More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1289 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1289  nucleoside diphosphate kinase  100 
 
 		 142 aa  289  8e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1182  nucleoside diphosphate kinase  98.59 
 
 		 142 aa  286  8e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0422  nucleoside diphosphate kinase  97.18 
 
 		 142 aa  283  5e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.920358  normal  0.0102374 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3613  nucleoside diphosphate kinase  88.65 
 
 		 141 aa  258  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.367991 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1114  nucleoside diphosphate kinase  85.92 
 
 		 143 aa  258  1e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.66458  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2741  Nucleoside-diphosphate kinase  85.21 
 
 		 143 aa  258  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3018  nucleoside diphosphate kinase  83.1 
 
 		 142 aa  252  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1254  nucleoside diphosphate kinase  83.8 
 
 		 142 aa  252  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3012  nucleoside diphosphate kinase  78.87 
 
 		 143 aa  239  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2670  nucleoside diphosphate kinase  78.17 
 
 		 143 aa  238  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.20658 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02410  nucleoside diphosphate kinase  78.17 
 
 		 143 aa  236  9e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1150  Nucleoside-diphosphate kinase  78.17 
 
 		 143 aa  236  9e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.306657  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2802  nucleoside diphosphate kinase  78.17 
 
 		 143 aa  236  9e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1159  nucleoside diphosphate kinase  78.17 
 
 		 143 aa  236  9e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.695355  normal  0.0329875 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2893  nucleoside diphosphate kinase  78.17 
 
 		 143 aa  236  9e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02372  hypothetical protein  78.17 
 
 		 143 aa  236  9e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3743  nucleoside diphosphate kinase  78.17 
 
 		 143 aa  236  9e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2669  nucleoside diphosphate kinase  78.17 
 
 		 143 aa  236  9e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2784  nucleoside diphosphate kinase  76.76 
 
 		 143 aa  234  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.19869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2765  nucleoside diphosphate kinase  76.76 
 
 		 143 aa  234  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2721  nucleoside diphosphate kinase  76.76 
 
 		 143 aa  234  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.916716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2896  nucleoside diphosphate kinase  76.76 
 
 		 143 aa  234  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2678  nucleoside diphosphate kinase  76.76 
 
 		 143 aa  234  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2310  nucleoside diphosphate kinase  76.76 
 
 		 143 aa  224  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00703116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1301  nucleoside diphosphate kinase  77.46 
 
 		 143 aa  223  5.0000000000000005e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.378961  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3130  nucleoside diphosphate kinase  76.06 
 
 		 143 aa  223  8e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0990343  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2862  nucleoside diphosphate kinase  75.35 
 
 		 143 aa  222  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.760882  hitchhiker  0.0000000204456 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2390  nucleoside diphosphate kinase  75.35 
 
 		 143 aa  222  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00297694  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2417  nucleoside-diphosphate kinase  75.35 
 
 		 164 aa  221  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1783  nucleoside diphosphate kinase  73.24 
 
 		 143 aa  220  4.9999999999999996e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000760949 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2141  nucleoside diphosphate kinase  75.35 
 
 		 143 aa  219  7e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000896706  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2389  nucleoside diphosphate kinase  74.65 
 
 		 143 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00124206  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2377  nucleoside diphosphate kinase  74.65 
 
 		 143 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000377324  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1970  nucleoside diphosphate kinase  74.65 
 
 		 143 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570351  hitchhiker  0.000372949 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2493  nucleoside diphosphate kinase  74.65 
 
 		 143 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000115766  hitchhiker  0.00287307 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2272  nucleoside diphosphate kinase  74.65 
 
 		 143 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000444266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01364  nucleoside diphosphate kinase  73.24 
 
 		 143 aa  218  3e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1747  nucleoside diphosphate kinase  73.94 
 
 		 143 aa  217  5e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000066664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1827  nucleoside diphosphate kinase  73.94 
 
 		 143 aa  217  5e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00692161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1498  nucleoside diphosphate kinase  71.83 
 
 		 143 aa  216  7e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.300953  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4256  nucleoside diphosphate kinase  71.83 
 
 		 143 aa  215  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2274  nucleoside diphosphate kinase  73.24 
 
 		 143 aa  216  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1123  nucleoside diphosphate kinase  70.21 
 
 		 142 aa  208  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592805  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1906  nucleoside diphosphate kinase  66.9 
 
 		 143 aa  205  1e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1342  nucleoside diphosphate kinase  69.78 
 
 		 139 aa  206  1e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00960069  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2052  Nucleoside-diphosphate kinase  68.31 
 
 		 143 aa  204  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.238298  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0725  nucleoside diphosphate kinase  65.25 
 
 		 144 aa  205  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2850  nucleoside diphosphate kinase  71.63 
 
 		 141 aa  204  4e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1430  nucleoside diphosphate kinase  68.09 
 
 		 141 aa  204  5e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1402  nucleoside diphosphate kinase  69.06 
 
