More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01364 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01364  nucleoside diphosphate kinase  100 
 
 		 143 aa  293  8e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3130  nucleoside diphosphate kinase  92.31 
 
 		 143 aa  275  1e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0990343  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2390  nucleoside diphosphate kinase  88.11 
 
 		 143 aa  263  4e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00297694  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2417  nucleoside-diphosphate kinase  88.11 
 
 		 164 aa  264  4e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2310  nucleoside diphosphate kinase  86.01 
 
 		 143 aa  259  1e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00703116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1301  nucleoside diphosphate kinase  85.31 
 
 		 143 aa  258  2e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.378961  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2862  nucleoside diphosphate kinase  85.31 
 
 		 143 aa  256  6e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.760882  hitchhiker  0.0000000204456 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4256  nucleoside diphosphate kinase  83.22 
 
 		 143 aa  251  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2389  nucleoside diphosphate kinase  83.92 
 
 		 143 aa  251  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00124206  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1970  nucleoside diphosphate kinase  83.92 
 
 		 143 aa  251  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570351  hitchhiker  0.000372949 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2377  nucleoside diphosphate kinase  83.92 
 
 		 143 aa  251  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000377324  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2493  nucleoside diphosphate kinase  83.92 
 
 		 143 aa  251  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000115766  hitchhiker  0.00287307 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2141  nucleoside diphosphate kinase  83.22 
 
 		 143 aa  250  5.000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000896706  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2272  nucleoside diphosphate kinase  83.22 
 
 		 143 aa  250  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000444266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1498  nucleoside diphosphate kinase  81.82 
 
 		 143 aa  249  8.000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.300953  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1747  nucleoside diphosphate kinase  82.52 
 
 		 143 aa  249  9.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000066664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1827  nucleoside diphosphate kinase  82.52 
 
 		 143 aa  249  9.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00692161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1783  nucleoside diphosphate kinase  80.42 
 
 		 143 aa  247  4e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000760949 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2274  nucleoside diphosphate kinase  81.12 
 
 		 143 aa  244  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2886  nucleoside diphosphate kinase  76.22 
 
 		 143 aa  234  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1248  nucleoside diphosphate kinase  75.18 
 
 		 141 aa  230  6e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2850  nucleoside diphosphate kinase  76.6 
 
 		 141 aa  228  3e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2741  Nucleoside-diphosphate kinase  74.83 
 
 		 143 aa  227  4e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2052  Nucleoside-diphosphate kinase  74.83 
 
 		 143 aa  226  8e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.238298  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1114  nucleoside diphosphate kinase  74.83 
 
 		 143 aa  224  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.66458  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1123  nucleoside diphosphate kinase  73.76 
 
 		 142 aa  223  5.0000000000000005e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592805  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0731  Nucleoside-diphosphate kinase  73.43 
 
 		 143 aa  223  1e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3018  nucleoside diphosphate kinase  73.05 
 
 		 142 aa  221  3e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1254  nucleoside diphosphate kinase  73.76 
 
 		 142 aa  221  4e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3504  nucleoside diphosphate kinase  73.43 
 
 		 143 aa  219  8e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0647  nucleoside diphosphate kinase  71.33 
 
 		 143 aa  218  9.999999999999999e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.415341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1182  nucleoside diphosphate kinase  73.94 
 
 		 142 aa  218  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1906  nucleoside diphosphate kinase  72.03 
 
 		 143 aa  218  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1289  nucleoside diphosphate kinase  73.24 
 
 		 142 aa  218  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2670  nucleoside diphosphate kinase  69.23 
 
 		 143 aa  217  5e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.20658 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0678  nucleoside diphosphate kinase  71.33 
 
 		 143 aa  216  7.999999999999999e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.910925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0422  nucleoside diphosphate kinase  72.54 
 
 		 142 aa  216  8.999999999999998e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.920358  normal  0.0102374 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02410  nucleoside diphosphate kinase  69.23 
 
 		 143 aa  216  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1150  Nucleoside-diphosphate kinase  69.23 
 
 		 143 aa  216  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.306657  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3743  nucleoside diphosphate kinase  69.23 
 
 		 143 aa  216  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2669  nucleoside diphosphate kinase  69.23 
 
 		 143 aa  216  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2893  nucleoside diphosphate kinase  69.23 
 
 		 143 aa  216  1e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2802  nucleoside diphosphate kinase  69.23 
 
 		 143 aa  216  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1159  nucleoside diphosphate kinase  69.23 
 
 		 143 aa  216  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.695355  normal  0.0329875 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02372  hypothetical protein  69.23 
 
 		 143 aa  216  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1307  nucleoside diphosphate kinase  69.93 
 
 		 143 aa  215  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3333  nucleoside-diphosphate kinase  74.1 
 
 		 140 aa  215  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148108 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14820  nucleoside diphosphate kinase  69.93 
 
 		 143 aa  215  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01064  nucleoside diphosphate kinase  69.5 
 
 		 141 aa  214  2.9999999999999998e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3012  nucleoside diphosphate kinase  68.53 
 
