More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0074 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0074  Nucleoside-diphosphate kinase  100 
 
 
138 aa  284  2.9999999999999996e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0204  nucleoside diphosphate kinase  61.31 
 
 
140 aa  183  6e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0229  nucleoside diphosphate kinase  60.58 
 
 
140 aa  182  1.0000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.559671  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2180  nucleoside diphosphate kinase  60.58 
 
 
140 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0298319  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2368  nucleoside diphosphate kinase  59.85 
 
 
140 aa  181  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0653822  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1746  nucleoside diphosphate kinase  60.87 
 
 
140 aa  181  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2901  normal  0.105235 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1350  nucleoside diphosphate kinase  60.14 
 
 
140 aa  180  6e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.388595 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0957  nucleoside diphosphate kinase  59.42 
 
 
140 aa  180  6e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1127  nucleoside diphosphate kinase  60.87 
 
 
140 aa  180  7e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.355617 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0339  nucleoside diphosphate kinase  59.12 
 
 
140 aa  178  2e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0685  nucleoside diphosphate kinase  57.97 
 
 
140 aa  178  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0694  nucleoside diphosphate kinase  57.97 
 
 
140 aa  178  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.900866  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2559  nucleoside diphosphate kinase  59.12 
 
 
137 aa  178  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.17056e-35 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0775  nucleoside diphosphate kinase  57.97 
 
 
140 aa  177  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.251907 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2122  nucleoside diphosphate kinase  60.14 
 
 
140 aa  178  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1654  nucleoside diphosphate kinase  59.12 
 
 
137 aa  177  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000296551  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2686  nucleoside diphosphate kinase  56.93 
 
 
137 aa  177  4.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  4.77267e-18  normal  0.505951 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1979  nucleoside diphosphate kinase  57.97 
 
 
140 aa  176  8e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1580  nucleoside diphosphate kinase  58.39 
 
 
137 aa  176  9e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000001622  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1110  nucleoside diphosphate kinase  58.39 
 
 
137 aa  176  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000208887  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1538  nucleoside diphosphate kinase  59.42 
 
 
140 aa  176  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115511  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2894  nucleoside diphosphate kinase  59.42 
 
 
140 aa  176  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.588521  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2009  nucleoside diphosphate kinase  58.39 
 
 
141 aa  175  2e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000148983  normal  0.309195 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2236  nucleoside diphosphate kinase  59.12 
 
 
141 aa  175  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2485  nucleoside diphosphate kinase  56.52 
 
 
140 aa  173  6e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0924623  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2961  nucleoside diphosphate kinase  56.52 
 
 
140 aa  173  9e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0984592  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2594  nucleoside diphosphate kinase  56.52 
 
 
140 aa  172  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.772748  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3466  nucleoside diphosphate kinase  56.52 
 
 
140 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.157142  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1601  nucleoside diphosphate kinase  58.7 
 
 
140 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00859967  normal  0.254258 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1822  nucleoside diphosphate kinase  55.8 
 
 
140 aa  171  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2318  nucleoside diphosphate kinase  55.8 
 
 
140 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201028  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3244  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 
137 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189269  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2183  Nucleoside-diphosphate kinase  58.82 
 
 
141 aa  171  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450102  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0990  nucleoside diphosphate kinase  58.39 
 
 
137 aa  169  9e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2164  Nucleoside-diphosphate kinase  56.2 
 
 
139 aa  169  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.961833 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3160  nucleoside diphosphate kinase  54.01 
 
 
139 aa  168  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00622384 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1439  nucleoside diphosphate kinase  53.28 
 
 
139 aa  167  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0019677  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1488  nucleoside diphosphate kinase  56.2 
 
 
137 aa  167  6e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.118139  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2148  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 
149 aa  167  6e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110193  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0925  nucleoside diphosphate kinase  54.35 
 
 
139 aa  167  6e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.621681 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3611  nucleoside diphosphate kinase  52.9 
 
 
138 aa  166  9e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1702  nucleoside diphosphate kinase  56.93 
 
 
137 aa  166  1e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3394  nucleoside diphosphate kinase  54.41 
 
 
141 aa  165  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01364  nucleoside diphosphate kinase  56.93 
 
 
143 aa  164  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2989  nucleoside diphosphate kinase  56.72 
 
 
142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0674599  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2992  nucleoside diphosphate kinase  56.93 
 
 
159 aa  164  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000780378  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0471  nucleoside diphosphate kinase  53.68 
 
 
149 aa  164  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1079  nucleoside diphosphate kinase  54.35 
 
 
140 aa  163  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000368146 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0237  nucleoside diphosphate kinase  55.88 
 
