More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0237 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0237  nucleoside diphosphate kinase  100 
 
 		 140 aa  286  9e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.803486  normal  0.83109 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1624  nucleoside diphosphate kinase  72.46 
 
 		 141 aa  213  7e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.615734  hitchhiker  0.00226942 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2169  nucleoside diphosphate kinase  74.82 
 
 		 140 aa  212  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1311  nucleoside-diphosphate kinase  72.66 
 
 		 140 aa  212  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.298971  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1350  nucleoside diphosphate kinase  69.78 
 
 		 140 aa  203  7e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.388595 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1759  nucleoside diphosphate kinase  69.06 
 
 		 140 aa  202  9e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.248736 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4923  nucleoside diphosphate kinase  69.78 
 
 		 140 aa  202  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0403558  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2328  nucleoside diphosphate kinase  70.5 
 
 		 140 aa  202  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0488  nucleoside diphosphate kinase  67.39 
 
 		 140 aa  201  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.94112  normal  0.716052 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4361  nucleoside diphosphate kinase  69.06 
 
 		 140 aa  201  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.669349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0030  nucleoside diphosphate kinase  68.35 
 
 		 140 aa  201  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.348386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0894  nucleoside diphosphate kinase  67.63 
 
 		 140 aa  201  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.139474  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1746  nucleoside diphosphate kinase  70.5 
 
 		 140 aa  201  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2901  normal  0.105235 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0225  Nucleoside-diphosphate kinase  71.85 
 
 		 137 aa  200  4e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1334  nucleoside diphosphate kinase  68.38 
 
 		 137 aa  199  9.999999999999999e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3333  nucleoside-diphosphate kinase  68.35 
 
 		 140 aa  198  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148108 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1538  nucleoside diphosphate kinase  69.78 
 
 		 140 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2894  nucleoside diphosphate kinase  69.78 
 
 		 140 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.588521  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2318  nucleoside diphosphate kinase  69.78 
 
 		 140 aa  197  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2122  nucleoside diphosphate kinase  68.35 
 
 		 140 aa  197  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1127  nucleoside diphosphate kinase  69.78 
 
 		 140 aa  197  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.355617 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0957  nucleoside diphosphate kinase  66.91 
 
 		 140 aa  197  3.9999999999999996e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1974  nucleoside diphosphate kinase  66.67 
 
 		 140 aa  197  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.209722 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2961  nucleoside diphosphate kinase  67.63 
 
 		 140 aa  196  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0984592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2612  nucleoside diphosphate kinase  67.39 
 
 		 141 aa  196  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00143318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1601  nucleoside diphosphate kinase  66.91 
 
 		 140 aa  194  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00859967  normal  0.254258 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1868  nucleoside diphosphate kinase  67.39 
 
 		 141 aa  195  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2012  nucleoside diphosphate kinase  65.94 
 
 		 140 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.684832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1234  nucleoside-diphosphate kinase  66.91 
 
 		 140 aa  195  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0263228  normal  0.0520892 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1656  nucleoside diphosphate kinase  66.19 
 
 		 141 aa  194  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.110606  normal  0.295678 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0990  nucleoside diphosphate kinase  67.65 
 
 		 137 aa  194  3e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3466  nucleoside diphosphate kinase  66.91 
 
 		 140 aa  194  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.157142  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2538  nucleoside diphosphate kinase  70.07 
 
 		 139 aa  194  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.565005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2288  nucleoside diphosphate kinase  65.94 
 
 		 140 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.416222 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2544  nucleoside diphosphate kinase  65.94 
 
 		 141 aa  193  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0478014  hitchhiker  0.00487946 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2850  nucleoside diphosphate kinase  65.47 
 
 		 141 aa  193  8.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2485  nucleoside diphosphate kinase  66.91 
 
 		 140 aa  192  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0924623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2311  nucleoside-diphosphate kinase  69.17 
 
 		 141 aa  192  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0861887  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1591  nucleoside diphosphate kinase  65.94 
 
 		 141 aa  192  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2190  Nucleoside-diphosphate kinase  65.94 
 
 		 142 aa  192  1e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0233  nucleoside diphosphate kinase  68.38 
 
 		 137 aa  192  1e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1702  nucleoside diphosphate kinase  67.65 
 
 		 137 aa  191  2e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1781  nucleoside diphosphate kinase  65.47 
 
 		 141 aa  191  3e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1717  nucleoside diphosphate kinase  65.47 
 
 		 141 aa  191  3e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1307  nucleoside diphosphate kinase  66.91 
 
 		 143 aa  191  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3394  nucleoside diphosphate kinase  67.67 
 
 		 141 aa  190  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0968  nucleoside diphosphate kinase  66.19 
 
 		 140 aa  191  4e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00326747 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14820  nucleoside diphosphate kinase  66.91 
 
 		 143 aa  191  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2052  Nucleoside-diphosphate kinase  65.47 
 
 		 143 aa  190  5e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.238298  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1086  nucleoside diphosphate kinase  65.94 
 
