More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1979 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1979  nucleoside diphosphate kinase  100 
 
 
140 aa  290  4e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0775  nucleoside diphosphate kinase  92.86 
 
 
140 aa  268  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.251907 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1079  nucleoside diphosphate kinase  88.57 
 
 
140 aa  260  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000368146 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1224  nucleoside diphosphate kinase  88.57 
 
 
140 aa  260  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131645 
 
 
-
 
NC_004310  BR0694  nucleoside diphosphate kinase  88.57 
 
 
140 aa  256  5.0000000000000005e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.900866  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0514  nucleoside diphosphate kinase  85.71 
 
 
140 aa  254  2e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.321088  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0685  nucleoside diphosphate kinase  87.86 
 
 
140 aa  255  2e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2594  nucleoside diphosphate kinase  87.86 
 
 
140 aa  253  7e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.772748  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1552  nucleoside diphosphate kinase  83.33 
 
 
132 aa  229  6e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.744593  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1759  nucleoside diphosphate kinase  74.29 
 
 
140 aa  219  8e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.248736 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0957  nucleoside diphosphate kinase  72.14 
 
 
140 aa  217  5e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3333  nucleoside-diphosphate kinase  72.86 
 
 
140 aa  216  6e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.148108 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1127  nucleoside diphosphate kinase  73.57 
 
 
140 aa  216  8.999999999999998e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.355617 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1822  nucleoside diphosphate kinase  72.14 
 
 
140 aa  214  2.9999999999999998e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2894  nucleoside diphosphate kinase  72.14 
 
 
140 aa  212  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.588521  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1538  nucleoside diphosphate kinase  72.14 
 
 
140 aa  212  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115511  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1350  nucleoside diphosphate kinase  72.14 
 
 
140 aa  212  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.388595 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0894  nucleoside diphosphate kinase  71.43 
 
 
140 aa  209  9e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.139474  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0030  nucleoside diphosphate kinase  71.43 
 
 
140 aa  209  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.348386  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2961  nucleoside diphosphate kinase  70 
 
 
140 aa  207  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0984592  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2318  nucleoside diphosphate kinase  70.71 
 
 
140 aa  206  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201028  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2485  nucleoside diphosphate kinase  68.57 
 
 
140 aa  206  9e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0924623  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2122  nucleoside diphosphate kinase  69.29 
 
 
140 aa  206  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3466  nucleoside diphosphate kinase  70 
 
 
140 aa  204  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.157142  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4923  nucleoside diphosphate kinase  68.57 
 
 
140 aa  204  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0403558  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3160  nucleoside diphosphate kinase  67.88 
 
 
139 aa  203  7e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00622384 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1746  nucleoside diphosphate kinase  69.29 
 
 
140 aa  202  9e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2901  normal  0.105235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4361  nucleoside diphosphate kinase  67.14 
 
 
140 aa  202  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.669349  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1234  nucleoside-diphosphate kinase  69.29 
 
 
140 aa  202  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0263228  normal  0.0520892 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1601  nucleoside diphosphate kinase  68.57 
 
 
140 aa  201  3e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00859967  normal  0.254258 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2169  nucleoside diphosphate kinase  68.57 
 
 
140 aa  201  4e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0968  nucleoside diphosphate kinase  69.29 
 
 
140 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00326747 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2328  nucleoside diphosphate kinase  67.86 
 
 
140 aa  199  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0488  nucleoside diphosphate kinase  65.22 
 
 
140 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.94112  normal  0.716052 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2433  nucleoside diphosphate kinase  66.43 
 
 
140 aa  198  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0925  nucleoside diphosphate kinase  65.94 
 
 
139 aa  197  5e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.621681 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2012  nucleoside diphosphate kinase  65.22 
 
 
140 aa  196  7.999999999999999e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.684832  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2288  nucleoside diphosphate kinase  64.49 
 
 
140 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.416222 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1974  nucleoside diphosphate kinase  64.49 
 
 
140 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.209722 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01364  nucleoside diphosphate kinase  64.75 
 
 
143 aa  195  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2886  nucleoside diphosphate kinase  65.22 
 
 
143 aa  192  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3838  nucleoside diphosphate kinase  70.71 
 
 
140 aa  191  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.502354 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3130  nucleoside diphosphate kinase  62.59 
 
 
143 aa  188  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0990343  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1248  nucleoside diphosphate kinase  63.04 
 
 
141 aa  188  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0237  nucleoside diphosphate kinase  63.31 
 
 
140 aa  186  7e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.803486  normal  0.83109 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2310  nucleoside diphosphate kinase  64.03 
 
 
143 aa  185  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00703116  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0590  nucleoside diphosphate kinase  63.77 
 
 
142 aa  184  3e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0697929  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2862  nucleoside diphosphate kinase  64.03 
 
 
143 aa  184  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.760882  hitchhiker  0.0000000204456 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0619  nucleoside-diphosphate kinase  60.29 
 
