More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3873 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3873  nucleoside diphosphate kinase  100 
 
 		 141 aa  293  5e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.775561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0925  nucleoside diphosphate kinase  60.29 
 
 		 139 aa  186  8e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.621681 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2890  Nucleoside-diphosphate kinase  60.29 
 
 		 138 aa  181  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.421827  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3160  nucleoside diphosphate kinase  58.52 
 
 		 139 aa  178  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00622384 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3611  nucleoside diphosphate kinase  58.82 
 
 		 138 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1439  nucleoside diphosphate kinase  57.78 
 
 		 139 aa  176  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0019677  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2625  nucleoside-diphosphate kinase  57.35 
 
 		 139 aa  175  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3244  nucleoside diphosphate kinase  58.09 
 
 		 137 aa  174  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189269  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1580  nucleoside diphosphate kinase  58.09 
 
 		 137 aa  174  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000001622  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2559  nucleoside diphosphate kinase  55.88 
 
 		 137 aa  170  5.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.17056e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1654  nucleoside diphosphate kinase  55.88 
 
 		 137 aa  170  5.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000296551  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2164  Nucleoside-diphosphate kinase  58.52 
 
 		 139 aa  169  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.961833 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2686  nucleoside diphosphate kinase  54.41 
 
 		 137 aa  166  8e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  4.77267e-18  normal  0.505951 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0894  Nucleoside-diphosphate kinase  53.28 
 
 		 139 aa  166  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150148  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0590  nucleoside diphosphate kinase  56.62 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0697929  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3333  nucleoside-diphosphate kinase  57.35 
 
 		 140 aa  164  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148108 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1110  nucleoside diphosphate kinase  55.15 
 
 		 137 aa  163  5.9999999999999996e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000208887  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2961  nucleoside diphosphate kinase  55.88 
 
 		 140 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0984592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2216  Nucleoside-diphosphate kinase  54.41 
 
 		 140 aa  161  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.529954  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2485  nucleoside diphosphate kinase  55.15 
 
 		 140 aa  160  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0924623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0030  nucleoside diphosphate kinase  54.81 
 
 		 140 aa  159  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.348386  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0787  nucleoside diphosphate kinase  55.88 
 
 		 141 aa  159  1e-38  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.365993  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0694  nucleoside diphosphate kinase  54.41 
 
 		 140 aa  159  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.900866  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2023  nucleoside diphosphate kinase  54.41 
 
 		 137 aa  159  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01364  nucleoside diphosphate kinase  55.15 
 
 		 143 aa  159  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2886  nucleoside diphosphate kinase  56.62 
 
 		 143 aa  158  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6029  Nucleoside-diphosphate kinase  57.14 
 
 		 139 aa  158  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.208035 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1759  nucleoside diphosphate kinase  52.94 
 
 		 140 aa  158  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.248736 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1906  nucleoside diphosphate kinase  55.88 
 
 		 143 aa  157  3e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2544  nucleoside diphosphate kinase  58.02 
 
 		 141 aa  158  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0478014  hitchhiker  0.00487946 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0685  nucleoside diphosphate kinase  53.68 
 
 		 140 aa  158  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1601  nucleoside diphosphate kinase  56.62 
 
 		 141 aa  158  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.144621 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1929  nucleoside diphosphate kinase  56.62 
 
 		 141 aa  158  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0387  nucleoside diphosphate kinase  54.01 
 
 		 141 aa  158  3e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1127  nucleoside diphosphate kinase  55.15 
 
 		 140 aa  157  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.355617 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1301  nucleoside diphosphate kinase  56.62 
 
 		 143 aa  157  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.378961  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1591  nucleoside diphosphate kinase  57.25 
 
 		 141 aa  157  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2328  nucleoside diphosphate kinase  53.68 
 
 		 140 aa  157  6e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0990  nucleoside diphosphate kinase  56.2 
 
 		 137 aa  156  7e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1430  nucleoside diphosphate kinase  55.15 
 
 		 141 aa  157  7e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3130  nucleoside diphosphate kinase  55.15 
 
 		 143 aa  157  7e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0990343  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2594  nucleoside diphosphate kinase  53.68 
 
 		 140 aa  157  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.772748  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2741  Nucleoside-diphosphate kinase  54.74 
 
 		 143 aa  156  8e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0775  nucleoside diphosphate kinase  53.68 
 
 		 140 aa  156  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.251907 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1717  nucleoside diphosphate kinase  53.28 
 
 		 141 aa  156  1e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1781  nucleoside diphosphate kinase  53.28 
 
 		 141 aa  156  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5149  Nucleoside-diphosphate kinase  53.68 
 
 		 139 aa  155  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.639842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3466  nucleoside diphosphate kinase  52.94 
 
 		 140 aa  155  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.157142  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1348  nucleoside diphosphate kinase  57.25 
 
