More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2310 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2310  nucleoside diphosphate kinase  100 
 
 		 143 aa  291  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00703116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2862  nucleoside diphosphate kinase  96.5 
 
 		 143 aa  283  5e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.760882  hitchhiker  0.0000000204456 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1301  nucleoside diphosphate kinase  93.01 
 
 		 143 aa  277  4e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.378961  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1498  nucleoside diphosphate kinase  92.31 
 
 		 143 aa  274  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.300953  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2417  nucleoside-diphosphate kinase  92.31 
 
 		 164 aa  273  7e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2390  nucleoside diphosphate kinase  90.91 
 
 		 143 aa  270  4.0000000000000004e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00297694  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1783  nucleoside diphosphate kinase  91.61 
 
 		 143 aa  270  5.000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000760949 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2274  nucleoside diphosphate kinase  89.51 
 
 		 143 aa  266  7e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2389  nucleoside diphosphate kinase  90.21 
 
 		 143 aa  265  1e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00124206  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2493  nucleoside diphosphate kinase  90.21 
 
 		 143 aa  265  1e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000115766  hitchhiker  0.00287307 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2377  nucleoside diphosphate kinase  90.21 
 
 		 143 aa  265  1e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000377324  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1970  nucleoside diphosphate kinase  90.21 
 
 		 143 aa  265  1e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570351  hitchhiker  0.000372949 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2141  nucleoside diphosphate kinase  89.51 
 
 		 143 aa  264  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000896706  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2272  nucleoside diphosphate kinase  88.81 
 
 		 143 aa  263  7e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000444266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1747  nucleoside diphosphate kinase  88.11 
 
 		 143 aa  261  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000066664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1827  nucleoside diphosphate kinase  88.11 
 
 		 143 aa  261  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00692161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01364  nucleoside diphosphate kinase  86.01 
 
 		 143 aa  259  1e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3130  nucleoside diphosphate kinase  87.41 
 
 		 143 aa  258  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0990343  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4256  nucleoside diphosphate kinase  85.31 
 
 		 143 aa  256  8e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2741  Nucleoside-diphosphate kinase  76.22 
 
 		 143 aa  233  9e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1114  nucleoside diphosphate kinase  75.52 
 
 		 143 aa  226  8e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.66458  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1182  nucleoside diphosphate kinase  76.76 
 
 		 142 aa  224  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1289  nucleoside diphosphate kinase  76.76 
 
 		 142 aa  224  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1123  nucleoside diphosphate kinase  75.18 
 
 		 142 aa  224  4e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592805  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0422  nucleoside diphosphate kinase  76.76 
 
 		 142 aa  223  6e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.920358  normal  0.0102374 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1248  nucleoside diphosphate kinase  75.18 
 
 		 141 aa  223  7e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2886  nucleoside diphosphate kinase  73.43 
 
 		 143 aa  223  9e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3504  nucleoside diphosphate kinase  76.22 
 
 		 143 aa  222  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1254  nucleoside diphosphate kinase  73.76 
 
 		 142 aa  220  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3018  nucleoside diphosphate kinase  73.05 
 
 		 142 aa  220  6e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1906  nucleoside diphosphate kinase  73.43 
 
 		 143 aa  220  6e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2850  nucleoside diphosphate kinase  75.89 
 
 		 141 aa  220  6e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1430  nucleoside diphosphate kinase  73.05 
 
 		 141 aa  219  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2052  Nucleoside-diphosphate kinase  72.03 
 
 		 143 aa  218  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.238298  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0849  nucleoside diphosphate kinase  75.18 
 
 		 141 aa  218  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0879  nucleoside diphosphate kinase  75.18 
 
 		 141 aa  218  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0731  Nucleoside-diphosphate kinase  72.73 
 
 		 143 aa  216  7e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3613  nucleoside diphosphate kinase  74.47 
 
 		 141 aa  216  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.367991 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4329  nucleoside diphosphate kinase  74.47 
 
 		 141 aa  215  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000143413 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0647  nucleoside diphosphate kinase  69.93 
 
 		 143 aa  214  2e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.415341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0892  nucleoside diphosphate kinase  73.76 
 
 		 141 aa  213  7e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000198835 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2670  nucleoside diphosphate kinase  70.63 
 
 		 143 aa  213  7e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.20658 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02410  nucleoside diphosphate kinase  70.63 
 
 		 143 aa  212  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1150  Nucleoside-diphosphate kinase  70.63 
 
 		 143 aa  212  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.306657  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0678  nucleoside diphosphate kinase  69.93 
 
 		 143 aa  212  9.999999999999999e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.910925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0899  nucleoside-diphosphate kinase  69.5 
 
 		 143 aa  212  9.999999999999999e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2802  nucleoside diphosphate kinase  70.63 
 
 		 143 aa  212  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2893  nucleoside diphosphate kinase  70.63 
 
 		 143 aa  212  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1159  nucleoside diphosphate kinase  70.63 
 
