More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2052 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2052  Nucleoside-diphosphate kinase  100 
 
 		 143 aa  291  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.238298  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2886  nucleoside diphosphate kinase  79.72 
 
 		 143 aa  241  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0731  Nucleoside-diphosphate kinase  80.42 
 
 		 143 aa  238  2e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1478  nucleoside diphosphate kinase  80.14 
 
 		 141 aa  236  9e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1505  nucleoside diphosphate kinase  79.43 
 
 		 141 aa  235  2e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01052  nucleoside diphosphate kinase  77.3 
 
 		 141 aa  233  5.0000000000000005e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.299785  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06114  nucleoside diphosphate kinase  77.3 
 
 		 141 aa  233  5.0000000000000005e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.109761  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1248  nucleoside diphosphate kinase  78.72 
 
 		 141 aa  233  9e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1656  nucleoside diphosphate kinase  77.3 
 
 		 141 aa  229  7.000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.110606  normal  0.295678 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2850  nucleoside diphosphate kinase  80.14 
 
 		 141 aa  229  9e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1624  nucleoside diphosphate kinase  77.3 
 
 		 141 aa  226  6e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.615734  hitchhiker  0.00226942 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1783  nucleoside diphosphate kinase  74.13 
 
 		 143 aa  226  7e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000760949 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01364  nucleoside diphosphate kinase  74.83 
 
 		 143 aa  226  8e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1747  nucleoside diphosphate kinase  74.83 
 
 		 143 aa  226  9e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000066664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1827  nucleoside diphosphate kinase  74.83 
 
 		 143 aa  226  9e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00692161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2190  Nucleoside-diphosphate kinase  77.3 
 
 		 142 aa  226  9e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0899  nucleoside-diphosphate kinase  75.18 
 
 		 143 aa  225  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1086  nucleoside diphosphate kinase  78.72 
 
 		 141 aa  226  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.895381  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2272  nucleoside diphosphate kinase  74.83 
 
 		 143 aa  226  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000444266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0647  nucleoside diphosphate kinase  75.52 
 
 		 143 aa  225  2e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.415341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2141  nucleoside diphosphate kinase  74.13 
 
 		 143 aa  224  3e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000896706  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1166  nucleoside diphosphate kinase  78.01 
 
 		 141 aa  224  4e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2389  nucleoside diphosphate kinase  73.43 
 
 		 143 aa  223  6e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00124206  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2493  nucleoside diphosphate kinase  73.43 
 
 		 143 aa  223  6e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000115766  hitchhiker  0.00287307 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2377  nucleoside diphosphate kinase  73.43 
 
 		 143 aa  223  6e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000377324  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1970  nucleoside diphosphate kinase  73.43 
 
 		 143 aa  223  6e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570351  hitchhiker  0.000372949 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2274  nucleoside diphosphate kinase  74.13 
 
 		 143 aa  223  9e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0678  nucleoside diphosphate kinase  74.83 
 
 		 143 aa  222  1e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.910925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1342  nucleoside diphosphate kinase  76.09 
 
 		 139 aa  222  1e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00960069  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1717  nucleoside diphosphate kinase  74.47 
 
 		 141 aa  221  2e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40330  Nucleoside-diphosphate kinase  74.83 
 
 		 143 aa  221  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1498  nucleoside diphosphate kinase  72.73 
 
 		 143 aa  221  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.300953  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1420  nucleoside diphosphate kinase  75.89 
 
 		 141 aa  221  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.803456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1591  nucleoside diphosphate kinase  76.6 
 
 		 141 aa  221  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2183  Nucleoside-diphosphate kinase  75.89 
 
 		 141 aa  222  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450102  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1781  nucleoside diphosphate kinase  74.47 
 
 		 141 aa  221  2e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4256  nucleoside diphosphate kinase  72.73 
 
 		 143 aa  221  3e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1402  nucleoside diphosphate kinase  75.91 
 
 		 144 aa  221  3e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000394217  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2544  nucleoside diphosphate kinase  75.89 
 
 		 141 aa  221  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0478014  hitchhiker  0.00487946 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2311  nucleoside-diphosphate kinase  75.18 
 
 		 141 aa  220  4e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0861887  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1123  nucleoside diphosphate kinase  75.18 
 
 		 142 aa  219  9e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592805  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2862  nucleoside diphosphate kinase  72.03 
 
 		 143 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.760882  hitchhiker  0.0000000204456 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3130  nucleoside diphosphate kinase  72.73 
 
 		 143 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0990343  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2090  nucleoside diphosphate kinase  75.18 
 
 		 141 aa  218  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2310  nucleoside diphosphate kinase  72.03 
 
 		 143 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00703116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2612  nucleoside diphosphate kinase  74.47 
 
 		 141 aa  217  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00143318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3504  nucleoside diphosphate kinase  73.43 
 
 		 143 aa  217  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1792  nucleoside diphosphate kinase  74.47 
 
 		 141 aa  217  5e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2390  nucleoside diphosphate kinase  70.63 
 
