More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3160 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_3160  nucleoside diphosphate kinase  100 
 
 		 139 aa  290  5e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00622384 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0925  nucleoside diphosphate kinase  86.33 
 
 		 139 aa  259  8e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.621681 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2164  Nucleoside-diphosphate kinase  70.5 
 
 		 139 aa  218  3e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.961833 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2890  Nucleoside-diphosphate kinase  73.72 
 
 		 138 aa  216  7e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.421827  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1439  nucleoside diphosphate kinase  69.78 
 
 		 139 aa  212  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0019677  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1759  nucleoside diphosphate kinase  72.06 
 
 		 140 aa  211  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.248736 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2625  nucleoside-diphosphate kinase  67.15 
 
 		 139 aa  205  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0775  nucleoside diphosphate kinase  67.88 
 
 		 140 aa  204  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.251907 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1979  nucleoside diphosphate kinase  67.88 
 
 		 140 aa  203  7e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3333  nucleoside-diphosphate kinase  68.61 
 
 		 140 aa  202  9e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148108 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0894  nucleoside diphosphate kinase  68.38 
 
 		 140 aa  201  4e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.139474  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0030  nucleoside diphosphate kinase  67.88 
 
 		 140 aa  200  7e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.348386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2961  nucleoside diphosphate kinase  67.15 
 
 		 140 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0984592  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0694  nucleoside diphosphate kinase  65.69 
 
 		 140 aa  197  3e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.900866  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0894  Nucleoside-diphosphate kinase  65.69 
 
 		 139 aa  197  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150148  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0514  nucleoside diphosphate kinase  64.96 
 
 		 140 aa  197  5e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.321088  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0685  nucleoside diphosphate kinase  64.96 
 
 		 140 aa  196  9e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2485  nucleoside diphosphate kinase  66.42 
 
 		 140 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0924623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1079  nucleoside diphosphate kinase  65.69 
 
 		 140 aa  194  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000368146 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1224  nucleoside diphosphate kinase  64.96 
 
 		 140 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131645 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1580  nucleoside diphosphate kinase  63.97 
 
 		 137 aa  194  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000001622  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1234  nucleoside-diphosphate kinase  66.42 
 
 		 140 aa  193  6e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0263228  normal  0.0520892 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1654  nucleoside diphosphate kinase  64.71 
 
 		 137 aa  193  7e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000296551  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2559  nucleoside diphosphate kinase  64.71 
 
 		 137 aa  192  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.17056e-35 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3611  nucleoside diphosphate kinase  63.5 
 
 		 138 aa  191  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2318  nucleoside diphosphate kinase  64.96 
 
 		 140 aa  190  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3466  nucleoside diphosphate kinase  64.96 
 
 		 140 aa  189  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.157142  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2594  nucleoside diphosphate kinase  62.77 
 
 		 140 aa  187  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.772748  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2328  nucleoside diphosphate kinase  64.96 
 
 		 140 aa  188  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0957  nucleoside diphosphate kinase  64.23 
 
 		 140 aa  187  5e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1127  nucleoside diphosphate kinase  62.77 
 
 		 140 aa  186  8e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.355617 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0968  nucleoside diphosphate kinase  63.5 
 
 		 140 aa  186  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00326747 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1601  nucleoside diphosphate kinase  64.23 
 
 		 140 aa  186  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00859967  normal  0.254258 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2169  nucleoside diphosphate kinase  64.71 
 
 		 140 aa  186  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1110  nucleoside diphosphate kinase  61.03 
 
 		 137 aa  185  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000208887  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2886  nucleoside diphosphate kinase  64.44 
 
 		 143 aa  185  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2122  nucleoside diphosphate kinase  62.77 
 
 		 140 aa  185  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1350  nucleoside diphosphate kinase  64.23 
 
 		 140 aa  184  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.388595 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1248  nucleoside diphosphate kinase  62.96 
 
 		 141 aa  184  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01364  nucleoside diphosphate kinase  62.96 
 
 		 143 aa  184  4e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4361  nucleoside diphosphate kinase  61.31 
 
 		 140 aa  183  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.669349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1552  nucleoside diphosphate kinase  65.15 
 
 		 132 aa  183  7e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.744593  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0590  nucleoside diphosphate kinase  64.44 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0697929  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1822  nucleoside diphosphate kinase  62.04 
 
 		 140 aa  182  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3244  nucleoside diphosphate kinase  61.76 
 
 		 137 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189269  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1538  nucleoside diphosphate kinase  61.31 
 
 		 140 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2894  nucleoside diphosphate kinase  61.31 
 
 		 140 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.588521  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2741  Nucleoside-diphosphate kinase  62.96 
 
 		 143 aa  181  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2686  nucleoside diphosphate kinase  58.82 
 
 		 137 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  4.77267e-18  normal  0.505951 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0488  nucleoside diphosphate kinase  61.07 
 
 		 140 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.94112  normal  0.716052 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2183  Nucleoside-diphosphate kinase  61.48 
 