 		 143 aa  212  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.695355  normal  0.0329875 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02372  hypothetical protein  70.63 
 
 		 143 aa  212  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3743  nucleoside diphosphate kinase  70.63 
 
 		 143 aa  212  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2669  nucleoside diphosphate kinase  70.63 
 
 		 143 aa  212  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4605  nucleoside diphosphate kinase  72.34 
 
 		 141 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.426522  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1430  nucleoside diphosphate kinase  71.63 
 
 		 141 aa  210  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1244  nucleoside diphosphate kinase  71.63 
 
 		 141 aa  210  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1342  nucleoside diphosphate kinase  72.46 
 
 		 139 aa  210  4.9999999999999996e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00960069  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40330  Nucleoside-diphosphate kinase  70.63 
 
 		 143 aa  209  7.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3012  nucleoside diphosphate kinase  69.23 
 
 		 143 aa  209  7.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1402  nucleoside diphosphate kinase  72.99 
 
 		 144 aa  209  9e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000394217  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1307  nucleoside diphosphate kinase  69.23 
 
 		 143 aa  209  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2721  nucleoside diphosphate kinase  68.53 
 
 		 143 aa  209  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.916716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2784  nucleoside diphosphate kinase  68.53 
 
 		 143 aa  209  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.19869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2678  nucleoside diphosphate kinase  68.53 
 
 		 143 aa  209  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2896  nucleoside diphosphate kinase  68.53 
 
 		 143 aa  209  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2765  nucleoside diphosphate kinase  68.53 
 
 		 143 aa  209  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14820  nucleoside diphosphate kinase  69.23 
 
 		 143 aa  209  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0084  nucleoside-diphosphate kinase  70.92 
 
 		 141 aa  208  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.311434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1624  nucleoside diphosphate kinase  70.92 
 
 		 141 aa  206  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.615734  hitchhiker  0.00226942 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01052  nucleoside diphosphate kinase  68.79 
 
 		 141 aa  205  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.299785  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06114  nucleoside diphosphate kinase  68.79 
 
 		 141 aa  205  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.109761  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1792  nucleoside diphosphate kinase  69.5 
 
 		 141 aa  205  2e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1656  nucleoside diphosphate kinase  70.21 
 
 		 141 aa  205  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.110606  normal  0.295678 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0285  nucleoside diphosphate kinase  70.92 
 
 		 142 aa  204  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000362394  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1086  nucleoside diphosphate kinase  69.5 
 
 		 141 aa  204  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.895381  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2612  nucleoside diphosphate kinase  68.79 
 
 		 141 aa  203  8e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00143318  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1505  nucleoside diphosphate kinase  69.5 
 
 		 141 aa  202  1e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1478  nucleoside diphosphate kinase  70.21 
 
 		 141 aa  202  1e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1166  nucleoside diphosphate kinase  69.5 
 
 		 141 aa  202  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1420  nucleoside diphosphate kinase  68.09 
 
 		 141 aa  202  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.803456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2231  nucleoside diphosphate kinase  70.68 
 
 		 141 aa  200  5e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1868  nucleoside diphosphate kinase  68.09 
 
 		 141 aa  200  6e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01064  nucleoside diphosphate kinase  67.38 
 
 		 141 aa  200  7e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1838  nucleoside diphosphate kinase  69.17 
 
 		 141 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.629382  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2193  nucleoside diphosphate kinase  69.17 
 
 		 141 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0662762  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2231  nucleoside diphosphate kinase  69.17 
 
 		 141 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.666945  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1110  nucleoside diphosphate kinase  69.17 
 
 		 141 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.539018  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1348  nucleoside diphosphate kinase  69.17 
 
 		 141 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0059  nucleoside diphosphate kinase  69.17 
 
 		 141 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.147771  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2358  nucleoside diphosphate kinase  69.17 
 
 		 141 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766138  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2544  nucleoside diphosphate kinase  67.38 
 
 		 141 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0478014  hitchhiker  0.00487946 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1352  nucleoside-diphosphate kinase  72.93 
 
 		 135 aa  198  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.378261  unclonable  0.00000000000374498 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1839  nucleoside diphosphate kinase  70.68 
 
 		 141 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.587203 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1423  nucleoside diphosphate kinase  71.43 
 
 		 141 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235945  normal  0.0433038 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6264  nucleoside diphosphate kinase  70.68 
 
 		 141 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1815  nucleoside diphosphate kinase  70.68 
 
 		 141 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2090  nucleoside diphosphate kinase  67.38 
 
 		 141 aa  197  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1726  nucleoside diphosphate kinase  70.68 
 
 		 141 aa  197  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.204847 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1753  nucleoside diphosphate kinase  70.68 
 
 		 141 aa  197  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0590  nucleoside diphosphate kinase  67.39 
 
 		 142 aa  197  3.9999999999999996e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0697929  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2311  nucleoside-diphosphate kinase  65.96 
 
 		 141 aa  197  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0861887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>