 		 144 aa  203  8e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000394217  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0285  nucleoside diphosphate kinase  67.38 
 
 		 142 aa  200  4e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000362394  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0084  nucleoside-diphosphate kinase  67.38 
 
 		 141 aa  200  5e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.311434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1624  nucleoside diphosphate kinase  67.38 
 
 		 141 aa  199  7e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.615734  hitchhiker  0.00226942 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01064  nucleoside diphosphate kinase  65.96 
 
 		 141 aa  199  8e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1248  nucleoside diphosphate kinase  67.38 
 
 		 141 aa  199  8e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1352  nucleoside-diphosphate kinase  72.93 
 
 		 135 aa  199  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.378261  unclonable  0.00000000000374498 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01052  nucleoside diphosphate kinase  65.96 
 
 		 141 aa  199  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.299785  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06114  nucleoside diphosphate kinase  65.96 
 
 		 141 aa  199  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.109761  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2886  nucleoside diphosphate kinase  64.79 
 
 		 143 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0647  nucleoside diphosphate kinase  66.2 
 
 		 143 aa  198  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.415341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2612  nucleoside diphosphate kinase  66.67 
 
 		 141 aa  197  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00143318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1656  nucleoside diphosphate kinase  66.67 
 
 		 141 aa  197  5e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.110606  normal  0.295678 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1781  nucleoside diphosphate kinase  65.96 
 
 		 141 aa  196  7e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1717  nucleoside diphosphate kinase  65.96 
 
 		 141 aa  196  7e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1868  nucleoside diphosphate kinase  65.96 
 
 		 141 aa  196  7.999999999999999e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0849  nucleoside diphosphate kinase  66.67 
 
 		 141 aa  195  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0899  nucleoside-diphosphate kinase  63.83 
 
 		 143 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0879  nucleoside diphosphate kinase  66.67 
 
 		 141 aa  195  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0678  nucleoside diphosphate kinase  64.79 
 
 		 143 aa  194  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.910925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004352  nucleoside diphosphate kinase  65.96 
 
 		 141 aa  195  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0731  Nucleoside-diphosphate kinase  64.79 
 
 		 143 aa  195  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1792  nucleoside diphosphate kinase  65.25 
 
 		 141 aa  194  3e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1086  nucleoside diphosphate kinase  65.25 
 
 		 141 aa  194  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.895381  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0892  nucleoside diphosphate kinase  65.96 
 
 		 141 aa  192  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000198835 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1420  nucleoside diphosphate kinase  63.83 
 
 		 141 aa  192  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.803456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1166  nucleoside diphosphate kinase  65.25 
 
 		 141 aa  192  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4605  nucleoside diphosphate kinase  64.54 
 
 		 141 aa  191  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.426522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4329  nucleoside diphosphate kinase  65.96 
 
 		 141 aa  191  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000143413 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2544  nucleoside diphosphate kinase  63.12 
 
 		 141 aa  192  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0478014  hitchhiker  0.00487946 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1307  nucleoside diphosphate kinase  63.83 
 
 		 143 aa  191  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14820  nucleoside diphosphate kinase  63.83 
 
 		 143 aa  191  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3333  nucleoside-diphosphate kinase  66.67 
 
 		 140 aa  191  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148108 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1591  nucleoside diphosphate kinase  63.12 
 
 		 141 aa  190  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2110  nucleoside diphosphate kinase  62.41 
 
 		 141 aa  191  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2090  nucleoside diphosphate kinase  63.83 
 
 		 141 aa  190  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0590  nucleoside diphosphate kinase  62.59 
 
 		 142 aa  190  5e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0697929  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2183  Nucleoside-diphosphate kinase  63.12 
 
 		 141 aa  190  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450102  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2311  nucleoside-diphosphate kinase  63.12 
 
 		 141 aa  190  7e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0861887  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1601  nucleoside diphosphate kinase  64.03 
 
 		 141 aa  189  8e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.144621 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1929  nucleoside diphosphate kinase  64.03 
 
 		 141 aa  189  8e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1430  nucleoside diphosphate kinase  63.83 
 
 		 141 aa  189  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1244  nucleoside diphosphate kinase  63.83 
 
 		 141 aa  189  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2231  nucleoside diphosphate kinase  63.83 
 
 		 141 aa  189  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40330  Nucleoside-diphosphate kinase  63.83 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2000  nucleoside diphosphate kinase  62.41 
 
 		 141 aa  187  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.136751 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3394  nucleoside diphosphate kinase  62.41 
 
 		 141 aa  187  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1838  nucleoside diphosphate kinase  62.41 
 
 		 141 aa  187  4e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.629382  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2231  nucleoside diphosphate kinase  62.41 
 
 		 141 aa  187  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.666945  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1348  nucleoside diphosphate kinase  62.41 
 
 		 141 aa  187  4e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2193  nucleoside diphosphate kinase  62.41 
 
 		 141 aa  187  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0662762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>