More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0957 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0957  nucleoside diphosphate kinase  100 
 
 		 140 aa  285  2e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1350  nucleoside diphosphate kinase  92.14 
 
 		 140 aa  267  4e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.388595 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2894  nucleoside diphosphate kinase  84.29 
 
 		 140 aa  242  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.588521  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1538  nucleoside diphosphate kinase  84.29 
 
 		 140 aa  242  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1127  nucleoside diphosphate kinase  83.57 
 
 		 140 aa  240  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.355617 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1822  nucleoside diphosphate kinase  82.14 
 
 		 140 aa  238  1e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1746  nucleoside diphosphate kinase  82.14 
 
 		 140 aa  235  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2901  normal  0.105235 
 
 
-
 
NC_004310  BR0694  nucleoside diphosphate kinase  76.43 
 
 		 140 aa  221  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.900866  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2594  nucleoside diphosphate kinase  75.71 
 
 		 140 aa  220  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.772748  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3333  nucleoside-diphosphate kinase  77.14 
 
 		 140 aa  221  4e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148108 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0685  nucleoside diphosphate kinase  75.71 
 
 		 140 aa  220  4.9999999999999996e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1979  nucleoside diphosphate kinase  72.14 
 
 		 140 aa  217  5e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2485  nucleoside diphosphate kinase  74.29 
 
 		 140 aa  214  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0924623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0775  nucleoside diphosphate kinase  73.57 
 
 		 140 aa  215  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.251907 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2961  nucleoside diphosphate kinase  73.57 
 
 		 140 aa  211  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0984592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2318  nucleoside diphosphate kinase  73.57 
 
 		 140 aa  211  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2992  nucleoside diphosphate kinase  69.78 
 
 		 159 aa  210  5.999999999999999e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000780378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1311  nucleoside-diphosphate kinase  72.86 
 
 		 140 aa  209  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.298971  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4361  nucleoside diphosphate kinase  73.57 
 
 		 140 aa  207  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.669349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3466  nucleoside diphosphate kinase  73.57 
 
 		 140 aa  207  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.157142  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0514  nucleoside diphosphate kinase  70 
 
 		 140 aa  207  4e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.321088  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0894  nucleoside diphosphate kinase  72.14 
 
 		 140 aa  207  4e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.139474  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4923  nucleoside diphosphate kinase  73.57 
 
 		 140 aa  207  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0403558  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1601  nucleoside diphosphate kinase  75 
 
 		 140 aa  207  5e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00859967  normal  0.254258 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2169  nucleoside diphosphate kinase  71.94 
 
 		 140 aa  206  9e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1759  nucleoside diphosphate kinase  71.43 
 
 		 140 aa  206  9e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.248736 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2122  nucleoside diphosphate kinase  74.29 
 
 		 140 aa  205  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2433  nucleoside diphosphate kinase  72.86 
 
 		 140 aa  205  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0488  nucleoside diphosphate kinase  72.46 
 
 		 140 aa  204  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.94112  normal  0.716052 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2328  nucleoside diphosphate kinase  72.86 
 
 		 140 aa  204  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1079  nucleoside diphosphate kinase  70 
 
 		 140 aa  204  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000368146 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1224  nucleoside diphosphate kinase  69.29 
 
 		 140 aa  204  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131645 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1974  nucleoside diphosphate kinase  71.01 
 
 		 140 aa  203  6e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.209722 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1234  nucleoside-diphosphate kinase  71.43 
 
 		 140 aa  203  6e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0263228  normal  0.0520892 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0968  nucleoside diphosphate kinase  72.14 
 
 		 140 aa  202  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00326747 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0030  nucleoside diphosphate kinase  71.43 
 
 		 140 aa  202  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.348386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2288  nucleoside diphosphate kinase  70.29 
 
 		 140 aa  201  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.416222 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2012  nucleoside diphosphate kinase  72.39 
 
 		 140 aa  200  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.684832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0237  nucleoside diphosphate kinase  66.91 
 
 		 140 aa  197  3.9999999999999996e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.803486  normal  0.83109 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1601  nucleoside diphosphate kinase  66.67 
 
 		 141 aa  196  7.999999999999999e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.144621 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1552  nucleoside diphosphate kinase  71.97 
 
 		 132 aa  196  7.999999999999999e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.744593  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1929  nucleoside diphosphate kinase  66.67 
 
 		 141 aa  196  7.999999999999999e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01364  nucleoside diphosphate kinase  68.35 
 
 		 143 aa  195  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2886  nucleoside diphosphate kinase  67.39 
 
 		 143 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2538  nucleoside diphosphate kinase  70.07 
 
 		 139 aa  193  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.565005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3130  nucleoside diphosphate kinase  66.91 
 
 		 143 aa  192  9e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0990343  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3838  nucleoside diphosphate kinase  74.29 
 
 		 140 aa  192  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.502354 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1342  nucleoside diphosphate kinase  63.77 
 
 		 139 aa  192  2e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00960069  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1402  nucleoside diphosphate kinase  65.41 
 