 		 143 aa  214  4e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3613  nucleoside diphosphate kinase  72.34 
 
 		 141 aa  213  5e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.367991 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0849  nucleoside diphosphate kinase  72.34 
 
 		 141 aa  213  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0879  nucleoside diphosphate kinase  72.34 
 
 		 141 aa  213  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0899  nucleoside-diphosphate kinase  68.79 
 
 		 143 aa  211  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0285  nucleoside diphosphate kinase  69.5 
 
 		 142 aa  211  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000362394  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1430  nucleoside diphosphate kinase  68.79 
 
 		 141 aa  212  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40330  Nucleoside-diphosphate kinase  69.93 
 
 		 143 aa  211  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2678  nucleoside diphosphate kinase  67.13 
 
 		 143 aa  211  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2896  nucleoside diphosphate kinase  67.13 
 
 		 143 aa  211  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2721  nucleoside diphosphate kinase  67.13 
 
 		 143 aa  211  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.916716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1342  nucleoside diphosphate kinase  71.01 
 
 		 139 aa  211  2.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00960069  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2765  nucleoside diphosphate kinase  67.13 
 
 		 143 aa  211  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4329  nucleoside diphosphate kinase  71.63 
 
 		 141 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000143413 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2784  nucleoside diphosphate kinase  67.13 
 
 		 143 aa  211  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.19869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0725  nucleoside diphosphate kinase  67.38 
 
 		 144 aa  210  4.9999999999999996e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1402  nucleoside diphosphate kinase  70.8 
 
 		 144 aa  209  9e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000394217  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1792  nucleoside diphosphate kinase  70.21 
 
 		 141 aa  209  9e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0892  nucleoside diphosphate kinase  70.92 
 
 		 141 aa  209  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000198835 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4605  nucleoside diphosphate kinase  70.92 
 
 		 141 aa  208  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.426522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0084  nucleoside-diphosphate kinase  69.5 
 
 		 141 aa  206  7e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.311434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1624  nucleoside diphosphate kinase  70.21 
 
 		 141 aa  206  8e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.615734  hitchhiker  0.00226942 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1430  nucleoside diphosphate kinase  69.5 
 
 		 141 aa  206  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1244  nucleoside diphosphate kinase  69.5 
 
 		 141 aa  206  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1086  nucleoside diphosphate kinase  70.92 
 
 		 141 aa  206  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.895381  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1656  nucleoside diphosphate kinase  68.79 
 
 		 141 aa  204  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.110606  normal  0.295678 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01052  nucleoside diphosphate kinase  68.09 
 
 		 141 aa  205  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.299785  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06114  nucleoside diphosphate kinase  68.09 
 
 		 141 aa  205  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.109761  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1352  nucleoside-diphosphate kinase  74.07 
 
 		 135 aa  204  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.378261  unclonable  0.00000000000374498 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2193  nucleoside diphosphate kinase  68.09 
 
 		 141 aa  204  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0662762  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1348  nucleoside diphosphate kinase  68.09 
 
 		 141 aa  204  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1505  nucleoside diphosphate kinase  70.21 
 
 		 141 aa  204  3e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1110  nucleoside diphosphate kinase  68.09 
 
 		 141 aa  204  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.539018  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2358  nucleoside diphosphate kinase  68.09 
 
 		 141 aa  204  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766138  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2231  nucleoside diphosphate kinase  68.09 
 
 		 141 aa  204  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.666945  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004352  nucleoside diphosphate kinase  68.09 
 
 		 141 aa  204  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1838  nucleoside diphosphate kinase  68.09 
 
 		 141 aa  204  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.629382  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0059  nucleoside diphosphate kinase  68.09 
 
 		 141 aa  204  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.147771  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0590  nucleoside diphosphate kinase  68.84 
 
 		 142 aa  204  4e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0697929  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1166  nucleoside diphosphate kinase  70.21 
 
 		 141 aa  204  4e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2183  Nucleoside-diphosphate kinase  67.38 
 
 		 141 aa  204  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450102  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2992  nucleoside diphosphate kinase  68.79 
 
 		 159 aa  204  4e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000780378  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1478  nucleoside diphosphate kinase  70.21 
 
 		 141 aa  203  5e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1420  nucleoside diphosphate kinase  68.09 
 
 		 141 aa  202  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.803456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2380  nucleoside-diphosphate kinase  68.79 
 
 		 141 aa  202  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2231  nucleoside diphosphate kinase  68.09 
 
 		 141 aa  202  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1591  nucleoside diphosphate kinase  67.38 
 
 		 141 aa  202  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1460  nucleoside diphosphate kinase  68.09 
 
 		 141 aa  202  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425797  normal  0.366312 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1601  nucleoside diphosphate kinase  67.39 
 
 		 141 aa  201  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.144621 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3394  nucleoside diphosphate kinase  69.92 
 
 		 141 aa  201  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1759  nucleoside diphosphate kinase  69.06 
 
 		 140 aa  202  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.248736 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>