More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1307 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1307  nucleoside diphosphate kinase  100 
 
 		 143 aa  289  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14820  nucleoside diphosphate kinase  100 
 
 		 143 aa  289  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40330  Nucleoside-diphosphate kinase  94.41 
 
 		 143 aa  273  5e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3504  nucleoside diphosphate kinase  86.71 
 
 		 143 aa  256  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0849  nucleoside diphosphate kinase  81.56 
 
 		 141 aa  233  8e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0879  nucleoside diphosphate kinase  81.56 
 
 		 141 aa  233  8e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2886  nucleoside diphosphate kinase  76.22 
 
 		 143 aa  228  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4329  nucleoside diphosphate kinase  80.14 
 
 		 141 aa  228  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000143413 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1430  nucleoside diphosphate kinase  80.85 
 
 		 141 aa  227  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1244  nucleoside diphosphate kinase  80.85 
 
 		 141 aa  227  4e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2850  nucleoside diphosphate kinase  78.01 
 
 		 141 aa  227  5e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1123  nucleoside diphosphate kinase  77.3 
 
 		 142 aa  227  5e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592805  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0892  nucleoside diphosphate kinase  79.43 
 
 		 141 aa  226  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000198835 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4605  nucleoside diphosphate kinase  79.43 
 
 		 141 aa  224  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.426522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3394  nucleoside diphosphate kinase  75.18 
 
 		 141 aa  222  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2989  nucleoside diphosphate kinase  78.2 
 
 		 142 aa  218  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0674599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1624  nucleoside diphosphate kinase  74.47 
 
 		 141 aa  218  3e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.615734  hitchhiker  0.00226942 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0647  nucleoside diphosphate kinase  72.73 
 
 		 143 aa  217  5e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.415341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0590  nucleoside diphosphate kinase  76.81 
 
 		 142 aa  216  7e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0697929  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1352  nucleoside-diphosphate kinase  76.12 
 
 		 135 aa  215  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.378261  unclonable  0.00000000000374498 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0731  Nucleoside-diphosphate kinase  73.43 
 
 		 143 aa  216  1e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3130  nucleoside diphosphate kinase  71.33 
 
 		 143 aa  216  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0990343  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01364  nucleoside diphosphate kinase  69.93 
 
 		 143 aa  215  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0678  nucleoside diphosphate kinase  72.73 
 
 		 143 aa  214  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.910925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1906  nucleoside diphosphate kinase  72.03 
 
 		 143 aa  214  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2052  Nucleoside-diphosphate kinase  71.33 
 
 		 143 aa  214  4e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.238298  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2417  nucleoside-diphosphate kinase  70.63 
 
 		 164 aa  213  5.9999999999999996e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1301  nucleoside diphosphate kinase  69.93 
 
 		 143 aa  213  7e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.378961  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1792  nucleoside diphosphate kinase  72.34 
 
 		 141 aa  212  9.999999999999999e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1868  nucleoside diphosphate kinase  73.76 
 
 		 141 aa  212  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2183  Nucleoside-diphosphate kinase  73.05 
 
 		 141 aa  211  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450102  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2090  nucleoside diphosphate kinase  73.76 
 
 		 141 aa  210  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4256  nucleoside diphosphate kinase  69.23 
 
 		 143 aa  210  5.999999999999999e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01052  nucleoside diphosphate kinase  73.05 
 
 		 141 aa  209  7.999999999999999e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.299785  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06114  nucleoside diphosphate kinase  73.05 
 
 		 141 aa  209  7.999999999999999e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.109761  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2190  Nucleoside-diphosphate kinase  73.76 
 
 		 142 aa  209  1e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2310  nucleoside diphosphate kinase  69.23 
 
 		 143 aa  209  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00703116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2380  nucleoside-diphosphate kinase  70.21 
 
 		 141 aa  209  1e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2390  nucleoside diphosphate kinase  68.53 
 
 		 143 aa  208  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00297694  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1248  nucleoside diphosphate kinase  68.79 
 
 		 141 aa  207  4e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1656  nucleoside diphosphate kinase  73.05 
 
 		 141 aa  207  5e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.110606  normal  0.295678 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1293  nucleoside diphosphate kinase  69.5 
 
 		 141 aa  206  6e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000414366  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1430  nucleoside diphosphate kinase  69.5 
 
 		 141 aa  207  6e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2110  nucleoside diphosphate kinase  72.34 
 
 		 141 aa  206  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0899  nucleoside-diphosphate kinase  66.9 
 
 		 143 aa  206  7e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2612  nucleoside diphosphate kinase  72.34 
 
 		 141 aa  206  7e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00143318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0662  nucleoside diphosphate kinase  70.21 
 
 		 141 aa  206  8e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0130513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2862  nucleoside diphosphate kinase  67.83 
 
 		 143 aa  206  8e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.760882  hitchhiker  0.0000000204456 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2311  nucleoside-diphosphate kinase  70.92 
 
 		 141 aa  206  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0861887  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2000  nucleoside diphosphate kinase  71.63 
 
