More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1293 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1293  nucleoside diphosphate kinase  100 
 
 		 141 aa  287  4e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000414366  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0662  nucleoside diphosphate kinase  97.87 
 
 		 141 aa  284  4e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0130513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2090  nucleoside diphosphate kinase  86.52 
 
 		 141 aa  257  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3394  nucleoside diphosphate kinase  87.23 
 
 		 141 aa  256  5.0000000000000005e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2000  nucleoside diphosphate kinase  86.52 
 
 		 141 aa  255  1e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.136751 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2110  nucleoside diphosphate kinase  85.82 
 
 		 141 aa  255  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1460  nucleoside diphosphate kinase  85.82 
 
 		 141 aa  251  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425797  normal  0.366312 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1726  nucleoside diphosphate kinase  85.82 
 
 		 141 aa  250  6e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.204847 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1753  nucleoside diphosphate kinase  85.82 
 
 		 141 aa  250  6e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1839  nucleoside diphosphate kinase  85.82 
 
 		 141 aa  249  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.587203 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6264  nucleoside diphosphate kinase  85.82 
 
 		 141 aa  249  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1815  nucleoside diphosphate kinase  85.82 
 
 		 141 aa  249  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2231  nucleoside diphosphate kinase  83.69 
 
 		 141 aa  248  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1423  nucleoside diphosphate kinase  84.4 
 
 		 141 aa  248  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235945  normal  0.0433038 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2989  nucleoside diphosphate kinase  84.89 
 
 		 142 aa  247  4e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0674599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2612  nucleoside diphosphate kinase  82.98 
 
 		 141 aa  247  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00143318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2872  nucleoside-diphosphate kinase  85.11 
 
 		 141 aa  246  6e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1838  nucleoside diphosphate kinase  83.69 
 
 		 141 aa  246  7e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.629382  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1348  nucleoside diphosphate kinase  83.69 
 
 		 141 aa  246  7e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2358  nucleoside diphosphate kinase  83.69 
 
 		 141 aa  246  7e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766138  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1110  nucleoside diphosphate kinase  83.69 
 
 		 141 aa  246  7e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.539018  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2231  nucleoside diphosphate kinase  83.69 
 
 		 141 aa  246  7e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.666945  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0059  nucleoside diphosphate kinase  83.69 
 
 		 141 aa  246  7e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.147771  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2193  nucleoside diphosphate kinase  83.69 
 
 		 141 aa  246  7e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0662762  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1868  nucleoside diphosphate kinase  82.98 
 
 		 141 aa  246  8e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1420  nucleoside diphosphate kinase  83.69 
 
 		 141 aa  244  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.803456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2183  Nucleoside-diphosphate kinase  83.69 
 
 		 141 aa  244  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450102  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2311  nucleoside-diphosphate kinase  81.56 
 
 		 141 aa  243  6e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0861887  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1086  nucleoside diphosphate kinase  81.56 
 
 		 141 aa  243  8e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.895381  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1591  nucleoside diphosphate kinase  81.56 
 
 		 141 aa  241  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1166  nucleoside diphosphate kinase  81.56 
 
 		 141 aa  241  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0084  nucleoside-diphosphate kinase  80.14 
 
 		 141 aa  240  5e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.311434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2544  nucleoside diphosphate kinase  80.85 
 
 		 141 aa  238  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0478014  hitchhiker  0.00487946 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2380  nucleoside-diphosphate kinase  78.01 
 
 		 141 aa  237  4e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5023  nucleoside diphosphate kinase  85.11 
 
 		 141 aa  233  8e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5116  nucleoside diphosphate kinase  86.52 
 
 		 141 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0360396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1055  nucleoside diphosphate kinase  83.69 
 
 		 141 aa  230  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.223396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1147  nucleoside diphosphate kinase  83.69 
 
 		 141 aa  230  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18828  normal  0.662914 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0590  nucleoside diphosphate kinase  77.7 
 
 		 142 aa  230  6e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0697929  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1211  nucleoside diphosphate kinase  82.98 
 
 		 141 aa  229  9e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1624  nucleoside diphosphate kinase  75.89 
 
 		 141 aa  225  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.615734  hitchhiker  0.00226942 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1402  nucleoside diphosphate kinase  75.71 
 
 		 144 aa  219  9.999999999999999e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000394217  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1342  nucleoside diphosphate kinase  75.54 
 
 		 139 aa  218  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00960069  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2886  nucleoside diphosphate kinase  76.69 
 
 		 143 aa  215  1e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1248  nucleoside diphosphate kinase  69.5 
 
 		 141 aa  213  7e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0731  Nucleoside-diphosphate kinase  76.69 
 
 		 143 aa  211  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2190  Nucleoside-diphosphate kinase  75.94 
 
 		 142 aa  212  1.9999999999999998e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40330  Nucleoside-diphosphate kinase  70.92 
 
 		 143 aa  209  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1307  nucleoside diphosphate kinase  69.5 
 
 		 143 aa  206  7e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2052  Nucleoside-diphosphate kinase  70.21 
 