 		 141 aa  180  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450102  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2380  nucleoside-diphosphate kinase  62.22 
 
 		 141 aa  180  7e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4923  nucleoside diphosphate kinase  59.12 
 
 		 140 aa  179  8.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0403558  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1311  nucleoside-diphosphate kinase  61.31 
 
 		 140 aa  179  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.298971  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1289  nucleoside diphosphate kinase  61.48 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2390  nucleoside diphosphate kinase  62.96 
 
 		 143 aa  178  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00297694  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3130  nucleoside diphosphate kinase  61.48 
 
 		 143 aa  178  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0990343  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2190  Nucleoside-diphosphate kinase  62.96 
 
 		 142 aa  177  2.9999999999999997e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3873  nucleoside diphosphate kinase  58.52 
 
 		 141 aa  178  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.775561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0619  nucleoside-diphosphate kinase  57.66 
 
 		 141 aa  177  4e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000154193  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1746  nucleoside diphosphate kinase  60.58 
 
 		 140 aa  177  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2901  normal  0.105235 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2850  nucleoside diphosphate kinase  62.22 
 
 		 141 aa  177  4.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0725  nucleoside diphosphate kinase  63.08 
 
 		 144 aa  177  5.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1591  nucleoside diphosphate kinase  63.08 
 
 		 141 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1906  nucleoside diphosphate kinase  61.03 
 
 		 143 aa  176  8e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1301  nucleoside diphosphate kinase  61.48 
 
 		 143 aa  176  8e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.378961  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2433  nucleoside diphosphate kinase  58.39 
 
 		 140 aa  176  9e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2012  nucleoside diphosphate kinase  59.54 
 
 		 140 aa  176  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.684832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2288  nucleoside diphosphate kinase  59.54 
 
 		 140 aa  175  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.416222 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1624  nucleoside diphosphate kinase  61.54 
 
 		 141 aa  175  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.615734  hitchhiker  0.00226942 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1601  nucleoside diphosphate kinase  60 
 
 		 141 aa  175  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.144621 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1929  nucleoside diphosphate kinase  60 
 
 		 141 aa  175  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3613  nucleoside diphosphate kinase  62.22 
 
 		 141 aa  174  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.367991 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1182  nucleoside diphosphate kinase  60.74 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2538  nucleoside diphosphate kinase  59.71 
 
 		 139 aa  175  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.565005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2417  nucleoside-diphosphate kinase  61.48 
 
 		 164 aa  175  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0422  nucleoside diphosphate kinase  60.74 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.920358  normal  0.0102374 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06114  nucleoside diphosphate kinase  61.03 
 
 		 141 aa  174  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.109761  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2141  nucleoside diphosphate kinase  61.48 
 
 		 143 aa  174  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000896706  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2493  nucleoside diphosphate kinase  61.48 
 
 		 143 aa  174  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000115766  hitchhiker  0.00287307 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01064  nucleoside diphosphate kinase  60.74 
 
 		 141 aa  174  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2377  nucleoside diphosphate kinase  61.48 
 
 		 143 aa  174  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000377324  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2389  nucleoside diphosphate kinase  61.48 
 
 		 143 aa  174  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00124206  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1970  nucleoside diphosphate kinase  61.48 
 
 		 143 aa  174  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570351  hitchhiker  0.000372949 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2272  nucleoside diphosphate kinase  61.48 
 
 		 143 aa  174  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000444266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01052  nucleoside diphosphate kinase  61.03 
 
 		 141 aa  174  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.299785  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1656  nucleoside diphosphate kinase  61.76 
 
 		 141 aa  174  4e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.110606  normal  0.295678 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2110  nucleoside diphosphate kinase  60 
 
 		 141 aa  174  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2052  Nucleoside-diphosphate kinase  59.26 
 
 		 143 aa  174  5e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.238298  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1781  nucleoside diphosphate kinase  59.56 
 
 		 141 aa  174  5e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1717  nucleoside diphosphate kinase  59.56 
 
 		 141 aa  174  5e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1114  nucleoside diphosphate kinase  59.26 
 
 		 143 aa  174  5e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.66458  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2544  nucleoside diphosphate kinase  62.31 
 
 		 141 aa  174  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0478014  hitchhiker  0.00487946 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1747  nucleoside diphosphate kinase  60.74 
 
 		 143 aa  173  5e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000066664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1827  nucleoside diphosphate kinase  60.74 
 
 		 143 aa  173  5e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00692161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1974  nucleoside diphosphate kinase  59.23 
 
 		 140 aa  174  5e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.209722 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2670  nucleoside diphosphate kinase  60 
 
 		 143 aa  173  7e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.20658 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3838  nucleoside diphosphate kinase  66.42 
 
 		 140 aa  173  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.502354 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2231  nucleoside diphosphate kinase  62.31 
 
 		 141 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1792  nucleoside diphosphate kinase  60 
 
 		 141 aa  172  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>