 
141 aa  183  7e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000154193  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2417  nucleoside-diphosphate kinase  63.04 
 
 
164 aa  183  7e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1906  nucleoside diphosphate kinase  61.87 
 
 
143 aa  182  9e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2538  nucleoside diphosphate kinase  62.77 
 
 
139 aa  182  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.565005  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1311  nucleoside-diphosphate kinase  60.71 
 
 
140 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.298971  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4256  nucleoside diphosphate kinase  61.43 
 
 
143 aa  181  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1342  nucleoside diphosphate kinase  61.59 
 
 
139 aa  181  3e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00960069  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1430  nucleoside diphosphate kinase  60.87 
 
 
141 aa  181  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2390  nucleoside diphosphate kinase  62.32 
 
 
143 aa  181  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00297694  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2850  nucleoside diphosphate kinase  61.87 
 
 
141 aa  181  4.0000000000000006e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1301  nucleoside diphosphate kinase  60.43 
 
 
143 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.378961  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1402  nucleoside diphosphate kinase  61.31 
 
 
144 aa  179  9.000000000000001e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000394217  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2183  Nucleoside-diphosphate kinase  62.69 
 
 
141 aa  179  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450102  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0731  Nucleoside-diphosphate kinase  63.91 
 
 
143 aa  179  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2164  Nucleoside-diphosphate kinase  59.12 
 
 
139 aa  179  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.961833 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1110  nucleoside diphosphate kinase  60.58 
 
 
137 aa  179  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000208887  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0849  nucleoside diphosphate kinase  61.59 
 
 
141 aa  178  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4605  nucleoside diphosphate kinase  62.32 
 
 
141 aa  178  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.426522  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3504  nucleoside diphosphate kinase  60.87 
 
 
143 aa  178  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0879  nucleoside diphosphate kinase  61.59 
 
 
141 aa  178  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1929  nucleoside diphosphate kinase  60.87 
 
 
141 aa  178  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2559  nucleoside diphosphate kinase  59.12 
 
 
137 aa  177  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.17056e-35 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1624  nucleoside diphosphate kinase  60.14 
 
 
141 aa  177  2.9999999999999997e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.615734  hitchhiker  0.00226942 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1601  nucleoside diphosphate kinase  60.87 
 
 
141 aa  178  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.144621 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14820  nucleoside diphosphate kinase  60.14 
 
 
143 aa  177  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2992  nucleoside diphosphate kinase  58.99 
 
 
159 aa  177  4e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000780378  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1307  nucleoside diphosphate kinase  60.14 
 
 
143 aa  177  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06114  nucleoside diphosphate kinase  59.71 
 
 
141 aa  177  4.999999999999999e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.109761  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01052  nucleoside diphosphate kinase  59.71 
 
 
141 aa  177  4.999999999999999e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.299785  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1792  nucleoside diphosphate kinase  60.87 
 
 
141 aa  177  4.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1654  nucleoside diphosphate kinase  59.12 
 
 
137 aa  177  4.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000296551  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1498  nucleoside diphosphate kinase  59.71 
 
 
143 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.300953  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1717  nucleoside diphosphate kinase  59.71 
 
 
141 aa  177  5.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2686  nucleoside diphosphate kinase  59.12 
 
 
137 aa  177  5.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  4.77267e-18  normal  0.505951 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1781  nucleoside diphosphate kinase  59.71 
 
 
141 aa  177  5.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0285  nucleoside diphosphate kinase  59.71 
 
 
142 aa  177  5.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000362394  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1580  nucleoside diphosphate kinase  59.12 
 
 
137 aa  176  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000001622  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40330  Nucleoside-diphosphate kinase  60.87 
 
 
143 aa  176  7e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0074  Nucleoside-diphosphate kinase  57.97 
 
 
138 aa  176  8e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1439  nucleoside diphosphate kinase  61.31 
 
 
139 aa  176  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0019677  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3613  nucleoside diphosphate kinase  59.42 
 
 
141 aa  176  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.367991 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2052  Nucleoside-diphosphate kinase  59.42 
 
 
143 aa  175  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.238298  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01064  nucleoside diphosphate kinase  58.99 
 
 
141 aa  175  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4329  nucleoside diphosphate kinase  60.87 
 
 
141 aa  175  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000143413 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2741  Nucleoside-diphosphate kinase  57.97 
 
 
143 aa  175  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2380  nucleoside-diphosphate kinase  60.14 
 
 
141 aa  174  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3611  nucleoside diphosphate kinase  59.42 
 
 
138 aa  174  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0892  nucleoside diphosphate kinase  60.87 
 
 
141 aa  174  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000198835 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2190  Nucleoside-diphosphate kinase  60.14 
 
 
142 aa  174  5e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2000  nucleoside diphosphate kinase  63.91 
 
 
141 aa  174  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.136751 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1289  nucleoside diphosphate kinase  57.97 
 
 
142 aa  174  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2377  nucleoside diphosphate kinase  60.43 
 
 
143 aa  173  6e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000377324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>