 		 144 aa  191  2e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000394217  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2183  Nucleoside-diphosphate kinase  63.04 
 
 		 141 aa  192  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450102  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3394  nucleoside diphosphate kinase  61.59 
 
 		 141 aa  188  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0925  nucleoside diphosphate kinase  66.67 
 
 		 139 aa  188  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.621681 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3160  nucleoside diphosphate kinase  64.23 
 
 		 139 aa  187  5e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00622384 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1086  nucleoside diphosphate kinase  62.32 
 
 		 141 aa  186  7e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.895381  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2000  nucleoside diphosphate kinase  62.32 
 
 		 141 aa  186  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.136751 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0731  Nucleoside-diphosphate kinase  66.92 
 
 		 143 aa  185  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1423  nucleoside diphosphate kinase  64.66 
 
 		 141 aa  185  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235945  normal  0.0433038 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2090  nucleoside diphosphate kinase  61.59 
 
 		 141 aa  185  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1906  nucleoside diphosphate kinase  64.75 
 
 		 143 aa  185  2e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3611  nucleoside diphosphate kinase  63.04 
 
 		 138 aa  184  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2389  nucleoside diphosphate kinase  65.47 
 
 		 143 aa  184  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00124206  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2377  nucleoside diphosphate kinase  65.47 
 
 		 143 aa  184  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000377324  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1970  nucleoside diphosphate kinase  65.47 
 
 		 143 aa  184  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570351  hitchhiker  0.000372949 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1166  nucleoside diphosphate kinase  61.59 
 
 		 141 aa  184  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2310  nucleoside diphosphate kinase  64.03 
 
 		 143 aa  184  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00703116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2493  nucleoside diphosphate kinase  65.47 
 
 		 143 aa  184  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000115766  hitchhiker  0.00287307 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2141  nucleoside diphosphate kinase  65.47 
 
 		 143 aa  184  5e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000896706  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4256  nucleoside diphosphate kinase  63.77 
 
 		 143 aa  183  6e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0590  nucleoside diphosphate kinase  62.32 
 
 		 142 aa  183  6e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0697929  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2272  nucleoside diphosphate kinase  65.47 
 
 		 143 aa  183  6e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000444266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5149  Nucleoside-diphosphate kinase  63.77 
 
 		 139 aa  183  7e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.639842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1248  nucleoside diphosphate kinase  62.32 
 
 		 141 aa  183  7e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2862  nucleoside diphosphate kinase  64.03 
 
 		 143 aa  183  8e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.760882  hitchhiker  0.0000000204456 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3504  nucleoside diphosphate kinase  61.59 
 
 		 143 aa  183  8e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2231  nucleoside diphosphate kinase  64.66 
 
 		 141 aa  183  8e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0849  nucleoside diphosphate kinase  63.77 
 
 		 141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0879  nucleoside diphosphate kinase  63.77 
 
 		 141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2110  nucleoside diphosphate kinase  59.42 
 
 		 141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2193  nucleoside diphosphate kinase  63.16 
 
 		 141 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0662762  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0059  nucleoside diphosphate kinase  63.16 
 
 		 141 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.147771  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1460  nucleoside diphosphate kinase  63.91 
 
 		 141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425797  normal  0.366312 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1838  nucleoside diphosphate kinase  63.16 
 
 		 141 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.629382  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1348  nucleoside diphosphate kinase  63.16 
 
 		 141 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2358  nucleoside diphosphate kinase  63.16 
 
 		 141 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766138  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4605  nucleoside diphosphate kinase  63.04 
 
 		 141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.426522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0662  nucleoside diphosphate kinase  59.42 
 
 		 141 aa  181  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0130513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2390  nucleoside diphosphate kinase  63.77 
 
 		 143 aa  181  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00297694  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2052  Nucleoside-diphosphate kinase  61.59 
 
 		 143 aa  181  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.238298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1110  nucleoside diphosphate kinase  63.16 
 
 		 141 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.539018  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2231  nucleoside diphosphate kinase  63.16 
 
 		 141 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.666945  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1747  nucleoside diphosphate kinase  64.03 
 
 		 143 aa  181  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000066664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1827  nucleoside diphosphate kinase  64.03 
 
 		 143 aa  181  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00692161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40330  Nucleoside-diphosphate kinase  62.32 
 
 		 143 aa  182  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0084  nucleoside-diphosphate kinase  60.87 
 
 		 141 aa  181  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.311434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1420  nucleoside diphosphate kinase  60.14 
 
 		 141 aa  181  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.803456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0899  nucleoside-diphosphate kinase  60.14 
 
 		 143 aa  181  4.0000000000000006e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1591  nucleoside diphosphate kinase  63.16 
 
 		 141 aa  180  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0074  Nucleoside-diphosphate kinase  59.42 
 
 		 138 aa  180  6e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2612  nucleoside diphosphate kinase  60.87 
 
 		 141 aa  180  6e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00143318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2417  nucleoside-diphosphate kinase  63.04 
 
 		 164 aa  179  8.000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>