 		 143 aa  216  7.999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00297694  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1301  nucleoside diphosphate kinase  71.33 
 
 		 143 aa  216  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.378961  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1868  nucleoside diphosphate kinase  73.76 
 
 		 141 aa  215  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2110  nucleoside diphosphate kinase  73.05 
 
 		 141 aa  215  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2417  nucleoside-diphosphate kinase  70.63 
 
 		 164 aa  215  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2741  Nucleoside-diphosphate kinase  70.63 
 
 		 143 aa  215  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0084  nucleoside-diphosphate kinase  75.18 
 
 		 141 aa  214  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.311434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0590  nucleoside diphosphate kinase  72.14 
 
 		 142 aa  214  2.9999999999999998e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0697929  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1307  nucleoside diphosphate kinase  71.33 
 
 		 143 aa  214  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14820  nucleoside diphosphate kinase  71.33 
 
 		 143 aa  214  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1110  nucleoside diphosphate kinase  73.76 
 
 		 141 aa  213  7e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.539018  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2193  nucleoside diphosphate kinase  73.76 
 
 		 141 aa  213  7e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0662762  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1348  nucleoside diphosphate kinase  73.76 
 
 		 141 aa  213  7e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2358  nucleoside diphosphate kinase  73.76 
 
 		 141 aa  213  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766138  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1838  nucleoside diphosphate kinase  73.76 
 
 		 141 aa  213  7e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.629382  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2231  nucleoside diphosphate kinase  73.76 
 
 		 141 aa  213  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.666945  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0059  nucleoside diphosphate kinase  73.76 
 
 		 141 aa  213  7e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.147771  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1906  nucleoside diphosphate kinase  71.33 
 
 		 143 aa  213  8e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3394  nucleoside diphosphate kinase  72.34 
 
 		 141 aa  211  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2231  nucleoside diphosphate kinase  73.76 
 
 		 141 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1147  nucleoside diphosphate kinase  77.3 
 
 		 141 aa  211  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18828  normal  0.662914 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1055  nucleoside diphosphate kinase  77.3 
 
 		 141 aa  211  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.223396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1460  nucleoside diphosphate kinase  73.76 
 
 		 141 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425797  normal  0.366312 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1839  nucleoside diphosphate kinase  73.05 
 
 		 141 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.587203 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6264  nucleoside diphosphate kinase  73.05 
 
 		 141 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1815  nucleoside diphosphate kinase  73.05 
 
 		 141 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2000  nucleoside diphosphate kinase  72.34 
 
 		 141 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.136751 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1726  nucleoside diphosphate kinase  73.05 
 
 		 141 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.204847 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1753  nucleoside diphosphate kinase  73.05 
 
 		 141 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1430  nucleoside diphosphate kinase  70.92 
 
 		 141 aa  210  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1244  nucleoside diphosphate kinase  70.92 
 
 		 141 aa  210  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0354  nucleoside diphosphate kinase  74.45 
 
 		 137 aa  209  7e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.773452  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0377  nucleoside diphosphate kinase  74.45 
 
 		 137 aa  209  9e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4329  nucleoside diphosphate kinase  71.63 
 
 		 141 aa  209  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000143413 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2380  nucleoside-diphosphate kinase  72.34 
 
 		 141 aa  209  1e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0879  nucleoside diphosphate kinase  71.63 
 
 		 141 aa  208  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0849  nucleoside diphosphate kinase  71.63 
 
 		 141 aa  208  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1423  nucleoside diphosphate kinase  72.34 
 
 		 141 aa  208  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235945  normal  0.0433038 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1211  nucleoside diphosphate kinase  75.18 
 
 		 141 aa  207  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0894  nucleoside diphosphate kinase  70 
 
 		 140 aa  207  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.139474  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0892  nucleoside diphosphate kinase  70.92 
 
 		 141 aa  207  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000198835 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2989  nucleoside diphosphate kinase  74.44 
 
 		 142 aa  206  7e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0674599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1293  nucleoside diphosphate kinase  70.21 
 
 		 141 aa  206  7e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000414366  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0990  nucleoside diphosphate kinase  71.53 
 
 		 137 aa  206  8e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1352  nucleoside-diphosphate kinase  74.44 
 
 		 135 aa  206  9e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.378261  unclonable  0.00000000000374498 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1254  nucleoside diphosphate kinase  68.09 
 
 		 142 aa  206  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0662  nucleoside diphosphate kinase  70.21 
 
 		 141 aa  206  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0130513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1601  nucleoside diphosphate kinase  71.43 
 
 		 141 aa  205  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.144621 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1929  nucleoside diphosphate kinase  71.43 
 
 		 141 aa  205  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1626  nucleoside diphosphate kinase  74.26 
 
 		 137 aa  206  1e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1289  nucleoside diphosphate kinase  68.31 
 
 		 142 aa  204  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2992  nucleoside diphosphate kinase  69.5 
 
 		 159 aa  205  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000780378  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>