 		 143 aa  206  7e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.238298  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14820  nucleoside diphosphate kinase  69.5 
 
 		 143 aa  206  7e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0899  nucleoside-diphosphate kinase  68.09 
 
 		 143 aa  206  8e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1478  nucleoside diphosphate kinase  70.92 
 
 		 141 aa  206  1e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1123  nucleoside diphosphate kinase  72.93 
 
 		 142 aa  204  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592805  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01052  nucleoside diphosphate kinase  69.5 
 
 		 141 aa  204  3e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.299785  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06114  nucleoside diphosphate kinase  69.5 
 
 		 141 aa  204  3e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.109761  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2850  nucleoside diphosphate kinase  70.21 
 
 		 141 aa  204  4e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1505  nucleoside diphosphate kinase  70.21 
 
 		 141 aa  203  7e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1656  nucleoside diphosphate kinase  67.38 
 
 		 141 aa  203  8e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.110606  normal  0.295678 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3333  nucleoside-diphosphate kinase  68.42 
 
 		 140 aa  202  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148108 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2992  nucleoside diphosphate kinase  68.79 
 
 		 159 aa  202  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000780378  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0849  nucleoside diphosphate kinase  68.79 
 
 		 141 aa  201  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0879  nucleoside diphosphate kinase  68.79 
 
 		 141 aa  201  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1792  nucleoside diphosphate kinase  65.96 
 
 		 141 aa  201  3e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1717  nucleoside diphosphate kinase  67.38 
 
 		 141 aa  201  4e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1781  nucleoside diphosphate kinase  67.38 
 
 		 141 aa  201  4e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3130  nucleoside diphosphate kinase  65.96 
 
 		 143 aa  200  5e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0990343  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1775  nucleoside-diphosphate kinase  72.52 
 
 		 137 aa  199  9.999999999999999e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4256  nucleoside diphosphate kinase  69.92 
 
 		 143 aa  198  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01364  nucleoside diphosphate kinase  65.25 
 
 		 143 aa  198  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1626  nucleoside diphosphate kinase  67.88 
 
 		 137 aa  197  3.9999999999999996e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1929  nucleoside diphosphate kinase  67.63 
 
 		 141 aa  197  5e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0354  nucleoside diphosphate kinase  70.99 
 
 		 137 aa  197  5e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.773452  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1601  nucleoside diphosphate kinase  67.63 
 
 		 141 aa  197  5e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.144621 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4329  nucleoside diphosphate kinase  67.38 
 
 		 141 aa  197  6e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000143413 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0377  nucleoside diphosphate kinase  70.99 
 
 		 137 aa  196  7.999999999999999e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2310  nucleoside diphosphate kinase  65.25 
 
 		 143 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00703116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0892  nucleoside diphosphate kinase  67.38 
 
 		 141 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000198835 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2390  nucleoside diphosphate kinase  66.67 
 
 		 143 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00297694  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2417  nucleoside-diphosphate kinase  67.38 
 
 		 164 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0225  Nucleoside-diphosphate kinase  72.52 
 
 		 137 aa  194  3e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1127  nucleoside diphosphate kinase  65.22 
 
 		 140 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.355617 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1430  nucleoside diphosphate kinase  65.96 
 
 		 141 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1244  nucleoside diphosphate kinase  65.96 
 
 		 141 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2894  nucleoside diphosphate kinase  65.22 
 
 		 140 aa  194  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.588521  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1538  nucleoside diphosphate kinase  65.22 
 
 		 140 aa  194  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4605  nucleoside diphosphate kinase  65.25 
 
 		 141 aa  193  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.426522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1334  nucleoside diphosphate kinase  65.69 
 
 		 137 aa  193  7e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2862  nucleoside diphosphate kinase  67.67 
 
 		 143 aa  192  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.760882  hitchhiker  0.0000000204456 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1301  nucleoside diphosphate kinase  66.92 
 
 		 143 aa  191  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.378961  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2182  nucleoside diphosphate kinase  67.91 
 
 		 146 aa  191  3e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0990  nucleoside diphosphate kinase  69.47 
 
 		 137 aa  191  3e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1488  nucleoside diphosphate kinase  66.91 
 
 		 137 aa  191  4e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.118139  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1234  nucleoside-diphosphate kinase  67.67 
 
 		 140 aa  191  4e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0263228  normal  0.0520892 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3504  nucleoside diphosphate kinase  63.83 
 
 		 143 aa  190  5e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1311  nucleoside-diphosphate kinase  62.32 
 
 		 140 aa  190  6e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.298971  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2231  nucleoside diphosphate kinase  65.22 
 
 		 147 aa  190  7e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00256702  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1629  nucleoside diphosphate kinase  65.22 
 
 		 147 aa  189  8e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243843  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2319  nucleoside diphosphate kinase  65.22 
 
 		 147 aa  189  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0482879  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1783  nucleoside diphosphate kinase  63.12 
 
 		 143 aa  187  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000760949 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>