 		 141 aa  190  5e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.895381  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1822  nucleoside diphosphate kinase  64.75 
 
 		 140 aa  190  6e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_004310  BR0694  nucleoside diphosphate kinase  66.91 
 
 		 140 aa  189  7e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.900866  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0775  nucleoside diphosphate kinase  66.19 
 
 		 140 aa  190  7e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.251907 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0084  nucleoside-diphosphate kinase  65 
 
 		 141 aa  190  7e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.311434  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0377  nucleoside diphosphate kinase  66.91 
 
 		 137 aa  189  1e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1626  nucleoside diphosphate kinase  67.41 
 
 		 137 aa  189  1e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1166  nucleoside diphosphate kinase  66.92 
 
 		 141 aa  189  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0354  nucleoside diphosphate kinase  66.91 
 
 		 137 aa  189  1e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.773452  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01052  nucleoside diphosphate kinase  63.31 
 
 		 141 aa  189  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.299785  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0685  nucleoside diphosphate kinase  66.19 
 
 		 140 aa  188  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0849  nucleoside diphosphate kinase  65.94 
 
 		 141 aa  188  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1183  nucleoside diphosphate kinase  62.59 
 
 		 139 aa  188  2e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06114  nucleoside diphosphate kinase  63.31 
 
 		 141 aa  189  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.109761  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0879  nucleoside diphosphate kinase  65.94 
 
 		 141 aa  188  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2183  Nucleoside-diphosphate kinase  67.91 
 
 		 141 aa  188  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450102  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2989  nucleoside diphosphate kinase  66.17 
 
 		 142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0674599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2594  nucleoside diphosphate kinase  65.47 
 
 		 140 aa  187  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.772748  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0514  nucleoside diphosphate kinase  64.03 
 
 		 140 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.321088  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1601  nucleoside diphosphate kinase  64.75 
 
 		 141 aa  187  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.144621 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40330  Nucleoside-diphosphate kinase  66.19 
 
 		 143 aa  187  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1929  nucleoside diphosphate kinase  64.75 
 
 		 141 aa  187  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4605  nucleoside diphosphate kinase  65.94 
 
 		 141 aa  187  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.426522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1775  nucleoside-diphosphate kinase  65.19 
 
 		 137 aa  187  5.999999999999999e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2872  nucleoside-diphosphate kinase  67.67 
 
 		 141 aa  187  5.999999999999999e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2231  nucleoside diphosphate kinase  63.04 
 
 		 141 aa  186  7e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1979  nucleoside diphosphate kinase  63.31 
 
 		 140 aa  186  7e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3838  nucleoside diphosphate kinase  69.06 
 
 		 140 aa  186  8e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.502354 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1110  nucleoside diphosphate kinase  62.32 
 
 		 141 aa  186  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.539018  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2193  nucleoside diphosphate kinase  62.32 
 
 		 141 aa  186  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0662762  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1348  nucleoside diphosphate kinase  62.32 
 
 		 141 aa  186  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1838  nucleoside diphosphate kinase  62.32 
 
 		 141 aa  186  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.629382  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2090  nucleoside diphosphate kinase  67.67 
 
 		 141 aa  185  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2358  nucleoside diphosphate kinase  62.32 
 
 		 141 aa  186  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766138  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1420  nucleoside diphosphate kinase  65.41 
 
 		 141 aa  186  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.803456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2231  nucleoside diphosphate kinase  62.32 
 
 		 141 aa  186  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.666945  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0059  nucleoside diphosphate kinase  62.32 
 
 		 141 aa  186  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.147771  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1342  nucleoside diphosphate kinase  62.59 
 
 		 139 aa  186  1e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00960069  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0662  nucleoside diphosphate kinase  63.31 
 
 		 141 aa  185  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0130513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2992  nucleoside diphosphate kinase  63.31 
 
 		 159 aa  185  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000780378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2433  nucleoside diphosphate kinase  63.31 
 
 		 140 aa  185  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0590  nucleoside diphosphate kinase  64.49 
 
 		 142 aa  184  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0697929  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1488  nucleoside diphosphate kinase  64.71 
 
 		 137 aa  184  2e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.118139  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4329  nucleoside diphosphate kinase  65.22 
 
 		 141 aa  184  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000143413 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2380  nucleoside-diphosphate kinase  62.32 
 
 		 141 aa  184  3e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1839  nucleoside diphosphate kinase  63.04 
 
 		 141 aa  184  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.587203 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6264  nucleoside diphosphate kinase  63.04 
 
 		 141 aa  184  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1815  nucleoside diphosphate kinase  63.04 
 
 		 141 aa  184  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1423  nucleoside diphosphate kinase  63.04 
 
 		 141 aa  184  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235945  normal  0.0433038 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1293  nucleoside diphosphate kinase  61.87 
 
 		 141 aa  184  5e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000414366  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1402  nucleoside diphosphate kinase  62.77 
 
 		 144 aa  183  5e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000394217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>