 
140 aa  163  8e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.803486  normal  0.83109 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1224  nucleoside diphosphate kinase  53.62 
 
 
140 aa  163  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131645 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2058  Nucleoside-diphosphate kinase  56.2 
 
 
149 aa  163  9e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0488  nucleoside diphosphate kinase  55.38 
 
 
140 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.94112  normal  0.716052 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1311  nucleoside-diphosphate kinase  53.28 
 
 
140 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.298971  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0514  nucleoside diphosphate kinase  52.9 
 
 
140 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.321088  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1601  nucleoside diphosphate kinase  54.41 
 
 
141 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.144621 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3333  nucleoside-diphosphate kinase  54.35 
 
 
140 aa  162  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.148108 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1929  nucleoside diphosphate kinase  54.41 
 
 
141 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4361  nucleoside diphosphate kinase  52.17 
 
 
140 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.669349  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1906  nucleoside diphosphate kinase  57.66 
 
 
143 aa  162  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0030  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 
140 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.348386  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2216  Nucleoside-diphosphate kinase  55.47 
 
 
140 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.529954  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2625  nucleoside-diphosphate kinase  51.45 
 
 
139 aa  161  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1430  nucleoside diphosphate kinase  57.66 
 
 
141 aa  161  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0787  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 
141 aa  160  5.0000000000000005e-39  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.365993  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2023  nucleoside diphosphate kinase  52.55 
 
 
137 aa  160  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1248  nucleoside diphosphate kinase  56.62 
 
 
141 aa  160  6e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2288  nucleoside diphosphate kinase  50.36 
 
 
140 aa  160  7e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.416222 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1759  nucleoside diphosphate kinase  53.68 
 
 
140 aa  160  7e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.248736 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2886  nucleoside diphosphate kinase  55.47 
 
 
143 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0233  nucleoside diphosphate kinase  55.88 
 
 
137 aa  159  8.000000000000001e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4923  nucleoside diphosphate kinase  52.17 
 
 
140 aa  159  9e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0403558  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6029  Nucleoside-diphosphate kinase  54.14 
 
 
139 aa  159  9e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.208035 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2231  nucleoside diphosphate kinase  55.15 
 
 
147 aa  159  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00256702  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0970  Nucleoside-diphosphate kinase  56.12 
 
 
141 aa  159  1e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2190  Nucleoside-diphosphate kinase  58.02 
 
 
142 aa  159  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2110  nucleoside diphosphate kinase  54.41 
 
 
141 aa  159  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2012  nucleoside diphosphate kinase  50.36 
 
 
140 aa  159  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.684832  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1307  nucleoside diphosphate kinase  54.41 
 
 
143 aa  159  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14820  nucleoside diphosphate kinase  54.41 
 
 
143 aa  159  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2328  nucleoside diphosphate kinase  52.9 
 
 
140 aa  159  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2319  nucleoside diphosphate kinase  55.15 
 
 
147 aa  158  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0482879  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0662  nucleoside diphosphate kinase  54.41 
 
 
141 aa  158  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0130513  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1420  nucleoside diphosphate kinase  53.68 
 
 
141 aa  158  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.803456  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0899  nucleoside-diphosphate kinase  56.49 
 
 
143 aa  158  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3130  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 
143 aa  159  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0990343  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0590  nucleoside diphosphate kinase  55.15 
 
 
142 aa  157  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0697929  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1974  nucleoside diphosphate kinase  50.37 
 
 
140 aa  158  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.209722 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3838  nucleoside diphosphate kinase  57.25 
 
 
140 aa  158  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.502354 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2090  nucleoside diphosphate kinase  54.41 
 
 
141 aa  157  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1086  nucleoside diphosphate kinase  52.94 
 
 
141 aa  157  4e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.895381  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0225  Nucleoside-diphosphate kinase  53.68 
 
 
137 aa  157  4e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1334  nucleoside diphosphate kinase  51.82 
 
 
137 aa  157  4e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40330  Nucleoside-diphosphate kinase  54.35 
 
 
143 aa  157  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2169  nucleoside diphosphate kinase  51.45 
 
 
140 aa  157  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2000  nucleoside diphosphate kinase  54.41 
 
 
141 aa  157  6e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.136751 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5149  Nucleoside-diphosphate kinase  54.41 
 
 
139 aa  157  7e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.639842  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1293  nucleoside diphosphate kinase  52.94 
 
 
141 aa  157  7e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000414366  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0731  Nucleoside-diphosphate kinase  57.69 
 
 
143 aa  156  7e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2850  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 
141 aa  156  8e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2311  nucleoside-diphosphate kinase  53.68 
 
 
141 aa  156  9e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0861887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>