphosphate kinase  66.91 
 
 		 143 aa  194  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000444266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1423  nucleoside diphosphate kinase  65.93 
 
 		 141 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235945  normal  0.0433038 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1906  nucleoside diphosphate kinase  66.91 
 
 		 143 aa  194  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2231  nucleoside diphosphate kinase  66.92 
 
 		 141 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>