 		 141 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1838  nucleoside diphosphate kinase  57.25 
 
 		 141 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.629382  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2193  nucleoside diphosphate kinase  57.25 
 
 		 141 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0662762  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2358  nucleoside diphosphate kinase  57.25 
 
 		 141 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766138  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1350  nucleoside diphosphate kinase  55.15 
 
 		 140 aa  155  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.388595 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1702  nucleoside diphosphate kinase  55.47 
 
 		 137 aa  155  2e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2183  Nucleoside-diphosphate kinase  56.39 
 
 		 141 aa  155  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450102  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0059  nucleoside diphosphate kinase  57.25 
 
 		 141 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.147771  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1110  nucleoside diphosphate kinase  57.25 
 
 		 141 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.539018  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1307  nucleoside diphosphate kinase  53.68 
 
 		 143 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2231  nucleoside diphosphate kinase  57.25 
 
 		 141 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.666945  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14820  nucleoside diphosphate kinase  53.68 
 
 		 143 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1538  nucleoside diphosphate kinase  54.41 
 
 		 140 aa  154  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2182  nucleoside diphosphate kinase  54.62 
 
 		 146 aa  154  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2052  Nucleoside-diphosphate kinase  52.94 
 
 		 143 aa  154  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.238298  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2894  nucleoside diphosphate kinase  54.41 
 
 		 140 aa  154  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.588521  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2231  nucleoside diphosphate kinase  56.49 
 
 		 141 aa  154  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0488  nucleoside diphosphate kinase  50.74 
 
 		 140 aa  154  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.94112  normal  0.716052 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1248  nucleoside diphosphate kinase  53.68 
 
 		 141 aa  154  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1123  nucleoside diphosphate kinase  56.3 
 
 		 142 aa  154  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592805  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2390  nucleoside diphosphate kinase  54.41 
 
 		 143 aa  154  4e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00297694  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3648  nucleoside diphosphate kinase  53.38 
 
 		 139 aa  154  4e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3012  nucleoside diphosphate kinase  54.35 
 
 		 143 aa  154  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1114  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 		 143 aa  154  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.66458  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2862  nucleoside diphosphate kinase  55.47 
 
 		 143 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.760882  hitchhiker  0.0000000204456 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2169  nucleoside diphosphate kinase  55.88 
 
 		 140 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2110  nucleoside diphosphate kinase  54.14 
 
 		 141 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10693  nucleoside diphosphate kinase  52.99 
 
 		 161 aa  154  6e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.371269  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1979  nucleoside diphosphate kinase  52.21 
 
 		 140 aa  154  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2288  nucleoside diphosphate kinase  50 
 
 		 140 aa  153  6e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.416222 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2012  nucleoside diphosphate kinase  50 
 
 		 140 aa  153  7e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.684832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3394  nucleoside diphosphate kinase  53.38 
 
 		 141 aa  153  7e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5469  Nucleoside-diphosphate kinase  54.89 
 
 		 139 aa  152  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.628942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2310  nucleoside diphosphate kinase  54.41 
 
 		 143 aa  152  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00703116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2090  nucleoside diphosphate kinase  54.14 
 
 		 141 aa  152  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1289  nucleoside diphosphate kinase  55.15 
 
 		 142 aa  153  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1234  nucleoside-diphosphate kinase  53.68 
 
 		 140 aa  152  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0263228  normal  0.0520892 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2231  nucleoside diphosphate kinase  54.2 
 
 		 147 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00256702  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4976  nucleoside diphosphate kinase  52.63 
 
 		 139 aa  152  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1498  nucleoside diphosphate kinase  53.68 
 
 		 143 aa  152  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.300953  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2319  nucleoside diphosphate kinase  54.2 
 
 		 147 aa  151  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0482879  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1974  nucleoside diphosphate kinase  49.26 
 
 		 140 aa  152  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.209722 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1629  nucleoside diphosphate kinase  54.2 
 
 		 147 aa  151  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243843  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2850  nucleoside diphosphate kinase  55.56 
 
 		 141 aa  152  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0957  nucleoside diphosphate kinase  53.68 
 
 		 140 aa  152  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2380  nucleoside-diphosphate kinase  55.73 
 
 		 141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2000  nucleoside diphosphate kinase  52.99 
 
 		 141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.136751 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0514  nucleoside diphosphate kinase  50.74 
 
 		 140 aa  151  4e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.321088  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0894  nucleoside diphosphate kinase  50 
 
 		 140 aa  150  4e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.139474  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1182  nucleoside diphosphate kinase  55.15 
 
 		 142 aa  151  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2417  nucleoside-diphosphate kinase  52.94 
 
 		 164 aa  150  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1311  nucleoside-diphosphate kinase  53.33 
 
 		 140 aa  150  4e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.298971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>