 		 141 aa  205  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.136751 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1498  nucleoside diphosphate kinase  66.43 
 
 		 143 aa  205  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.300953  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1478  nucleoside diphosphate kinase  70.92 
 
 		 141 aa  204  3e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1783  nucleoside diphosphate kinase  66.43 
 
 		 143 aa  204  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000760949 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2231  nucleoside diphosphate kinase  70.92 
 
 		 141 aa  204  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1702  nucleoside diphosphate kinase  72.26 
 
 		 137 aa  204  3e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0084  nucleoside-diphosphate kinase  70.21 
 
 		 141 aa  204  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.311434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1110  nucleoside diphosphate kinase  70.21 
 
 		 141 aa  204  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.539018  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2274  nucleoside diphosphate kinase  67.83 
 
 		 143 aa  204  4e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2231  nucleoside diphosphate kinase  70.21 
 
 		 141 aa  204  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.666945  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1348  nucleoside diphosphate kinase  70.21 
 
 		 141 aa  204  4e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1505  nucleoside diphosphate kinase  70.21 
 
 		 141 aa  204  4e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1838  nucleoside diphosphate kinase  70.21 
 
 		 141 aa  204  4e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.629382  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2358  nucleoside diphosphate kinase  70.21 
 
 		 141 aa  204  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766138  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2193  nucleoside diphosphate kinase  70.21 
 
 		 141 aa  204  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0662762  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1747  nucleoside diphosphate kinase  67.83 
 
 		 143 aa  204  4e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000066664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1827  nucleoside diphosphate kinase  67.83 
 
 		 143 aa  204  4e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00692161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0059  nucleoside diphosphate kinase  70.21 
 
 		 141 aa  204  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.147771  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1488  nucleoside diphosphate kinase  72.26 
 
 		 137 aa  203  6e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.118139  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2992  nucleoside diphosphate kinase  65.96 
 
 		 159 aa  203  6e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000780378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1086  nucleoside diphosphate kinase  69.5 
 
 		 141 aa  203  7e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.895381  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2141  nucleoside diphosphate kinase  67.13 
 
 		 143 aa  202  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000896706  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1717  nucleoside diphosphate kinase  69.5 
 
 		 141 aa  202  1e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2741  Nucleoside-diphosphate kinase  66.43 
 
 		 143 aa  202  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1781  nucleoside diphosphate kinase  69.5 
 
 		 141 aa  202  1e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01064  nucleoside diphosphate kinase  66.67 
 
 		 141 aa  202  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1591  nucleoside diphosphate kinase  70.21 
 
 		 141 aa  202  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2872  nucleoside-diphosphate kinase  70.21 
 
 		 141 aa  202  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2272  nucleoside diphosphate kinase  67.13 
 
 		 143 aa  202  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000444266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1166  nucleoside diphosphate kinase  68.79 
 
 		 141 aa  201  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1420  nucleoside diphosphate kinase  68.79 
 
 		 141 aa  202  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.803456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0285  nucleoside diphosphate kinase  65.96 
 
 		 142 aa  202  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000362394  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2389  nucleoside diphosphate kinase  66.43 
 
 		 143 aa  201  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00124206  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1970  nucleoside diphosphate kinase  66.43 
 
 		 143 aa  201  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570351  hitchhiker  0.000372949 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2493  nucleoside diphosphate kinase  66.43 
 
 		 143 aa  201  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000115766  hitchhiker  0.00287307 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2377  nucleoside diphosphate kinase  66.43 
 
 		 143 aa  201  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000377324  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1929  nucleoside diphosphate kinase  71.01 
 
 		 141 aa  201  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1601  nucleoside diphosphate kinase  71.01 
 
 		 141 aa  201  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.144621 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2544  nucleoside diphosphate kinase  69.5 
 
 		 141 aa  201  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0478014  hitchhiker  0.00487946 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1147  nucleoside diphosphate kinase  72.34 
 
 		 141 aa  200  5e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18828  normal  0.662914 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1055  nucleoside diphosphate kinase  72.34 
 
 		 141 aa  200  5e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.223396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0990  nucleoside diphosphate kinase  69.34 
 
 		 137 aa  200  6e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1342  nucleoside diphosphate kinase  68.12 
 
 		 139 aa  199  8e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00960069  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1423  nucleoside diphosphate kinase  69.5 
 
 		 141 aa  199  8e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235945  normal  0.0433038 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1460  nucleoside diphosphate kinase  69.5 
 
 		 141 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425797  normal  0.366312 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1334  nucleoside diphosphate kinase  70.07 
 
 		 137 aa  198  1.9999999999999998e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1839  nucleoside diphosphate kinase  68.79 
 
 		 141 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.587203 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1402  nucleoside diphosphate kinase  68.61 
 
 		 144 aa  199  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000394217  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6264  nucleoside diphosphate kinase  68.79 
 
 		 141 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1815  nucleoside diphosphate kinase  68.79 
 
 		 141 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1726  nucleoside diphosphate kinase  68.79 
 
 		 141 aa  198  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.204847 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>